• 제목/요약/키워드: Hypocreales

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Characterization of Two Species of Acremonium (Unrecorded in Korea) from Soil Samples: A. variecolor and A. persicinum

  • Park, Se Won;Nguyen, Thuong T.T.;Lee, Hyang Burm
    • Mycobiology
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    • 제45권4호
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    • pp.353-361
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    • 2017
  • During a survey of fungal diversity of the order Hypocreales in Korea, two Acremonium isolates, CNUFC-1YSRS2-4 and CNUFC-GSNPF3-1, were isolated from soils collected on a bank of the Yeongsan River, Naju, and in a forest on the Mt. Daegak located on Sinsi Island, Gunsan, South Korea, respectively. Based on the morphological characteristics and sequence analysis of the internal transcribed spacer and D1/D2 domains of 28S ribosomal DNA, the isolates CNUFC-1YSRS2-4 and CNUFC-GSNPF3-1 were identified as A. variecolor and A. persicinum, respectively. These 2 species represent novel Hypocreales isolates in Korea.

Isolation and Characterization of Previously Undescribed Seventeen Fungal Species Belonging to the order Hypocreales in Korea

  • Jaeduk Goh;Yoosun Oh;Young-Hwan Park;Hye Yeon Mun;Sangkyu Park;Wonsu Cheon
    • 한국균학회지
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    • 제50권1호
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    • pp.1-29
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    • 2022
  • Hypocreales is one of the largest orders within the class Sordariomycetes in Ascomycota. Several species of this order are cosmopolitan and have a broad range of habitats. Here, we isolated several fungal strains from environmental samples, including freshwater sediment and plant litter. The strains were identified via molecular and phylogenetic analyses of rDNA and other DNA markers, such as TUB, RPB2, and EF1. The morphological characteristics of the fungi were investigated using microscopy, and culture characteristics were assessed from their growth on several media. We identified 17 species previously unrecorded in Korea: Dactylonectria hordeicola, Flavocillium bifurcatum, Fusarium luffae, Ilyonectria ilicicola, Ilyonectria qitaiheensis, Ilyonectria robusta, Lecanicillium aphanocladii, Nectria ulmicola, Neonectria lugdunensis, Ovicillium oosporum, Pseudonectria foliicola, Sarocladium spinificis, Scolecofusarium ciliatum, Trichoderma appalachiense, Trichoderma subviride, Trichoderma taiwanense, and Trichoderma tsugarense.

고창갯벌의 염생식물 뿌리로부터 분리된 내생진균의 다양성 (Diversity of Endophytic Fungi from the Roots of Halophytes Growing in Go-chang Salt Marsh)

  • 유영현;윤혁준;우주리;서영교;김미애;이경민;김종국
    • 한국균학회지
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    • 제40권2호
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    • pp.86-92
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    • 2012
  • 염생식물인 칠면초, 갈대, 갯질경, 해홍나물을 고창갯벌로부터 채집하였으며, 39점의 내생진균을 염 습지에 자생하고 있는 염생식물의 뿌리로부터 분리하였다. 내생진균들은 ITS1, 5.8s와 ITS2를 포함하는 ITS-rDNA 영역에 의해 분석되었다. 다양한 내생진균은 Eurotiales (36%), Pleosporales (26%), Hypocreales (18%), Incertae sedis (8%), Glomerellales (5%), Sordariales (2%), Xylariales (2%), Capnodiales (3%)등 8종류 목에 속하는 것으로 확인되었다. 39점의 내생진균은 속(genus)단계에서 Alternaria, Aspergillus, Chaetomium, Cladosporium, Colletotrichum, Coniothyrium, Dothideomycete, Fusarium, Gibberella, Macrophoma, Penicillium, Pestalotiopsis, Phaeosphaeria, Phoma, Pleosporales, Pseudozyma, Talaromyces, 그리고 Termitomyces에 포함되는 것으로 분석되었다. 그리고 내생진균은 Eurotiales목의 Penicillium속이 가장 많이 분포하고 있는 것으로 분석되었다.

