• 제목/요약/키워드: Laccaria bicolor

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Characteristics of Microsatellites in the Transcript Sequences of the Laccaria bicolor Genome

  • Li, Shuxian;Zhang, Xinye;Yin, Tongming
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제20권3호
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    • pp.474-479
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    • 2010
  • In this paper, we analyzed the microsatellites in the transcript sequences of the whole Laccaria bicolor genome. Our results revealed that, apart from the triplet repeats, length diversification and richness of the detected microsatellites positively correlated with their repeat motif lengths, which were distinct from the variation trends observed for the transcriptional microsatellites in the genome of higher plants. We also compared the microsatellites detected in the genic regions and in the nongenic regions of the L. bicolor genome. Subsequently, SSR primers were designed for the transcriptional microsatellites in the L. bicolor genome. These SSR primers provide desirable genetic resources to the ectomycorrhizae community, and this study provides deep insight into the characteristics of the micro satellite sequences in the L. bicolor genome.

Heterologous Expression and Characterization of a Laccase from Laccaria bicolor in Pichia pastoris and Arabidopsis thaliana

  • Wang, Bo;Yan, Ying;Xu, Jing;Fu, Xiaoyan;Han, Hongjuan;Gao, Jianjie;Li, Zhenjun;Wang, Lijuan;Tian, Yongsheng;Peng, Rihe;Yao, Quanhong
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제28권12호
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    • pp.2057-2063
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    • 2018
  • Laccases can oxidize a variety of phenolic and non-phenolic substrates including synthetic dyes. In this research, a laccase gene Lcc9 from Laccaria bicolor was chemically synthesized and optimized to heterogeneous expression in Pichia pastoris and Arabidopsis thaliana. The properties of recombinant laccase expressed by P. pastoris were investigated. The laccase activity was optimal at 3.6 pH and $40^{\circ}C$. It exhibited $K_m$ and $V_{max}$ values of $0.565mmol\;l^{-1}$ and $1.51{\mu}mol\;l^{-1}\;min^{-1}$ for ABTS respectively. As compared with untransformed control plants, the laccase activity in crude extracts of transgenic lines exhibited a 5.4 to 12.4-fold increase. Both laccases expressed in transgenic P. pastoris or A. thaliana could decolorize crystal violet. These results indicated that L. bicolor laccase gene may be transgenically exploited in fungi or plants for dye decolorization.

느타리 버섯에서 수한 품종 특이 SCAR marker 개발 (Development of Suhan Strain-specific SCAR Marker in Pleurotus ostreatus)

  • 서경인;장갑열;유영복;박순영;김광호;공원식
    • 한국균학회지
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    • 제39권1호
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    • pp.31-38
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    • 2011
  • 현재 70개 이상의 느타리 품종이 유통되어 재배되고 있다. 본 연구에서는 81개 품종을 수집하여 핵산지문법으로 분석하였다. 이중 수한과 그 유사품종에서 특이하게 나타나는 밴드를 이용하여 수한 품종에 특이적인 SCAR marker로 개발하였다. 수한 품종 특이 band에 대한 clone을 기존에 알려진 유전자 염기서열과 유사성이 있는지를 확인한 결과 POMFBO1 Pleurotus ostreatus cDNA clone MFB02-A05, mRNA sequence와 92%의 homology를 나타냈고, 등록된 아미노산 서열과의 유사성을 확인한 결과 큰졸각버섯인 Laccaria bicolor의 predicted protein과 가장 높은 sequence homology (BlastX score = 73.9, E value = $5e^{-25}$)를 보였다. 본 연구를 통하여 개발된 수한특이 마커는 정확한 품종구분이 요구되는 종균유통 과정에서 수한계통 품종을 구분하는 유용한 마커로 이용될 것으로 기대된다.

한국(韓國) 12개(個) 수종(樹種) 임분내(林分內)의 외생균근(外生菌根) 버섯의 기주선택성(寄主選擇性)과 분석(分布)에 관(關)한 연구(硏究) (Host Specificity and Distribution of Putative Ectomycorrhizal Fungi in Pure Stands of Twelve Tree Species in Korea)

