Detection of Giardia lamblia in River Water Samples Using PCR and RT-PCR

PCR 및 RT-PCR을 이용한 하천수 중 Giardia lamblia 검출

  • Cho, Eun-Ju (Waterworks Research Institute, Seoul Metropolitan Government) ;
  • Lee, Mok-Young (Waterworks Research Institute, Seoul Metropolitan Government) ;
  • Byun, Seung-Heun (Waterworks Research Institute, Seoul Metropolitan Government) ;
  • Han, Sun-Hee (Waterworks Research Institute, Seoul Metropolitan Government) ;
  • Ahn, Seoung-Koo (Department of Environmental Engineering University of Seoul)
  • 조은주 (서울특별시 상수도연구원) ;
  • 이목영 (서울특별시 상수도연구원) ;
  • 변승헌 (서울특별시 상수도연구원) ;
  • 한선희 (서울특별시 상수도연구원) ;
  • 안승구 (서울시립대학교 환경공학부)
  • Published : 2007.08.31

Abstract

The protozoan pathogen Giardia lamblia has been major cause of waterborne enteric disease. In this study, we tried to identify G. lamlbia of human infectious species and to detect viable C. lamblia in river water samples including three sites of Han River mainstream and an its creek using PCR and RT-PCR technique. The PCR/RT-PCR methods were performed by using giardin primer based on the giardin gene targeting ventral disk of Giardia. Sensitivity testing in the DNA/RNA extraction and PCR/RT-PCR amplification steps showed that it was possible to detect a single cyst of G. lamblia and viable G. lamblia. The PCR/RT-PCR methods were compared with immunofluorescence(IF) assay by analyzing 48 samples collected from the mainstream water and the creek water. The mean concentration of the total cysts were 6.3 cysts/10 L(arithmetic mean, n = 48) and the positive detection rate were 62.5%(30/48). And the mean concentration of the cysts excluding empty cysts were 4.5 cysts/10 L and the positive detection rate were 52.1%(25/48). It resulted that 24 of 48 samples included Giardia lamblia by PCR assay and 10 of 48 samples included viable G. lamblia by RT-PCR assay. It resulted that the PCR/RT-PCR technique would be available to river water samples with low concentration of Giardia cysts. And it could support the Korean protozoan standard method, which provides useful information for species and viability.

병원성 원생동물인 지아디아 람블리아는 수인성 질병을 야기하는 주요 원인이 되고 있다. 본 연구는 PCR 및 RT-PCR 기법을 적용하여 한강본류 하천수 시료에서 사람감염성 종인 지아디아 람블리아를 동정하고, 활성 여부를 판별하여 현 표준시험방법을 보완하고자 하였다. PCR과 RT-PCR에는 지아디아의 복부 흡반 구성 유전자를 증폭하는 giardin primer를 사용하였으며, DNA/RNA 추출 및 PCR/RT-PCR 과정에서의 민감도 검사를 수행한 결과, 1포낭까지 검출가능한 것으로 나타났다. 또한 한강본류 및 유입지천 시료 48점에 적용하여 면역형광항체법과 PCR 및 RT-PCR 방법을 비교하였다. 면역형광항체법을 이용한 현미경관찰 결과 48개 시료의 지아디아 총포낭수의 평균 농도는 6.3 cysts/10 L이었고 양성율은 62.5%였으며, 속빈 포낭을 제외한 지아디아의 평균 농도는 4.5 cysts/10 L이었고 양성율은 52.1%였다. PCR 수행결과 48개 시료 중 24개(50%)의 시료에서 지아디아 람볼리아가 검출되었으며, RT-PCR 수행결과 10개(21%) 시료가 살아있는 G. lamblia를 포함한 것으로 나타났다. 본 연구를 통해 PCR/RT-PCR 기법이 지아디아 포낭을 저농도로 포함하고 있는 하천수 시료에 적용가능하며 원생동물 표준시험방법을 보완하여 종(species) 및 활성에 대한 정보를 제공할 수 있을 것으로 결과되었다.

Keywords

References

  1. WHO Home page, http://www.who.int/water_sanitation_health/dwq/gdwq0506_11.pdf(2006)
  2. Morteza Abbaszadegan, Mary S. Huber, Dharles P. Gerba, Ian L. Pepper, 'Detection of Viable Giardia Cysts by Amplification of Heat Shock-Induced mRNA,' Appl. Environ. Microbiol., 63, 324-328(1997)
  3. Meena H. Mahbubani, Bej, A, K, Perlin M, Schaefer III F. W., Jakubowski W. Atlas R. M, 'Detection of Giardia Cysts by Using the Polymerase Chain Reaction and Distinguishing Live from Dead Cysts,' Appl. Environ. Microbiol., 57, 3456-3461(1991)
  4. Paul A Rochelle, Ricardo de Leon, MIC H. Stewart, Roy L. Wolfe, 'Comparison of Primers and Optimization of PCR Conditions for Detection of Cryptosporidium parvum and Giardia lamblia in Water,' Appl. Environ. Microbiol., 63, 106-114(1997)
  5. Maux, M., Bertrand, I., Gantzer, C., and Schwartzbrod, J., 'Estimating Giardia cyst viability using RT-PCR,' Water Science and Technology : Water Supply, 2(3), 107-115(2002)
  6. Cynthial. Mayer and Carol J. PalMer, Evaluation of PCR, 'Nested PCR and Fluorescent Antibodies for Detection of Giardia and Cryptosroporidium species in Wastewater,' Appl. Environ. Microbiol., 62, 2081-2085(1996)