• 제목/요약/키워드: Hub Network

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Identification of novel potential drugs and miRNAs biomarkers in lung cancer based on gene co-expression network analysis

  • Sara Hajipour;Sayed Mostafa Hosseini;Shiva Irani;Mahmood Tavallaie
    • Genomics & Informatics
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    • 제21권3호
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    • pp.38.1-38.8
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    • 2023
  • Non-small cell lung cancer (NSCLC) is an important cause of cancer-associated deaths worldwide. Therefore, the exact molecular mechanisms of NSCLC are unidentified. The present investigation aims to identify the miRNAs with predictive value in NSCLC. The two datasets were downloaded from the Gene Expression Omnibus (GEO) database. Differentially expressed miRNAs (DEmiRNA) and mRNAs (DEmRNA) were selected from the normalized data. Next, miRNA-mRNA interactions were determined. Then, co-expression network analysis was completed using the WGCNA package in R software. The co-expression network between DEmiRNAs and DEmRNAs was calculated to prioritize the miRNAs. Next, the enrichment analysis was performed for DEmiRNA and DEmRNA. Finally, the drug-gene interaction network was constructed by importing the gene list to dgidb database. A total of 3,033 differentially expressed genes and 58 DEmiRNA were recognized from two datasets. The co-expression network analysis was utilized to build a gene co- expression network. Next, four modules were selected based on the Zsummary score. In the next step, a bipartite miRNA-gene network was constructed and hub miRNAs (let-7a-2-3p, let-7d-5p, let-7b-5p, let-7a-5p, and let-7b-3p) were selected. Finally, a drug-gene network was constructed while SUNITINIB, MEDROXYPROGESTERONE ACETATE, DOFETILIDE, HALOPERIDOL, and CALCITRIOL drugs were recognized as a beneficial drug in NSCLC. The hub miRNAs and repurposed drugs may act a vital role in NSCLC progression and treatment, respectively; however, these results must validate in further clinical and experimental assessments.

A Study on the Activation Plan of Busan Port (Focused on northeast feeder network service cost, From LA to China and Japan)

  • Han, Yu-Nam;Yoon, Mi-Sun;Kang, Dal-Won;Kim, Hyun;Kwak, Kyu-Seok;Nam, Ki-Chan
    • 한국항해항만학회:학술대회논문집
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    • 한국항해항만학회 2006년도 Asia Navigation Conference
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    • pp.203-212
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    • 2006
  • The purpose of this research is to suggest the activation plan of Busan port. In the past years, Busan port enjoyed the golden days because of the China's rapid economic growth. But China's continuous development of ports, the trend of increasing container ship size and increasing direct call to China are coming threats to Busan port. So Korea needs to revise the 'Northeast Logistics Hub' strategy because it is considered that Korea ports continuously will handle China's transshipment cargoes. But now China's transshipment cargo share has decreased by direct call to China ports. It means that China has a lot of its local cargoes, so many ship companies change liner service route to handle China cargoes except Bussan ports although Busan port is included in the main trunk route. In the future, Bussan port will not be able to compete again about throughput with China ports if Busan port's transshipment cargo share decreases. So we must find out and develop Busan port's strength which is the competitive edge. By good luck, Busan port has a few opportunities such as the developed feeder network service and geographical advantages. Busan port has many feeder network service like spider's web in any northeast countries so we can suggest that if Japanese shippers use Busan port to distribute their cargoes to Japanese local areas, its transport costs are cheaper than when they use Japan's main ports. In this paper analyzed side of cost when they use Bussan port like hub to distribute their cargo to their local areas. Because most companies tried to reduce the total cost about logistics. Finally, this paper suggests when northeast shippers(China, Japan) use Bussan port which is more economical than their local main ports.

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디지털 LMDS 시스템을 위한 점대점 중계망 시스템 구현에 관한 연구 (A Study on the Implementation of Point-to-Point Relay System for Digital LMDS System)

  • 장태화;방효창;정철종;김원후
    • 한국통신학회논문지
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    • 제24권9B호
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    • pp.1601-1607
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    • 1999
  • LMDS 시스템은 미리미터파 대역을 통하여 신호를 정송하는 광대역 무선 전송 시스템이다. LMDS 시스템은 크게 하드웨어와 허브를 연결하는 중계망과 허브와 가입자간을 연결하는 분배망으로 구성된다. 본 연구에서는 LMDS 시스템의 백본망으로 활용이 가능한 점대점 중계망 시스템을 구현하였다. STM-1급의 전송신호를 27GHz 대역의 밀리미터파 대역으로 전송하는 시스템을 구현하고 이에 대한 성능을 분석하였다. 시험 결과 밀리미터 대역으로 STM-1을 전송하는 경우 이론적인 계산치에 근사하는 결과를 얻을 수 있었으며, 이 시스템은 LMDS 시스템의 백본망으로 충분히 활용할 수 있음을 증명하였다.

