미국 국방성에서 주관한 시뮬레이션 표준인 HLA(High Level Architecture)의 목적은 시뮬레이션 소프트웨어들 사이의 상호 호환을 용이하게 하고 그들 구성 요소들의 재사용을 촉진하는데 있다. 산업 현장에는 HLA가 시뮬레이션 표준이 되기 이전에 개발된 많은 시뮬레이션 소프트웨어들이 있다. 레거시 시뮬레이션들을 HLA를 사용한 패더레이션으로의 통합은 M&S(Modeling 고 Simulation) 영역에서 중요한 연구 주제이다. 원자력과 우주항공 같은 임무 완수가 중요한 산업의 레거시 시뮬레이션 소프트웨어들은 일반적으로 Fortran 언어를 사용한다. 하지만 HLA가 Fortran 언어를 지원하고 있지 않기 때문에 그들의 재사용은 쉽지 않다. 본 논문은 레거시 시뮬레이션 소프트웨어의 변경을 최소화하면서 HLA 패더레이션으로 이전을 용이하게 하는 통합 방법을 제시한다. 패더레이션에 참여하는 각 패더레이트는 실행 시간에 생성되는 공유메모리를 통하여 통신하는 분리된 실행을 갖는다. 발행과 접수를·위한 두 가지 유형의 공유메모리 블록이 사용된다 레거시 시뮬레이션 소프트웨어에서 사용되는 전역변수 선언 블록은 발행과 접수를 위하여 분할되고 HLA FOM 설계를 위하여 객체 및 상호작용 클래스로 사상된다. 제안된 방법을 검증하기 위하여 플랜트 설계에 사용되고 있는 레거시 원자력 시뮬레이션 코드의 HLA 통합을 시도하였고 통합 결과를 관측하기 위하여 FMT(Federation Management Tool)를 사용하였다. FMT가 표시하는 진단정보는 본 연구가 제안하는 방법이 성공적이고 효과적으로 HLA 통합에 사용될 수 있음을 보였다.
The human leukocyte antigen (HLA), the major histocompatibility complex (MHC) in humans has been known to reside on chromosome 6 and encodes cell-surface antigen-presenting proteins and many other proteins related to immune system function. The HLA is highly polymorphic and the most genetically variable coding loci in humans. In addition to a critical role in transplantation medicine, HLA and disease associations have been widely studied across the populations worldwide and are found to be important in prediction of disease susceptibility, resistance and of evolutionary maintenance of genetic diversity. Because recently developed molecular based HLA typing has several advantages like improved specimen stability and increased resolution of HLA types, the association between HLA alleles and a given disease could be more accurately quantified. Here, in this review, we have collected HLA association data on some autoimmune diseases, infectious diseases, cancers, drug responsiveness and other diseases with unknown etiology in Koreans and attempt to summarize some remarkable HLA alleles related with specific diseases.
IEEE(Institute of Electrical and Electronics Engineers)1516 에 규정된 HLA(High Level Architecture) 기반 기술은 상이한 목적으로 개발된 다수의 개별 시뮬레이션들이 결합된 복합 시뮬레이션 네트워크 시스템을 구성하는데 있어서 필수적 요소이다. 본 논문에서는 상용 비행 시뮬레이션을 HLA를 기반으로 구현하는 과정과 구현된 시스템의 동작 과정을 보여줌으로써 확장성 및 상호 운용성을 갖춘 비행 시뮬레이션 모델 구조를 제시하였다. 또한 HLA를 기반으로 구현된 실시간 시뮬레이션 시스템과 상용 비행 시뮬레이션을 비교하여 얻어진 비행 정보 데이터 분석을 통해 완벽한 실시간성을 보장할 수 있는 지에 대한 여부를 판단하였다.
HLA는 이기종 시뮬레이션간의 연동을 위한 IEEE 1516 표준이며, RTI는 연동을 위한 하부 인프라 서비스를 제공하는 기술이다. 본 논문에서는 HLA/RTI에 호환 가능한 OO기반의 페더레이트 모델 구조를 제안함으로써 코드의 재사용성을 높인다. 이는 시스템 개발 프로세스의 효율을 높이고, 개발시간의 단축 및 소프트웨어 개발 비용의 절감효과를 가져 온다. 제안된 페더레이트 모델은 이를 구현한 페더레이트에 대한 HLA 인증으로 그 실질적인 효과를 검증 받는다.
