• 제목/요약/키워드: HaeIII

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Thr-6Pro missense mutation in human lysosomal acid lipase (LAL) gene in patients with familial hypercholesterolemia in Korea

  • Hwang, Hye-Suk;Hwang, Jung-Hee;Kim, Hyun-Sup;Kim, Nam-Keun;Kim, Se-Jae;Lee, Chung-Choo;Chung, Ki-Wha
    • Journal of Genetic Medicine
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    • 제2권2호
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    • pp.65-70
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    • 1998
  • Lysosomal acid lipase (LAL) plays a central role in the intracellular degradation of neutral lipids derived from plasma lipoproteins. In this study, we investigated the missense mutation within exon 2 of human LAL gene changing of codon -6 of prepeptide from threonine to proline. The Thr-6Pro mutation was detected by the HaeIII restriction fragment length polymorphism (RFLP) and single-strand conformation polymorphism (SSCP). We analyzed the mutation in subjects with 221 unrelated randomly selected control samples and 86 patients with familial hypercholesterolemia (FH) in Korea. We observed that mutation is present with high frequency in Korea compared to other populations studied previously. The frequency of PP homozygote in the FH group was observed considerably higher than that of control. However, there was no significant difference of genotype frequency between two groups. These results, together with the fact that plasma lipids and lipoproteins levels between genotypes showed no statistical difference, suggest that the Thr-6Pro mutation in the LAL gene may have no association with the increased risk of FH development.

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Nucleotide Sequencing and PCR-RFLP of Insulin-like Growth Factor Binding Protein-3 Gene in Riverine Buffalo (Bubalus bubalis)

  • Padma, B.;Kumar, Pushpendra;Choudhary, V.;Dhara, S.K.;Mishra, A.;Bhattacharya, T.K.;Bhushan, B.;Sharma, Arjava
    • Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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    • 제17권7호
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    • pp.910-913
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    • 2004
  • Insulin-like growth factor binding protein-3 (IGFBP-3) gene is a structural gene associated with the growth and development of the animals. The present investigation was carried out to unravel nucleotide sequence and polymerase chain reactionrestriction fragment polymorphism (PCR-RFLP) of IGFBP-3 gene in buffalo. Genomic DNA was isolated from a total of 157 animals belonging to Murrah, Surti, Jaffarabadi and Nagpuri breeds of Indian riverine buffalo. A 655 bp of IGFBP-3 gene was amplified in all the breeds and amplicons were digested with Hae III, Taq I and Msp I restriction enzymes. On digestion with Hae III yielded single restriction pattern of 8 fragments of sizes 201, 165, 154, 56, 36, 19, 16 and 8 bp in all the animals studied. Similarly Taq I and Msp I also revealed single restriction pattern yielding fragments of sizes 240 and 415 bp and 145 and 510 bp, respectively. This shows nonpolymorphic nature of restriction sites in buffalo. Nucleotide sequencing of 587 bp of IGFBP-3 gene in Murrah buffalo was done and submitted to the GenBank (Accession No. AY304829). Nucleotide sequencing revealed an addition of 4 bases in the intronic region as compared to cattle.

Effect of Leptin and IGFBP-3 Gene Polymorphisms on Serum IgG Level of Cattle Calves

  • Choudhary, Vivek;Kumar, Pushpendra;Saxena, V.K.;Bhattacharya, T.K.;Bhushan, Bharat;Sharma, Arjava;Ahmed, K.A.
    • Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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    • 제19권8호
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    • pp.1095-1099
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    • 2006
  • Leptin and IGFBP-3 are two proteins that play an important role in growth and metabolism of the animals. They are also involved in the immune function of animals and, thus, are candidate genes for the study of association with immune functions. Polymerase Chain Reaction-Restriction Fragment Length Polymorphism (PCR-RFLP) of these two genes was done to screen 64 crossbred (Holstein Friesian${\times}$Hariana) female calves of one year of age. From each RFLPs (fragments) three genotypes were observed. In all the RFLPs the mutant homozygotes were very less in numbers and, hence, were excluded from the least squares analysis. The serum IgG level was estimated using SRID assay. The mean level of serum IgG was $28.83{\pm}2.73mg/ml$. The effect of these identified genotypes on serum IgG level of calves at one year of age was analysed using least squares analysis. The HaeIII RFLP-AB genotype had significantly (p<0.05) higher serum IgG level ($31.86{\pm}3.05$) than the HaeIII RFLP-AA ($25.62{\pm}2.96$) genotype. There was no significant effect of leptin genotypes on the IgG level. The present results indicated a role of the IGFBP-3 gene on serum IgG level of cattle calves.

