• 한국패류학회지
• /
• 제26권1호
• /
• pp.19-31
• /
• 2010

Seogundo is a small island adjacent to the southern coast of Jeju Island and connected to it by a boulder beach at low tide Surveys of this area were conducted from 2001 to 2009 to enumerate the mollusks there and also to examine their diversity, relative abundance, and ecological relationships. Both the boulder beach itself and several large tide pools were studied, including the coarse sand substrate and several species of seaweed and coralline algae found in the tide pools. Of the 121 species obtained or observed, there were 97 gastropods, 16 bivalves, and 8 polyplacophorans. Live specimens were obtained for about half of those species. About one third were found on rocky substrate, with the most common species being Nodilittorina radiata and Nerita japonica in the upper intertidal zone, N. radiata and Littorina brevicula in the middle intertidal, and Turbo (Lunella) coronata coreensis and Acanthopleura japonica in the lower intertidal and shallow subtidal. The seaweeds and coralline algae contained about 40% of all mollusk species. The most common mollusks in two species of brown seaweed were Ittibittum parcum, Musculus nanus, and Euplica scripta. In a species of red seaweed, Komaitrochus pulcher was the most frequent, as in the coralline algae, along with M. nanus. The coarse sand in the tidepools contained about 25% of the species, with the Cerithiidae having the largest number. A sample of beach drift contained 17 species, with Bittium aleutaceum and Rissoina (Phosinella) pura being most common. Most species, about 60%, were found in a variety of habitats, especially the marine flora; few species exhibited any habitat preferences. Biographically, Jeju Island is part of the Warm Temperate Northwest Pacific Province and the East China Sea ecoregion with a strong faunal affinity with southern Japan, eastern China, and northeastern Taiwan. Zonal-geographical groupings reveal that the fauna is mainly subtropical-low boreal, preferring moderately warm water, with a somewhat smaller number of tropical-subtropical species.

• 식물병연구
• /
• 제13권3호
• /
• pp.137-144
• /
• 2007

거봉 포도나무에 혹병을 일으키는 A. vitis 균주간의 DNA 다양성 평가를 하기 위하여 12종류의 URP primer 적용 성을 조사한 결과 URP1F, URP2F, URP2R, URP4R, URP17R primer가 균주 간 DNA 다형성검정에 유용하였다. 국내외에서 분리한 59 A. vitis 균주를 URP-PCR 증폭하였던 바 균주간의 매우 다양한 PCR 다형성 밴드를 형성 하였으며 12 strain type으로 나눌 수 있었으며 거봉포도로부터 분리된 A. vitis 균주는 4 strain type의 비교적 단순한 유전적 다양성으로 나타났으나, 거봉이외의 다른 포도 품종이나 국외에서 도입된 A. vitis 균주는 8 strain type의 많은 유전적 다양성을 보여 거봉품종 유래 국내 균주와는 PCR 다형성 type에 있어 차이점을 보였다. URP-PCR 다형성 밴드를 집괴 분석하여 UPGMA dendrogram을 작성한 결과 7개의 대 Group으로 분류할 수 있었으며, 그룹 간에는 $62{\sim}100$%까지 다양한 유전적 유사성이 나타났다.

• The Plant Pathology Journal
• /
• 제33권3호
• /
• pp.296-306
• /
• 2017

Sugarcane mosaic virus (SCMV) is one of the most damaging viruses infecting sugarcane, maize and some other graminaceous species around the world. To investigate the genetic diversity of SCMV in Iran, the coat protein (CP) gene sequences of 23 SCMV isolates from different hosts were determined. The nucleotide sequence identity among Iranian isolates was more than 96%. They shared nucleotide identities of 75.5-99.9% with those of other SCMV isolates available in GenBank, the highest with the Egyptian isolate EGY7-1 (97.5-99.9%). The results of phylogenetic analysis suggested five divergent evolutionary lineages that did not completely reflect the geographical origin or host plant of the isolates. Population genetic analysis revealed greater between-group than within-group evolutionary divergence values, further supporting the results of the phylogenetic analysis. Our results indicated that natural selection might have contributed to the evolution of isolates belonging to the five identified SCMV groups, with infrequent genetic exchanges occurring between them. Phylogenetic analyses and the estimation of genetic distance indicated that Iranian isolates have low genetic diversity. No recombination was found in the CP cistron of Iranian isolates and the CP gene was under negative selection. These findings provide a comprehensive analysis of the population structure and driving forces for the evolution of SCMV with implications for global exchange of sugarcane germplasm. Gene flow, selection and somehow homologous recombination were found to be the important evolutionary factors shaping the genetic structure of SCMV populations.

