• 제목/요약/키워드: Gridding

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유전체 연구용 그리딩 로봇 시스템의 개발 (Development of Gridding Robot System for Genome Research)

  • 추창환;서동현;김찬수;박지영;임용표;김기대
    • Journal of Biosystems Engineering
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    • 제26권4호
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    • pp.391-398
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    • 2001
  • A robot system for clone replication and gridding, which is a preliminary state of the genome research, was developed and evaluated its performance. This gridding robot system consisted of 1) a gridding heat that replicated the clone, 2) a manipulator, as a part of body of robot, which transferred the gridding head along x-, y-, z-axis, 3) a well plate arranging board, 4) a sterilization unit, and 5) a control unit. Performance of the system was evaluated with 1) repeatability of the robot system, 2) clone replication efficiency, 3) time requirement of the replication, and 4) sterilization efficiency. The repeatability error of the robot system showed 0.219 mm and 0.094 mm in the direction of x- and y-axis, respectively. The success rate of the clone replication with the gridding head was 100% on the membrane filter. The time required for the replication was four minutes and fifty-five seconds from the four 96 well plates to a 384 well plate meanwhile the required time with well experienced hand labor was three minutes thirty-five seconds. The gridding operation of clone could not be done by hand labor and the required time with robot system for the gridding on the membrance filter with the control program 5$\times$5: 1 copy and 384 gridding pins was twenty minutes and twenty-five seconds. The efficiency of the sterilization was considered to be satisfactory since no growth of fungi was found around the area of replication in the membrane filter.

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3D 점 데이터 그리딩을 위한 고성능 병렬처리 기법 (A Parallel Approach for Accurate and High Performance Gridding of 3D Point Data)

  • 이창섭;;이희진;오상윤
    • 정보처리학회논문지:컴퓨터 및 통신 시스템
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    • 제3권8호
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    • pp.251-260
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    • 2014
  • 3D 점 데이터는 높은 정확성을 가진 사물의 표면 정보 데이터로 다양한 분야에서 사용되고 있으며, 특히 지리학에서 지형 파악과 분석에 많이 사용되고 있다. 일반적으로 3D 점 데이터의 Gridding 과정을 거치게 되는데 이는 불연속적인 점 데이터를 일정한 좌표 값으로 만드는 과정으로 긴 실행 시간과 높은 비용이 필요하다. 특히 Gridding 과정 중 보간 작업을 위해서 Kriging이 높은 정확성으로 주목받고 있지만 처리과정이 복잡하고 연산이 많아 처리속도가 상대적으로 느리기 때문에 많이 사용되지 않고 있다. 본 논문에서는 Gridding을 고성능으로 처리하기위해 Kriging 연산 과정을 병렬화했으며 격자 자료구조를 MapReduce 패러다임에 맞게 변형하여 Kriging에 적용하였다. 실험은 항공 LiDAR 데이터 약 1.6백만 개와 4.3백만 개의 점 데이터를 이용해서 제안한 MapReduce 구조에 적용하였고, 그 결과 3대의 이기종 클러스터에서 전체 실행시간이 순차적 프로그램에 비해 최대 3.4배 단축하였다.

격자화 기법에 따른 이산지형정보의 보간특성 연구 (A Study on the Interpolation Characteristics of the Scattered Geographic Data according to the Gridding methods)

  • 이용창
    • 대한공간정보학회지
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    • 제4권2호
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    • pp.173-180
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    • 1996
  • 격자화 자료변환에서는 격자절점의 보간과정에서 경중률을 산정하는 수학적 알고리즘과 이산자료의 특성에 따라 격자화 기법들간에 상이한 보간결과를 제시하므로 격자화기법의 최종선정에 앞서 탐색거리, 탐색영역, 탐색옵션에 따른 격자화기법들의 사전 검토가 요망된다.; 이를 위해 본 연구에서는 해석 입체도화기로부터 획득한 이산지형정보에 6가지 격자화기법을 동일한 검색기준에 따라 적용하고 원자료의 보존성 및 입체도화기로부터 제작된 등고선도와의 비교를 통하여 격자화 기법에 따른 3차원 이산지형정보의 보간특성을 고찰하였으며 아울러 격자화된 DEM의 임의 종단방향에 대한 단면선형의 검토 및 토공량 산정을 통하여 격자화기법의 실 응용면도 고찰하였다.

