• BMB Reports
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• 제34권3호
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• pp.244-249
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• 2001

The anabolic acetolactate synthase III was purified to homogeneity from Serratia marcescens using DEAE-Sepharose, Phenyl-Sepharose, and hydroxylapatite column chromatography The native molecular weight of the enzyme was approximately 165 kDa. The enzyme is composed of two large and two small subunits with molecular weights of 64 and 15 kDa, respectively. The N-terminal sequence of the large and small subunit of the enzyme was Ser-Ala-Thr-Pro-Gln-Pro-Ser-Thr-Arg-Phe-Thr-Cys-Ala-Gln-Leu-Ile-Ala-His-Leu and Met-Leu-Gln-Pro-Gln-Asp-Lys-Pro-Gln-Val-Ile-Leu-Glu-Leu-Ala-Val-Arg-Asn-His-Pro-Gly-Val-Met-Ser-His-Val, respectively. The optimum pH and pI value were 7.5 and 5.5, respectively The $IC_{50}$ values were $20\;{\mu}M$ and $14\;{\mu}M$ for valine and herbicide SU7, respectively. The substrate specificity ratio, R value, was determined to be approximately 40, which suggests that this enzyme prefers the formation of $\alpha$-aceto-$\alpha$-hydroxybutyrate leading to the synthesis of isoleucine.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제17권8호
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• pp.1308-1315
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• 2007

Lipase B from Candida antarctica (CalB) displayed on the cell surface of H. polymorpha has been functionally improved for catalytic activity by molecular evolution. CalB was displayed on the cell surface by fusing to a cell-wall anchor motif (CwpF). A library of CalB mutants was constructed by in vivo recombination in H. polymorpha. Several mutants with increased whole-cell CalB activity were acquired from screening seven thousand transformants. The two independent mutants CalB 10 and CalB 14 showed an approximately 5 times greater whole-cell activity than the wild-type. When these mutants were made as a soluble form, CalB 10 showed 6 times greater activity and CalB 14 showed an 11 times greater activity compared with the wild-type. Sequence analyses of mutant CALB genes revealed amino acid substitutions of $Leu^{278}Pro$ in CalB10 and $Leu^{278}Pro/Leu^{219}Gln$ in CalB14. The substituted $Pro^{278}$ in both mutants was located near the proline site of the ${\alpha}$10 helix. This mutation was assumed to induce a conformational change in the ${\alpha}$10 helix and increased the $k_{cat}$ value of mutant CalB approximately 6 times. Site-directed mutagenized CalB, LQ ($Leu^{219}Gln$) was secreted into the culture supernatant at an amount of approximately 3 times more without an increase in the CalB transcript level, compared with the wild-type.

• 한국수산과학회지
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• 제34권3호
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• pp.279-284
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• 2001

군소의 중추신경계로부터 myomodulin A (MMA)과 myomodlin E (MME)의 정제에 대해 보고하고자 한다. 500마리 군소의 중추신경계를 산조건으로 추출한 후 4종류의 HPLC column system에 적용하여 두가지 신경성 펩타이드를 정제하였다. HPLC 분리과정에서 얻어진 모든 분획의 활성을 조사하기 위하여 bioassay system으로 진주담치 (Mytilis edulis)의 ABRM을 이용하였다. 최종 정제된 신경성 펩타이드는 Edman 분해법을 이용한 아미노산 서열 분석기, 질량분석기와 화학합성을 통해 완전한 일차구조를 밝힐 수 있었다. 정제한 MMA와 MME의 일차구조는 각각 Pro-Met-Ser-Met-Leu-Arg-Leu-$NH_2$, (847.41 Da) 과 Gly-Leu-Gln-Met-Leu-Arg-Leu-$NH_2$, (830.50Da) 이었다. 또한 이들 합성 펩타이드는 진주담치의 ABRM에 대해 phasic contration의 조절활성을 나타내었다.

