• Animal Bioscience
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• 제35권8호
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• pp.1141-1150
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• 2022

Objective: To understand the domestication and spread of horses in history, genetic information is essential. However, mitogenetic traits of ancient or medieval horses have yet to be comprehensively revealed, especially for East Asia. This study thus set out to reveal the maternal lineage of skeletal horse remains retrieved from a 15th century archaeological site (Gongpyeongdong) at Old Seoul City in South Korea. Methods: We extracted DNA from the femur of Equus caballus (SNU-A001) from Joseon period Gongpyeongdong site. Mitochondrial (mt) DNA (HRS 15128-16116) of E. caballus was amplified by polymerase chain reaction. Cloning and sequencing were conducted for the mtDNA amplicons. The sequencing results were analyzed by NCBI/BLAST and phylogenetic tool of MEGA7 software. Results: By means of mtDNA cytochrome b and D-loop analysis, we found that the 15th century Korean horse belonged to haplogroup Q representing those horses that have historically been raised widely in East Asia. Conclusion: The horse is unique among domesticated animals for the remarkable impact it has on human civilization in terms of transportation and trade. Utilizing the Joseon-period horse remains, we can obtain clues to reveal the genetic traits of Korean horse that existed before the introduction of Western horses.

• 헤리티지:역사와 과학
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• 제41권1호
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• pp.99-108
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• 2008

1980년대 이후 전 세계적으로 발굴지에서 출토되는 인골 분석에 대한 고고학적 중요성이 증가하면서 인골의 자연과학적 연구가 활발히 진행되고 있다. 국내에서도 출토 인골의 고고유전학 연구가 점차 활성화 되어감에 따라 고대 DNA 연구를 위한 주요 방법 및 기술적 지식의 축적이 이루어지고 있다. 인골의 보존 상태는 매장환경과 밀접하게 연관되어 있는데 국내에서 출토되는 인골, 동물 뼈 등과 같은 생물유체의 보존 상태가 좋지 못한 주요 원인은 우리나라의 토성(土性) 및 기후적인 특성 때문이다. 그러나 조선시대 회곽묘(灰槨墓)에서는 대체로 보존 상태가 좋은 인골이 출토되고 있는데, 이는 회곽의 구조적 화학적 특성에서 기인된 것이다. 이것은 묘제(墓制)와 장법(葬法)이 피장자(埋葬者)의 매장 환경을 조절함으로써 인골이 잘 보존 될 수 있음을 보여주는 좋은 사례이다. 인골의 미생물에 의한 오염, 물리 화학적 손상 등 다양한 원인은 고대 DNA 분석에 많은 영향을 미치기 때문에 이를 효과적으로 제거할 수 있는 DNA 분석법이 요구된다. 특히, 고대 DNA가 사람 DNA에 의하여 오염되지 않았음을 증명하기 위한 실험 절차가 체계적으로 검증되어야만 연구결과의 신뢰성을 확보할 수 있다. 우리나라 고대 인류의 이동과 그들의 문화를 이해하기 위하여 고대 DNA 분석과 더불어 안정동위원소를 이용한 인골의 골화학 분석 등 인골에 대한 자연과학적 분석이 종합적으로 병행되어야 한다. 더불어 출토 인골의 고고유전학 연구는 형질인류학, 고고학과 같은 인문사회학적 연구와 동시에 수행될 때 가장 좋은 양질의 결과를 얻을 수 있으며 이러한 학제 간 연구는 더욱더 활성화 되어야 한다. 본고는 출토 인골 연구의 학문적 가치와 종합연구의 필요성을 자연과학적 연구의 입장에서 강조하였다. 또한 출토 인골의 DNA 연구 방법과 그 결과를 예로 소개함으로써 고고유전학 연구에 대한 이해를 돕고자 하였다.

