Jeong, Ho Jin;Ha, Gwangsu;Shin, Su-Jin;Jeong, Su-Ji;Ryu, Myeong Seon;Yang, Hee-Jong;Jeong, Do-Youn
Journal of Life Science
/
v.31
no.12
/
pp.1079-1087
/
2021
To analyze gut microbiota of livestock in Korea and compare taxonomic differences, we conducted 16S rRNA metagenomic analysis through next-generation sequencing. Fecal samples from broiler chickens, pigs, and cattle were collected from domestic feedlots randomly. α-diversity results showed that significant differences in estimated species richness estimates (Chao1 and ACE, Abundance-based coverage estimators) and species richness index (OUTs, Operational taxonomic units) were identified among the three groups. However, NPShannon, Shannon, and Simpson indices revealed that abundance and evenness of the species were statistically significant only for poultry (broiler chickens) and mammals (pigs and cattle). Firmicutes was the most predominant phylum in the three groups of fecal samples. Linear discriminant (LDA) effect size (LEfSe) analysis was conducted to reveal the ranking order of abundant taxa in each of the fecal samples. A size-effect over 2.0 on the logarithmic LDA score was used as a discriminative functional biomarker. As shown by the fecal analysis at the genus level, broiler chickens were characterized by the presence of Weissella and Lactobacillus, as well as pigs were characterized by the presence of provetella and cattele were characterized by the presence of Acinetobacter. A permutational multivariate analysis of variance (PERMANOVA) showed that differences of microbial clusters among three groups were significant at the confidence level. (p=0.001). This study provides basic data that could be useful in future research on microorganisms associated with performance growth, as well as in studies on the livestock gut microbiome to increase productivity in the domestic livestock industry.
This study was to investigate the growth of planted red pine (Pinus densiflora S. et. Z.) seedling, soil properties and understory vegetation structure after fertilizer treatments [unfertilized plot (control), CF plot (Combination Fertilizer), UF plot (Urea Formaldehyde Fertilizer)] in a Pinus densiflora stand planted after the forest fires in Gosung, Gangwon province. The height growth rates of seedlings in four years were 264% in unfertilized, 404% in CF, and 388% in UF plots, respectively. The root collar diameters were increased 340% in unfertilized, 454% in CF, and 427% in UF plots, respectively. No significant changes occurred in soil total nitrogen and potassium ion ($K^+$) with the fertilization. However, available $P_2O_5$, content in the soil surface (0-15 cm) increased with the fertilizer application. Soil organic matter increased significantly with fertilizer treatments, while gradual decrease occurred in unfertilized plots. Sodium ion ($Na^-$) decreased in all sites. Soil pH, CEC, calcium ion ($Ca^{2+}$) and magnesium ion ($Mg^{2+}$) contents were not significantly different among treatments. Although Shannon's species diversity index and species richness in understory vegetation did not change with fertilizer treatments, vegetation cover rates in forest floor increased significantly with the fertilization. These results suggest that the increase of pine seedling growth and vegetation cover rates with fertilization could enhance soil stabilization in forest tire areas.
This study was carried out to investigate the ecological succession sere and conservative value, and to provide the basic data in Woonsooam Valley, in Jogyesan (Mt.) (altitude 884m), Suncheon City, Korea by analysing the structure of the plant community. Fifteen plots (size is $20m{\times}20m$) were set up at an altitude of range from 255m to 495m. As a result of analysis of DCA which is one of the ordination technique, the plant communities were divided into five groups which are community I (Pinus densiflora community), community II (Quercus variabilis-Quercus serrata community), community III (Q. serrata-Q. variabilis community), and community IV (Carpinus tschonoskii-Q. serrata community) and community v(Deciduous broad-leaved forest community). We found out that the vegetation of the study site located in the South Temperate Climate Zone. The study site is found out that Q. serrata community 34.4%, part of slope in valley is the distribution that dominant species is Q. serrata-Q. variabilis community 32.1%. And in valley showed Carpinus tschonoskii community 5.5%. And Sasa borealis was dominant species in the shrub layer. We couldn't supposed that the ecological succession sere of the study site, however we should do a long-term monitoring to investigate the changes of the ecological succession each plant community, According to the index of Shannon's diversity (unit: $400m^2$), community III was ranged from 1.0102 to 1.1013, community V was 0.9945, community II was ranged from 0.7913 to 1.1503, community IV was ranged from 0.8081 to 1.0749 and community I was 0.9273.