  • 이경준;김양섭
    • 한국균학회지
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    • 제15권1호
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    • pp.48-69
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    • 1987
  • 외생균근(外生菌根)버섯의 기주범위(寄主範圍)와 기주선택성(寄主選擇注)을 구명(究明)하고 주요(主要) 조림수종(造林樹種)의 균근균(菌根菌) 선택성(選擇性)을 상호비교(相互比較)하기 위하여 1981년(年)부터 1986년(年)까지 전국(全國)의 여러 곳에서 12개수종(個樹種)의 순림(純林)(소나무, 리기다소나무, 잣나무, 종비나무, 일본잎갈나무, 젓나무, 현사시, 밤나무, 갈참나무, 상수리나무, 신갈나무, 자작나무)를 대상(對象)으로 균근(菌根)버섯을 채집(採集)하여 분석(分析)을 비교(比較)하였다. 6년(年)동안 총(總) 48리(履) 196종(種) 8 품종(品種)의 균근(菌根) 버섯을 동정(同定)하였으며 그 중 Russla가 31종(種) 1 품종(品種), Amanita가 22종(種) 5 품종(品種), Lactarius가 18종(種) 1 품종(品種)이었다. 기주범위(寄主範圍)가 넓은 종(種)은 Russula, Amanita, Lactarius, Laccaria, Cantharellus 속(屬)에 속(屬)해 있있다. Laccaria Laccata는 12개조사수종중(個調査樹種中)에서 12개수종전분의 임분(林分)에서, Amanita vaginata group은 11개수종(個樹種)에서, Labtarius gerardii와 Russula sororia는 9 개수종(個樹種)에 서, Amanita agglutinata, Cantharellus cibarius, Russula bella, Russula bella, Russula virescens는 8개수종(個樹種)의 침개엽수임분(針開葉樹林分)에서 채집(採集)되어 기주(寄主)의 범위(範圍)가 넓은 버섯으로 분류(分類)되었다. Amanita citrina, Boletus bicolor, Boletus erythropus, Lactarius piperatus, L. subzonarius, Russula pseudodelica는 침개활수(針葉闊樹)의 $4{\sim}5$개수종(個樹種)에서 채집(採集)되어 기주(寄主)의 범위(範圍)가 중간(中間)정도(程度)인 버섯으로 분류(分類)되었으며 특히 Suillus grevillei는 잎갈나무에서서만 채집(採集)되어 기주(寄主)의 범위(範圍)가 가장 좁은 버섯으로 판명(判明)되었다. 12개수종(個樹種)의 임분중(林分中)에서 균근(菌根)버섯의 종류(種類)가 가장 많은 젓나무림(林)으로써 83종(重)의 균근(菌根)버섯을 채집(採集)했으며, 소나무(赤松)림(林)에서 66종(重)을, 리기다소나무림(林)에서 50종(種)을, 잣나무림(林)에서 49종(重)을, 갈참나무림(林)에서 46종(種)을 채집(採集)했다. 일본잎갈나무림(林)에서는 23종(種)의 균근(菌根)버섯을 채집(採集)했는데 다른 임분(林分)과 달리 Amanita, Lactarius, Russula 는 적고 대신 Laccaria 가 많이 관찰(觀察)되었다. 본(本) 실험(實驗)에서 조사(調査)된 12개수종(個樹種)의 대부분(大部分)은 다양(多樣)한 균근(菌根)버섯과 공생(共生)하는 듯하며 균선택성(菌選擇性)이 적은 것으로 사료(思料)된다.

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Cloning and mRNA Expression Analysis of the Gene Encoding Phenylalanine Ammonia-Lyase of the Ectomycorrhizal Fungus Tricholoma matsutake

  • Yoon, Hyeokjun;You, Young-Hyun;Kim, Ye-Eun;Kim, Young Ja;Kong, Won-Sik;Kim, Jong-Guk
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제23권8호
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    • pp.1055-1059
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    • 2013
  • The ectomycorrhizal fungus Tricholoma matsutake grows symbiotically with Pinus densiflora. Phenylalanine ammonia-lyase (E.C. 4.3.1.24) catalyzes the conversion of L-phenylalanine to trans-cinnamic acid. The role of fungal phenylalanine ammonia-lyase, however, has not been clear until now. In this study, the gene encoding phenylalanine ammonia-lyase (PAL), which was isolated from T. matsutake, was cloned and characterized. The PAL gene (tmpal) consists of 2,160 nucleotides, coding for a polypeptide containing 719 amino acid residues. The deduced amino acid sequence of tmpal from T. matsutake shows high identity (70%) with that from Laccaria bicolor. Comparative analysis of the PAL genes among T. matsutake and other species of the class Agaricomycetes showed that both active sites and binding sites were significantly conserved among these genes. The transcriptional analysis of the PAL gene revealed a differential gene expression pattern depending on the developmental stages (mycelium, primordium, stipe, pileus, and gills) of T. matsutake. These results suggest that the PAL gene in T. matsutake plays an important role in multiple physiological functions.