• 제목/요약/키워드: Group A rotavirus

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2009년부터 2013년까지 서울의 일개 대학병원에서 동정된 로타바이러스 유전형의 분포 (Distribution of Human Rotavirus Genotypes in a Tertiary Hospital, Seoul, Korea During 2009-2013)

  • 한태희;박상훈;정주영;황응수
    • Pediatric Infection and Vaccine
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    • 제22권2호
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    • pp.81-90
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    • 2015
  • 목적: 한국에 백신이 도입된 이후 장염으로 입원한 소아에서 확인된 로타바이러스 유전형의 분포를 알아보고자 하였다. 방법: 2009년 8월부터 2013년 6월 사이에 급성 위장관염으로 입원한 소아에게서 수집된 201개의 로타바이러스 양성 대변 검체를 대상으로 로타바이러스 유전형 분석이 시행되었다. 결과: G 유전형은 G9 (33.3%), G1 (22.4%), G3 (15.9%), G2 (6.0%), G4 (3.0%), G10 (1.5%)이었고 혼합형(15.4%) 및 분류불능(2.5%)이 관찰되었다. P 유전형은 P[4] (45.3%)과 P[8] (43.8%)가 주로 검출되었고 혼합형(10.4%)과 P[2] (0.5%)가 발견되었다. G9P[4] 유전형이 2010/2011년에 자주 검출되었으나 이후에 G1P[8] 유전형이 주로 검출되었다. 결론: 로타바이러스 백신 도입 이후 2009-2013년 동안 G1, G3 및 G9이 번갈아가며 주로 검출되는 것을 확인하였다.

돼지 설사 분변에서 돼지 장염 바이러스의 감별 진단을 위한 마이크로 어레이 기법의 적용

  • 조호성;김현진;김용환;조경오;박남용
    • 한국수의병리학회:학술대회논문집
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    • 한국수의병리학회 2002년도 추계학술대회초록집
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    • pp.143-143
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    • 2002
  • 돼지 장염 바이러스를 동시에 감별 진단할 수 있는 새로운 진단법인 oligonicleotide microarray 기법을 돼지 설사 분변을 대상으로 바이러스 감염을 진단하고 기존의 진단법으로 널리 사용되고 있는 RT-PCR과 진단기법의 민감도와 특이도를 비교하고자 하였다. 32개 양돈장, 102 예의 포유 및 이유자돈의 설사분변에서 microarray를 이용한 검사결과 Transmissible gastroenteritis virus (TGEV) 9.8%, porcine epidemic diarrhea virus (PEDV) 28%, (porcine enteric calicivirus (PECV) 18.6%, porcine rotavirus (PRV) group A 6.9%, PRY group C 1% 의 검출률을 확인하였다. 또한 RT-PCR 기법과의 비교에서도 100%의 민감도와 72.2%의 특이도를 보였으며 agreement는 85.3%, kappa value 0.71로 우수한 진단기법임을 확인하였다. 이를 통해 microarray 진단법은 RT-PCR 후의 전기영동 과정과 민감도를 높이기 위해 수행되는 nested PCR 수행의 번거러움을 없애면서 정확한 감별진단을 수행할 수 있는 진단 기법임을 확인하였다.

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단일 센터에서 경험한 소아에서의 노로바이러스 위장관염과 연관된 양성 경련 (Convulsions with Noroviral Gastroenteritis in Children at a Single Center in Korea)