• Journal of Ginseng Research
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• 제43권4호
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• pp.580-588
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• 2019

Background: Ginsenoside Rg1 has been shown to clear senescence-associated beta-galactosidase (SA-${\beta}$-gal) in cultured cells. It remains unknown whether Rg1 can influence SA-${\beta}$-gal in exercising human skeletal muscle. Methods: To examine SA-${\beta}$-gal change, 12 young men (age $21{\pm}0.2years$) were enrolled in a randomized double-blind placebo controlled crossover study, under two occasions: placebo (PLA) and Rg1 (5 mg) supplementations 1 h prior to a high-intensity cycling (70% $VO_{2max}$). Muscle samples were collected by multiple biopsies before and after cycling exercise (0 h and 3 h). To avoid potential effect of muscle biopsy on performance assessment, cycling time to exhaustion test (80% $VO_{2max}$) was conducted on another 12 participants (age $23{\pm}0.5years$) with the same experimental design. Results: No changes of SA-${\beta}$-gal were observed after cycling in the PLA trial. On the contrary, nine of the 12 participants showed complete elimination of SA-${\beta}$-gal in exercised muscle after cycling in the Rg1 trial (p < 0.05). Increases in apoptotic DNA fragmentation (PLA: +87% vs. Rg1: +133%, p < 0.05) and $CD68^+$ (PLA:+78% vs. Rg1:+121%, p = 0.17) occurred immediately after cycling in both trials. During the 3-h recovery, reverses in apoptotic nuclei content (PLA:+5% vs. Rg1 -32%, p < 0.01) and increases in inducible nitrate oxide synthase and interleukin 6 mRNA levels of exercised muscle were observed only in the Rg1 trial (p < 0.01). Conclusion: Rg1 supplementation effectively eliminates senescent cells in exercising human skeletal muscle and improves high-intensity endurance performance.

• 대한의생명과학회지
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• 제7권2호
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• pp.59-64
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• 2001

Nebulin is an unusually large actin-binding protein specific to the skeletal muscle of vertebrates. The correlation of nebulin size with thin filament length have led to the suggestion that nebulin acts as a molecular ruler for the length of thin filaments. An SH3 domain occupies the C terminus of nebulin, in the sarcomeric Z-disk and is preceded by a 120-residue stretch containing multiple putative phosphorylation sites. SH3 domain mediates protein-protein interaction involved in the subcellular localization of proteins, cytoskeletal organization and signal transduction. However the binding partner and physiological role of nebulin SH3 domains remains unknown. Using the yeast two-hybrid system, we identified supervillin, an actin-binding protein, as a nebulin SH3 domain-interacting protein. The SH3 domain of nebulin binds to the sequence encoding amino acids 977 to 1335 of supervillin. But the sequence encoding amino acids 977 to 1335 displays weaker binding than the sequence encoding amino acids 977 to 1788.

• 한국동물학회지
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• 제31권4호
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• pp.295-299
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• 1988

An endogenous 17-6a inhibitor of Caa+_activated protease has been purified from neo-plastic tissues of human stomach using heat treahent and conventional chromatographir procedures. It appears to consist of a single polvpeptide since the same molecular weight was obtained by both gel fntration under nondenaturing condition and gel electrophoresis in the presence of SDS. Since the size of the inhibitor or is the smallest amens those reported so far, it may represent a functional unit for inhibiting Caa+_activated protease. This protein is also capable of inhibiting the protease isolated loom chick skeletal muscle. Thus, the functional unit of the inhibitor most well be conserved during evolution. Howrver, it remains unclear what may be the physiological significance of the presence of the Iow-molecular weight form of the inhibitor in neoplastic tissues of human stomach. 사람의 위암조직으로부터 Ca2)_activated protease을 저해하는 단백질을 열처리 및 여러 크로마토그라피 방법을 이용하여 순수분리 하였다. 이 저해단백질은SDS-전기영동카자1 filtra-tion의 방법에 의하여 그 분자량이 17 kDa으로 나타남으로 보아 단일 Polypeptide로 구성되어 있음을 알 수 있었다. 이 저해 단백질의 분자량은 지금까지 알려진 CaB+_activated protease의 저해단백질에 비하여 가장 작은 것이었다. 따라서, 이 단.백질은 Ca2)에 의하여 활성화되는 단백질 분해효소의 작용을 저해하는 기능적 단위로 추측되었다. 한편, 이 저해제는 계 골격근에서 추출한 Ca2+ _activated protease의 촹성 도 억제 하는 것으로 나타났다. 이러 한 결과는 이 저 해 단백질의 기능적 단위가 진화과정 동안 오래 보존되어 왔음을 시사한다. 그러나, 사람의 위암조직에서 이 저해제가 무슨 이유로 가장 작은 분자량의 단백질로 존재하는지에 대한 생리학적 중요성에 관한 문제는 앞으로 많이 연구되어져 야 할 것이다.

