• Parasites, Hosts and Diseases
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• 제58권1호
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• pp.87-91
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• 2020

Gymnophallid metacercariae found in the Manila clam Ruditapes philippinarum ('Banjirak' in Korean) from Gochang-gun, Jeollabuk-do, Korea were morphologically and molecularly confirmed to be Parvatrema duboisi (Dollfus, 1923) Bartoli, 1974. The metacercariae were morphologically characterized by having a large oral sucker, small ventral sucker, genital pore some distance anterior to the ventral sucker, no ventral pit, and 1 compact or slightly lobed vitellarium, which were all compatible with P. duboisi. Some of the metacercariae were experimentally fed to mice, and adult flukes were recovered at day 7 post-infection. The morphology of the adult flukes was basically the same as that of the metacercariae except for the presence of uterine eggs; the uterus was filled with up to 40 eggs. The nucleotide sequences (1,193 bp) from ITS regions (ITS1, 5.8S rDNA, and ITS2) of the metacercariae showed 99.7% identity with P. duboisi and 75.7% identity with Gymnophalloides seoi deposited in GenBank. These results confirmed the presence of P. duboisi metacercariae in the Manila clam R. philippinarum in an estuary region of Gochang-gun, Korea.

• 한국균학회지
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• 제42권2호
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• pp.138-143
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• 2014

잿빛곰팡이병의 전형적인 병징을 나타내는 병든 사과, 고추, 딸기, 오이, 토마토에서 곰팡이를 분리하고, 그들의 배양학적 특성과, 형태적 특성 및 PCR-RFLP을 통해 이 병원성 곰팡이를 모두 Botrytis cinerea로 동정하였다. 또한, 배양학적 특징에 따라 사과, 고추, 오이에서 분리한 잿빛곰팡이병균의 표현형은 균핵형이며, 딸기와 토마토에서 분리한 잿빛곰팡이병균은 균사형이었다. 각각의 잿빛곰팡이병균의 ITS 영역 염기서열을 포함한 4종의 유전자(RPB2, HSP60, G3PDH)의 염기서열을 결정하고 분자계통학적 유연관계를 분석하였다. RPB2 유전자 염기서열을 제외한 ITS 영역, HSP60유전자 및 G3PDH 유전자의 염기서열은 Botrytis cinerea 종 내 뿐만 아니라 Botrytis 속 종간에도 매우 높은 상동성을 나타내어 계통학적 유연관계 분석이 어려웠다. 하지만, 3종의 유전자(RPB2, HSP60, G3PDH)를 결합한 유전자 염기서열을 이용한 분자계통수 작성 결과, 본 연구에서 분리한 잿빛곰팡이병균은 Botrytis 속의 다른 종들과 구별되며, 사과, 고추, 오이, 토마토의 분리주는 아주 높은 근연관계에 있고, 딸기잿빛곰팡이병균은 다른 분리주와 달리 종내 다른 lineage를 형성하였다.

• Parasites, Hosts and Diseases
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• 제57권4호
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• pp.417-422
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• 2019

From October 2015 to August 2018, tapeworm proglottids were obtained from 10 patients who were residents of Daegu and Gyeongbuk provinces and had a history of raw beef consumption. Most of them had no overseas travel experience. The gravid proglottids obtained from the 10 cases had 15-20 lateral uterine branches. A part of internal transcribed spacer 1 (ITS1) DNA of the 10 cases, amplified by polymerase chain reaction (PCR) and digested with AleI restriction enzyme, produced the same band pattern of Taenia saginata, which differentiated from T. asiatica and T. solium. Sequences of ITS1 and cytochrome c oxidase subunit 1 (cox1) showed higher homology to T. saginata than to T. asiatica and T. solium. Collectively, these 10 cases were identified as T. saginata human infections. As taeniasis is one of the important parasitic diseases in humans, it is necessary to maintain hygienic conditions during livestock farming to avoid public health concerns.

