• Pediatric Infection and Vaccine
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• 제30권3호
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• pp.180-187
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• 2023

2023년 9월까지 19세이하소아청소년인구의 90% 이상에서코로나바이러스감염증-19 (coronavirus disease 2019, COVID-19) 감염력이 있으며, 그중 40-60%에서 두통, 경련발작, 뇌염 등의 신경학적 증상이 보고되고 있다. 본 증례에서 저자들은 severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 감염 후 경련과 의식 변화로 내원, COVID-19 뇌염으로 진단하여 정맥내 면역글로불린, 고용량 스테로이드, 항바이러스제, 항경련제 투여 등의 적극적인 치료로 회복된 3세 여자 환자를 보고하고자 한다. 환자는 입원 39일차 말하기와 혼자 걷기가 가능한 상태로 퇴원하였고 발병 1년이 지난 시점, 경한 언어 지연을 보이나 전반적으로 좋은 예후를 보이고 있다. COVID-19 뇌염 환자에서 조기 발견과 적극적인 치료가 긍정적인 예후와 연관됨을 본 증례를 통하여 보고하는 바이다.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제28권11호
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• pp.1928-1936
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• 2018

Recently, human infections caused by severe fever with thrombocytopenia syndrome virus (SFTSV), which can lead to fatality, have dramatically increased in East Asia. With the unavailability of vaccines or antiviral drugs to prevent and/or treat SFTSV infection, early rapid diagnosis is critical for prevention and control of the disease. Here, we report the development of a simple, rapid and sensitive portable detection method for SFTSV infection applying reverse transcription-loop mediated isothermal amplification (RT-LAMP) combined with one-pot colorimetric visualization and electro-free reaction platform. This method utilizes a pocket warmer to facilitate diagnosis in a resource-limited setting. Specific primers were designed to target the highly-conserved region of L gene of SFTSV. The detection limit of the RT-LAMP assay was approximately $10^0$ viral genome copies from three different SFTSV strains. This assay exhibited comparable sensitivity to qRT-PCR and 10-fold more sensitivity than conventional RT-PCR, with a rapid detection time of 30 to 60 minutes. The RT-LAMP assay using SFTSV clinical specimens has demonstrated a similar detection rate to qRT-PCR and a higher detection rate compared to conventional RT-PCR. Moreover, there was no observed cross-reactive amplification of other human infectious viruses including Japanese Encephalitis Virus (JEV), Dengue, Enterovirus, Zika, Influenza and Middle East Respiratory Syndrome Coronavirus (MERS-CoV). This highly sensitive, electro- and equipment-free rapid colorimetric visualization method is feasible for resource-limited SFTSV field diagnosis.

• Parasites, Hosts and Diseases
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• 제51권3호
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• pp.269-277
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• 2013

Amoebic keratitis (AK) caused by Acanthamoeba is one of the most serious corneal infections. AK is frequently misdiagnosed initially as viral, bacterial, or fungal keratitis, thus ensuring treatment delays. Accordingly, the early detection of Acanthamoeba would contribute significantly to disease management and selection of an appropriate anti-amoebic therapy. Recently, the loop-mediated isothermal amplification (LAMP) method has been applied to the clinical diagnosis of a range of infectious diseases. Here, we describe a rapid and efficient LAMP-based method targeting Acanthamoeba 18S rDNA gene for the detection of Acanthamoeba using clinical ocular specimens in the diagnosis of AK. Acanthamoeba LAMP assays detected 11 different strains including all AK-associated species. The copy number detection limit for a positive signal was 10 DNA copies of 18S rDNA per reaction. No cross-reactivity with the DNA of fungi or other protozoa was observed. The sensitivity of LAMP assay was higher than those of Nelson primer PCR and JDP primer PCR. In the present study, LAMP assay based on directly heat-treated samples was found to be as efficient at detecting Acanthamoeba as DNA extracted using a commercial kit, whereas PCR was only effective when commercial kit-extracted DNA was used. This study showed that the devised Acanthamoeba LAMP assay could be used to diagnose AK in a simple, sensitive, and specific manner.