신두리 해안사구에 자생하는 사구식물 내생진균의 다양성 분석 (Endophytic Fungal Diversity Associated with the Roots of Coastal Sand-dune Plants in the Sindu-ri Coastal Sand Dune, Korea)

  • 유영현;서영교;윤혁준;김현;김예은;이리나 할무라토바;임순옥;김창무;김종국
    • 한국미생물·생명공학회지
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    • 제41권3호
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    • pp.300-310
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    • 2013
  • 98주의 내생진균은 신두리 해안사구에 자생하고 있는 해안사구식물의 뿌리로부터 분리하였다. 8종의 해안사구식물 샘플은 모래지치(Argusia sibirica), 갯메꽃(Calystegia soldanella), 갯그령(Elymus mollis), 반디지치(Lithospermum zollingeri), 갯무(Raphanus sativus), 솔장다리(Salsola collina), 왕잔디(Zoysia macrostachya) 및 갯잔디(Zoysia sinica)이며, 신두리 해안사구로부터 채집되었다. 그리고 분리된 내생진균들은 ITS1, 5.8S와 ITS2를 포함하는 ITS-rDNA 영역에 의해 분석되었다. 해안사구식물로부터 분리된 내생진균에 대하여 다양한 지수를 적용하여 분석하였다. 해안사구식물로부터 분리된 모든 내생진균은 Capnodiales (3.09%), Eurotiales (70.10%), Glomerellales (1.03%), Helotiales (3.09%), Hypocreales (9.28%), Mortierellales (2.06%), Onygenales (1.03%), Ophiostomatales (1.03%), Pleosporales (1.03%), Polyporales (1.03%), Russulales (1.03%), Saccharomycetales (2.06%), Xylariales (1.03%)로 13개 목과 분류체계가 명확하지 않은 Incertae sedis (3.09%)으로 확인되었다. 본 연구에서는 8종의 식물로부터 내생진균을 분석한 결과 Eurotiales 목과 Hypocreales 목의 Penicillium 속(59.18%)과 Fusarium속 (5.10%)이 가장 많이 분포하는 것으로 나타났다. 갯메꽃으로부터 분리된 내생진균이 다른 해안사구식물들로부터 분리된 내생진균의 다양성 보다 높은 것으로 확인되었다.

태안반도에 자생하는 해안식물 뿌리에서 분리한 내생진균의 다양성 분석 (Diversity Analysis of Endophytic Fungi Isolated from the Roots of Coastal Plants in Taean Peninsula)

  • 유영현;윤남경;윤혁준;김현;임성환;추연식;김종국
    • 한국균학회지
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    • 제42권1호
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    • pp.79-85
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    • 2014
  • 태안반도에 자생하는 해안식물인 해국(Aster sphathulifolius Maxim.), 갯개미취(Aster tripolium L.), 갈대(Phragmites australis), 갯꾸러미풀(Puccinellia nipponica Ohwi) 의 뿌리로부터 총 42주의 내생진균이 분리되었다. 그리고 분리된 내생진균의 ITS지역의 염기서열을 이용하여 동정한 결과 모두 자낭균문에 속하며, 8종류의 목(Botryosphaeriales, Capnodiales, Diaporthales, Dothideales, Eurotiales, Helotiales, Hypocreales, and Pleosporales)과 13종류의 속(Alternaria, Aureobasidium, Cadophora, Cladosporium, Davidiella, Diaporthe, Fusarium, Gibberella, Macrophomina, Metarhizium, Neosartorya, Penicillium, and Phoma)으로 분류되었으며, Eurotiales목의 Penicillium속의 분포비율이 가장 높게 존재하였다. Shannon 다양성지수를 비교한 결과 4종의 해안식물 중 갯개미취에서 분리한 내생진균의 다양성이 가장 높게 확인되었다.