A bionomic study of the coralligenous concretionary hard bottom in the northwestern Mediterranean was carried out at four stations : three stations(Arnette, Laurons, Auguette) under the influence of intense multisource pollution(gradient decreasing from north to south) in the Gulf of Fos, west of Marseille, France, and one control station(Moyade islet) in an unpolluted area near Riou island, east of Marseille. Along the increasing pollution gradient from the outer to the inner part of the Gulf of Fos, there is a qualitative and quantitative impoverishment of the fauna. On the whole, the species richness, the numerical abundance. and the species diversity index are all on the decrease. Accordingly, the innermost station in the Gulf of Fos(Auguette) is most heavily affected by the industrial, and to a lesser extent by the domestic wastes, from the nearby industrial complex and urban areas. The impact on the benthic coralligenous community of this serious alteration has been analysed in view of community composition, functional aspect, and ecological stocks. The faunal affinity between stations has been studied by means of the two coefficients : fourfold point correlation coefficient and Jaccard's community coefficient. The upper layer and inferior face communities of the coralligenous concretionary structures are also compared.
Forest road construction can degrade the physical and biological environments of forest ecosystems. Although this degradation may be temporary, some research has shown the potential for the long-term recovery of the original ecosystem. This study investigated changes in communities' structures over time to understand the process of ecosystem change following road construction. Data were collected from 63 plots, each measuring 25m2, in Buyeo-gun, Chungcheongnam-do, including plots from roads constructed in 1998 (25 years elapsed), 2021 (two years elapsed), and 2022 (one year elapsed), using phytosociological methods. The results showed that the importance of the values of Pinus densiflora an d Quercus variabilis in the tree and subtree layers of the 25-year-old cut slopes were similar to those of the control plots, indicating the significant recovery of the original ecosystem's structure and function after 25 years. Species diversity analysis revealed the higher evenness and lower dominance of the cut slopes and road surfaces attributed to the high dominance of species such as Arundinella hirta and Miscanthus sinensis. The community similarity index and detrended correspondence analysis (DCA) indicated that the control plots, all the edge plots, and the 25-year-old cut slopes could be considered part of the same community. In conclusion, forest roads in place for 25 years appear to have been restored to the level of the original ecosystem. These findings can serve as valuable ecological data for understanding the vegetation recovery process at future forest road construction sites.
This study was conducted to investigate the flora and vegetation structure at a 15-year-old artificial wetland for the water purification in Jincheon, Korea. The percentage of species number of obligate wetland plants and facultative wetland plants totaled 40%, whereas that of obligate upland plants and facultative upland plants was 57%. This result showed that the artificial wetland in the study experienced terrestrialization. The number of annual and biennial plants that are pioneer vegetation in a successional stage was lower than that of perennial herbs as a result of the long-term stabilization of vegetation. From the results of DCA (detrended correspondence analysis), water depth played an important role on the classification of vegetation structure in an old artificial wetland. Species diversity was higher in the terrestrialized plant communities such as Iris pseudacorus and Aster koraiensis than in any other wetland communities. Plant communities could be classified according to the wetland indices; obligate upland for A. koraiensis community, facultative wetlands for Carex dispalata var. dispalata and I. pseudacorus community, and obligate wetlands for Nymphoides peltata, Nymphaea tetragona, Phragmites communis, Potamogeton maackianus, and Typha angustifolia community. In conclusion, this result suggests that wetland vegetation should be maintained against terrestrialization through the proper management of sedimentation and hydrological regime in an artificial wetland.
The Sea:JOURNAL OF THE KOREAN SOCIETY OF OCEANOGRAPHY
/
v.8
no.3
/
pp.285-294
/
2003
To select an appropriate sampler for the environmental monitoring survey in coastal waters of Saemangeum, Jeollabuk-do, a macrobenthic sampling was conducted in April 2002. Employed samplers were dredge (type Charcot), a semi-quantitative sampler and Smith-McIntyre (SM) and van Veen grab (VV) as quantitative ones. One haul was tried for dredge and 3 replicates (0.1 ㎡${\times}$3) for SM and W at each of 11 stations. Comparisons of sediment volume in sampler bucket and of precision of biological parameters (i.e., density, biomass, species number and diversity index, H') were made between SM and VV. Sediment volume was significantly different (SM > VV) at p-value of 0.0050 (paired t-test) and, in average, 3 replicate samples of SM and VV satisfied a precision level of 0.2 by applying 4th root transformation. Patterns of observed and expected species numbers and H' were compared. Dredge-VV samples showed higher affinity than any other pair. Several dominant species in the area were underestimated in dredge samples (e.g., polychaete Heteromastus filiformis. Aricidea assimilis etc.). Quantifying the agreement pattern of multi-species responses was accomplished by estimating correlations between similarity matrices. Correlation between dredge and VV was slightly higher, but near-per-fect matches were found in general. Different ranks and composition among principal species lists were presumably linked to the effect of penetration depth that differs among samplers. Lower level of some species' abundance in VV samples (ca. 50% compared with those of SM) was explained in this context. It seem appropriate to regard the effect as a probable cause of relatively higher correlations in dredge-VV, Overall bio-logica1 features indicated that a better choice could be SM in situations of requiring high data quality. The others work well, however, on observing and defining faunal characteristics and their capability cannot be questionted if we do not expect a first-order quality.