We describe a heterogeneous simulation framework, so called DEVS-HLA, in which conventional simulation models and the DEVS (Discrete Event System Specification) models are interoperable. DEVS-HLA conceptually consists of three layers: model layer, DEVS BUS layer, and HLA (High Level Architecture) layer. The model layer has a collection of heterogeneous simulation models, such as DEVS, CSIM, SLAM, and so on, to represent various aspects of a complex system. The DEVS BUS layer provides a virtual software bus, DEVS BUS, so that such simulation models can communicate with each other. Finally, the HLA layer is employed as a communication infrastructure, which supports several good features for distributed simulation. The DEVS BUS has been implemented on the HLA/RTI (Run-Time Infrastructure) and a simple example of a flexible manufacturing system has been developed to validate the DEVS-HLA.
HLA(High Level Architecture)를 기반으로 한 시뮬레이션들은 분산 환경에서 수행되는 특징을 갖는다. 이러한 시뮬레이션들은 지난 몇 년 동안 계속해서 그 규모가 커지고, 복잡해지고 있다. 이런 분산 시뮬레이션을 실행시킬 때 페더레이트(federate)들의 오동작으로 네트워크의 혼잡을 유발하는 등의 문제점이 생길 수 있다. 이러한 문제점을 효율적으로 해결하기 위해서는 이와 같은 분산 시뮬레이션을 관리 할 수 있는 수단이 필요하게 되었다. HLA 개발자들은 페더레이션(federation)의 내부를 알기 위해서 객체 모델을 개발했고, 이것을 Management Object Model(MOM) 이라고 한다. HLA MOM은 페더레이션을 모니터링과 컨트롤하며 관리 할 수 있게 한다. HLA RTI는 페더레이트간에 효율적으로 정보를 교환하게 하는 분산 운영 시스템이며 MOM을 통해서 RTI의 운영정보에 접근하고, 수행을 통제 할 수 있는 방법을 제공하고 있다. MOM을 이용할 경우 RTI 운영 정보들은 기존의 RTI 서비스를 이용해서 전달될 수 있으며, 이런 특성으로 인해 시스템 관리를 목적으로 하는 어플리케이션을 용이하게 구현 할 수 있다. 따라서 본 논문에서는 HLA MOM을 이용한 페더레이션을 관리 하는 FMS(federation Management System)을 개발하고자 한다.
오늘날 발전을 거듭하고 있는 첨단 정보기술을 이용한 지능형 시뮬레이션/시뮬레이터의 표준으로 확고히 자리를 잡고 있는 HLA(High Level Architecture)는 시뮬레이션 소프트웨어의 재사용성과 상호운용성을 촉진시키기 위하여 미 국방성에 의해 개발되어 이제는 분산 시뮬레이션의 표준이라 할 수 있다. 이 논문에서는 지능정보 기술이 시뮬레이션/시뮬레이터 기술과 어떻게 연관되어 있으며, 어떻게 사용될 것인가에 대한 개념 연구와, 시뮬레이션/시뮬레이터모델 내에서 첨단 정보기술들이 무슨 역할을 하는지에 대한 방향을 도출하였다. 또한, HLA와 HLA의 가장 중요한 구성 요소중 하나인 RTI(Run Time Infrastructure)의 최신 버전과 RTI가 지원하는 서비스에 대해 고찰하였다. HLA 페더레이션 개발자들이 HLA 페더레이션 개발시 지침이 되는 여섯 단계의 페더레이션 개발 절차인 FEDEP(Federation Development and Execution Process) 모델을 따랐으며, RTI의 최신 버전(RTI-NG 1.3v4)을 사용하여 HLA를 따르는 지능정보형 시뮬레이션 프로그램의 프로토타입을 개발하였다.