• 한국어병학회지
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• 제23권1호
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• pp.85-98
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• 2010

농림수산식품부와 국립수산과학원에서는 2009년도 방류 품종 (해면 품종 22종과 내수면 품종 11품종)을 대상으로 수산동물전염병의 감염 여부를 검사하였다. 총 12개 지방자치단체에 서 방류를 실시한 것으로 나타났으며, 이 중에서 경상남도, 전라남도, 제주도 및 충청남도는 해면 품종을 주로 방류하였으며, 경기도, 전라북도 및 충청북도는 내수면 품종을 많이 방류하는 것으로 나타났다. 검사품종중에서 해산품종으로는 전복이 24.5%로 가장 많았으며, 그 다음 해삼(15.2%), 넙치 (11.5%), 감성돔과 조피볼락(6.8%), 꽃게 (5.6%), 돌돔 (5.1%), 볼락 (4.6%), 붉은쏨뱅이 (4.5%)로 나타났다. 내수면 품종 중에서는 붕어가 19.4%로 가장 많았으며, 그 다음으로 뱀장어 (17.0%), 동자개 (12.3%), 다슬기 (12.0%), 메기 (8.4)의 순으로 검사 실적이 많았다. 총 33종의 품종을 대상으로 1,080회의 검사가 의뢰되었으며, 검사항목별로 2,066건의 검사를 실시한 결과 19건에서 red sea bream iridovirus (RSIV), koi herpesvirus (KHV) 또는 white spot syndrome virus (WSSV)와 같은 병원체가 검출되어 불합격 처리되었다.

• Pediatric Infection and Vaccine
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• 제20권2호
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• pp.81-88
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• 2013

목 적 : 본 연구는 최근 5년간 엔테로바이러스의 분자유전학적 역학 및 임상 양상을 조사하고자 하였다. 방 법 : 2006년부터 2010년까지 한전병원에서 엔테로바이러스 감염이 의심되는 소아 환자의 검체를 질병관리본부로 의뢰하였고, 감염이 확진된 환자를 후향적으로 분석하였다. 결 과 : 277명 환자에서 386개의 검체가 분석되었고 그 중 적어도 한 개 이상의 검체에서 양성을 소견을 보인 환자는 총 98명(35.4%) 이었다. 98명의 환자로부터 100개의 엔테로바이러스가 확인되었고, echovirus 30형 28건(28%), enterovirus 71형 12건(12%), echovirus 25형 10건(10%), echovirus 9형 9건(9%), coxsackievirus A6형 8건(8%) 순이었다. 연도별 분포는 2006년과 2008년에 각각 echovirus 25형 및 echovirus 30형에 의한 무균성 뇌수막염이 각각 61.5% 및 69.2%로 대부분을 차지하였다. Enterovirus 71형에 의한 합병증을 동반한 환자는 없었다. 결 론 : 단일기관에서 최근 5년간 분리된 엔테로바이러스 감염 양상을 확인하였고 우리나라 소아에서의 최근 역학을 파악하는 데 도움이 될 것으로 사료된다.

• 미생물학회지
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• 제47권2호
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• pp.117-123
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• 2011

본 연구는 human rotavirus (HRV)의 검출법을 최적화하기 위해 real-time RT-PCR과 세포 배양법을 이용하여 여러 가지 탈리 농축법을 비교 및 평가하는 것을 목적으로 하였다. 채소류 중 배추, 상추, 깻잎을 선정하여 바이러스 희석액을 접종하고 탈리액 비교를 위하여 buffer A (100 mM Tris-HCl, 50 mM glycine, 3% beef extract, pH 9.5)와 buffer B (250 mM Threonine, 300 mM NaCl, pH 9.5)를 이용하여 탈리하였고, 농축방법을 비교하기 위하여 PEG (polyethylene glycol) 침전법 또는 filtration [Nanoceram filter$^{(R)}$ (Argonide corporation)]을 이용하여 농축하였다. 또한 바이러스의 감염성 평가를 위하여 MA-104 cell을 배양하여 탈리, 농축 방법을 거쳐 회수된 HRV를 접종하고 1, 48, 72, 96, 120, 144, 168시간 후 세포를 수거하여 real-time RT-PCR을 시행하고 세포병변을 관찰하였다. 탈리 용액은 buffer A가 회수율 29.54%로 buffer B의 18.32%보다 더 뛰어난 탈리효과를 보였으며 농축방법을 비교했을 때 filtration 방법이 회수율 51.89%를 나타내며 PEG 침전법에 비해서 바이러스의 농축에 효과적이었으며 검출 소요시간이나 간단한 과정 면에서 효율적이었다. ICC/real-time RT-PCR을 시행하였을 때 세포병변 72시간 후부터 나타나기 시작했지만 Ct value는 48시간부터 감소하기 시작하여 더 빠른 시간 내에 감염성을 평가할 수 있었다. 따라서, filtration과 integrated/cell culture real-time RT-PCR을 이용하면 기존의 검출방법보다 빠른 시간 내에 바이러스 검출이 가능할 것으로 여겨진다.