Alder (Alnus japonica) forests are representative of the wetland in East Asia, including Korea. In the past, alder forests were relatively common in various habitats such as mountains, riversides, back marshes, and alluvial plains. However, this plant community has recently become rare due to increasingly arid habitats and the influence of various land uses. In this study, we identify the synecological characteristics of alder (A. japonica) forests distributed naturally in the mountainous wetlands of Korea and provide basic data for their systematic conservation and management in the future. Based on vegetation survey data collected from 66 alder forests, community types were classified using the methods of the Zürich-Montpellier School of Phytosociology and two-way indicator species analysis. There were eight community types: Styrax obassia, Weigela subsessilis-Fraxinus mandschurica, Spiraea fritschiana, Viola verecunda, Impatiens textori-Spiraea salicifolia, Glyceria leptolepis, Molinia japonica, and Lindera obtusiloba-Quercus acutissima. These community types constituted a vegetation unit hierarchy of two communities, four subcommunities, and eight variants. In addition, the ecological characteristics of each community type were compared (including total coverage per 100 square meter, importance value index, constancy class, life-form composition, diversity indices, community similarity coefficient, and indicator species).
Mesozooplankton dynamics were studied in Watan stream which flows into the Yellow Sea in Yeonggwang, Korea. Samples were collected at eight stations bimonthly during April 2006~February 2007. Mesozooplankton community was consisted of 45 taxa (8 cladocerans and 29 cope-pods). The abundance varied between the highest one ($31{\sim}127,587\;indiv.m^{-3}$) in October, and the lowest ($12{\sim}233\;indiv.m^-3$) in December. Diversity index showed to be the highest value in July (0.671) and the lowest one in August (0.368). A euryhaline species, Acartia hongi was dominant in brackish water stations (the highest abundance at $13.4^{\circ}C$ and 14.1 psu). In freshwater stations of the upstream, two cladoceran species of Polyphemus pediculus and Moina weismani occurred in high abundance in August. Dominant taxa of copepod were clustered to two or three groups mainly due to the difference of salinity gradients. Spatial distribution of mesozooplankton revealed to be determined by salinity gradients which were affected by opening and closing of the artificial dam in Watan stream.
Benthic macroinvertebrate communities were studied after a small dam removal from the mid-section of the Gyeongan stream in Gyeonggi-do, Korea. Quantitative sampling was conducted at immediately upstream (upper) and downstream (lower) sites from the dam as well as at the site where the dam was located (dam site: middle) using a Surber sampler (50$\times$50 cm, mesh 0.25 mm), four times (November 2004, May 2005, January 2006, and May 2006) after the dam removal. As a result, 46 species of benthic macroinvertebtates, belonged in 35 genera, 27 families, 11 orders, 5 classes, and 4 phyla, were sampled from the stream sites, but the number of species that occurred at each sampling trial was different (ranged 3$\sim$17 spp.) according to the seasons and sites. Approximately one year after the dam removal, the species number has in-creased and taxa composition has changed as the microhabitat became more heterogeneously due to a riffle formation in the upstream site. Chironomid larvae and tubificid worms, which are common in Korean urban streams, were the dominant species, while Hydropsyche kozhantschikovi was the 2nd dominant species at some sampling trials. In general, McNaughton's dominance indices decreased and Shannon species diversity indices increased approximately one year after the dam removal. Compositions of collector-filterers, clingers, and swimmers increased as hydropsychid caddisflies, heptageniid mayflies, and baetid mayflies increased, respectively, in the upstream site. The group pollution index and the ecological score using benthic macroinvertebrates both indicated that water environment has been improved in the upstream site after the dam removal.
본 웹사이트에 게시된 이메일 주소가 전자우편 수집 프로그램이나
그 밖의 기술적 장치를 이용하여 무단으로 수집되는 것을 거부하며,
이를 위반시 정보통신망법에 의해 형사 처벌됨을 유념하시기 바랍니다.
