• 제목/요약/키워드: IR marker

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The complete chloroplast genome of Diarthron linifolium (Thymelaeaceae), a species found on a limestone outcrop in eastern Asia

  • KIM, Sang-Tae;OH, Sang-Hun;PARK, Jongsun
    • 식물분류학회지
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    • 제51권4호
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    • pp.345-352
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    • 2021
  • Diarthron linifolium Turcz. is an annual herb usually found in sandy soil or limestone areas. Plants in the genus Diarthron are known to have toxic chemicals that may, however, be potentially useful as an anticancer treatment. Diarthron linifolium is a unique species among the species of the genus distributed in Korea. Here, we determine the genetic variation of D. linifolium collected in Korea with a full chloroplast genome and investigate its evolutionary status by means of a phylogenetic analysis. The chloroplast genome of Korean D. linifolium has a total length of 172,644 bp with four subregions; 86,158 bp of large single copy and 2,858 bp of small single copy (SSC) regions are separated by 41,814 bp of inverted repeat (IR) regions. We found that the SSC region of D. linifolium is considerably short but that IRs are relatively long in comparison with other chloroplast genomes. Various simple sequence repeats were identified, and our nucleotide diversity analysis suggested potential marker regions near ndhF. The phylogenetic analysis indicated that D. linifolium from Korea is a sister to the group of Daphne species.

Adiponectin induced AMP-activated protein kinase impairment mediates insulin resistance in Bama mini-pig fed high-fat and high-sucrose diet

  • Niu, Miaomiao;Xiang, Lei;Liu, Yaqian;Zhao, Yuqiong;Yuan, Jifang;Dai, Xin;Chen, Hua
    • Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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    • 제30권8호
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    • pp.1190-1197
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    • 2017
  • Objective: Adipose tissue is no longer considered as an inert storage organ for lipid, but instead is thought to play an active role in regulating insulin effects via secretion adipokines. However, conflicting reports have emerged regarding the effects of adipokines. In this study, we investigated the role of adipokines in glucose metabolism and insulin sensitivity in obese Bama mini-pigs. Methods: An obesity model was established in Bama mini-pigs, by feeding with high-fat and high-sucrose diet for 30 weeks. Plasma glucose and blood biochemistry levels were measured, and intravenous glucose tolerance test was performed. Adipokines, including adiponectin, interleukin-6 (IL-6), resistin and tumor necrosis factor alpha ($TNF-{\alpha}$), and glucose-induced insulin secretion were also examined by radioimmunoassay. AMP-activated protein kinase (AMPK) phosphorylation in skeletal muscle, which is a useful insulin resistance marker, was examined by immunoblotting. Additionally, associations of AMPK phosphorylation with plasma adipokines and homeostasis model assessment of insulin resistance (HOMA-IR) index were assessed by Pearce's correlation analysis. Results: Obese pigs showed hyperglycemia, high triglycerides, and insulin resistance. Adiponectin levels were significantly decreased (p<0.05) and IL-6 amounts dramatically increased (p<0.05) in obese pigs both in serum and adipose tissue, corroborating data from obese mice and humans. However, circulating resistin and $TNF-{\alpha}$ showed no difference, while the values of $TNF-{\alpha}$ in adipose tissue were significantly higher in obese pigs, also in agreement with data from obese humans but not rodent models. Moreover, strong associations of skeletal muscle AMPK phosphorylation with plasma adiponectin and HOMA-IR index were obtained. Conclusion: AMPK impairment induced by adiponectin decrease mediates insulin resistance in high-fat and high-sucrose diet induction. In addition, Bama mini-pig has the possibility of a conformable model for human metabolic diseases.

정상 갑상샘 기능을 보이는 성인 남성에서 갑상샘 호르몬과 대사증후군 위험요인과의 관계 (Association between Thyroid Hormone and Risk Factors of Metabolic Syndrome in Adult Men of Normal Thyroid Function)