  • 강수연;이현주;김신혜
    • 대한소아신경학회지
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    • 제26권4호
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    • pp.233-239
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    • 2018
  • 목적: 바이러스성 위장염은 유소아에서 흔한 질병이다. 바이러스성 위장염은 위장염과 연관된 양성 경련의 형태로서 경련을 일으킬 수 있다. 로타바이러스 백신 개발 후 노로바이러스는 소아에서 더욱 임상적으로 의미를 갖게 되었다. 본 연구에서는 바이러스 감염이 확진된 위장염과 연관된 소아 경련 환자에서, 특히 노로바이러스를 중심으로 후향적으로 임상양상을 분석해 보고자 하였다. 방법: 2014년 7월부터 2016년 6월까지 명지병원을 내원한 소아환자 중 경련 및 위장염으로 입원한 15세 미만의 소아 환자를 대상으로 의무 기록 조회를 통한 후향적 연구를 진행하였다. 결과: 경련 및 위장염으로 입원한 46명의 환자(남아 24명, 여아 22명)을 대상으로 연구하였다. 이 환자들 중 노로바이러스 21건(45.7%), 아데노바이러스 3건(6.5%), 로타바이러스 2건(4.3%), 아스트로바이러스 1건(2.2%)이 검출되었다. 노로바이러스 위장염군의 환자는 비-노로 바이러스성 위장염군에 비해 설사 발생률이 높았다(61.9% vs 28.0%, P<0.05). 노로바이러스 위장염과 연관된 양성 경련은 전신발작 형태를 보였다. 12명의 환자는 뇌전증 지속상태가 나타났으며, 그 중 5명 (23.8%)이 노로바이러스 위장염군에서, 7명 (33.0%)이 비-노로 바이러스 위장염군(P=0.837) 에서 발생하였다. 발작은 12명의 환자 중 8명(66.7%)에서 정맥으로 투여한 benzodiazepines에 의해 효과적으로 종결되었다. 12명의 환자 중 3명(25%)에서 fosphenytoin이나 levetiracetam과 같은 지속성 항 경련제가 필요하였다. 결론: 위장염과 연관된 양성 경련 환자는 원인이 노로바이러스 또는 비-노로바이러스임에 따라 임상양상이 크게 달라지지 않으나, 초기에 적극적인 항경련 치료를 필요로 하는 경우를 드물지 않게 확인할 수 있었다.

Detection and molecular characteristics of bovine rotavirus A in dairy calves in China

  • Liu, Xiaoying;Yan, Nan;Yue, Hua;Wang, Yuanwei;Zhang, Bin;Tang, Cheng
    • Journal of Veterinary Science
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    • 제22권5호
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    • pp.69.1-69.12
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    • 2021
  • Background: Bovine group A rotavirus (BoRVA) is a major cause of severe gastroenteritis in newborn dairy calves. Only one study has investigated the G and P genotypes among dairy calves in a few regions of China, which were G6 and P[5]. Therefore, data on the prevalence and molecular characteristics of BoRVA in dairy calves in China remains limited. Objectives: The purpose of this study was to investigate the prevalence and molecular characteristics of BoRVA in dairy calves in China. Methods: 269 dairy calves diarrheic samples from 23 farms in six provinces in China were collected to detect BoRVA using reverse transcription polymerase chain reaction. Results: 71% of samples were determined to be BoRVA-positive. Two G genotypes (G6, G10) and two P genotypes (P[1], P[5]) were identified, and G6P[1] BoRVA was the predominant strain. Moreover, the VP7 and VP4 gene sequences of these dairy calf BoRVA strains revealed abundant genetic diversity. Interestingly, eight out of 17 complete G6 VP7 sequences were clustered into G6 lineage VI and analysis showed the strains were closely related to Chinese yak BoRVA strains. Conclusions: The results of this study show that BoRVA circulates widely among dairy calves in China, and the dominant genotype in circulation is G6P[1], first report on molecular characteristics of complete P[5] VP4 genes in chinese dairy calves. These results will help us to further understand the prevalence and genetic evolution of BoRVA among dairy calves in China and, thus, prevent the disease more effectively.