Simultaneous detection of fungal, bacterial, and viral pathogens in insects by multiplex PCR and capillary electrophoresis

  • Kwak, Kyu-Won;Nam, Sung-Hee;Choi, Ji-Young;Lee, Seokhyun;Kim, Hong Geun;Kim, Sung-Hyun;Park, Kwan-Ho;Han, Myung-Sae
    • International Journal of Industrial Entomology and Biomaterials
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    • 제30권2호
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    • pp.64-74
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    • 2015
  • Beetles Protaetia brevitarsis seulensis Kolbe (Coleoptera: Cetoniidae) and Allomyrina dichotoma Linn. (Coleoptera: Scarabaeidae) are widely used in traditional medicine, and the number of insect-rearing farms is increasing in South Korea. The purpose of this study was to establish a multiplex PCR-based assay for rapid simultaneous detection of multiple pathogens causing insect diseases. Six insect parasites such as fungi Beauveria bassiana (Bals.-Criv.) Vuill. (Hypocreales: Cordycipitaceae) and Metarhizium anisopliae (Metschn.) Sorokin (Hypocreales: Clavicipitaceae), bacteria Bacillus thuringiensis Berliner (Bacillales: Bacillaceae), Pseudomonas aeruginosa Migula (Pseudomonadales: Pseudomonadaceae), and Serratia marcescens Bizio (Enterobacteriales: Enterobacteriaceae), and Oryctes rhinoceros nudivirus were chosen based on the severity and incidence rate of insect diseases in South Korea. Pathogen-specific primers were designed and successfully applied for simultaneous detection of multiple infectious agents in farm-bred insects P. b. seulensis and A. dichotoma using multiplex PCR and high resolution capillary electrophoresis. Our results indicate that multiplex PCR is an effective and time-saving method for simultaneous detection of multiple infections in insects, and the QIAxcel capillary electrophoresis system is useful for quantitative evaluation of the individual impact of each infectious agent on the severity of insect disease. The approach designed in this study can be utilized for rapid and accurate diagnostics of infection in insect farms.

Diversity of Culturable Soil Micro-fungi along Altitudinal Gradients of Eastern Himalayas

  • Devi, Lamabam Sophiya;Khaund, Polashree;Nongkhlaw, Fenella M.W.;Joshi, S.R.
    • Mycobiology
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    • 제40권3호
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    • pp.151-158
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    • 2012
  • Very few studies have addressed the phylogenetic diversity of fungi from Northeast India under the Eastern Himalayan range. In the present study, an attempt has been made to study the phylogenetic diversity of culturable soil fungi along the altitudinal gradients of eastern Himalayas. Soil samples from 24 m above sea level to 2,000 m above sea level altitudes of North-East India were collected to investigate soil micro-fungal community structure and diversity. Molecular characterization of the isolates was done by PCR amplification of 18S rDNA using universal primers. Phylogenetic analysis using BLAST revealed variation in the distribution and richness of different fungal biodiversity over a wide range of altitudes. A total of 107 isolates were characterized belonging to the phyla Ascomycota and Zygomycota, corresponding to seven orders (Eurotiales, Hypocreales, Calosphaeriales, Capnodiales, Pleosporales, Mucorales, and Mortierellales) and Incertae sedis. The characterized isolates were analysed for richness, evenness and diversity indices. Fungal diversity had significant correlation with soil physico-chemical parameters and the altitude. Eurotiales and Hypocreales were most diverse and abundant group of fungi along the entire altitudinal stretch. Species of Penicillium (D=1.44) and Aspergillus (D=1.288) were found to have highest diversity index followed by Talaromyces (D=1.26) and Fusarium (D=1.26). Fungal distribution showed negative correlation with altitude and soil moisture content. Soil temperature, pH, humidity and ambient temperature showed positive correlation with fungal distribution.