  • 신경아
    • 대한임상검사과학회지
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    • 제47권4호
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    • pp.324-331
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    • 2015
  • 갑상샘 호르몬은 교감신경계와의 상호작용으로 세포의 에너지 대사조절 및 항상성 유지에 중요한 역할을 한다. 본 연구는 건강검진을 실시한 성인 남성을 대상으로 갑상샘 호르몬과 대사증후군 위험요인간의 연관성을 밝히고자 하였다. 경기지역 일개 종합병원에서 2011년 1월부터 2013년 12월까지 건강검진센터에서 종합건강검진을 실시한 20세 이상 80세 이하의 남성 12,250명을 대상으로 하였다. 대사증후군은 American Heart Association/National Heart, Lung, and Blood Institute (AHA/NHLBI, 2005)에서 제시한 진단 기준에 따랐으며, 3개 이상의 위험요인을 가진 경우 대사증후군으로 진단하였다. 정상군보다 대사증후군 진단군에서 FT4가 낮았으며(p<0.001), TSH는 대사증후군 유무에 따른 차이는 없었다. 또한 FT4는 대사증후군 위험요인 중 허리둘레, 중성지방에 영향을 미치는 것으로 나타났으며(각각 p<0.001), FT4의 가장 낮은 사분위수가 가장 높은 사분위수보다 HbA1c, 인슐린, HOMA-IR, hs-CRP 농도가 높았다(각각 p<0.001). FT4는 허리둘레, 중성지방에 영향을 미치는 것으로 나타났으나, TSH는 대사증후군 위험요인에 영향을 미치지 않는 것으로 나타났다. 또한 FT4의 가장 높은 분위수의 대사증후군 발생위험이 가장 낮은 분위수보다 낮게 나타났다.

Genetic Diversity of Didymella bryoniae for RAPD Profiles Substantiated by SCAR Marker in Korea

  • Shim, Chang-Ki;Seo, Il-Kyo;Jee, Hyeong-Jin;Kim, Hee-Kyu
    • The Plant Pathology Journal
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    • 제22권1호
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    • pp.36-45
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    • 2006
  • Twenty isolates of Didymella bryoniae were isolated from infected cucurbit plants in various growing areas of southern Korea in 2001 and 2002. Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD) group [RG] I of D. bryoniae was more virulent than RG IV to watermelon. Virulence of the RG I isolate was strong to moderate to cucumber, whereas that of the RG IV varied from strong, moderate to weak. Two hundred seventy-three amplified fragments were produced with 40 primers, and were analyzed by a cluster analysis using UPGMA method with an arithmetic average program of NTSYSPC. At the distance level of 0.7, two major genomic DNA RAPD groups were differentiated among 20 isolates. The RG I included 7 isolates from watermelon and one isolate from melon, whereas the RG IV included 12 isolates from squash, cucumber, watermelon and melon. Amplification of internal transcribed spacer (ITS) region and small subunit rRNA region from the 20 isolates yielded respectively a single fragment. Restriction pattern with 12 restriction enzymes was identical for all isolates tested, suggesting that variation in the ITS and small subunit within the D. bryoniae were low. Amplification of the genomic DNAs of the tested isolates with the sequence characterized amplified regions (SCAR) primer RG IF-RG IR specific for RG I group resulted in a single band of 650bp fragment for 8 isolates out of the 20 isolates. Therefore, these 8 isolates could be assigned into RG I. The same experiments done with RG IIF-RG IIR resulted in no amplified PCR product for the 20 isolates tested. An about 1.4 kb-fragment amplified from the RG IV isolates was specifically hybridized with PCR fragments amplified from genomic DNAs of the RG IV isolates only, suggesting that this PCR product could be used for discriminating the RG IV isolates from the RG I isolates as well other fungal species.

ubiGuide: 비간섭 증강현실 기술을 이용한 지능형 가이드 시스템 (ubiGuide: Intelligent Guide System Using Nonintrusive Augmented Reality Techniques)