• Pediatric Infection and Vaccine
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• 제25권2호
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• pp.61-71
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• 2018

목적: 소아의 급성 위장관염의 세균성 원인 중 살모넬라균, 이질균, 대장균 등은 임상양상과 합병증에 대해 많이 알려져 있는 반면, 황색포도알균의 임상양상에 대한 연구는 드물다. 본 연구는 소아의 분변에서 발견된 황색포도알균의 빈도와 임상적 연관성을 밝히고자 하였다. 방법: 2012년 1월부터 2015년 12월까지 일개 이차병원에서 급성 위장관염 증상으로 입원한 18세 이하 소아 환자의 분변 검체를 서울시보건환경연구원에 보내어 원인 세균 및 바이러스를 검사하였다. 임상양상에 대해 후향적으로 의무기록지를 검토하였다. 결과: 총 663명에서 세균 검출률은 26.2% (174명), 바이러스 검출률은 29.7% (197명), 아무것도 검출되지 않은 미검출군은 43.1% (286명)으로 나타났다. 황색포도알균 양성이면서 장독소가 확인된 사례는 총 102례(15.4%)였고, 그 중 단일 원인체로 황색포도알균이 확인된 경우는 53례(8.0%)로 단일원인체로는 세 번째로 높은 비율을 차지했다. 황색포도알균 단독 검출군의 연령에 따른 검출률은 0-2세에서 45.3% 로 가장 높았고, 주로 여름철에 발생하였다. 증상은 설사(71.7%), 구토(67.9%), 발열(49.1%), 복통(37.7%) 순으로 발생하였고, 미검출군 286명의 증상과 비교하여 유의한 차이를 보인 것은 구토 증상이 유일하였다(P=0.001). 장독소 중 표준형 장독소 (SEA, SEB, SEC, SED, and SEE)와 SEH에 의한 경우 구토 발생률이 더 높았다(P=0.027). 결론: 황색포도알균은 급성 위장관염 소아에게서 흔히 분리되는 균주였다. 본 연구를 통해 소아의 분변에서 발견된 황색포도알균 위장관염의 특징적인 임상 증상 및 호발연령과 계절적 분포, 장독소와의 연관성을 확인할 수 있었다.

• 대한수의학회지
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• 제38권4호
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• pp.793-802
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• 1998

Salmonellosis caused by a number of serotypes of Salmonella is an infectious, acute or chronic, zoonotic disease and characterized by enteritis and diarrhea, septicemia in animal. In these studies we investigated the prevalent serotypes of Salmonella causing animal salmonellosis in Korea and the 71 strains of Salmonella spp. were isolated from materials such as mesenteric lymph nodes, fecal samples from slaughtered animal. With the identification test results, the most prevalent serotypes were, in order, S stanley 31 strains (43.7%), S typhimurium 19 strains (26.8%) and S montevideo 11 strains (15.5%), respectively. And we could establish the method for detection of antibodies to broad variety of Salmonella serotypes. Lipopolysaccharide(LPS) antigen extracted from Salmonella was more sensitive and specific than outer membrane protein antigen from that for detection of Salmonella antibody by using an indirect ELISA. The optimal concentration of antigen was 100ng/ml of LPS, the dilutions of conjugate and serum were 1 : 1,000~2,000 and 1 : 200~400, respectively. The mix LPS-ELISA which was used by mixing LPS from S typhimurium (group B), S choleraesuis (group C) and S enteritidis (group D) were more rapid and effective than that used LPS from individual strain for detection of Salmonella serogroup O4, O7 and O9 antibody at the same time. We could obtain the high values of optical density ($0.73{\pm}0.32$) by mix LPS-ELISA on the farm which had occurred salmonellosis, but very low values of $0.17{\pm}0.06$ on the negative farm of salmonellosis. So, the mix LPS-ELISA may be used to monitor the serological surveillance for the presence of infection with a number of serotypes of Salmonella and would be useful for prevention and control of salmonellosis in animal.