생의학분야에서 문헌에 표기된 개체를 인식하기 위해 길이우선매칭기법을 빈번히 사용한다. 길이우선매칭기법은 사전을 이용한 개체인식기법으로 좋은 사전만 구축되어 있다면 빠르고 정확하게 개체를 찾아낼 수 있다는 장점을 가진다. 그러나 개체가 나열되고 중복된 단어가 생략될 경우에는 길이우선매칭기법을 이용할 경우 성능이 현저히 떨어지게 된다. 우리는 이러한 인식성능문제를 해결하기 위해 부분매칭기법을 제안한다. 제안된 부분매칭기법은 생략이 발생될 수 있다는 것을 가정하여 다수의 후보개체를 만들어 내고 그 후에 최적화 알고리즘을 통해 다수의 개체후보 중에서 가장 타당해 보이는 개체를 선택한다. 우리는 생의학분야의 개체 중에서 나열되는 경우가 빈번한 HLA 유전자, HLA 항원, HLA 대립유전자 개체들을 대상으로 길이우선매칭기법과 제안된 부분매칭기법의 개체인식성능을 분석하였다. 3종의 HLA 개체들을 인식하기 위해서 먼저 확장사전과 태그기반사전을 구축하였으며, 그 후 구축된 사전을 이용해 길이우선매칭과 부분매칭을 수행하였다. 실험결과에 따르면 길이우선매칭기법은 HLA 항원 개체에서 좋은 성능을 보였으며 부분매칭기법은 생략된 표현이 빈번한 HLA 유전자 개체, HLA 대립유전자 개체에서 좋은 성능을 보였다. 부분매칭기법은 HLA 대립유전자 개체를 대상으로 95.59%의 높은 F-score를 얻었다.
Atoum, Manar Fayiz;Tanashat, Reem Qasem;Mahmoud, Sameer Al Haj
Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
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제14권11호
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pp.7007-7010
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2013
Background: In the literature, data concerning the relationship between breast cancer and HLA class II gene polymorphisms are limited, so the aim of this study was to determine if HLA-DQB1 and HLA-DRB1 MHC class-II alleles may confer susceptibility or resistance to the disease among Jordanian females. Materials and Methods: This case control study enrolled 56 Royal Hospital breast cancer patients and 60 age matched healthy controls, all of whom provided blood samples (2011-2013). A questionnaire was filled after signing a consent form and DNA was extracted, nucleic acids being amplified for assessment of HLA-DQB1 and HLA-DRB1 alleles by muliplex INNO-LiPA and allele typing carried out by reverse hybridization. Comparison of HLA-DQB1 and HLA-DRB1 allele distributions was carried out with paired t-test and chi-square statistics. Risk factors were assessed by odd ratios with 95% confidence intervals. Results: A significant negative correlation was observed between $HLADQB1^*$ 02 alleles and breast cancers (p=0.013). No significant associations were observed among $HLADQB1^*$ 03, 04, 05 and 06 or among $HLA-DRB1^*$ 01, 03, 04, 07, 08, 10, 11, 13, 14 and 15. Conclusions: $HLADQB1^*$ 02 alleles may provide positive protection against breast tumor risk among Jordanians, but not $HLADQB1^*$ 03, 04, 05 and 06 or $HLA-DRB1^*$ 01, 03, 04, 07, 08, 10, 11, 13, 14 and 15 alleles.
Membrane-bound HLA-G (mHLA-G) discovery on adipose derived stem cells (ADSCs) as a tolerogenic and immunosuppressive molecule was very important. Many documents have shown that HLA-G expression can be controlled via some hormones such as progesterone (P4) and estradiol (E2). Therefore, this study was designed to evaluate progesterone and estradiol effects on mHLA-G in ADSCs at restricted and combination concentrations. Three independent cell lines were cultured in complete free phenol red DMEM and subcultured to achieve sufficient cells. These cells were treated with P4, E2 and P4 plus E2 at physiologic and pregnancy concentrations for 3 days in cell culture conditions. The HLA-G positive ADSCs was measured via monoclonal anti HLA-G-FITC/ MEMG-09 by means of flow cytometry in nine groups. Data were analyzed by one way ANOVA and Tukey's post hoc tests. There were no significant values of the mean percentage of HLA-G positive cells in E2-treated and the combination of P4 plus $E_2-treated$ ADSCs compared to control cells (p value>0.05) but P4 had a significant increase on mHLA-G in ADSCs (p value<0.05). High P4 concentration increased mHLA-G but E2 and the combination of P4 plus E2 could not change mHLA-G on ADSCs.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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