• 한국버섯학회지
• /
• 제18권1호
• /
• pp.84-90
• /
• 2020

국내의 다양한 지역에서 수집한 19 야생버섯균주를 이용하여 배지조성인 참나무 톱밥과 밀기울을 부피비율 7:3으로 병재배 650 g/1,100 ml에서 자실체를 생산하였다, 시험한 19균주중 14균주가 원기를 형성하였으며 자실체를 생산 할 수 있었으며 대조품종 노루1, 2호의 병당 75 g보다 KFRI349, KFRI1091, KFRI1093은 병당 120 g 이상으로 높은 수확량을 나타내었다. 자실체 색형은 백색과 핑크색으로 나눌 수 있었으며 침의 형태에 따라 고드름형과 산호형으로 구분할 수 있었다. 전자현미경(SEM)에 의한 노루궁뎅이버섯의 담자기, 포자, 침의 형태를 포함한 자실체 미세구조를 관찰 하였으며 UFP-PCR분석으로 균주간의 PCR다형성밴드가 검출되어 4 그룹으로 분류 할 수 있었으며 높은 유전적 다양성을 확인 할 수 있었다.

• 생명과학회지
• /
• 제16권5호
• /
• pp.740-745
• /
• 2006

ISSR 마크로 한국내 자생하는 음나무속 4분류군(음나무, 가시없는 음나무, 털음나무, 가는잎음나무)에 대해 유전적 다양성과 계통관계를 조사하였다. 64개의 재현성 높은 ISSR 밴드가 생성되었다. 음나무속의 각 개체별 분석에서 41개 밴드(64.1%)가 다형성을 나타내었다. 네 분류군을 통합하였을 때 그룹내 다양도는 0.115였고 그룹간 다양도는 0.467이였다. 종내 유전자 흐름(Nm)의 측정결과 음나무의 Nm값은 털음나무, 가는잎음나무에 비해 낮았다. 이는 지리적 거리에 따른 생식적 격리가 이 종의 집단구조를 형성하고 있다고 판단된다. 계통도 분석에서 ISSR 마크로 속수준의 네 분류군뿐만 아니라 집단까지도 잘 분리되어 본 연구에 사용한 마크가 분류에 효과적임이 규명되었다.

• 미생물학회지
• /
• 제46권3호
• /
• pp.255-261
• /
• 2010

남태평양에 서식하는 두 종의 해면 Hyrtios sp. 604와 Callyspongia sp. 612로부터 16S rDNA DGGE 방법을 이용하여 공생세균 군집의 다양성을 분석하였다. DGGE band로부터 염기서열 분석 결과, Hytrios sp. 604의 공생세균은 Alphaproteobacteria, Gammaproteobacteria, Acidobacteria, Actinobacteria, Chloroflexi, Cyanobacteria, Firmicutes로 나타났으며, Callyspongia sp. 612의 공생세균 그룹은 Alphaproteobacteria, Gammaproteobacteria, Chloroflexi, Cyanobacteria로 나타났다. 풍부한 이차대사산물의 생산자로 보고된 Hyrtios 해면 속의 Hyrtios sp. 604는 Callyspongia sp. 612에 비해 더 다양한 공생세균 군집을 나타내었으며 주요 공생세균 군집으로 Actionobacteria가 포함되었다. 동일 지역에 서식하나 화학적 특성이 다른 두 해면 종의 세균 군집은 서로 다른 것으로 나타났다. 발견된 공생세균의 염기서열은 90% 이상이 uncultured clone들과 높은 상동성을 나타내었다.

• 한국작물학회지
• /
• 제66권4호
• /
• pp.443-451
• /
• 2021

Finger millet (Eleusine coracana) is widely cultivated in tropical regions worldwide owing to its high nutritional value. Finger millet is more tolerant against biotic and abiotic stresses such as pests, drought, and salt than other millet crops; therefore, it was proposed as a candidate crop to adapt to climate change in Korea. In 2019, we used expressed sequence tag simple sequence repeat (EST-SSR) markers to evaluate the genetic diversity and structure of 102 finger millet accessions from two geographical regions (Africa and South Asia) to identify appropriate accessions and enhance crop diversity in Korea. In total, 40 primers produced 116 alleles, ranging in size from 135 to 457 bp, with a mean polymorphism information content (PIC) of 0.18225. Polymorphism was detected among the 40 primers, and 13 primers were found to have PIC values > 0.3. Principal coordinate and phylogenetic analyses, based on the combined data of both markers, grouped the finger millet accessions according to their respective collection areas.Therefore, the 102 accessions were classified into two groups, one from Asia and the other from Africa. We have conducted an in-depth study on the finger millet landrace pedigree. By sorting out and using the molecular characteristics of each pedigree, it will be useful for the management and accession identification of the plant resource. The novel SSR markers developed in this study will aid in future genetic analyses of E. coracana.

