• 제목/요약/키워드: HyperChem

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트립탄 유도체의 구조적 특성에 관한 이론적 연구 (Theoretical Study on Structural Properties of Triptan Derivatives)

  • 이철재;남기영
    • 문화기술의 융합
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    • 제9권4호
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    • pp.503-508
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    • 2023
  • 트립탄 유도체는 급성 편두통을 치료하는 물질로 크로마토그래피, 전기화학, 분광학 및 모세관 전기영동학 등의 분석법과 관련된 연구가 많이 진행되었다. 최근 분석화학자들의 약물 분석과 생물학적 중요성에 대한 근본적인 문제 해결에 더욱 관심이 깊어지고 있다. 따라서 본 연구에서는 트립탄 유도체의 분자단위 수준의 구조적 특성을 알아보기 위하여 HyperChem8.0의 반경험적 PM3 방법을 이용하여 수마트립탄, 리자트립탄, 나라트립탄 그리고 엘레트립탄의 전체에너지, 밴드갭, 정전포텐셜, 전하량을 계산하여 각 유도체의 분자 구조적 변화에 따른 화학적 특성을 조사하였다. 본 연구의 결과 수마트립탄, 나라트립탄 그리고 엘레트립탄의 경우 황 원자에 결합된 산소와 질소 원자를 중심으로 화학작용이 진행될 것으로 예상된다. 또한, 황원자가 없는 리자트립탄의 경우는 5원헤테로 고리화합물의 17, 19번 질소에서 화학작용이 진행될 것으로 나타났다.

착물을 형성하는 가지달린 사슬형 아미노포스린류 리간드에 대한 이론적 연구 (Theoretical Studies of Diphosphinoaminoethane Ligands with Methyl Group)

  • 이철재;김동엽;정맹준
    • 한국산업융합학회 논문집
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    • 제15권4호
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    • pp.95-101
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    • 2012
  • In order to explain observed catalytic reactivity of aminophosphine complexes (seven-membered chelate), total energy, net charge, atomic orbital electron population, HOMO and LUMO energy of free ligands are calculated by PM3 methods of HyperChem 6.0. Free ligands are 1,2-bis{(diphosphino)amino}propane{$H_2PNHCH_2CH(CH_3)NHPH_2$;ligand 1},1,2-bis{(dimenylphosphino)amino}propane{$(CH_3)_2PNHCH_2CH(CH_3)NHP(CH_3)_2$;ligand 2},1,2-bis{(diphenylphosphino)amino}propane{$(C_6H_5)_2PNHCH_2CH(CH_3)NHP(C_6H_5)_2$;ligand 3}. The result showed that ligand 3 is stable than ligand 2 and ligand 1 and ligand 2 is stable than ligand 1 in total energy. Net charge of P atom is changed by H atom, methyl groups and phenyl groups in P atoms. Net charge of N atoms in ligands is nagative. The results of atomic orbital electron population are similar net charge data..

The effective model of the human Acetyl-CoA Carboxylase inhibition by aromatic-structure inhibitors

  • Minh, Nguyen Truong Cong;Thanh, Bui Tho;Truong, Le Xuan;Suong, Nguyen Thi Bang;Thao, Le Thi Xuan
    • 전기전자학회논문지
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    • 제21권3호
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    • pp.309-319
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    • 2017
  • The research investigates the inhibition of fatty acid biosynthesis of the human Acetyl-CoA Carboxylase enzyme by the aromatic-structure inhibitors (also known as ligands) containing variables of substituents, contributing an important role in the treatment of fatty-acid metabolic syndrome expressed by the group of cardiovascular risk factors increasing the incidence of coronary heart disease and type-2 diabetes. The effective interoperability between ligand and enzyme is characterized by a 50% concentration of enzyme inhibitor ($IC_{50}$) which was determined by experiment, and the factor of geometry structure of the ligands which are modeled by quantum mechanical methods using HyperChem 8.0.10 and Gaussian 09W softwares, combining with the calculation of quantum chemical and chemico-physical structural parameters using HyperChem 8.0.10 and Padel Descriptor 2.21 softwares. The result data are processed with the combination of classical statistical methods and modern bioinformatics methods using the statistical softwares of Department of Pharmaceutical Technology - Jadavpur University - India and R v3.3.1 software in order to accomplish a model of the quantitative structure - activity relationship between aromatic-structure ligands inhibiting fatty acid biosynthesis of the human Acetyl-CoA Carboxylase.