• 한국식물병리학회:학술대회논문집
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• 한국식물병리학회 2003년도 정기총회 및 추계학술발표회
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• pp.76.1-76
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• 2003

The coat protein (CP) of Turnip crinkle virus (TCV) is organized into 3 distinct domains, R domain (RNA-binding) connected by an arm, 5 domain and P domain. We have previously shown that the CP of TCV strongly suppresses RNA silencing, and have mapped N-terminal R domain of which is also the elicitor of resistance response in the Arabidopsis ecotype Di-17 carrying the HRT resistance gene. In order to map the region in the TCV CP that is responsible for silencing suppression, a series of CP mutants were constructed, transformed into Agrobacterium, coinfiltrated either with HC-Pro (the helper component proteinase of tobacco etch potyvirus) known as a suppressor of PTGS or GFP constructs into leaves of Nicotiana benthmiana expressing GFP transgenically. In the presence of HC-Pro, all CP mutants were well protected, accumulating mutant CP mRNAs and their proteins even 5 days post-infiltration (DPI). In the presence of GFP, some mutant constructs which showed the accumulation of CP mutants and GFP mRNAs at early stage but eventually degraded at 5 DPI. Only a mutant which carrying 4 amino acid deletion of R domain was tolerable to maintain suppressing activity, suggesting that the suppressing activity is not directly related with the eliciting activity. A transient assay also revealed that the mutants synthesized their proteins, suggesting that a full length of CP sequences and its intact structure are required to stabilize CP, which suppresses the RNA silencing.

• 한국정보전자통신기술학회논문지
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• 제8권4호
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• pp.263-269
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• 2015

디지털 워터마킹은 인간의 감각으로 감지할 수 없고 통계적인 방법에 의하여 검출되지 않는 정보를 디지털 데이터에 삽입하는 기술이다. 일반적으로 디지털 음향 신호에 대한 워터마킹은 의미 있는 정보를 갖는 이진 시퀀스를 원래의 디지털 음향 신호에 삽입하여 구현한다. 그러나 삽입된 이진 정보는 원래의 디지털 음향 신호의 관점에서는 잡음으로 작용하여 원래의 음향 신호를 왜곡 시키거나 열화 시키는 원인으로 작용한다. 본 논문에서는 인간의 가청 주파수 영역에서 이진 정보의 삽입으로 인한 원 음향 정보의 왜곡을 최소화시킬 수 있는 이진 정보 발생 방법을 제안하였다. 제안한 방법은 표준부호 디지트 코딩을 이용한 방법으로서 인접한 데이터간의 주파수 간섭을 최소화 하여 인간의 가청 주파수 영역에서의 이진 정보 시퀀스의 영향을 최소화 하도록 구현하였다. 제안한 방법은 일반적인 이진 정보발생 방법과 주파수 분석 비교를 통하여 성능을 평가하였다.

• 한국균학회지
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• 제44권1호
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• pp.8-15
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• 2016

진균 오염은 톱밥배지를 이용한 실내 표고 재배에 있어서 피해를 주는 요인 중 하나이다. 표고 재배사를 대상으로 진균을 모니터링하는 중, 재배사의 실내공기와 재배사내에서 채집한 버섯파리로부터 여러 진균을 분리 동정하였다. 동정된 진균 중에는 Mucor nidicola, Perenniporia medulla-panis, Discosia artocreas, Pseudozyma prolifica, Ascochyta hordei 등을 국내 미기록종으로 보고하고, Penicillium charlesii와 Penicillium brevicompactum의 국내존재를 확인하였다. 본 논문에서는 이들 미기록 균류에 대한 형태적 특성과 더불어 internal transcribed spacer (ITS) rDNA region 또는 calmodulin 유전자 염기서열에 기반한 계통학적 관계에 대해 기술하였다.

