The aim of this study was to screen the polymorphisms and distribution of each genotype of insertion/ deletion (indel) markers which were found in a preliminary comparative study of bovine genomic sequence databases. Comparative bioinformatic analyses were first performed between the nucleotide sequences of Bovine Genome Project and those of expressed sequence tag (EST) database, and a total of fifty-one species of indel markers were screened. Of these, forty-two indel markers were evaluated, and nine informative indel markers were ultimately selected for population analysis. Nucleotide sequences of each marker were re-sequenced and their polymorphic patterns were typed in six cattle breeds: Holstein, Angus, Charolais, Hereford, and two Korean native cattle breeds (Hanwoo and Jeju Black cattle). Cattle breeds tested in this study showed polymorphic patterns in eight indel markers but not in the Indel-15 marker in Charolais and Holstein. The results of analysis for Jeju Black cattle (JBC) population indicated an observed heterozygosity (Ho) that was highest in HW_G1 (0.600) and the lowest in Indel_29 (0.274). The PIC value was the highest in HW_G4 (0.373) and lowest in Indel_6 (0.305). These polymorphic indel markers will be useful in supplying genetic information for parentage tests and traceability and to develop a molecular breeding system for improvement of animal production in cattle breeds as well as in the JBC population.
Lee, Hae-Lee;Park, Jae-Hee;Kim, Yong-Su;Kim, Jong Gug
Journal of Embryo Transfer
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v.30
no.1
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pp.65-71
/
2015
The aim of this study was to determine the relationship between the coat color appearance of Korean brindle cattle and the changes of relevant hormone levels that may affect the hair pigmentation during different stages of growth and maturation. In mature cattle, levels of both ACTH and DHEA in Korean brindle cattle with brown color were significantly higher than those with black color (p<0.05). Levels of ${\alpha}$-MSH in Korean brindle cattle with whole brindle ($${\geq_-}50%$$) color were significantly higher than those with brown color (p<0.05). In calves of Korean brindle cattle at 2 to 6 months, the concentration of estradiol was significantly higher in calves with whole brindle color than those with part brindle color (p<0.05), when the coat color was confirmed. After 6 month of coat color confirmation, levels of testosterone and ACTH increased in calves with part brindle color and were significantly higher than those with whole brindle color (p<0.05). In calves of Korean brindle cattle at 1 or 2 months, there were no significant differences in hormone levels of estradiol, ACTH, DHEA and ${\alpha}$-MSH between the calves with brindle color and brown color, except estradiol before brindle color appearance. Changes of relevant hormone levels at different stage of growth and maturation may affect the pigmentation of coat during the development of cattle. In addition to the current study correlating the different coat colors with relevant hormone levels, investigation of the coat color associated genes expressed in Korean brindle cattle may further clarify the mechanisms of coat color changes during their development.
To characterize the colorization patterns of bovine hairs, the melanin contents were quantitatively assayed and compared among cattle breeds. The total melanin levels measured by spectrophotometric assay (A500) from Jeju Black cattle were significantly lower than those from Holstein or Angus with black coat color but significantly higher than those from Hanwoo with yellow coat color or Angus and Holstein with red coat color (P<0.001). The total melanin levels from Hanwoo were significantly lower than those from Red Angus and Red Holstein but significantly higher than those from Hanwoo×Charolais crossbred (P<0.001). The relative ratios of eumelanin to pheomelanin (A650/A500) were 0.382, 0.359, 0.112 and 0.124 in Angus, Jeju Balck cattle, Red Holstein and Hanwoo, respectively. These results show that the spectrophotometric method provides a convenient way to qualitatively characterize hair melanin and may be useful for studying expression of major coat color genes in Hanwoo and Jeju Black cattle.
Park, S.J.;Takahashi, Y.;Park, S.B.;Baek, K.S.;Ahn, B.S.;Jeon, B.S.;Ryu, I.S.;Kim, H.S.