• Journal of Species Research
• /
• 제12권4호
• /
• pp.281-285
• /
• 2023

The red-tongue viper(Gloydius ussuriensis) is one of only three species of the genus Gloydius found in South Korea. Gloydius ussuriensis has a narrow activity radius and is distributed nationwide, and this species was reported to have the largest population among the Korean species in genus Gloydius. Preliminary results of a phylogenetic analysis using part of the mitochondrial DNA indicated that domestic G. ussuriensis is not comprised of monophyletic groups, and morphological analysis showed differences between domestic populations. In this study, we developed 17 microsatellites for the analysis of G. ussuriensis genetic diversity based on these characteristics. These microsatellites were developed using six multiplex panels, which could be employed to validate 80 G. ussuriensis specimens from different geographical regions in South Korea. The average number of alleles per locus was 12.2 and ranged from 4 to 25 alleles; the observed heterozygosity ranged from 0.238 to 0.950 and the expected heterozygosity ranged from 0.213 to 0.933. As a result of assessing four inland populations, a high level of genetic diversity was confirmed. These newly developed markers will be useful for further studies on the population structure and evolutionary history of the G. ussuriensis.

• 한국습지학회지
• /
• 제22권2호
• /
• pp.100-105
• /
• 2020

수변 및 육상 식생의 경계에 서식하는 쥐방울덩굴(Aristolochia contorta)은 국내 취약종인 꼬리명주나비(Sericinus montela) 유충의 유일한 기주식물이라는 점에서 높은 보전가치를 지닌다. 개체군의 장기적인 유지에 있어서 유전적 다양성은 반드시 고려되어야 하며, 이를 위하여 기존 개체군의 유전적 다양성을 파악하는 과정이 선행되어야 한다. 쥐방울덩굴 개체군이 장기적으로 유지되고 있는 네 서식처의 개체군을 대상으로 개체들의 잎을 채집하여 DNA를 추출하였으며, 5개의 무작위 프라이머를 이용한 RAPD-PCR을 수행하여 각 개체군의 유전적 다양성을 비교하고 개체군 간의 유연관계를 파악하였다. 개체군 내 유전적 다양성은 4개 개체군 중 가평 개체군(GP)이 가장 높았으나, 전반적인 유전적 다양성은 다른 종에 비해 낮은 편으로 나타났다(h: 0.0607 ~ 0.1491; I: 0.0819 ~ 0.1759). 또한 가평 개체군의 경우 지리적 거리와 무관하게 다른 개체군들과의 유전적 거리가 큰 편으로 나타났다. 이는 파편화된 서식지와 더불어 낮은 유성생식 비율에서 기인한 것으로 추정된다. 쥐방울덩굴 개체군의 보전을 위해서는 개체군 혼합 식재와 적절한 차광이나 물리적 지지와 같이 쥐방울덩굴의 유성생식 을 촉진하는 환경이 적극적으로 고려되어야 할 것이다.

• 생명과학회지
• /
• 제25권5호
• /
• pp.533-538
• /
• 2015

경상남도 고성군 거류면 용산리 신은저수지 수계 4곳과 정촌 저수지 1곳 수계에서 어류 다양성 분석을 실시하였다. 인위적 교란과 환경변화에 따른 집단조절을 유도하는 밀도 의존성을 평가하였다. SMATR freeware를 사용하여 어류 밀도에 영향을 미치는 환경 요인 분석을 실시하였다. 2012년에 4과 8속 9종 158개체가 동정되었다. 비교적 풍부한 어종은 참붕어(Pseudorasbora parva)로 빈도는 33.1%였다. 그 다음은 송사리(Oryzias latipes)로 28.8%였다. 2012년에는 4곳에서 밀도 효과가 감소하였다. 신은저수지의 Shannon-Weaver의 다양도 지수(H’)는 정촌 저수지의 다양도와 유사하였다. 종 다양도는 0.645에서 2.105로 다양하게 나타났다. 상류지역의 다양도(H’)는 중류와 하류지역보다 높았다. 풍부도 지수 역시 상류가 하류보다 높았다. 강의 하류 두 지점을 제외한 최대 가능성 분석을 이용하면 한 지점에서 다른 지점으로 이동한 5종의 가능성은 평균 0.623이였다. 특히 신은저수지와 정촌저수지 간 이동 가능성은 높았다(평균 0.681). 이는 두 저수지간 지리적으로 짧은 탓에 기인한다(50 m). 나머지 4종에 대한 최대 이동가능성은 유의성이 없어 지점간 유사함을 시사한다.