• Molecules and Cells
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• 제41권6호
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• pp.575-581
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• 2018

Postmenopausal osteoporosis (PMOP) is a common systemic skeletal disease characterized by reduced bone mass and microarchitecture deterioration. Although differentially expressed SOX5 has been found in bone marrow from ovariectomized mice, its role in osteogenic differentiation in human mesenchymal stem cells (hMSCs) from bone marrow in PMOP remains unknown. In this study, we investigated the biological function of SOX5 and explore its molecular mechanism in hMSCs from patients with PMOP. Our findings showed that the mRNA and protein expression levels of SOX5 were upregulated in hMSCs isolated from bone marrow samples of PMOP patients. We also found that SOX5 overexpression decreased the alkaline phosphatase (ALP) activity and the gene expression of osteoblast markers including Collagen I, Runx2 and Osterix, which were increased by SOX5 knockdown using RNA interference. Furthermore, $TNF-{\alpha}$ notably upregulated the SOX5 mRNA expression level, and SOX5 knockdown reversed the effect of $TNF-{\alpha}$ on osteogenic differentiation of hMSCs. In addition, SOX5 overexpression increased Kruppel-like factor 4 (KLF4) gene expression, which was decreased by SOX5 silencing. KLF4 knockdown abrogated the suppressive effect of SOX5 overexpression on osteogenic differentiation of hMSCs. Taken together, our results indicated that $TNF-{\alpha}$-induced SOX5 upregulation inhibited osteogenic differentiation of hMSCs through KLF4 signal pathway, suggesting that SOX5 might be a novel therapeutic target for PMOP treatment.

• Journal of Nutrition and Health
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• 제21권4호
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• pp.242-252
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• 1988

Branched-chain 아미노산이인 leucine이 골격근육의 단백질 합성을 촉진하는 요소로 보고되어 왔다. 이러한 역할은 다른 아미노산도 나타낼 수 없는 특이한 것이나 생체로부터 분리된 근육(isolated muscle system)에서 라는 제한된 실험조건하에 얻어진 결과에 바탕하므로, 본 연구는 생체내에서 leucine이 단백질의 생합성에 미치는 영향을 조사하고자 시도되었다. 실험동물은 정상으로 먹이를 먹인 또는 하루 굶게된 주로 leucine군과 비교군으로 나누었다. Leucine군은 80 또는 $160\mu\textrm{moles}$의 leucine을 복강으로 한번 주사하여 주입받았고 비교군에는 생리적 식염수를 같은 방법으로 주입했다. 단백질 합성속도는 $^{14}\textrm{C}-tyrosine을 주사한 후 근육의 단백질에 혼입된 $^{14}\textrm{C}의 량으로 측정하였다. 본 연구에 이용된 근육은 두가지 형태의 뒷다리 근육 즉 oxidative형 soleus와 glycolytic형 extensor digitorium longus(EDL)와 plataris근육이었다. 만 하루 굶게된 뒤의 EDL과 plantaris 근육은 $160\mu\textrm{moles}$의 leucine에 의해 단백질 합성 속도가 24%, 29% 씩 각각 상승했다. 하루 굶게된 쥐의 soleus근육과 정상으로 먹인 쥐의 어느 근육도 첨가된 leucine에 대해 반응을 보이지 않았다. Leucine에 의해 단백질 합성 속도가 상승된 근육은 굶게되므로 합성속도가 정상군의 54%로 떨어졌고 soleus근육은 정상군의 78%에 상당한 단백질 합성 능력을 가지고 있었다. 따라서 생체로부터 분리된 근육에서 동물의 영양상태나 홀몬 분비의 정상여부에 관계없이 leucin이 단백질 생합성 속도를 상승시키는 현상은 생체내에서 재현되지 않았다. 본 연구결과는 식이 제한등으로 인한 스트레스에 민감하게 반응하여 근육내 생성 활동이 저하된 특수한 상태에서만 leucine은 골격근육의 질소 보유능력을 상승시키리라는 것을 시사한다.