16S rRNA 유전자 분석에 의한 전남 순천만 갯벌의 세균 다양성 (Bacterial Diversity in the Mud Flat of Sunchon Bay, Chunnam Provice, by 16S rRNA Gene Analysis)

  • 이명숙;홍순규;이동훈;배경숙
    • 미생물학회지
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    • 제37권2호
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    • pp.137-144
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    • 2001
  • 순천만 갯벌의 세균 군집의 다양성을 조사하기 위해 16S rDNA의 다양성을 조사하였다. 갯벌로부터 전체 핵산을 분리한 후, 세균에 상보적인 universal primer로 증폭된 16S rDNA로부터 클론 라이브러리를 만들었다. 총 111개의 클론으로부터 HaeIII를 이용하여 amplified rDNA restriction analysis (ARDRA)를 수행하고, Gelcompar II 프로그램을 이용하여 pattern을 clustering하였다. 111개의 클론 중 100가지의 서로 다른 RFLP type이 조사되었고, 이들 중 전체 클론 라이브러리를 대표할 수 있는 20개의 클론을 선별하여 부분적인 염기서열을 분석하여 세균 다양성을 분석하였다. 20개의 클론중에는 RDP와 GenBank에서 제공하는 small subunit RNA database와 동일한 클론은 존재하지 않았으며, 이미 알려진 배양 가능한 세균의 16S rRNA 염기서열과 비교 하였을때 77∼96.8%의 유사도를 보였다. 또한 이들 20개의 클론은 alpha-, delta-, gamma-Proteobacteria, low G+C Gram positive bacteria, high G+C Gram positive bacteria, Sphingobacteria (Cytophaga); Cyanobacteria (Chloroplast)등 주요한 7개 lineage에 속했으며, 클론들 중 Proteobacteria가 우점종을 차지하고 있었다.

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모세관 젤 전기영동을 이용한 안드로젠 수용체 유전자 분석 (Analysis of Androgen Receptor Gene by Capillary Gel Eelectrophoresis)

  • 김용성;백승권;강충무;강대천;이수만;최병옥;정기화;최규성
    • 대한화학회지
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    • 제50권1호
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    • pp.37-45
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    • 2006
  • 연구에서는 모세관 젤 전기 영동에서 분자체 역할을 하는 poly(ethylene oxide)를 이용하여 남성불임(Androgen receptor) 유전자의 정확한 CAG 반복 배열의 길이를 측정하였다. 표준물질인 X174 RF/Hae III, 100bp step ladder를 이용하여 non-linear regression analysis를 통한 81명의 한국의 불임 남성과 89명의 정상적인 한국 남성을 대조군으로 하여, 남성 불임과 관련된 AR gene의 exon 1의 CAG 반복 수를 측정하였다. 불임 남성의 CAG 반복 길이는 24.97±2.6 range, 17-29)이고, 정상인 남성은 23.99±2.4(range, 18-29)이다. P값은 0.018로써(<0.05) 두 그룹의 결과는 통계학적으로 주목 할 수 있는 차이를 나타내었다.