The prevalence of causative agents of calf diarrhea in Korean native calves

  • Chae, Jeong-Byoung;Kim, Hyeon-Cheol;Kang, Jun-Gu;Choi, Kyoung-Seong;Chae, Joon-Seok;Yu, Do-Hyeon;Park, Bae-Keun;Oh, Yeon-su;Choi, Hak-Jong;Park, Jinho
    • Journal of Animal Science and Technology
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    • 제63권4호
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    • pp.864-871
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    • 2021
  • Infectious calf diarrhea is one of the most significant diseases of neonatal calves. This study is conducted to identify the prevalence of pathogens in calf diarrhea for 2 years. A total of 544 feces samples from Korean native beef calves were obtained to investigate selected seven pathogens causing calf diarrhea: bovine rotavirus, bovine coronavirus, Cryptosporidium parvum, bovine viral diarrhea virus, Eimeria species, Escherichia coli K99, and Salmonella species. The presence of diarrhea, the number and species of detected pathogens, and the calves' ages were analyzed using various statistical methods depending on the case. Of the 544 calves, 340 calves (62.5%) had normal feces and 204 calves (37.5%) had diarrhea. The presence of pathogens was significantly associated with diarrhea (p < 0.01) and fecal scores and the number of detected pathogens showed a significant linear trend (p < 0.001). Of the 7 target pathogens, 6 were detected in samples, but only C. parvum (p = 0.001) and bovine rotavirus (p < 0.001) were found at significantly higher rates in diarrheic calves than in non-diarrheic calves. Only Eimeria spp. showed a significant linear trend between the detection rate of the pathogen and the age groups (p < 0.05).

2015년부터 2018년까지 일개 이차병원에서 동정된 소아 급성 위장염 원인 병원체의 분자진단과 역학의 임상적 연구 (Molecular Detection and Epidemiology of Etiologic Agents among Children with Acute Gastroenteritis at a Secondary Hospital from 2015 to 2018)

  • 김영상;정주영
    • Pediatric Infection and Vaccine
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    • 제27권2호
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    • pp.90-101
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    • 2020
  • 목적: 급성 위장염의 대부분의 경우 원인 병원체가 확인되지 않는다. 최근 들어 발달한 multiplex reverse transcriptase-polymerase chain reaction (RT-PCR) 검사는 장염 병원체 검출에 도움을 줄 수 있다. 이 연구는 multiplex RT-PCR을 이용해, 소아 장염환자에서 병원체의 역학을 조사하고자 하였다. 방법: 2015년 5월부터 2018년 6월까지 대한민국 서울의 2차병원에서 급성 위장염으로 진단받은 소아 환자의 대변에서 병원체를 확인하기 위해 multiplex RT-PCR 검사를 시행하였다. 결과: 바이러스 병원체에 대한 1,366개의 대변 검체 중, 483개(35.3%)에서 1개 이상의 병원체가 분리되었다. A군 로타바이러스는 106건(7.8%)에서 확인되었으며, 양성률은 3.0% (8/263)에서 16.7% (48/288)까지 매년 증가했다(P<0.001). 노로바이러스 GII는 가장 흔한 바이러스성 병원체였고(263/1366, 19.3%), 3년간 양성률은 증가하지 않았다. 세균성 병원체에 대한 304개의 대변 검체 중 캄필로박터(32/304, 10.5%)는 가장 흔한 세균성 병원체였으며, 그 다음으로 Clostridium difficile (toxin B) (22/304, 7.2%), 살모넬라균(17/304, 5.6%)이었다. 이 균들의 양성률은 연구기간 동안 증가하지 않았다. 결론: 로타바이러스 백신 도입 이후 노로바이러스 GII가 소아 장염에서 주요한 병원체였지만, 연구기간 동안 로타바이러스 감염 환자가 증가했고, 특히 2018년에는 급증했다. 따라서 새로운 로타바이러스 균주의 등장 가능성을 포함한 추가 연구가 필요하다. 캄필로박터는 소아 세균성 장염의 주요 원인이며, 적절한 치료를 위해 이 균의 임상적 특성을 고려하고 지속적 감시가 필요하겠다.