• Tuberculosis and Respiratory Diseases
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• 제60권2호
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• pp.171-179
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• 2006

목 적 : RFP과 RBU 사이의 교차 내성률은 다양하게 보고되고 있으며 rpoB 돌연변이가 이에 관여하는 것으로 알려져 있다. 본 연구에서는 본원에서 동정되어 보관중인 다제내성 결핵균주를 대상으로 하여 두 약물간의 교차 내성률 및 rpoB 돌연변이와의 연관성을 조사함으로써 다제내성 결핵의 치료에 있어 RBU의 효용성에 대하여 알아보고자 하였다. 방 법 : 2004년 한 해 동안 본원 검사실에서 다제내성 결핵균으로 동정되어 보관중인 130균주를 대상으로 하였다. RFP과 RBU의 내성검사는 L-J 배지를 이용한 절대농도법으로 시행하였으며 추가로 다음과 같은 다섯 가지의 농도를 이용하여 RBU의 MICs를 조사하였다; 10, 20, 40, 60, $120{\mu}g/ml$. 내성기준농도는 RFP의 경우 $40{\mu}g/ml$, RBU의 경우 $20{\mu}g/ml$로 하여 내성유무를 판정하였다. rpoB 돌연변이는 LiPA법을 이용한 REBA $MTB-Rifa^{(R)}$검사로 조사하였으며 염기서열분석을 의뢰하여 그 결과를 검증하고 구체적인 개별 돌연변이양상을 알아보았다. 결 과 : RFP은 모두 내성으로 확인되었고 RBU의 $MIC_{50}$은 $80{\mu}g/ml$, $MIC_{90}$은 ${\geq}160{\mu}g/ml$였으며 RFP과 RBU간의 교차내성률은 70.5%였다. REBA $MTB-Rifa^{(R)}$검사 결과 rpoB 돌연변이는 대부분 코돈 524-534 사이에서 발생하였고 검사를 시행한 100균주 가운데 98개의 균주에서 돌연변이가 확인되어 RFP내성을 진단할 수 있는 진단율은 약물감수성검사와 비교하여 98%의 일치율을 보였다. 염기서열분석결과 코돈 531과 513의 돌연변이는 돌연변이의 양상에 관계없이 항상 RBU내성과 관련되어 있었던 반면 코돈 526의 돌연변이는 돌연변이의 양상에 따라 내성 혹은 감성과 관련되어 있었다. 가장 흔한 돌연변이는 Ser531Leu로 전체의 45.5%를 차지하였다. 약물감수성검사에 비추어 His526Gln, His526Leu, Leu533Pro, Gln513Glu, Leu511Pro가 감성 돌연변이로 판단되었다. 결 론 : 두 약제간의 내성률을 고려하여 볼 때 RBU은 일부 다제내성 결핵의 치료에 있어서 효과가 있겠다. 우선 RBU에 대한 전통적인 약물감수성 검사를 도입하여 적절한 내성기준농도를 확립하는 노력이 필요하며 현재까지 rpoB 유전자 검사법은 임상에 적용하기에 한계가 있는 것으로 사료된다.

• 한국자기공명학회논문지
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• 제21권3호
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• pp.78-84
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• 2017

Pseudin is a naturally occurring 24 amino-acid-residue antimicrobial peptide derived from the skin of paradoxical frog Pseud's paradoxa. It shows potency against the bacteria and antibiotic-resistant bacteria strain, but has high cytotoxicity against mammalian cell. In our previous study, substitution of $Pro^{11}$ for Gly (Ps-P) increased bacterial cell selectivity but decreased the antibacterial activity of pseudin. In this study, we designed pseudin analogue, Ps-4K-P with increased cationicity up to +7 in Ps-P by substituting Glu14, Gln10, Gln24, and Leu18 with Lys. Ps-4K-P showed improved potent antibacterial activity with high bacterial cell selectivity. We determined the tertiary structure of Ps-4K-P in the presence of DPC micelles by NMR spectroscopy and it has a hinge structure at $Pro^{11}$ followed by three turn helices from $Pro^{11}$ to $Val^{23}$ at the C-terminus. Amphipathicity with increased cationicity as well as helix-hinge-helix structural motif provided by introduction of a Pro at position $Gly^{11}$ are the crucial factors which confer antibacterial activity with bacterial cell selectivity to Ps-4K-P.

