• 제목/요약/키워드: Halobacteria

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내부 필터 발효기에서 Halobacterium halobium의 배양에 의한 박테리오로돕신의 생산 (Production of Bacteriorhodopsin by Halobacterium halobium in the Internal Membrane Bioreactor)

  • 엄영순;박준택;홍순호;이상엽;장호남
    • KSBB Journal
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    • 제13권3호
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    • pp.268-271
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    • 1998
  • Bacteriorhodopsin in the purple membrane (PM) of halobacteria has recently been attracting much attention to be used as a component of molecular electron device and optical computers. In order to increase the productivity of bacteriorhodopsin in high cell density cultures of Halobacterium halobium R1, an internal membrane cell-retention bioreactor system was employed. As a result, the production of cell mass at OD660 of 12 and of bacteriorhodopsin at 125-130 mg/L were obtained using the internal membrane bioreactor system at a dilution rate of 0.066 hr-1. The productivity achieved by the internal membrane system (0.7 mg/L$.$hr) was 3.5-fold higher than that obtained by the corresponding batch cultivations (0.2 mg/L$.$hr).

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고세균 122종의 보존적 COG pathways와 유전자 (Conserved COG Pathways and Genes of 122 Species of Archaea)

  • 이동근;이상현
    • 생명과학회지
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    • 제33권11호
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    • pp.944-949
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    • 2023
  • 이 연구의 목적은 122종의 고세균 종에 보존된 대사 경로와 보존된 유전자를 확인하는 것이었다. 각각의 122개 고세균이 63개의 COG 대사 경로, 이를 구성하는 822개의 COG, 총 4,877개의 COG를 보유하고 있는지 분석했다. 대사경로에서는 archaeal ribosomal proteins만이 가장 보존적이었다. 122종의 고세균 모두에 공통적인 COG는 7개의 COG pathways에서 46개, 그리고 그 외가 20개였다. COG pathways에서는 ribosome을 구성하는 29개, tRNA synthetase와 전사인자가 각각 5개, RNA polymerase를 구성하는 3개, 그리고 tRNA modification에 관련된 2개의 COG가 공통적이었다. COG pathways에 속하지 않고 122종의 고세균에 공통적인 보존적 유전자까지 고려하면 외부와 세포질을 구분 짓는 세포벽과 세포외기질의 합성, 복제, 전사, 번역, 단백질 대사에 관련된 유전자들 중에서 일부가 공통적이었다. 계통수에서 구한 각 고세균의 distance value를 분류단위로 보면 Euryarchaeota 문의 Halobacteria강의 평균이 가장 낮았고 표준편차는 Thaumarchaeota 문의 Nitosospharia강, 강을 알 수 없는 Thaumarchaeota문의 고세균, Euryarchaeota 문의 Halobacteria 강, Crenarchaeota 문의 Thermoprotei 강, 기타 고세균(OA)이 높았다. 계통수 분석으로 6가지의 공통점을 찾았다. 본 연구결과는 보존된 유전자에 관한 자료 외에도 의약품 개발, 균주 개선을 위한 유전자의 선택 등에 활용될 수 있을 것이다.

Polymerase Chain Reaction 방법에 의한 Halobacteria gvp 유전자의 역전사 및 증폭 (Reverse Transcription and Amplification of Halobacterial gvp Genes with Polymerase Chain Reaction Method)

  • 윤병수;이상섭
    • 미생물학회지
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    • 제30권6호
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    • pp.456-459
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    • 1992
  • Halobacteria 의 gvpD. gvpE 유전자는 가스포 형성에 관여하는 유전자로, 이들은 그 transcripts 의 분석에 있어 특유의 연약성 때문에 많은 실험상의 문제를 야기시키고 있다. 본 실험은 연약한 mRNA 를 reverse transcriptase 를 사용, DNA 로 바꾸고 이를 다시 PCR(Polymerase Chain Reaction) 방법으로 증폭시킴으로써, 유전자의 연약한 mRNA 를 다시 상보적인 안정한 DNA 로 대치케 하여 RNA 상의 cloning, RNA sequencing 을 용이하게 하였다. 결과는 유전자 gvpD 에서 거의 전 ORF(Open Reading Frame) 의 범위에서 northern hybridization 에서 발견치 못한 transcipts 를 확인할 수 있었다.

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Haloarcular sp. EH-1으로부터 생분해성 Poly-3-Hydroxyalkanoate의 생산 (Production of Poly-3-Hydroxyalkanhoate by Haloarcular sp. EH-1)

  • 정명주;박형숙
    • 생명과학회지
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    • 제9권6호
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    • pp.737-742
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    • 1999
  • 천일염에서 분리된 고호염성균인 Haloarual sp. EH-1으로부터 PHA를 생산하여 PHA의 구조 및 성질 등을 검토하였다. 그 결과는 다음과 같다. PHA를 GC chromatogram, IR 및 300MHz H-NMR로 분석한 결과 Haloarcnly sp. EH-1으로부터 추출된 PHA는 3-hydroxybutyric acid와 3-hydroxyvaleric acid 와 3-hydroxyvaleric acid의 중합체인 PBB/HV로 추정되었으며, thermal property는 $152.46^{\circ}C.$ 점도는 1.25dl/g 그리고 분사량은 $1.44 X 10^5$이었다.

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