• 대한환경공학회지
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• 제29권8호
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• pp.904-908
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• 2007

병원성 원생동물인 지아디아 람블리아는 수인성 질병을 야기하는 주요 원인이 되고 있다. 본 연구는 PCR 및 RT-PCR 기법을 적용하여 한강본류 하천수 시료에서 사람감염성 종인 지아디아 람블리아를 동정하고, 활성 여부를 판별하여 현 표준시험방법을 보완하고자 하였다. PCR과 RT-PCR에는 지아디아의 복부 흡반 구성 유전자를 증폭하는 giardin primer를 사용하였으며, DNA/RNA 추출 및 PCR/RT-PCR 과정에서의 민감도 검사를 수행한 결과, 1포낭까지 검출가능한 것으로 나타났다. 또한 한강본류 및 유입지천 시료 48점에 적용하여 면역형광항체법과 PCR 및 RT-PCR 방법을 비교하였다. 면역형광항체법을 이용한 현미경관찰 결과 48개 시료의 지아디아 총포낭수의 평균 농도는 6.3 cysts/10 L이었고 양성율은 62.5%였으며, 속빈 포낭을 제외한 지아디아의 평균 농도는 4.5 cysts/10 L이었고 양성율은 52.1%였다. PCR 수행결과 48개 시료 중 24개(50%)의 시료에서 지아디아 람볼리아가 검출되었으며, RT-PCR 수행결과 10개(21%) 시료가 살아있는 G. lamblia를 포함한 것으로 나타났다. 본 연구를 통해 PCR/RT-PCR 기법이 지아디아 포낭을 저농도로 포함하고 있는 하천수 시료에 적용가능하며 원생동물 표준시험방법을 보완하여 종(species) 및 활성에 대한 정보를 제공할 수 있을 것으로 결과되었다.

• Parasites, Hosts and Diseases
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• 제52권3호
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• pp.305-310
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• 2014

Ascidian soft tunic syndrome (AsSTS) caused by Azumiobodo hoyamushi (A. hoyamushi) is a serious aquaculture problem that results in mass mortality of ascidians. Accordingly, the early and accurate detection of A. hoyamushi would contribute substantially to disease management and prevention of transmission. Recently, the loop-mediated isothermal amplification (LAMP) method was adopted for clinical diagnosis of a range of infectious diseases. Here, the authors describe a rapid and efficient LAMP-based method targeting the 18S rDNA gene for detection of A. hoyamushi using ascidian DNA for the diagnosis of AsSTS. A. hoyamushi LAMP assay amplified the DNA of 0.01 parasites per reaction and detected A. hoyamushi in 10 ng of ascidian DNA. To validate A. hoyamushi 18S rDNA LAMP assays, AsSTS-suspected and non-diseased ascidians were examined by microscopy, PCR, and by using the LAMP assay. When PCR was used as a gold standard, the LAMP assay showed good agreement in terms of sensitivity, positive predictive value (PPV), and negative predictive value (NPV). In the present study, a LAMP assay based on directly heat-treated samples was found to be as efficient as DNA extraction using a commercial kit for detecting A. hoyamushi. Taken together, this study shows the devised A. hoyamushi LAMP assay could be used to diagnose AsSTS in a straightforward, sensitive, and specific manner, that it could be used for forecasting, surveillance, and quarantine of AsSTS.