• Animal Systematics, Evolution and Diversity
• /
• 제38권4호
• /
• pp.274-278
• /
• 2022

One marine ciliate, Diophrys quadrinucleata Zhang et al., 2020 was newly recorded from South Korea in this study. We provided morphological diagnosis and images of the Korean D. quadrinucleata population. We determined the small subunit ribosomal DNA (SSU rDNA) and cytochrome oxidase subunit I (CO1) sequence data of D. quadrinucleata, and then the sequences were compared with other Diophrys species. Intra-specific variation between the Korean and type (Chinese) populations was identical in the SSU rDNA, while the inter-specific variations between seven Diophrys species were 0.3-3.8% in the SSU rDNA and 12.6-18.2% in the CO1. In this study, we obtained 18S and CO1 data from species with identified morphology. As the importance of securing 18S and CO1 based on morphology increases in current studies, this study will contribute to ciliate studies.

• 한국해양학회지:바다
• /
• 제12권3호
• /
• pp.225-233
• /
• 2007

Small subunit ribosomal RNA (18S rRNA)의 loop 부위들의 변이를 분석하여 해양 섬모충류의 종 특이 유전적 마커로써 이용 가능성을 확인하고자 9종의 Euplotes (Hypotrichia : Ciliophora)에 대하여 18S rRNA 유전자의 염기서열 변이성을 조사하였다. 연구 결과에 의하면 V1, V3 그리고 V5 부위는 종간 변이가 없었고, V7과 V8은 종간변이는 높으나 염기서열의 길이가 각각 44 bp와 79 bp로 길이가 짧아서 충분한 유전 정보를 가지기 어렵기 때문에이 부위들은 종특이 분자마커로 적합하지 않았다. 그러나 V2와 V4부위는 $1.75{\sim}20.61%$로 높은 변이성을 보여주었고 종간 계통 관계도 잘 나타내었다. 또한 염기서열의 길이도 각각 123 bp와 306 bp로 마커 개발에 충분한 길이를 가지고 있었다. 따라서 18S rRNA의 V2와 V4부위는 섬모충류의 종 특이 분자 마커 개발에 가장 적합한 부위라는 결론을 얻었다.