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서브 그리딩 유한 차분 시간 영역법을 이용한 계단형 임피던스 저역 통과 필터 해석 (Analysis of the Stepped-Impedance Low Pass Filter using Sub-Gridding Finite-Difference Time-Domain Method)

  • 노범석;최재훈;이상선;정제명
    • 한국전자파학회논문지
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    • 제13권2호
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    • pp.217-224
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    • 2002
  • FDTD 해석법에서 공간적 셀의 크기는 해석의 정확도를 결정하는 중요한 요소이다. 하지만 정확도를 향상시키기 위하여 진의 크기를 줄이게 되면, 해석시간과 기억용량의 증가를 초래하게 되는데 서브 그리딩을 사용하여 이를 해결할 수 있다. 본 논문에서는 관심영역만 세밀하게 해석할 수 있는 3차원 서브 그리딩법을 기술하고 이를 응용하여 몇 가지의 구조를 해석하였다. 제안한 방범의 타당성을 화인하기 위하여 균일 그리딩과 서브 그리딩을 적용하여 특성을 해석하고 그 격과를 비교하였다. 제안한 방법을 사용하였을 경우 동일한 정확도에서 균일 그리딩에 비하여 6배의 해석시간의 줄었고 기억용량은 2.5배 정도 줄어들었다.

마이크로어레이 이미지 분석을 위한 계층적 그리드 정렬 알고리즘 (A Hierarchical Grid Alignment Algorithm for Microarray Image Analysis)

  • 천봉경;진희정;이평준;조환규
    • 한국정보과학회논문지:소프트웨어및응용
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    • 제33권2호
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    • pp.143-153
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    • 2006
  • 마이크로어레이(microarray) 실험은 수백 개 혹은 수천 개의 유전자 발현(expression) 정보를 한 번에 실험을 할 수 있기 때문에, 유전자 비교분석에 있어서 획기적인 실험 방법이다. 먼저, 각 유전자의 발현량을 측정하기 위해서 마이크로어레이 실험 결과로 생성된 이미지를 분석해야 한다. 그러나 마이크로어레이 이미지는 많은 유전자들로 구성되어 있기 때문에 사용자가 일일이 수동으로 유전자인 스팟(spot)들을 분석하기는 어려운 일이다. 이와 같은 문제점을 해결하기 위하여 메타그리드(meta-grid)를 이용한 그리딩(gridding) 방법과 자동 그리딩 방법이 제안되었지만, 여전히 이 방법들은 문제점을 가지고 있다. 예를 들어, 메타 그리딩 방법은 동일한 마이크로어레이 칩에서 생성된 이미지일 지라도, 실험 시 발생하는 오류로 인해 그리딩 시 사용자의 수작업이 필요하다. 자동 그리딩 방법은 생성된 마이크로어레이 이미지가 잡영이 많거나 발현율이 낮을 경우, 이미지 분석 작업을 수행하지 못할 수도 있다. 본 논문에서는 메타 그리딩 방법과 자동 그리딩 방법을 혼합한 새로운 그리딩 방법인 자동 메타 그리딩 방법을 위한 계층적 그리드 정렬(hierarchical grid alignment) 알고리즘을 제안한다. 자동 메타 그리딩 방법은 메타 그리드를 입력으로 하여, 계층적 그리드 정렬 알고리즘을 통해 메타 그리드를 마이크로어레이 이미지에 맞게 자동으로 정렬해주는 방법이다. 실험 결과, 본 논문에서 제안한 방법은 이전 방법들보다 휠씬 강건하고 신뢰할 수 있는 그리딩 결과를 제공하였다. 또한 같은 칩에서 생성된 다수의 이미지들을 동시에 분석하는 일괄 분석(batch analysis)시 제안한 방법을 적용함으로써, 보다 신뢰할 수 있는 일괄 분석 환경을 제공해 줄 수 있다. 분리된 빈도수가 높았다는 것과 무관하지 않을 것으로 사료된다. 특히 S. cerevisiae와 Z. rouxii 두 균주는 무염 또는 7% NaCl이 첨가된 배지에서 가장 먼저 가스를 생성하였으며 7% NaCl이 첨가된 조건하에서의 가스생산량은 Z. rouxii 및 S. cerevisiae 각각에서 0.024 ml/ml/hr, 0.013ml/ml/hr로 나타났다.분중 acetix acid ethyl ester, 3-methyl-1-butanol, acetix acid, 2-phenylethanol등의 성분이 다른 향기 성분에 비해 면적 비율이 높은 경향을 보였다.$의 반응표면을 정준분석한 결과 중속 변량인 ${\beta}-carotene$추출함량이 최대점임을 확인하였다. 3) 최적조건 즉, 압력은 350bar, 온도는 $51^{\circ}C$ 및 시간은 200min의 조건을 동시에 만족하는 관심영역에서의 ${\beta}-carotene$의 최대추출량은 생당근 100g당 10,611 ${\mu}g$으로 예측되었다.이 높은 반면 AsA는 둘다 낮은 편이었다. 무기질은 무에서 Fe, Ca, Na, K과 우엉에서는 Na, P, K의 잔존량이 높은 반면 우엉에서 Fe의 잔존율이 극히 낮았다. 6. 각종 조리시 비타민과 무기질의 잔존상태가 전체적으로 좋은 결과를 보인 채소의 순서는 사용된 횟수에 차이가 있으나 도라지>들깻잎, 양배추>무, 오이>참취, 상추>숙주>시금치, 우엉, 돌나물>당근, 호박>콩나물>가지로 나타났으며, 조리법 중에서 잔존율이 좋은 것은 비타민의 경우는 생채이었고 무기질은 생채, 볶음, 조림이었다. 또한 Vit.A는 생채, 볶음, 조림에서 Niacin은 생채, 조림, 찜에서 AsA는