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Shadow Libraries: A Bibliometric Analysis of Black Open Access Phenomenon (2011: 2023)

  • Safinaz Mahmoud Elroukh
    • International Journal of Computer Science & Network Security
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    • 제24권5호
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    • pp.21-32
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    • 2024
  • This study analyzes the global literature on the black open-access phenomenon from 2011 to 2023. A bibliometric analysis was conducted using the Scopus database. The search strategy employed advanced queries with multiple synonymous terms to ensure exhaustive retrieval of relevant documents. The VOSviewer software was employed to visualize the co-occurrence networks. The findings reported 90 papers published during the study period. An evolving scholarly landscape was revealed, with heightened attention from 2016 onwards, peaking in 2017, 2021, and 2023. Articles constitute 83.3% of the total published documents. Singh and Srichandan are prolific authors, with 11.2% of the total publications. The United States contributes 18.9% of the papers, followed by India and Spain. Information Development and Scientometrics are pivotal journals in scholarly discussions about this scope, contributing 4.4% of publications. Co-occurrence network visualization revealed "Sci-Hub" and "open access" as the most used keywords in the global literature. The findings underscore the need for additional research to discover innovative business models to safeguard intellectual property rights while meeting researchers' evolving needs. The importance of this paper comes from being the first bibliometric study analyzing international literature related to this phenomenon, which provides a basis for future research efforts and policymaking.

아시아 주요공항의 저비용항공사 네트워크 분석 (Analyzing the LCC Network at Asian Major Airports)

  • 배현준;박용화;김영인
    • 대한교통학회지
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    • 제35권3호
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    • pp.247-259
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    • 2017
  • 본 연구는 네트워크 연결망 관점에서 저비용항공사에 따른 공항 네트워크의 구조적 특성을 파악하고자 진행하였다. IATA의 Airport Intelligence Service의 SRS Analyser Schedule Database를 이용하여 2010년 1월부터 2016년 1월까지 아시아 주요공항을 운항하는 71개 저비용항공사(LCC)를 선정하여 국내선을 제외한 국제선 노선을 대상으로 하여 네트워크 분석을 실시하였다. 본 논문에서는 인천국제공항을 비롯하여 홍콩, 싱가포르, 나리타, 간사이, 푸동, 가오슝, 김포, 제주공항 등을 중심으로 네트워크 연결 메커니즘을 파악하고, 4가지 중심성 분석을 통해 LCC 네트워크의 구조적 변화를 분석하였다. 분석결과에 따르면 이들 공항에서는 LCC 네트워크가 형성되어 있고 타 공항과의 연결성 밀도가 높아진 것으로 나타났다. 최근 저비용항공사들도 기존 항공사들의 동맹체(Alliance)와 같은 형태의 LCC-Alliance를 출범함에 따라 허브-앤-스포크 네트워크를 지원하는 운영방식을 확대할 것으로 보인다.

고고보드를 이용한 능동적 참여 모의실험을 위한 NetLogo 확장 모듈 (NetLogo Extension Module for the Active Participatory Simulations with GoGo Board)

  • 웅홍우;소원호
    • 한국통신학회논문지
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    • 제36권11B호
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    • pp.1363-1372
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    • 2011
  • 본 논문에서는 기존 HubNet 기반의 참여 모의실험의 한계를 극복하기 위한 능동형 참여 모의실험 (Active Participatory Simulation; APS) 학습 구조를 제시하고, 이를 위한 고고보도용 NetLogo 확장 모듈을 자바로 개발한다. NetLogo는 복잡하게 보이는 과학현상의 이면에 존재하는 복잡계를 모델링할 수 있는 에이전트 기반 모델링 (Agent Based Modeling) 언어다. 이것과 HubNet을 이용하면 모의실험이 수행되는 동안 학생은 하나의 에이전트로서 이 실험에 참여할 수 있다. 하지만 HubNet에서는 서버만이 외부장치와 연결된다. 따라서 고고보드를 이용한 환경 데이터 및 사용자 입력을 다수의 클라이언트를 통하여 수신할 수 없어 이중초점 모델링 기반 학습이 불가능하다. 이에 클라이언트에 연결된 고고보드의 입력 정보를 TCP/IP 소켓을 이용하여 수신하고 보드를 제어하는 자바 확장 모듈을 개발한다. 또한 HubNet과 이 확장 모듈을 사용한 APS 학습 구조 모델링 방법과 이를 위한 NetLogo 프로그래밍을 소개한다. 마지막으로 다양한 APS 학습 구조에 따른 예시를 제시하고 응답처리지연 시간 관점에서 평가하여 과학분야에 활용될 수 있는 방안을 모색한다.