Journal of Embryo Transfer
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v.22
no.1
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pp.21-26
/
2007
본 연구는 mSOF(modified synthetic oviduct fluid medium) 배양액을 이용하여 $100{\mu}1$와 $10{\mu}1$ 배양 소적에서 일본 흑우의 수정란 생산 효율을 개선하기 위하여 수행하였다. 난구세포가 부착된 미성숙 난자는 각각 단독 배양조건($S;\;10{\mu}1$ 소적) 및 그룹 배양 조건 ($G;\;100{\mu}1$ 소적)에서 실시하였고 배양액은 TCM-199의 기본 배지에 10% FCS, 0.02IU/ml FSH와 $1{\mu}g/ml$$estradiol-17{\beta}$를 첨가하여 사용하였다. 배반포 단계로 발육한 수정란은 1.5M ethylene glycol로 직접 이식법에 의한 동결 방법으로 동결을 실시하였고, 세포수는 융해 후 생존 수정란에 대해 조사하였다. 체외 배양 시간이 $16{\sim}17$시간 배양 조건에서 난자의 성숙율은 그룹 배양 조건$(27.1{\pm}16.8%)$보다는 단독 배양조건$(57.1{\pm}15.0%)$에서 성숙율이 높았다(p<0.05). 그러나 체외 배양 시간이 $18{\sim}19$ 시간과 $20{\sim}21$시간 배양시는 유사한 성숙율을 보였다. 난자의 체외 배양율은 체외 배양 시간의 증가에 의해 성숙도가 $86.3{\pm}9.9%$로 증가하였다. 접합체(zygote)의 분할율은 단독이나 그룹 배양 조건에서도 유사한 결과를 얻었다. 배반포 발달율은 배양 $7{\sim}8$일째에 조사한 결과 단독 배양 방법보다는 그룹 배양 방법에서 발달율이 높았으나, 분할된 접합체를 기준으로 한 경우 배반포 발달율$(S;\; 21.4{\pm}10.6%,\;G;\;39.0{\pm}13.1%)$에서는 유의적인 차이가 없었다. 단독 배양과 그룹 배양에서 $6.5{\pm}8$일 사이에 배반포로 발달된 수정란의 세포수 조사에서는 유사한 결과를 얻었다. 동결 융해 후 24시간 배양 후 배반포 생존율(5; 24.2%, G; 30.2%), 부화율(S: 20.9%, G: 12.7%) 및 생존 수정란수(S; 45.2%, G: 42.8%)에서도 배양 조건에 따른 유의적인 차는 없었다. 결론적으로 mSOF배양액을 이용하는 경우 미성숙 난자의 체외 성숙 유도 배양 시 단독이나 그룹 배양 시 배반포 발달율에서 그룹간에 유의적인 차가 인정되었다(p<0.01).
One-step dilution and direct transfer would be a practical technique for the field application of frozen embryo. This study was to examine whether Jeju Black Cattle (JBC, Korean Cattle) can be successfully cloned from vitrified and one-tep diluted somatic cell nuclear transfer (SCNT) blastocyst after direct transfer. For vitrification, JBC-SCNT blastocysts were serially exposed in glycerol (G) and ethylene glycol (EG) mixtures [10%, (v/v) G for 5 min., 10% G plus 20% EG (v/v) for 5 min., and 25% G plus 25% EG (v/v) for 30 sec.] which is diluted in 10% FBS added D-PBS. And then SCNT blastocysts were loaded in 0.25 ml mini straw, placed in cold nitrogen vapor for 3 min. and then plunged into $LN_2$. One-step dilution in straw was done in $25^{\circ}C$ water for 1 min, by placing vertically in the state of plugged-end up and down for 0.5 min, respectively. When in vitro developmental capacity of vitrified SCNT blastocyst was examined at 48 h after one-step dilution, hatched rate (56.4%) was slightly lower than that of control group (62.5%). In field trial, when the vitrified-thawed SCNT blastocysts were transferred into uterus of synchronized 5 recipients, a cloned female JBC was delivered by natural birth on day 299 and healthy at present. In addition, when the short tandem repeat marker analysis of the cloned JBC was evaluated, microsatellite loci of 11 numbers was perfectly matched genotype with donor cell (BK94-14). This study suggested that our developed vitrification and one-step dilution technique can be applied effectively on field trial for cloned animal production, which is even no longer in existence.
The hemal nodes of the Korean native cattle were studied by gross anatomy and light microscopy. Hemal nodes were spherical or ovoid in shape, and red or black in colors. A hemal node consisted of a thick capsule and a hilum, and had extensive subcapsular and deep sinuses distended by a great number of erythrocytes. Although a few lymphatic nodules and tissues were seen in the parenchyma, no typical cortex and medulla was defined. Blood vessels occurred, but lymph vessel was not observed in nodes. The stroma of the hemal node was composed of reticular cells and fibers. The parenchyma consisted of many erythrocytes and lymphocytes, and a few macrophages and megakaryocytes. The capsule and trabecula was a collagenous connective tissue with smooth muscle cells. B-lymphocytes were principally located in the lymphatic nodules of the hemal node. T-lymphocytes were scattered in the diffuse lymphatic tissues of the hemal node.