Phenylcyclohexylamine의 정량적 구조-작용 상관관계에 관한 연구 (Quantitative Structure-Activity Relationship Study on Phenylcyclohexylamine)

  • 김자홍;손성호;양기수;홍성완
    • 대한화학회지
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    • 제42권4호
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    • pp.378-382
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    • 1998
  • Phenylcyclohexylamine과 dexoxadrol에 대한 정량적 구조-작용 상관관계에 관한 계산을 반경험적 분자궤도법인 PM3와 Hyper Chem 프로그램을 이용하여 수행하였다. 19개의 PCA 유도체들의 프론티어 오비탈 크기와 LogP 값은 운동에 영향을 미치는 독성과 MES 발작 실험에서 $MES\;ED_{50}$$TD_{50}$을 예측하는 좋은 매개 변수라는 사실을 알았다.

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안토시아닌 유도체의 전기적 특성에 대한 이론적 연구 (Theoretical Studies on the Electrical Characteristics of the Anthocyanin Derivatives)

  • 이철재;최정원;장운근
    • 문화기술의 융합
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    • 제4권4호
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    • pp.343-348
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    • 2018
  • 안토시아닌 유도체는 다수의 식물에서 적색, 보라색 및 청색을 나타내는 천연 화합물의 중요한 성분이다. 안토시아닌 분자는 2-페닐 벤조피릴리움 염의 폴리메톡시 유도체이다. 안토시아닌의 유익한 특성에도 불구하고 다양한 질병을 예방하거나 치료하는 효과는 생체 이용률에 달려 있다. 따라서 이 연구에서는 안토시안 유도체의 전기적 특성을 알아보기 위해 HyperChem8.0의 PM3 방법을 이용하여 안토시아닌 유도체의 총 에너지, 밴드갭, 정전포텐셜, 알짜 전하량을 계산하여 유도체의 전기화학적 특성을 조사 하였다.

페네틸아민 유도체의 구조적 특성에 관한 이론적 연구 (Theoretical Study on Structural Properties of Phenthylamine Derivatives)

  • 이철재
    • 문화기술의 융합
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    • 제6권4호
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    • pp.761-766
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    • 2020
  • 페네틸아민 유도체는 생화학적 작용을 하는 물질로 향정신성 약물로 많이 응용되고 있다. 특히 에페드린, 암페타민, 펜터마인 그리고 도파민과 같은 물질의 정량적 검출과 관련해서는 전기화학적, 진공자외선법, 그리고 가스크로마토그래피법 등의 선행연구가 많이 진행되었다. 그러나 분자 단위의 구조적 특성에 따른 연구는 많이 보고되지 않았다. 따라서 이 연구에서는 페네틸아민 유도체의 구조적 특성을 알아보기 위하여 (HyperChem8.0, HC)의 반경험적 PM3 방법을 이용하여 에페드린, 암페타민, 펜터마인 그리고 도파민의 전체에너지, 밴드갭, 정전포텐셜, 전하량을 계산하여 각 유도체의 분자구조적 변화에 따른 화학적 특성을 조사하였다. 그 결과 총에너지의 경우 -43,171.8, -32,9538.3, -36,407.3 그리고 -43,061.2 Kcal/mol로 각각 나타났으며 밴드 갭의 경우 10.1637937, 9.9531666, 9.7878002 그리고 9.0589282 eV로 나타났다. 또한, 정전포텐셜의 경우 1.301~-0.045, 1.694~0.299, 0.694~-0.158 그리고 1.587~-0.048로 각각 나타났다. 마지막으로 알짜전하 분포를 살펴보면 산소 원자, 질소 원자 그리고 탄소 원자의 경우 각각 -0.312~-0.242, -0.161~-0.051 그리고 +0.13~-0.12로 나타났다. 이와 같은 결과는 페네틸아민 유도체에 공통으로 존재하는 페닐기와 산소 및 질소 원자를 중심으로 화학작용이 진행될 것으로 예상한다.