  • 진윤종;박한훈;노성규;최희준;박종일
    • 한국HCI학회:학술대회논문집
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    • 한국HCI학회 2007년도 학술대회 1부
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    • pp.643-648
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    • 2007
  • 유비쿼터스 컴퓨팅 기술이 문화예술 분야에 접목되면서 수동적이었던 전시 관람 형태가 능동적인 관람 형태로 바뀌고 있다. 특히, 지능형 가이드 시스템의 등장은 기존의 관람 문화를 크게 변화시켰다. 지능형 가이드 시스템이란 사용자에게 전시물에 대한 정보 및 전시장의 위치 정보를 제공해주는 시스템을 말한다. 현재 상용화되고 있는 지능형 가이드 시스템은 크게 휴대폰, PDA, 게임기 등의 휴대형 장치 기반의 가이드 시스템과 HMD와 같은 착용형 장치 기반의 가이드 시스템으로 나뉠 수 있다. 본 논문에서는 이러한 현재 상용화된 시스템들의 한계(예를 들어, 특정 장치를 직접 착용 혹은 소지해야 함)를 서술하고, 이를 보완하는 프로젝터 기반의 가이드 시스템에서 더 나아가 임의의 공간에 원하는 전시물 구성, 설치 등을 신속, 정확하게 수행하는 지능형 가이드 시스템을 제안한다. 프로젝터 기반의 지능형 가이드 시스템은 기반 기술로 지능형 프로젝션 기술을 필요로 하는데, 이는 임의의 환경에서 임의의 위치에 다수의 사용자에게 고화질, 대화면 영상 정보를 제공해 준다. 그러나, 기존의 지능형 프로젝션 기술은 성능 및 안정성을 위해 대부분 가시적인 패턴 및 마커를 사용하는데, 이는 사용자에게 제공되는 정보를 관찰하는 데 방해가 될 수 있다. 본 논문에서는 사용자의 관점에서 유용한 비간섭 지능형 프로젝션 기술을 사용한다. 즉, 본 논문에서는 마커나 패턴을 사용함으로써 정확성이나 안정성은 보장하지만, 마커나 패턴을 은닉하여 사용자의 눈에 띄지 않도록 함으로써, 사용자는 원하는 정보를 아무런 방해 없이 제공받을 수 있다. 제안된 시스템을 미술 작품 감상을 위한 가이드 시스템으로 적용해 본 결과, 사용자는 자유로운 환경에서 자신의 위치나 작품에 대한 설명을 대화면으로 제공받으면서, 편안하게 그림을 감상할 수 있었다.

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증포 횟수를 달리하여 만든 선식을 첨가한 고지방식이가 비만 쥐의 혈당과 염증지표에 미치는 영향 (Effects of Sunsik Prepared through Steaming-Drying Cycles on Blood Glucose and Inflammatory Marker in Rats Fed High Fat)

  • 황경희;공현주;이언희;최은미;황수정;장정현;양경미
    • 동아시아식생활학회지
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    • 제25권1호
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    • pp.111-120
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    • 2015
  • This study was conducted to evaluate the effects of Sunsik prepared by steaming -drying cycles- on blood glucose and inflammatory markers in high fat diet-induced obese rats. The experimental animals were divided into five groups and subjected to diets for 8 weeks; normal diet (control), high fat diet (HF), and high fat diet+10% supplementation of Sunsik (1HF, 3HF, 7HF, 9HF). The results showed body weight, food efficiency ratio, blood glucose and insulin levels of high fat diet groups were significantly higher than those of the control group. Increased glucose levels by high fat diet were reduced to normal levels by the four Sunsik supplementations. Insulin resistance (HOMA-IR) of the HF group was significantly higher than those of the control group, whereas supplementation with the four types of Sunsik reduced insulin resistance to similar levels as the control group. Increased insulin secretion and leptin levels of high fat diet-induced obese rats were significantly reduced by supplementation with the four types of Sunsik. C-reactive protein (CRP) of inflammation related components was significantly higher than the control group. However, increased CRP concentration by high fat diet was significantly reduced by supplementation with Sunsik.

단일 카메라와 평면거울을 이용한 하지 운동 자세 추정 (Human Legs Motion Estimation by using a Single Camera and a Planar Mirror)

  • 이석준;이성수;강선호;정순기
    • 한국정보과학회논문지:컴퓨팅의 실제 및 레터
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    • 제16권11호
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    • pp.1131-1135
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    • 2010
  • 본 논문에서는 고정시킨 평면거울을 바라보는 단일 카메라에서 얻어진 영상을 이용하여 훈련자 양 하지의 자세를 3차원으로 추정하는 방법을 제안한다. 이를 위해, 카메라 입력영상으로부터 평면거울에 부착된 네 개의 적외선 마커를 탐색하여 단일 카메라의 자세를 추정한다. 추정된 카메라 자세를 통해 거울평면을 기준으로 하는 훈련공간을 정의하고, 압력 센서를 사용하여 공간 내의 훈련자의 양 하지 위치를 측정한다. 양 하지의 마커는 직접적으로, 또는 거울을 통해 카메라 영상으로 투영되고, 정의된 훈련 공간에서 3차원 위치로 변환된다. 변환된 마커들의 3차원 위치관계에 의해 최종적으로 양 하지의 자세를 얻고 연속적인 움직임에 대해 운동 상태를 추정한다.