태안반도에 자생하는 염생식물의 뿌리로부터 분리한 내생 진균의 다양성 (Endophytic Fungal Diversity Isolated from the Root of Halophytes in Taean Peninsula)

  • 유영현;이명철;김종국
    • 한국균학회지
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    • 제42권4호
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    • pp.269-275
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    • 2014
  • 7종의 자생 염생식물은 천일사초, 갯질경, 퉁퉁마디, 나문재, 칠면초, 해홍나물, 그리고 지채로서 태안반도에서 채집되었다. 염생식물의 뿌리로부터 분리된 37균주의 내생진균은 ITS영역 염기서열에 대하여 분석하였다. 모든 내생진균들은 다양성 지수들을 이용하여 분석되었다. 분리된 내생진균은 Eurotiales (78%), Capnodiales (5%), Hypocreales (5%), Agaricales (3%), Corticiales (3%), Glomerellales (3%), Pleosporales (3%)으로 7개 목으로 분류되었다. 그리고 분리된 내생진균의 속을 분석한 결과 자낭균문과 담자균문에 포함되는 Alternaria, Aspergillus, Cladosporium, Paecilomyces, Penicillium, Phanerochaete, Schizophyllum, Talaromyces, Verticillium등 9개 속으로 분류되었다. 내생진균을 분석하였을 때, Penicillium이 염생식물로부터 가장 많이 분포하고 있었다. 본 연구는 태안반도에 자생하는 염생식물들에 대한 내생진균의 분포와 다양성을 분석하였다.

국내 기수역 환경의 균류 다양성 (Diversity of Fungi in Brackish Water in Korea)

  • 전유정;고재덕;문혜연
    • 한국균학회지
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    • 제48권4호
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    • pp.457-473
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    • 2020
  • 본 연구에서는 국내 기수 환경의 물과 토양에서 균류의 다양성을 확인하기 위해 을숙도, 금강하구둑, 순천만습지, 대호방조제, 신두리사구 및 부남방조제 총 6지점의 현장조사 및 시료를 채집하였다. 현장에서 여과한 담수시료와 담수퇴적물로부터 곰팡이를 순수분리하여 PDA배지에 접종한 후 25℃에서 배양하였다. 기수역 시료에서 순수분리된 균주는 총 173균주로 ITS 부분을 분석하여 속 수준으로 동정하였다. 분리 동정된 균주를 다양성 지수를 이용하여 분석하였다. 분리된 균류는 Pleosporales, Eurotiales, Capnodiales, Hypocreales, Polyporales, Saccharomycetales, Agaricales, Glomerellales, Mucorales, Dothideales, Russulales, Xylariales, Sordariales, Myrmecridiales, Tubeufiales, Onygenales, Cantharellales, Amphisphaeriales 목에 속하며 Cladosporium속이 20%로 가장 우점하며, 그 다음은 Penicillium (19%), Fusarium (5%)의 순서로 많이 분포하였다. Sarocladium kiliense NNIBRFG3280와 Fusicolla merismoides NNIBRFG23708를 국내 기수환경에서 발굴하였으며, 이를 국내 미기록종으로 보고하고자 한다.

전자현미경적 관찰에 의한 말레이지아산 목재부후균 Hypocrea microrufa의 특징 (Distinctive Features of Hypocrea microrufa, Wood Decay Fungi, from Malaysia as Revealed Scanning Electron Microscopy)

  • 이양수
    • 한국균학회지
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    • 제27권5호
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    • pp.341-344
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    • 1999
  • 점버섯목의 점버섯속은 자낭각을 지닌 노란색이나 탁한 황토색의 자좌를 형성하며, 각진 입방형의 자낭포자를 지닌다. 열대지역인 말레이지아에서 발견된 Hypocrea microufa를 형태적으로 유사한 H. rufa, H. microsplendens와 비교하여 동정하였다. 본 H. microrufa는 열대지방에서는 최초로 발견 기록되며, 또한 전자현미경을 이용한 최초의 보고이다. 전자현미경을 이용한 자낭포자의 표면무늬도 검색표의 주된 분류 동정기준으로 사용하였다.

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