광주지역 한우 분변 내 설사병 병원체 조사 (Prevalence of enteropathogens in the feces from diarrheic Korean native cattle in Gwangju area, Korea)

  • 고바라다;김효중;오아름;정보람;박재성;이재기;나호명;김용환
    • 한국동물위생학회지
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    • 제42권2호
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    • pp.93-112
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    • 2019
  • Calf diarrhea is a common disease in young claves and is still a major cause of productivity and economic loss in livestock farms. Fecal samples from Korean native cattle (n=100) with diarrhea from 64 farms in Gwangju area, Korea from september 2017 to December 2018 were examined for shedding of important protozoan parasitic, viral and bacterial pathogens using culture, rapid test kit and PCR methods. Of 57 (89.1%) of the 64 Korean native cattle farms examined had samples infected with at least one of the investigated pathogens. Among 100 fecal samples, 88 samples were positive for at least one the twelve pathogens and 51 samples were simultaneously positive for two or more pathogens by culture and PCR assay. Bovine group A rotavirus (BRV) was the most common pathogen, found in 43/100 (43.0%) samples on 32/64 (50.0%) farms. Subsequently, kobuvirus (30.0%), pathogenic E. coli (29.0%), bovine parvovirus (17.0%), Giardia spp. (13.0%), Eimeria spp. (10.0%), Clostridium perfringens type A (8.0%), bovine torovirus (8.0%), bovine viral diarrhea virus (6.0%), bovine coronavirus (5.0%), bovine norovirus (2.0%) and Cryptosporidium spp. (2.0%) were detected. Nebovirus, kırklareli virus, bovine adenovirus, Salmonella spp. and intestinal parasites were not detected. Of the 72 calves sampled in this age group, 64 (88.9%) samples were positive for at least one enteropathogen. BRV was identified in 34/72 (47.2%) samples from 27/48 (56.3%) farms. Subsequently, pathogenic E. coli (30.6%), kobuvirus (29.2%), BPaV (22.2%), Giardia spp. (15.3%), Eimeria spp. (9.7%), BVDV (6.9%), Cl. perfringens type A (6.9%), BCoV (4.6%) and Cryptosporidium spp. (2.8%) were detected in fecal samples. A total of ninety-six strains of E. coli were isolated from one hundred fecal samples collected from Korean native cattle with diarrhea. The presence of stx1, stx2, eaeA, LT, STa, STb, ehxA, saa, F4, F5(K99), F6, F17, F18 and F41 genes in the isolates was investigated by PCR. Out of ninety-six E. coli isolates screened for specific genes, 30 strains E. coli were identified to harbor shiga toxin-producing E. coli (STEC) 7 (7.3%), enterohemorrhagic E. coli (EHEC) 8 (8.3%), enteropathogenic E. coli (EPEC) 6 (6.3%), enterotoxigenic E. coli (ETEC) 2 (2.1%) and STEC/ETEC hybrid 7 (7.3%). This study provides epidemiological estimates of the prevalence of Korean native cattle's enteropathogens in Gwangju area, Korea, which would be used for cattle farmers and veterinarians to select appropriate therapeutic method.

RT-PCR 기법을 이용한 돼지 로타바이러스 주요 혈청법 감별진단 (RT-PCR for detection of group A, B and C porcine rotaviruses)

  • 박최규;류영수
    • 대한수의학회지
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    • 제38권1호
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    • pp.85-89
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    • 1998
  • 본 연구에서는 돼지 로타바이러스의 혈청형 A, B 및 C를 동시에 진단할 수 있는 RT-PCR 기법을 개발하였다. 각각의 혈청형에 특이적인 primer를 이용하여 RT-PCR 기법으로 분변시료에서 직접 바이러스 동정을 실시한 결과, 23건의 로타바이러스 감염 분변 시료에서 13건이 혈청형 A, 3건이 혈청형 B, 2건이 혈청형 C로 나타나 국내에서도 A, B 및 C형의 돼지 로타바이러스가 공히 발생하고 있음을 확인하였으며, 발생분포는 외국의 예와 유사하였다. 이 RT-PCR기법은 돼지 로타바이러스의 주요 혈청형인 A, B 및 C형의 동시감별진단법으로 이용될 수 있을 것으로 판단된다.

