• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제16권6호
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• pp.901-910
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• 2006

Poly(3-hydroxybutyrate) [P(3HB)] is a microbial polyester intracellularly accumulated as distinct granules in numerous microorganisms as an energy and carbon storage material. Recombinant Escherichia coli harboring the heterologous P(3HB) biosynthesis genes accumulates large amounts of P(3HB) granules, yet the granule-associated proteins have not been identified. Therefore, this study reports on an analysis of the P(3HB) granule-associated proteome in recombinant E. coli. Fiye proteins out of 7 spots identified were found to be involved in functions of translation, heat-stress responses, and P(3HB) biosynthesis. Two of the major granule-associated proteins, IbpA/B, which are already known to bind to recombinant proteins forming inclusion bodies in E. coli, were further analyzed. Immunoblotting and immunoelectron microscopic studies with IbpA/B antibodies clearly demonstrated the binding and localization of IbpA/B to P(3HB) granules. IbpA/B seemed to play an important role in recombinant E. coli producing P(3HB) by stabilizing the interface between the hydrophobic P(3HB) granules and the hydrophilic cytoplasm. Thus, IbpA/B were found to act like phasins in recombinant E. coli, as they are the major proteins bound to the P(3HB) granules, affect the morphology of the granules, and reduce the amount of cytosolic proteins bound to the P(3HB) granules.

• 한국정보처리학회논문지
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• 제6권6호
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• pp.1581-1589
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• 1999

광대역 종합 정보 통신망에서 주문형 비디오 시스템과 같은 분산 형태의 서비스에 대한 요구가 증대될 것으로 기대되기 때문에 멀티캐스트 기능의 효과적인 구현이 매우 중요하다. 본 논문에서는 완전 결합형 ATM 스위치의 멀티캐스트 성능 특성에 대하여 연구를 수행하였다. 연구 대상 교호나기 구조는 소규모 스위치 요소에 적절한 구조로서 주소 기법으로 비트 주소 방법을 사용하기 때문에 별도의 기능 블록의 추가 없이 멀티캐스트 기능을 구현하기가 용이하다. ATM망에서 트래픽의 버스티니스 특성을 반영하기 위하여 입력 트래픽 모델로 IBP(Interrupted Bernoulli Process)를 사용하였다. 스위치의 멀티캐스트 운영 측면에서의 모의실험 결과를 제시하고 분석하였다. 본 연구를 통하여, 멀티캐스트로 인하여 발생하는 과부하 시점을 찾아 트래픽 제어 기법을 적절히 사용하면 망의 폭주 방지가 가능한 것으로 분석되었다.

• 한국통신학회논문지
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• 제19권6호
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• pp.1085-1094
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• 1994

본 논문에서는 망 노드에서의 폭주를 B-ISDN UNI에서 예방하기 위해 B-NT에서 일시적인 셀 저장 및 선택적 셀 폐기를 수행하는 트래픽 흐름 제어를 제안하였다. 제안된 구조는 B-NT 시스템에서 T 접속을 향하는 출력 셀 흐름을 감소 또는 억제시키도록 구성하고, 인접 망 노드의 상태를 정상, 준폭주, 폭주의 세상태로 정의하였다. 준폭주 상태에서는 손실에 민감한 트래픽은 일시적으로 저장되어 출력 셀 흐름의 속도를 저하시키고, 폭주 상태에서는 손실에 민감한 트래픽의 셀 저장과 더불어 지연에 민감한 트래픽의 셀이 선택적으로 폐기되어 최대한 출력 트래픽 흐름을 억제시킨다. 입력 셀 흐름과 망 노드 상태의 변화를 IBP와 3 상태 마르코프 체인으로 모델링하여 B-NT 시스템에서 제안된 구조의 성능 분석을 위한 시뮬레이션을 수행하여 적당한 버퍼 사이즈를 구하고 망 노드의 상태에 따른 제안한 구조의 성능 변화를 조사한 결과 망 노드에서의 폭주 정도가 극심한 경우에는 제안한 방법으로 제어가 거의 불가능하지만, 그 외의 경우에는 2,000셀 이상의 버퍼 사이즈로 제어가 가능함을 알 수 있었다.

• Journal of Plant Biotechnology
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• 제39권1호
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• pp.33-48
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• 2012

작물의 구조와 기능을 이해하려는 과학적 탐구심과 이를 작물 육종에 적용하려는 실험적 노력의 일환으로 다양한 작물에서 유전자 지도가 개발되었다. 특히, 배추과 작물의 경우 모델식물인 애기장대의 유전체 정보가 공개된 이후 다양한 정보 (염기서열 정보, 유전자 구조 및 기능정보 등)의 이용이 가능해져 유전자 지도 작성이 가속화 되었으며 이는 최근 $B.$ $rapa$ A genome (배추)유전체 해독이라는 결과를 가져왔다. 배추과 작물의 유전자 지도 작성에 있어서 초기에는 RFLP 마커들이 사용되었으나 이후 분자마커, 즉, RAPD, AFLP, SSR 등과 같이 비교적 사용이 간단하고 시간적 제약이 없는 PCR 마커의 형태로 점차 바뀌었다. 배추과 작물의 경제적, 학문적 가치가 고려되어 $B.$ $rapa$ (배추)를 표준재료로 A genome 유전체 염기서열 해독이라는 목표로 다국적 유전체 프로젝트가 결성되었고 2011년 국내연구진이 주도적으로 참여한 국제 컨소시엄 (BrGSPC, $B.$ $rapa$ Genome Sequencing Project Consortium)에 의해 배추 (10개 염색체)의 유전자 영역(gene space), 약 98% (83.8 Mb)의 염기서열이 해독되어 발표되었다. 유전체 해독 과정에서 축적된 염기서열 정보는 대량의 SSR, SNP, IBP 마커의 개발을 가능하게 하였고 이들 마커는 $B.$ $rapa$ A genome 유전자 지도와 물리 지도 작성에 이용되어 이후 배추과 작물연구 전반에 널리 적용되고 있다. 대량의 분자마커 개발은 유전자 지도 작성을 가속화하여 더욱 정밀한 유전자 지도를 가능하게 하였고 공통의 분자마커 정보는 애기장대와 배추과 작물 간 비교유전체 연구를 통해 농업적 우수 형질의 클로닝, 마커도움선발 (MAS)등의 방법으로 분자육종의 기반을 제공하고 있다. 뿐만 아니라. 최근 등장한 NGS 유전체 해독 기술로 생산된 대량의 정보는 분자육종 실현 가능성을 높여 분자육종 실용화에 박차를 가하는 계기가 되고 있다. 본 논문에서는 $B.$ $rapa$에서 분자마커를 이용한 유전자 지도 개발의 과정과 농업적 유용형질 탐색을 위한 양적 형질 유전자좌 (QTLs)의 연구 현황에 대하여 알아보고 유전체연구에서 유전자 지도의 중요성과 육종에의 응용에 대하여 서술하였다. 또한 다양한 유전체 정보와 오믹스 정보를 국내 배추과 분자육종에 효율적으로 활용하여 분자육종 실용화를 가능하게 하기 위해 사용자가 쉽게 사용할 수 있는 데이터베이스를 구축함으로서 연구자와 육종가 간의 간격을 좁히고 원활한 정보교환의 필요성을 제기하였다.