• 대한의생명과학회지
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• 제13권1호
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• pp.1-10
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• 2007

Nebulin, a giant modular protein from muscle, is thought to act as molecular ruler in sarcomere assembly. In skeletal muscle, the C-terminal ${\sim}50 kDa$ region of nebulin extends into the Z-line lattice. The most recent studies implicated highlighting its extensive isoform diversity and exciting reports revealed its expression in cardiac and non-muscle tissues containing brain. Also these novel findings are indicating that nebulin is actually a multifunctional filament system, perhaps playing roles in signal transduction, contractile regulation, and myofibril force generation, as well as other not yet defined functions. However the binding protein of nebulin and function in brain is still unknown. A novel binding partner of nebulin C-terminal region was identified by screening a human brain cDNA library using yeast two-hybrid system. Nebulin C-terminus binding protein 51 (NCBP51) was contained a RING-finger domain and identified a new isoform of RING finger protein 125 (RNF125). The interaction was confirmed using the GST pull-down assay. NCBP51 belongs to a family of the RING finger proteins and its function remains to be identified in brain. The role of nebulin and NCBP51 will be studied by loss-of-function using siRNA technique in brain.

• 분석과학
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• 제21권4호
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• pp.338-343
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• 2008

발굴된 유골에서 DNA 추출은 DNA신원확인과정에서 매우 중요한 단계이지만 유골에 오염된 미생물 DNA와 사람 DNA가 동시에 추출되는 문제점이 있다. 이를 극복하기 위해 발굴된 10명의 유골 시료를 페놀-ultrafiltration 후 $QIAquick^{(R)}$ PCR Purification Kit (ultrafiltration법)와 $QIAamp^{(R)}$ DNA Mini kit(Column-affinity법)를 적용하여 전체(미생물+사람) DNA정량 및 사람 DNA정량 후 각각 STR마커를 분석하므로서 DNA 분리 효율성을 확인하였다. 회수된 전체 DNA양은 Column-affinity법($19.6ng/{\mu}L$)이 ultrafiltration법($16.0ng/{\mu}L$) 보다 1.2배 더 나은 결과를 보였으나 사람 DNA 정량 결과로는 Column-affinity 법($0.034ng/{\mu}L$) 보다 ultrafiltration법($0.498ng/{\mu}L$)이 14.6배 더 많은 회수율을 나타냈다. 유골에 있던 다량의 미생물 DNA가 사람 DNA와 섞여있을 경우, 사람 DNA가 실리카 친화성 컬럼에 부착되는 것이 미생물 DNA의 영향을 받으나, 필터의 경우는 미생물 DNA의 영향을 받지 않아서 ultrafiltration법이 높은 회수율을 보였다.

• Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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• 제19권3호
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• pp.329-334
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• 2006

Adipocyte-specific secretory factor (ADSF)/resistin, a hormone, is a small cysteine-rich protein secreted from adipose tissue and has been implicated in modulating adipogenesis in humans and rodents. The objective of this study was to clone a gene encoding ADSF/resistin and to characterize its function in Korean Native Cattle (Hanwoo). The coding sequence was 330 base pairs and it encoded a protein of 109 amino acids. An NCBI BLAST-search revealed the cloned cDNA fragment shared significant homology (82%) with the cDNA encoding the human ADSF/resistin. The nucleotide sequence homology of the Hanwoo sequence was 73% and 64% for the rat and mouse, respectively. A 654 bp ADSF/resistin gene promoter was cloned and putative binding sites of transcription factors were identified. Tissue distribution of ADSF mRNA was examined in liver, skeletal muscles (tenderloin, biceps femoris), subcutaneous fat, and perirenal fat by RT-PCR. ADSF mRNAs were detected in fat tissues but not in liver and muscles, suggesting that ADSF/resistin expression may be induced during adipogenesis. Although, the physiological function of ADSF/resistin in the cow remains to be determined, these data indicate ADSF is related to the adipocyte phenotype and may have a possibly regulatory role in adipocyte function.