등온증폭법을 이용한 고감도 JC polyomaviruses 진단법 개발 (Diagnostic Method for the Detection of JC Polyomavirus Using Loop-mediated Isothermal Amplification)

  • 조규봉
    • 대한임상검사과학회지
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    • 제51권4호
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    • pp.414-419
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    • 2019
  • JC polyomavirus (JCPyV)는 viral group I, Polyomaviridae로 분류되는 사람 병원성 바이러스 이다. JCPyV는 최근 하수 등 수질오염 지표로 제안됨에 따라 수질환경에서 모니터링 필요성이 제기되고 있다. 임상 및 환경 시료 중 JCPyV 검출을 위해서 PCR 시스템이 사용되어 왔다. 그러나 신속하고 높은 검출 민감도를 가진 방법의 필요성에 따라 이번 연구에서는 등온증폭 프라이머 조합을 개발하였다. 이번에 개발한 방법은 기존 PCR 시스템에 비해 더욱 신속 및 약 10배 더 높은 검출 민감도를 보여주었다. 또한 본 연구에서 개발한 검출 방법의 재 검정을 위해서 HaeIII 제한효소를 이용한 방법을 함께 고안하였다. 따라서 이번 연구는 임상, 환경 등의 시료에서 JCPyV를 모니터링 하기 위한 방법으로 활용이 기대된다.

정상교합과 부정교합에서의 상${\cdot}$하악골과 제 1 대구치 위치에 관한 비교연구 (A COMPARATIVE STUDY ABOUT THE POSITION OF UPPER AND LOWER JAWS, AND FIRST MOLARS IN NORMAL OCCLUSION AND ANGLE'S CLASS $I{\cdot}II{\cdot}III$ MALOCCLUSIONS)

  • 윤병모;안병근;이건주;김선해;박영주;한호진
    • 대한치과교정학회지
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    • 제23권4호
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    • pp.633-644
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    • 1993
  • There has been so much controversies about the position of upper and lower jaws, and their first permanent molars in normal occlusion and Angle's class $I{\cdot}II{\cdot}III$ malocclusions. So, the purpose of this study is to compare the position of upper and lower jaws, and their first molars in normal occlusion and Angle's class $I{\cdot}II{\cdot}III$ malocclusions by lateral cephalometric analysis. The sample consisted of one hundred and twenty girls(thirty in each group) who had completed growth. The findings of this study were as follows : 1. In class I malocclusion, both maxilla and mandible were slightly posterior position than normal occlusion, but they showed harmonious relationship. 2. In class II malocclusion, the mandible was greatly retruded, and the maxilla was also slightly retruded to the cranial base as compared with normal occlusion. 3. In class III malocclusion, the maxilla was significantly retruded to the cranial base, but no significant difference was found in mandibular position as compared with normal occlusion. 4. The maxillary first molar was located at posterior position in class II malocclusion, and anterior position in class III malocclusion to the cranium, so that the rotation of mandible was influenced by that. 5. The mandibular first molar showed constant relationship to the mandible in all four groups, but different position to the cranial base in direct proportion to the mandibular position. 6. On the treatment planning of class III malocclusion, it seems to be better to promote the mandibular horizontal growth by inhibiting the vertical growth of maxillary molar area, and on the treatment planning of class III malocclusion, it seems to be better to promote the antero-inferior growth of maxilla mi to promote the mandibular vertical growth by inducing the vertical growth of maxillary molar area.

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동부박을 첨가한 두부의 품질특성 (Quality Characteristics of Tofu with Added Cowpea (Vigna unguiculata) Meal)