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2008년 대한소아과학회 예방접종 스케줄 (Immunization schedule Recommended by Korean Pediatric Society, 2008)

  • 이환종
    • Pediatric Infection and Vaccine
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    • 제15권1호
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    • pp.1-4
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    • 2008
  • Immunizations are among the most cost-effective and widely used public health interventions. This is a report a revision of recommendation of immunization for children by Korean Pediatric Society. Immunization. Vaccines were divided into 4 groups. 1) Vaccines that are recommended to all infants and children (BCG, hepatitis B vaccine, DTaP, Td, Polio vaccine, Japanese encephalitis vaccine, MMR, varicella vaccine, influenza vaccine [6-23 months of age], H. influenzae type b vaccine), 2) those that can be administered to all infants and children, but decision of administration is made by parents (pneumococcal conjugate vaccine, hepatitis A vaccine, influenza vaccine [healthy children ${\geq}24$ months of age], rotavirus vaccine, human papilloma virus vaccine), 3) those that should be given to high risk group (pneumococcal polysaccharide vaccine [high risk patients ${\geq}24$ months of age], influenza vaccine [high risk patients ${\geq}24$ months of age], typhoid vaccine), and 4) those administered for control of outbreaks or prevention of emerging infectious diseases. Immunization schedule recommended by Korean Pediatric Society in 2008 is presented.

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2004년 충남지역 의료기관의 설사환자 가검물에서 분리된 병원성미생물 감염실태에 관한 조사연구 (Investigation for the Infectious Diarrhea by Pathogenic Microorganism from Hospitals in ChungNam Province in 2004)

  • 김우식;송낙수;성시열;차윤태;서우성;이무식;김건엽;나백주
    • 농촌의학ㆍ지역보건
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    • 제30권2호
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    • pp.137-149
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    • 2005
  • 2004년 1월부터 12월까지 충남지역 5개 지정 협력병원에서 수거한 설사환자의 대변가검물 787건에 대한 병원성세균, 설사바이러스 및 원충에 대한 검사를 실시하여 다음과 같은 결론을 얻었다. 병원성 세균 10종에 대한 검사결과 Salmonella spp. 27건, 병원성대장균 20건(EHEC 3건, EPEC 9건, ETEC 8건), Clostridium perfringens 18건, Staphy-lococcus aureus 6건, Vibrio parahaem-olyticus 4건과 Shigella spp. 4건 등 79건이 분리되었다. 병원성 바이러스 4종에 대한 검사결과 rotavirus 115건, norovirus 55건, astro-virus 5건, rotavirus 4건, norovirus 4건의 혼합감염, adenovirus 3건, rotavi-rus 2건과 astrovirus 2건의 혼합감염으로 총 190건이 검출되었다. 원충 3종에 대한 검사결과 Entam-oeba histolytica 5건, Giardia lamblia 1건으로 6건이 검출되었다. 병원성세균은 10세 이하에서 26.8%, 61세 이상에서 45.6%, 바이러스는 10세 이하에서 65.8%, 61세 이상에서 17.4% 그리고 원충은 10세 이하에서 83.3%, 61세 이상에서 16.7%로 모두 10세 이하와 61세 이상에서 높은 검출을 보였다. 특히, 5세 이하의 어린이 경우 세균은 20.3%, 바이러스는 63.7% 그리고 원충은 83.3%로 높은 검출을 보였다. 병원성세균은 월별, 계절별로 분리율 차이가 미미하나 1월과 3월에 각각 2.5%로 가장 적게 분리되었고 8월에 16.7%로 가장 많이 분리되었다. 병원성 바이러스는 9월에 1.6%로 가장 적게 4월에 14.7%로 가장 많이 검출 되었다. Salmonella spp.는 ampicillin, chloramphenicol, tetracycline, nalidixic acid, ticarcillin에 비교적 높은 내성을 나타냈고, Shigella spp.는 ampicillin, trimethoprim/sulfamethoxazole, chloram-phenicol, tetracycline, ampicillin/sulbactam, ticarcillin에 비교적 높은 내성을 나타냈으며, 병원성대장균은 ampicillin, ceph-alothin, gentamicin, tetracycline, nalidi-xic acid, ampicllin/sulbactam, ticarcillin에 비교적 높은 내성을 나타내었다.

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