확장하는 Scale-free 네트워크에서의 허브노드 도출을 위한 Stochastic Community Bridge Node Finder 개발 (Development of Modeling to Find the Hub Nodes on Growing Scale-free Network based on Stochastic Community Bridge Node Finder)

  • 은상규;김수진;배승종;김대식
    • 농촌계획
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    • 제23권1호
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    • pp.1-10
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    • 2017
  • 네트워크를 분석하는 방법인 stochastic 기반의 community bridge node finder는 네트워크 구조의 일부 정보만을 이용하여 중심지 및 확산 경로의 유추가 가능하다. 그러나, heterogeneity 네트워크에 적용하기 어려운 단점을 보유하고 있어, 본 연구에서는 이를 개선하고자 하였다. heterogeneity 네트워크에 적용할 수 있는 community bridge node finder 방법을 개발하기 위해 네트워크의 modularity를 계측하는 방법을 적용하였으며, 개선된 방법을 통해 community bridge node를 정량적으로 평가할 수 있어 heterogeneity 네트워크의 분석이 가능하였다. 농촌계획분야 정보의 경우, 대부분 자료의 불확실성이 존재하며 무결성이 떨어지는 특성을 가지고 있는 바 본 연구에서 적용한 전염병 확산 예측 뿐만 아니라 개선된 방법을 활용할 경우 주산지 정비 거점 분석 등 다양한 형태로 이용될 수 있을 것으로 기대된다.

Inferring genetic regulatory networks of the inflammatory bowel disease in human peripheral blood mononuclear cells

  • Kim, Jin-Ki;Lee, Do-Heon;Yi, Gwan-Su
    • Bioinformatics and Biosystems
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    • 제2권2호
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    • pp.71-74
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    • 2007
  • Cell phenotypes are determined by groups of functionally related genes. Microarray profiling of gene expression provides us response of cellular state to its perturbation. Several methods for uncovering a cellular network show reliable network reconstruction. In this study, we present reconstruction of genetic regulatory network of inflammation bowel disease in human peripheral blood mononuclear cell. The microarray based on Affymetrix Gene Chip Human Genome U133 Array Set HG-U133A is processed and applied network reconstruction algorithm, ARACNe. As a result, we will show that inferred network composed of 450 nodes and 2017 edges is roughly scale-free network and hierarchical organization. The major hub, CCNL2 (cyclin A2), in inferred network is shown to be associated with inflammatory function as well as apoptotic function.

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인천국제공항의 환적화물에 대한 연계성 분석 연구 (Analyzing the Airfreight Transshipment Connectivity at Incheon Airport)

  • 김중엽;박용화
    • 대한교통학회지
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    • 제26권5호
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    • pp.117-127
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    • 2008
  • 1978년 미국 내 항공시장의 규제완화와 함께 항공은 허브-앤-스포크 시스템(hub-and-spoke system)의 형태로 재구성되었다. 항공의 확장성을 중점적으로 고려할 때, 허브-앤-스포크의 활용은 여객의 환승이나 화물의 환적에 있어서 어느 정도의 이점이 존재한다는 것이 일반적인 견해이다. 또한 국가 차원으로 볼 때, 허브-앤-스포크를 통해 공항의 활성화 및 노선에 따른 밀도의 경제를 실현하도록 허브공항을 개발하는 정책적 지원의 동기가 될 수도 있다. 기존 선행연구들은 대다수 항공여객에 대한 연구들로 집중되어 왔으나 항공환적화물에 대한 연구는 그 수가 상대적으로 적게 나타났다. 이에 본 연구에서는 인천국제공항을 대상으로 하여 항공화물의 환적연계성에 대한 분석을 통해 허브-앤-스포크 상에서 과연 허브공항으로서의 기능과 성과를 수행하고 있는지를 측정코자 하였다. 이를 위한 연구의 범위는 인천국제공항을 통해 환적 되는 항공화물을 대상으로 하며, 개설 가능한 환적노선인 직항연결 및 우회연결(Direct and Indirect Connection)로 한정하였다. 인천국제공항을 기반으로 한 항공화물의 환적연계성을 분석하기 위해 인천국제공항과 연결된 공항들의 노선 수나 연결시간 등을 기준으로 하여 직항연결과 우회연결의 품질을 평가하는 방식으로 취하였다. 이를 위해 공항의 웨이브-시스템 구조를 분석하여 활용하는 NETSCAN 모델을 적용하였다.

WBAN 환경에서 성능향상을 위한 버퍼 관리 알고리즘 (Buffer Management Algorithm for Performance Improvement in WBAN)

  • 김지원;김강희;이창호;최상방
    • 전자공학회논문지
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    • 제52권5호
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    • pp.106-114
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    • 2015
  • Wireless Body Area Network(WBAN)은 인체를 중심으로 다양한 의료 센서나 기기들을 연결하는 네트워크 표준으로써, 데이터의 전송률, 우선순위, 지연 시간등의 요구사항을 만족해야 한다. 본 논문에서는 네트워크의 상황에 따라 WBAN 데이터의 우선순위와 전송 지연 시간을 고려하여 WBAN 서비스의 성능을 향상할 수 있는 알고리즘을 제안한다. 이 알고리즘은 허브의 버퍼가 이전보다 혼잡해지면 데이터의 우선순위에 따라 데이터 제거 확률을 적용하여 데이터를 처리하고, 버퍼가 이전보다 원활해지면 데이터의 지연 시간을 고려하여 서비스한다. 기존 알고리즘과의 비교를 통해 제안한 알고리즘이 의료 데이터의 손실률을 낮추고 데이터의 지연 시간을 줄여 WBAN 서비스의 품질이 향상된 것을 확인할 수 있었다.