[게시일 2004년 10월 1일]
이용약관
제 1 장 총칙
제 1 조 (목적)
이 이용약관은 KoreaScience 홈페이지(이하 “당 사이트”)에서 제공하는 인터넷 서비스(이하 '서비스')의 가입조건 및 이용에 관한 제반 사항과 기타 필요한 사항을 구체적으로 규정함을 목적으로 합니다.
제 2 조 (용어의 정의)
① "이용자"라 함은 당 사이트에 접속하여 이 약관에 따라 당 사이트가 제공하는 서비스를 받는 회원 및 비회원을
말합니다.
② "회원"이라 함은 서비스를 이용하기 위하여 당 사이트에 개인정보를 제공하여 아이디(ID)와 비밀번호를 부여
받은 자를 말합니다.
③ "회원 아이디(ID)"라 함은 회원의 식별 및 서비스 이용을 위하여 자신이 선정한 문자 및 숫자의 조합을
말합니다.
④ "비밀번호(패스워드)"라 함은 회원이 자신의 비밀보호를 위하여 선정한 문자 및 숫자의 조합을 말합니다.
제 3 조 (이용약관의 효력 및 변경)
① 이 약관은 당 사이트에 게시하거나 기타의 방법으로 회원에게 공지함으로써 효력이 발생합니다.
② 당 사이트는 이 약관을 개정할 경우에 적용일자 및 개정사유를 명시하여 현행 약관과 함께 당 사이트의
초기화면에 그 적용일자 7일 이전부터 적용일자 전일까지 공지합니다. 다만, 회원에게 불리하게 약관내용을
변경하는 경우에는 최소한 30일 이상의 사전 유예기간을 두고 공지합니다. 이 경우 당 사이트는 개정 전
내용과 개정 후 내용을 명확하게 비교하여 이용자가 알기 쉽도록 표시합니다.
제 4 조(약관 외 준칙)
① 이 약관은 당 사이트가 제공하는 서비스에 관한 이용안내와 함께 적용됩니다.
② 이 약관에 명시되지 아니한 사항은 관계법령의 규정이 적용됩니다.
제 2 장 이용계약의 체결
제 5 조 (이용계약의 성립 등)
① 이용계약은 이용고객이 당 사이트가 정한 약관에 「동의합니다」를 선택하고, 당 사이트가 정한
온라인신청양식을 작성하여 서비스 이용을 신청한 후, 당 사이트가 이를 승낙함으로써 성립합니다.
② 제1항의 승낙은 당 사이트가 제공하는 과학기술정보검색, 맞춤정보, 서지정보 등 다른 서비스의 이용승낙을
포함합니다.
제 6 조 (회원가입)
서비스를 이용하고자 하는 고객은 당 사이트에서 정한 회원가입양식에 개인정보를 기재하여 가입을 하여야 합니다.
제 7 조 (개인정보의 보호 및 사용)
당 사이트는 관계법령이 정하는 바에 따라 회원 등록정보를 포함한 회원의 개인정보를 보호하기 위해 노력합니다. 회원 개인정보의 보호 및 사용에 대해서는 관련법령 및 당 사이트의 개인정보 보호정책이 적용됩니다.
제 8 조 (이용 신청의 승낙과 제한)
① 당 사이트는 제6조의 규정에 의한 이용신청고객에 대하여 서비스 이용을 승낙합니다.
② 당 사이트는 아래사항에 해당하는 경우에 대해서 승낙하지 아니 합니다.
- 이용계약 신청서의 내용을 허위로 기재한 경우
- 기타 규정한 제반사항을 위반하며 신청하는 경우
제 9 조 (회원 ID 부여 및 변경 등)
① 당 사이트는 이용고객에 대하여 약관에 정하는 바에 따라 자신이 선정한 회원 ID를 부여합니다.
② 회원 ID는 원칙적으로 변경이 불가하며 부득이한 사유로 인하여 변경 하고자 하는 경우에는 해당 ID를
해지하고 재가입해야 합니다.
③ 기타 회원 개인정보 관리 및 변경 등에 관한 사항은 서비스별 안내에 정하는 바에 의합니다.
제 3 장 계약 당사자의 의무
제 10 조 (KISTI의 의무)
① 당 사이트는 이용고객이 희망한 서비스 제공 개시일에 특별한 사정이 없는 한 서비스를 이용할 수 있도록
하여야 합니다.
② 당 사이트는 개인정보 보호를 위해 보안시스템을 구축하며 개인정보 보호정책을 공시하고 준수합니다.