Development of Rainfed-adapted, Fertilizer-efficient Temperate Rice Varieties by Pup1 Introgression

  • Ian Paul Navea;Jae-Hyuk Han;Na-Hyun Shin;Yeong-Ju Lee;Joong Hyoun Chin
    • 한국작물학회:학술대회논문집
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    • 한국작물학회 2022년도 추계학술대회
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    • pp.272-272
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    • 2022
  • Water and phosphorus (P) fertilizer are two of the most critical inputs in rice cultivation. Under climate change scenarios and urbanization, irrigation and fertilizer are becoming limiting factors often leading to significant decrease in yield whenever supplied scarcely. It has been shown that the Pup1 QTL confers tolerance to P starvation and improved early-stage root vigor in indica rice grown in the tropics. However, whether the QTL works in japonica rice genetic background grown in temperate regions remains to be elucidated. Here, we have introgressed the Pup1 QTL into three temperate rice varieties MS11, TR22183, and Dasan using marker-assisted backcrossing and next generation sequencing. The selected lines all harbored the full Pup1 QTL with recurrent parent genome recovery rates ranging from 66.5% to 99.8%. Evaluation of the introgression rice lines grown in South Korea under low inputs of P and water revealed early vegetative growth advantage relative to that of the recurrent parents. Under rainfed condition, Pup1 introgression lines had yield advantage ranging from 7.2 to 19.9% and 24 to 26% in P non-supplied soil and P-supplied soil, respectively compared to that of the recurrent parents suggesting that Pup1 confers enhanced yield under low P and water inputs in temperate rice genetic background grown in temperate climate. In terms of early vegetative growth, temperate Pup1 introgression lines showed a similar trend on the extent to which Pup1 promotes yield advantage in temperate rice in comparison with indica control Pup1 introgression line IR64-Pup1.

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고혈압 환자에서 혈장 고분자량 아디포넥틴 농도와 심장-대사위험인자와의 관련성 연구 (Plasma Levels of High Molecular Weight Adiponectin are Associated with Cardiometabolic Risks in Patients with Hypertension)

  • 정혜경;신민정
    • Journal of Nutrition and Health
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    • 제41권8호
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    • pp.733-741
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    • 2008
  • 고혈압 환자 110명을 대상으로 혈장 고분자량 아디포넥틴과 총 아디포넥틴 농도를 측정하고 심장-대사위험인자와의 관련성을 비교 평가한 연구 결과를 요약하면 다음과 같다. 1) 비만군과 비비만군으로 나누어 비교한 결과, 고분자량 아디포넥틴 농도는 비만군에서 유의적으로 낮았으나 총 아디포넥틴 농도는 두군간 유의적인 차이를 보이지 않았다. 2) 비만도를 나타내는 BMI 및 허리둘레의 경우 고분자량 아디포넥틴과 음의 상관관계를 보였으나 혈장 아디포넥틴과는 유의적인 상관관계를 보이지 않았다. 3) 혈액 지질 수준과의 상관성 평가시, 고분자량 아디포넥틴은 중성지방과 음의 상관관계를, 고밀도 콜레스테롤과는 양의 상관관계를 보였으며 혈장 아디포넥틴의 경우 단지고밀도 콜레스테롤과 유의적인 양의 상관관계를 보였다. 4) 인슐린 저항성 지표인 HOMA-IR의 경우 고분자량 아디포넥틴 및 혈장 아디포넥틴 모두와 음의 상관관계를 보였다. 5) 염증지표와의 상관성 분석 시, 고분자량 아디포넥틴은 C-반응성 단백질, IL-6과 강한 음의 상관 관계를 TNF-${\alpha}$, ICAM-1과 음의 경향을 보였으나 혈장 아디포넥틴은 C-반응성 단백질외에는 상관관계를 보이지 않았다. 또한 회귀분석 결과, 혈장 고분자량 아디포넥틴 농도는 C-반응성 단백질 수준을 예측하는 독립적 인자였다. 위의 결과로 보아 고분자량 아디포넥틴은 혈장 아디포넥틴보다 전반적으로 심장-대사위험인자와 더 많은 상관성을 보여주었다. 따라서 심혈관 질환 및 대사성증후군을 예측하고 반영하는 데 혈장 고분자량 아디포넥틴 수준이 총 아디포넥틴 수준보다 민감하고 정확한 지표로 활용될 수 있을 것이다.