• 전자공학회논문지CI
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• 제46권1호
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• pp.128-135
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• 2009

동영상에서 시공간상 일정한 위상을 갖는 윤곽선을 정합시켜 물리적 공간에서의 동일한 위치를 추적하는 방법은 명암이 일정한 윤곽선을 정합시키거나 일정한 명암을 전제로 추적하는 방법에 비해 정확성이 높고 조명조건에 대해 안정된 특성이 있다. 본 논문에서는 이러한 성질을 이용하여 조명변화와 노이즈에 강인하게 카메라의 움직임을 추정하는 기법을 소개한다. 우선, 가버 필터뱅크를 사용하여 공간적으로 여과된 연속영상으로부터 계산된 위상의 크기를 기반으로 필터의 방향과 수직인 곳의 광류를 구한 후, 최소제곱법을 적용하여 어파인 모델에 상응하는 카메라의 움직임 파라미터를 구한다. 실험을 통하여 이러한 방법은 조명조건의 변화를 야기하는 디스플레이 기기를 피사체로 하여 카메라의 위치변화를 추정하는 방식의 영상기반 포인팅 디바이스에도 적용될 수 있음을 보인다.

• BMB Reports
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• 제41권6호
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• pp.466-471
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• 2008

Three isoforms of pig PDE4B were cloned and classified as two forms: PDE4B1 and PDE4B3, which contain UCR1 and UCR2; and PDE4B2, which contains only UCR2. The amino acid sequences of each isoform showed good conservation in human and rat. PDE4B2 is expressed in a wide range of tissues, but PDE4B1 and PDE4B3 are not. Using an informative SNP for the Iberian x Landrace intercross detected from intron 12, a linkage map was constructed. The location of PDE4B was estimated at 123.6 cM outside of the QTL-CI (124-128 cM) for IMF. However, the QTL-CI for IMF was reconfirmed with high significance, and its position was narrowed down to an interval of 4 cM (the region defined by markers PDE4B and SW1881). Using radiation hybrid mapping, LEPR, LEPROT, DNAJC6, AK3L1 and AK3L2 were selected as positional and/or functional candidates related to the QTL.

• 원예과학기술지
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• 제29권2호
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• pp.123-129
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• 2011

To identify unintended vertical gene-transfer rates from the developed transgenic plants, rapid and unequivocal techniques are needed to identify event-specific markers based on flanking sequences around the transgene and to distinguish zygosity such as homo- and hetero-zygosity. To facilitate evaluation of zygosity, a polymerase chain reaction technique was used to analyze a transgenic pepper line B20 (homozygote), P915 wild type (null zygote), and their F1 hybrids, which were used as transgene contaminated plants. First, we sequenced the 3'-flanking region of the T-DNA (1,277 bp) in the transgenic pepper event B20. Based on sequence information for the 3'- and 5'-flanking region of T-DNA provided in a previous study, a primer pair was designed to amplify full length T-DNA in B20. We successfully amplified the full length T-DNA containing 986 bp from the flanking regions of B20. In addition, a 1,040 bp PCR product, which was where the T-DNA was inserted, was amplified from P915. Finally, both full length T-DNA and the 1,040 bp fragment were simultaneously amplified in the F1 hybrids; P915 ${\times}$ B20, Pungchon ${\times}$ B20, Gumtap ${\times}$ B20. In the present study, we were able to identify zygosity among homozygous transgenic event B20, its wild type P915, and hemizygous F1 hybrids. Therefore, this novel zygosity identification technique, which is based on PCR, can be effectively used to examine gene flow for transgenic pepper event B20.

• 한국균학회지
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• 제44권4호
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• pp.240-246
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• 2016

2015년 찐고구마, 저장 마늘, 소나무재선충병에 감염된 목재칩, 버섯재배 배지용 농업부산물 등의 식물재료로부터 진균을 조사하던 중 5종의 진균을 분리하고 동정하였다. 본 논문에서는 동정된 Geomyces pannorum, Neopestalotiopsis javaensis, Ophiognomonia setacea, Penicillium allii, Penicillium chermesinum 등 5종 진균을 국내 미기록 진균으로 보고하고자 한다. 이들 미기록 균류에 대한 배양 배지에서의 집락 형성 특성과 광학현미경 관찰을 의한 미세구조 특성, 그리고 internal transcribed spacer (ITS) rDNA region 또는 calmodulin 유전자 염기서열에 기반한 분자계통학적 관계에 대해 기술하였다.