멜라토닌의 특성에 대한 이론적 연구 (Theoretical Study for the Characteristics of Melatonin)

  • 김동엽;정맹준;이철재
    • 한국산업융합학회 논문집
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    • 제15권2호
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    • pp.59-63
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    • 2012
  • Melatonin has been studied as a potential treatment of cancer, immune disorders, cardiovascular diseases, depression, seasonal affective disorder (SAD), circadian rhythm sleep disorders, sexual dysfunction and some forms of insomnia. Prolonged release melatonin has shown good results in treating insomnia in older adults. It may ameliorate circadian misalignment and SAD. Basic research indicates that melatonin may play a significant role in modulating the effects of drugs of abuse such as cocaine. A 2004 review found that melatonin significantly increased total sleep time in people suffering from sleep restriction. Therefore, in this study, in order to explain characteristics of melatonin, total energy, net charge, vibrational mode of melatonin are calculated by PM3 methods of HyperCam 6.0.

피나스테라이드의 특성에 대한 이론적 연구 (Theoretical Study for the Characteristics of Finasteride)

  • 이철재;정맹준;김동엽
    • 한국산업융합학회 논문집
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    • 제16권3호
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    • pp.69-74
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    • 2013
  • Finasteride, ($5{\alpha}$, $17{\beta}$)-N-(1,1-dimethylethyl)-3-oxo-4-azaandrost-1-ene-17-carboxamide), is a 5a-reductase enzyme inhibitor. This enzyme converts testosterone to the more potent androgen, a-dihydrotestosterone. This molecules a logical medical treatment for benign prostatic hyperplasia (BPH), as it induced a reduction in serum dihydrotestosterone and prostatic specific antigen levels with a concomittant increase in blood testosterone concentration . Despite its widespread use, little has been published concerning its molecular properties. Therefore, in this study, in order to explain characteristics of finasteride, total energy, net charge, vibrational mode of melatonin are calculated by PM3 methods of HyperCam 8.0.

머신러닝 기법을 활용한 LDPE 공정의 이상 감지 (Fault Detection in LDPE Process using Machine Learning Techniques)

  • 이창송;이규황;이호경
    • Korean Chemical Engineering Research
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    • 제58권2호
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    • pp.224-229
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    • 2020
  • 머신러닝 기법을 활용하여 LDPE (Low Density Polyethylene) 공정의 이상을 사전 감지하고, 설비의 수명을 예측할 수 있는 기술을 소개한다. 안전성과 생산성 극대화를 위해, 화학 공정의 예상치 못한 이상을 사전에 감지하고 예방하는 것은 매우 중요하다. LDPE 공정은 3,000 kg/㎠g 이상까지 승압되는 고압 공정이기 때문에, ESD (Emergency Shutdown)가 발생하면 예상치 못한 부동이 발생하고, 그에 따른 보수 기간 증가로 인한 생산성 손실이 발생한다. 고압 공정의 주요 변수들의 운전 데이터를 수집하고, 비지도학습 머신러닝 기술을 활용하여, ESD의 사전 감지 모형을 개발하였다. 4회의 ESD를 2.4일 전에 감지하는 결과를 얻을 수 있었다. 더불어, 물리적으로 의미 있는 핵심 변수들을 활용하면, 고압 설비의 수명을 예측할 수 있음을 확인할 수 있었다.

Classification and Regression Tree Analysis for Molecular Descriptor Selection and Binding Affinities Prediction of Imidazobenzodiazepines in Quantitative Structure-Activity Relationship Studies

  • Atabati, Morteza;Zarei, Kobra;Abdinasab, Esmaeil
    • Bulletin of the Korean Chemical Society
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    • 제30권11호
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    • pp.2717-2722
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    • 2009
  • The use of the classification and regression tree (CART) methodology was studied in a quantitative structure-activity relationship (QSAR) context on a data set consisting of the binding affinities of 39 imidazobenzodiazepines for the α1 benzodiazepine receptor. The 3-D structures of these compounds were optimized using HyperChem software with semiempirical AM1 optimization method. After optimization a set of 1481 zero-to three-dimentional descriptors was calculated for each molecule in the data set. The response (dependent variable) in the tree model consisted of the binding affinities of drugs. Three descriptors (two topological and one 3D-Morse descriptors) were applied in the final tree structure to describe the binding affinities. The mean relative error percent for the data set is 3.20%, compared with a previous model with mean relative error percent of 6.63%. To evaluate the predictive power of CART cross validation method was also performed.