New Approach for Stability of Perturbed DC-DC Converters

  • Hote, Yogesh V.;Choudhury, D. Roy;Gupta, J.R.P.
    • Journal of Power Electronics
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    • 제9권1호
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    • pp.61-67
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    • 2009
  • In this paper, a simple technique is presented for robust stability testing of perturbed DC-DC converters having multi-linear uncertainty structure. This technique provides a necessary and sufficient condition for testing robust stability. It is based on the corollary of Routh criterion and gridding of parameters. The previous work based on parametric control theory using Kharitonov's theorem and Hermite Biehler theorem gives conservative results and only the sufficient condition of stability, whereas the proposed method provides the necessary and sufficient condition for testing robust stability and it is computationally efficient. The superiority of the method is compared with the Edge theorem.

자동 격자 생성법과 설계 요소를 이용한 형상 최적 설계에 관한 연구 (A Study on the Optimal Shape Design Using Automatic Regridding and Design Element)

  • 김호룡;단병주
    • 한국정밀공학회지
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    • 제10권3호
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    • pp.87-96
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    • 1993
  • In this study, the peak stress of a fuillet in elastic structure was optimized to have minimum value by using quadratic isoparametric element. The method of auomatic gridding was also developed along with shape algorithm and design element technique was adopted in selecting design variables. The computer program developed was combined with the Hooke-Jeeves direct algorithm of optimization techniques in order to minimize the peak stress of the fillet. The imployment of design element technique significantly cut down computer time by the reduction in design variables, and the opitmum fillet shape with uniform minimum stress was obtained by varying design variables along x and y directions in improving the shape compared to other results. By using automatic gridding, in which Bezier surfaces and Coons surfaces of cubic interpolation were employed, the irregular boundary was removed resulting in smoother anbd more accurate fillet shape possessing uniform minimum stress.

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DNA칩 이미지 처리를 위한 완전 그리딩 알고리즘 (A Perfect Gridding Algorithm for DNA Chip Image Processing)

  • 김판규;정호열;조환규
    • 한국정보과학회:학술대회논문집
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    • 한국정보과학회 2000년도 가을 학술발표논문집 Vol.27 No.2 (2)
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    • pp.392-394
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    • 2000
  • 본 논문에서는 DNA칩 이미지 처리시스템을 위한 완전 그리딩 알고리즘을 제안한다. DNA칩 이미지를 분석하여 처리할 수 있는 많은 DNA칩 분석 시스템이 있다. 하지만 이전의 시스템들은 정확한 이미지 처리를 통한 올바른 유전자 발현정보를 얻기 위해서 많은 사용자의 개입이 필요한 단점이 있었다. 본 논문에서는 사용자의 개입이 없는 정확한 자동 이미지 처리를 위해서, $\varepsilon$-그래프 모델링 기법을 제시하고, MBR, Mass, Geometry 등 세가지 종류의 반점(spot) 중심을 이용한 완전 그리딩 알고리즘을 제안한다. 제시된 이미지 처리 기술은 완전한 자동 DNA칩 분석 시스템으로, 사용자의 개입없이도 정확한 DNA칩 위치 정보를 얻을 수 있다.

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NOAA/AVHRR 영상의 기하학적 보정 (Geometric Correction of the NOAA/AVHRR Imagery)

  • 서명석;신경섭;박경윤
    • 대한원격탐사학회지
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    • 제6권1호
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    • pp.25-37
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    • 1990
  • Methods of geometric correction for the Advanced Very High Resolution Radiometer imagery of NOAA satellites were developed and applied to the software for image processing of meteorological satellite data. The software for finding the earth location of each scan position and the software for gridding on original imagery were dedigned. On the assumption of circular orbits and the spherical earth, the methods developed were sufficiently accurate in the purpose of most meteorological data analyses.