PCR-RFLP analysis was carried out to investigate the genotype of Melanocortin receptor 1 (MC1R) gene in Korean Brindle Cattle and Korean Cattle with dark muzzle, which are coat color and muzzle pigmentation variants of Korean Cattle, respectively. Allelic variants of MC1R in cattle were analyzed by digestion with BsrFⅠ, AciⅠ. Among six genotypes, $E^D/E^D,\;E^D/E^+,\;E^D/e,\;E^+/E^+,\;E^+$/e and e/e, detected in cattle, only two genotypes, $E^+/E^+\;and\;E^+$/e, were observed in Korean Brindle Cattle, probably reflecting the necessary of $E^+$ allele for the expression of black brindle coat color. As in Korean Cattle with light muzzle, the $E^+$/e and e/e genotypes were detected in Korean Cattle with dark muzzle. The $E^+$ and e alleles frequencies in two populations of Korean Cattle with dark muzzle and with light muzzle were 0.37, 0.63 and 0,11, 0.89, respectively. Although the frequency of $E^+$ allele in Korean Cattle with dark muzzle was higher than in Korean Cattle with light muzzle, the $E^+$ allele was not completely associated with dark muzzle pigmentation. The results of this experiment indicate that the difference of MC1R genotype and frequency may be useful for fixation of coat color in Korean Cattle as well as Korean Brindle Cattle.
To understand the relationship between coat color inheritance patterns and genotypes of Extension (E) and Agouti (A) loci in cattle, the genotypes for melanocortin-1 receptor (MC1R) and agouti signaling protein (ASIP) were analyzed in Hanwoo, Jeju black cattle (JBC), and their crossbred progeny. Three MC1R alleles ($E^D$, $E^+$, and e) were found in the black-colored JBC population. JBC had no recessive homozygotes (e/e), but this genotype was predominant in the Hanwoo breed. However, MC1R $E^+$/e Hanwoo did not produce a black coat color as they appeared either as brown or solid red. For ASIP, three genotypes (A/A, A/$A^{Br}$, and $A^{Br}/A^{Br}$) were determined by insertion/deletion of an L1-BT element in Hanwoo. The ASIP $A^{Br}$ allele was rarely observed, and no ASIP $A^{Br}/A^{Br}$ homozygotes were detected in the JBC population. Cattle carrying ASIP $A^{Br}$ did not show any agouti-like brindle pigmentation patterns in either breed or their progeny. The coat colors of the crossbred progeny were discriminated by two colors, yellowish-brown versus dark-brown or black, and their coat colors were directly related to the genotypes of the Extension locus, yellowish-brown (e/e) and dark-brown or black ($E^+$/e), but not to the Agouti locus. ASIP genotypes probably did not affect coat color development in the Hanwoo or crossbred progeny. Our results suggest that the ASIP genotypes do not play key roles in coat color variation, but the MC1R genotypes do direct the phenotypes of Hanwoo, JBC, and their progeny.
Q fever is a worldwide zoonotic disease caused by Coxiella burnetii. Domestic ruminants are considered to be major source of human infection. The aim of this survey was to investigate seroprevalence of C. burnetii in ruminants in Gwangju area. A total of 1,000 samples (serum and lactoserum) were collected from 987 Korean native cattle, 5 Korean native goats, 2 beef cattle, 6 bulk-tank milk from each dairy farm in Gwangju area from January to October 2020 and analyzed by ELISA. The seroprevalence of C. burnetii in bulk-tank milk from each dairy farms was 50.0%. Korean black goat and beef cattle had negative antibody test results for C. burnetii. The seroprevalence of C. burnetii in Korean native cattle in Gwangju area was 7.1% and was higher in female (7.8%) than in male (3.4%) (P=0.024). The seroprevalence of C. burnetii in Korean native cattle appeared to increase with age (3.8% in 1 year-old, 7.1% in 3 year-old, and 10.7% in more than 5 year-old) (P<0.001). The seroprevalence of C. burnetii of Korean native cattle increased in spring and May was the highest in particular (P<0.001). As the distribution and density of tick-habitat are expected to increase due to climate crisis, this survey highlights the need for monitoring C. burnetii in domestic ruminants, including surveillance of C. burnetii infection in people working for livestock industry.
Natural-killer-cell-enhancing factor (NKEF) belongs to the newly defined peroxiredoxin (Prx) family. It was originally isolated from human erythroid cells. The black rockfish NKEF cDNA was identified through the expressed sequence tag (EST) analysis of PBLs libraries. The full-length NKEF cDNA was 1433 bp long and contained an open reading frame (ORF) of 594 bp that encoded 198 amino-acid residues. The 5' UTR had a length of 39 bp, and the 3’UTR 800 bp. The deduced amino-acid sequence of the black rockfish had a density 93.4, 92.9, 87.8, 85.8, 84.8, 83.8, 80.3, 79.7, 77.2, and 75.2% that of the pufferfish, olive flounder, channel catfish, zebrafish, chicken, common carp, Myotis lucifugus, cattle, human PrxI, rat PrxI, human NKEF-A, and Xenopus tropicalis, respectively. The NKEF gene was expressed in all the tissues of the black rockfish. The RT-PCR indicated that the NKEF transcripts were predominantly in the spleen and gill, less dominantly in the PBLs, head kidney, trunk kidney, and liver, and least in the intestine and muscles. This is the first report on the existence of the NKEF-A gene in black rockfish.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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