  • 이경혜;이명희;김경탁
    • 한국식품위생안전성학회지
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    • 제29권4호
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    • pp.363-369
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    • 2014
  • 동부박(CPM)을 첨가하여 제조한 두부의 품질특성의 변화를 측정하였다. CPM 첨가비율이 증가할수록 L값은 대조구 CPM-O과 처리구 CPM-I, CPM-II, CPM-III 간에 유의적인 차이를 나타내지 않았다(p < 0.05). b값은 CPM-III에서 14.26로 가장 낮았으며, 동부박(CPM) 첨가비율이 증가함에 따라 감소하였다. 텍스쳐 프로파일의 결과는 대조구 CPM-O와 동부박 첨가 처리구 CPM-I간에는 응집성(cohesiveness)을 제외한 모든 조사항목에서 유의적인 차이를 나타내지 않았다. 처리구 별 pH는 6.36~6.52로 대조구와 유의적인 차이를 나타내지 않았다. 탁도는 1.46~1.81 범위로 CPM 첨가비율이 증가됨에 따라 증가하였다. 일반 세균수는 CPM-III에서 $4.40{\times}10^2CFU/g$로 대조구와 유의적인 차이를 나타내었다. Esterichia coli의 경우, 대조구 CPM-O와 전 처리구에서 검출되지 않았다. 관능적인 분석 결과는 동부박 현탁액 첨가비율이 10%인 처리구 CPM-I의 경우 대조구와 유의적인 차이를 나타내지 않아, 동부묵 제조의 부산물을 이용하여 두부제조에 적용할 때는 동부박 첨가 비율이 10%가 적합하다고 판단되었다. Isoflavone glycoside (IG)는 genistin, daidzin, glycitin 순으로 많이 함유되어 있었으며, 동부박(CPM) 첨가 비율이 증가함에 따라 그 함량은 유의적으로 감소하였다. Isoflavone-aglycone(IA)는 IG보다는 함량이 낮았으며, genistein과 daidzein이 glycitein 보다 많이 함유되어 있었으며, 동부박 첨가비율이 증가됨에 따라 유의적으로 감소하였다.

화살꼴뚜기 Heterololigo bleekeri (Keferstein, 1866) 의 국내출현 (Occurrence of a Spear Squid, Heterololigo bleekeri (Keferstein, 1866) from Korea)

  • 김영혜;이해원;전영열;강현정
    • 한국패류학회지
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    • 제28권3호
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    • pp.255-258
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    • 2012
  • 표본은 2012년 3월 경상북도 독도주변해역에서 자망에 의해 어획된 것이다. 화살꼴뚜기는 몸통길이 (ML) 22.5-34.2cm (평균 $27.1cm{\pm}2.8$) 이다. 지느러미길이 (FL) 는 몸통길이 (ML) 의 2/3정도인 60%를 차지하였다. 지느러미폭(FW) 은 몸통길이 (ML) 의 약 1/2정도이다. 팔은 몸통길이(ML) 에 비해 짧고 굵으며, 팔길이식은 III>II>IV>I 이었다. 왼쪽 4번째 팔의 말단부 약 30%가 교접기로 되어 있다. 교접기는 아주 작은 흡반 및 거의 흔적적인 흡반이 나열되어있다. 표본 44개체 중 암컷 (♀) 은 23개체, 수컷 (♂) 21개체이었다. 생식소 발달단계는 암컷 (♀) 완숙단계, 수컷 (♂) 방정단계였다.

비소세포성 폐암의 방사선 치료 (Radiation Therapy in Non-Small Cell LUNG Cancer)

  • 한혜경;이명자
    • Radiation Oncology Journal
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    • 제6권1호
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    • pp.35-39
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    • 1988
  • From Jan.1984 to Dec. 1986, 90 patients with lung cancer were treated at the Department of Radiation Therapy in Hanyang University Hospital. Histopathologically, 67 cases of them were the squamous cell carcinoma,7 cases were the adenocarcinoma, 4 cases were the large cell undiffe rentiated carcinoma and 12 cases were the small cell carcinoma. Among the 78 patients with non small cell carcinoma, 50 patients had received radiation dosage above 4000 cGy.40 patient had follow up from 17 months to 53 months. The complete response rate was $7.3\%$ and partial response rate was $68.3\%$. Overall survival at 1, 2 and 3 years were $47.5\%,\;23.5\%\;and\;6.3\%$ respectively. None was survived longer than 38 months. Median survival was 12.2 month for 40 patient and 9 month for stage III, M1 group and 9.5 month for stage III, MO group. In M1 patient no survival was seen after 2 years while in M0 patient $23.3\%$ survival was seen.

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