• KSBB Journal
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• 제14권6호
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• pp.724-730
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• 1999

본 연구에서는 인뇨에서 분리 정제한 urokinase와 유전자 재조합 CHO(Chinese Hamster Ovary) 세포 배양액으로부터 분리 정제한 pro-urokinase의 물리화학적 특성과 혈액 내에서의 효소활성을 비교 분석하였다. Two chain form인 urokinase와 single chain form인 pro-urokinase를 각각 순수 분리한 후, electrophoresis한 결과 모두 54 kd의 단일밴드를 나타냈다. 그러나 urokinase는 환원시켰을 때 33 kd과 21 kd으로 나누어짐을 확인하였으나 gel filtration결과 분자량이 54 kd 정도임을 확인되어 용액 내에서 단일분자로 존재함을 알 수 있었다. Urokinase와 pro-urokinase가 물리화학적으로 거의 동일한 구조를 가졌다는 사실은 isoelectro focusing에 의한 pI 값이 모두 8.6으로 동일하다는 점과, 아미노산 조성을 분석한 결과 동일하다는 사실로도 알 수 있었다. N-terminal 아미노산 서열을 분석한 결과, urokinase는 이중사슬구조이므로 N-terminal이 두개 존재하여 pro-urokinase의 서열(Ser-Asn-Glu-Leu-His-Gln-Val-Pro-Ser-Asn)이외에도, 159번째의 Ile다음부터 Ile-Gly-Gly-Glu-Phe-Thr-Thr-Ile-Glu가 같은 peak로 나타남을 확인하였다. 효소활성 조사결과 pro-urokinase와 urokinase는 모두 농도 의존적으로 혈전용해 활성을 보였으나, 특이하게도 짧은 반응시간동안에는 urokinase가 동일 농도 하에서 강한 활성을 보인 반면, 2시간이 지난 오랜 반응조건에서는 pro-urokinase가 혈전용해활성을 나타내었다. Fibrinogen에 대한 분해활성을 조사한 결과, urokinase는 혈장 내 fibrinogen을 상당히 손상시키지만, pro-urokinase는 거의 영향을 주지 않아 혈전선택성이 매우 좋음을 알 수 있었다.

• 생명과학회지
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• 제22권2호
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• pp.220-225
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• 2012

굴 효소 가수분해물은 굴을 alcalase, protamex, neutrase, flavourzyme, pepsin으로 각각 처리하였고, 이들의 ACE 저해활성을 측정하였다. ACE 저해활성은 가수분해 시간에 따라 증가 또는 감소하였으며, 그 중 10시간 이상 가수분해 처리한 PEH에서 가장 높은 ACE 저해활성을 나타내었다. PEH 가수분해물을 한외여과(30, 10 kDa) 하여 낮은 분자량의 분획물을 얻었다. 30 kDa와 10 kDa 이하 분자량 별 ACE 저해활성은 각각 $69.18{\pm}0.75$, $83.71{\pm}1.12$의 활성을 나타내었다. 이 결과 10 kDa 이하의 시료로부터 HPLC column (watchers 120 ODS-AP $250{\times}4.6$ ($5{\mu}m$))을 이용하여 각각의 활성 분획을 분취하여 얻은 6분획의 ACE 저해 활성은 29.56~85.85% 로 나타났다. 그 중 저해활성이 가장 높게 나타나는 B fraction의 아미노산 서열을 확인한 결과 Leu-Gln-Pro 임을 확인하였고, peptide합성하여 얻은 저해활성 농도($IC_{50}$)가 1.18 uM임을 확인하였다. 이러한 결과는 PEH를 이용하여 건강 기능성 식품의 개발에 도움이 될 수 있을 것으로 생각된다.