③ 당 사이트는 회원으로부터 제기되는 의견이나 불만이 정당하다고 객관적으로 인정될 경우에는 적절한 절차를
거쳐 즉시 처리하여야 합니다. 다만, 즉시 처리가 곤란한 경우는 회원에게 그 사유와 처리일정을 통보하여야
합니다.
제 11 조 (회원의 의무)
① 이용자는 회원가입 신청 또는 회원정보 변경 시 실명으로 모든 사항을 사실에 근거하여 작성하여야 하며,
허위 또는 타인의 정보를 등록할 경우 일체의 권리를 주장할 수 없습니다.
② 당 사이트가 관계법령 및 개인정보 보호정책에 의거하여 그 책임을 지는 경우를 제외하고 회원에게 부여된
ID의 비밀번호 관리소홀, 부정사용에 의하여 발생하는 모든 결과에 대한 책임은 회원에게 있습니다.
③ 회원은 당 사이트 및 제 3자의 지적 재산권을 침해해서는 안 됩니다.
제 4 장 서비스의 이용
제 12 조 (서비스 이용 시간)
① 서비스 이용은 당 사이트의 업무상 또는 기술상 특별한 지장이 없는 한 연중무휴, 1일 24시간 운영을
원칙으로 합니다. 단, 당 사이트는 시스템 정기점검, 증설 및 교체를 위해 당 사이트가 정한 날이나 시간에
서비스를 일시 중단할 수 있으며, 예정되어 있는 작업으로 인한 서비스 일시중단은 당 사이트 홈페이지를
통해 사전에 공지합니다.
② 당 사이트는 서비스를 특정범위로 분할하여 각 범위별로 이용가능시간을 별도로 지정할 수 있습니다. 다만
이 경우 그 내용을 공지합니다.
제 13 조 (홈페이지 저작권)
① NDSL에서 제공하는 모든 저작물의 저작권은 원저작자에게 있으며, KISTI는 복제/배포/전송권을 확보하고
있습니다.
② NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 상업적 및 기타 영리목적으로 복제/배포/전송할 경우 사전에 KISTI의 허락을
받아야 합니다.
③ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 보도, 비평, 교육, 연구 등을 위하여 정당한 범위 안에서 공정한 관행에
합치되게 인용할 수 있습니다.
④ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 무단 복제, 전송, 배포 기타 저작권법에 위반되는 방법으로 이용할 경우
저작권법 제136조에 따라 5년 이하의 징역 또는 5천만 원 이하의 벌금에 처해질 수 있습니다.
제 14 조 (유료서비스)
① 당 사이트 및 협력기관이 정한 유료서비스(원문복사 등)는 별도로 정해진 바에 따르며, 변경사항은 시행 전에
당 사이트 홈페이지를 통하여 회원에게 공지합니다.
② 유료서비스를 이용하려는 회원은 정해진 요금체계에 따라 요금을 납부해야 합니다.
제 5 장 계약 해지 및 이용 제한
제 15 조 (계약 해지)
회원이 이용계약을 해지하고자 하는 때에는 [가입해지] 메뉴를 이용해 직접 해지해야 합니다.
제 16 조 (서비스 이용제한)
① 당 사이트는 회원이 서비스 이용내용에 있어서 본 약관 제 11조 내용을 위반하거나, 다음 각 호에 해당하는
경우 서비스 이용을 제한할 수 있습니다.
- 2년 이상 서비스를 이용한 적이 없는 경우
- 기타 정상적인 서비스 운영에 방해가 될 경우
② 상기 이용제한 규정에 따라 서비스를 이용하는 회원에게 서비스 이용에 대하여 별도 공지 없이 서비스 이용의
일시정지, 이용계약 해지 할 수 있습니다.
제 17 조 (전자우편주소 수집 금지)
회원은 전자우편주소 추출기 등을 이용하여 전자우편주소를 수집 또는 제3자에게 제공할 수 없습니다.
제 6 장 손해배상 및 기타사항
제 18 조 (손해배상)
당 사이트는 무료로 제공되는 서비스와 관련하여 회원에게 어떠한 손해가 발생하더라도 당 사이트가 고의 또는 과실로 인한 손해발생을 제외하고는 이에 대하여 책임을 부담하지 아니합니다.
제 19 조 (관할 법원)
서비스 이용으로 발생한 분쟁에 대해 소송이 제기되는 경우 민사 소송법상의 관할 법원에 제기합니다.
[부 칙]
1. (시행일) 이 약관은 2016년 9월 5일부터 적용되며, 종전 약관은 본 약관으로 대체되며, 개정된 약관의 적용일 이전 가입자도 개정된 약관의 적용을 받습니다.