• Tuberculosis and Respiratory Diseases
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• 제59권3호
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• pp.257-265
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• 2005

연구 배경 : 리팜핀 내성 균주에서 리파부틴 약제의 교차 내성정도와 리팜핀 내성-리파부틴 감수성 결핵균의 rpoB 유전자 돌연변이의 특성을 알아보고자 연구를 실시하였다. 연구 방법 : 감수성검사에서 리팜핀에 내성인 균주를 선정하여 리파부틴 농도 $0-80{\mu}g/ml$ 농도로 재접종하여 감수성 여부를 확인하였다. 리팜핀-내성균주 모두 염기서열 분석을 통하여 리파부틴 감수성과의 관계를 조사하였다. 역교잡 방법으로 리파부틴 감수성균을 구별하였다. 연구 결과 : 우리나라에서 분리된 리팜핀 내성인 201균주 중에서 41균주(20.4%)는 리파부틴에 감수성을 보였다. 리파부틴 감수성을 보이는 rpoB 유전자 돌연변이는 Leu511Pro, Ser512Arg, Gln513Glu, Asp516Ala, Asp516Gly, Asp516Val, Asp516Tyr, Ser522Leu, His526Asn, His526Leu, His526Cys, Arg529Pro, Leu533Pro 등 이었다. 역교잡 방법을 이용하였을 경우 rpoB 돌연변이를 가진 균주 중에서 리파부틴 감수성균의 민감도는 92.5%이었고, 특이도는 96.1%이었다. 결 론 : 리팜핀 내성균이라도 약 20.4% (95% 신뢰구간: 14.8% to 26.0%)가 리파부틴 약제에 감수성이므로, 우리나라의 다제내성 결핵환자의 치료에서도 리파부틴이 중요한 약제로서 역할을 할 수 있음이 밝혀졌다. 향후 다제내성 결핵 환자에서의 리파부틴의 치료 효과에 대한 임상적 연구가 필요하다.

• 한국축산식품학회지
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• 제36권4호
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• pp.487-493
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• 2016

The antimicrobial activity of bovine lactoferrin hydrolysates (bLFH) was measured against Pseudomonas strains (P. syringae and P. fluorescens) in vitro. To compare susceptibility to bLFH, minimal inhibitory concentration (MIC) values were determined using chemiluminescence assays and paper disc plate assays. Antimicrobial effect against P. fluorescens was not observed by either assay, suggesting that bLFH did not exhibit antimicrobial activity against P. fluorescens. However, a significant inhibition of P. syringae growth was observed in the presence of bLFH. The addition of bLFH in liquid or solid medium inhibited growth of P. syringae in a dose-dependent manner. Furthermore, a bLFH peptide with antimicrobial activity toward P. syringae was isolated and identified. The N-terminal amino acid sequences of thus obtained antimicrobial bLFH peptides were analyzed by a protein sequencer and were found to be Leu-Arg-Ile-Pro-Ser-Lys-Val-Asp-Ser-Ala and Phe-Lys-Cys-Arg-Arg-Trp-Gln-Trp-Arg-Met. The latter peptide sequence is known to be characteristic of lactoferricin. Therefore, in the present study, we identified a new antimicrobial peptide against P. syringae, present within the N-terminus and possessing the amino acid sequence of Leu-Arg-Ile-Pro-Ser-Lys-Val-Asp-Ser-Ala.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제22권3호
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• pp.339-342
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• 2012

This study describes the characterization of a new angiotensin I-converting enzyme (ACE) inhibitory peptide from a Korean traditional rice wine. After purification of the ACE inhibitor peptides with ultrafiltration, Sephadex G-25 column chromatography, and successively $C_{18}$ and SCX solid-phase extraction, reverse-phase HPLC, and size exculsion chromatography, two types of the purified ACE inhibitors with $IC_{50}$ values of 0.34 mg/ml and 1.23 mg/ml were finally obtained. The two purified ACE inhibitors (F-1 and F-2) were found to have two kinds of novel oligopeptides, showing very little similarity to other ACE inhibitory peptide sequences. The amino acid sequences of the two purified oligopeptides were found to be Gln-Phe-Tyr-Ala-Val (F-1) and Ala-Gly-Pro-Val-Leu-Leu (F-2), and their molecular masses were estimated to be 468.7 Da (F-1) and 357.7 Da (F-2), respectively. They all showed a clear antihypertensive effect on spontaneously hypertensive rats at a dosage of 500 mg/kg.