• 한국발생생물학회지:발생과생식
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• 제13권2호
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• pp.97-103
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• 2009

Genomic DNA samples isolated from four geographical freshwater crab (Eriocheir sinensis) populations collected in the inland of the Korean Peninsula (Gunsan, Paju, and Nampo) and a Chinese site, were used for PCR amplification. Seven decamer primers generated 19 specific loci (19/243 loci, 7.81%) in the Gunsan population, 32 (32/215 loci, 14.88%) in the Paju population, 19 (19/231 loci, 8.23%) in the Nampo population and 62 (62/340 loci, 18.24%) in a Chinese population. The average 8.9 specific loci exhibited inter-individual-specific characteristics, thus revealing DNA polymorphisms in the Chinese population. The number of unique shared loci to each population and number of shared loci by the four populations were generated by molecular analysis using seven primers in four populations. 35 unique shared loci to each population, with an average of 5.0 per primer, were observed in the Gunsan population, and 50 loci, with an average of 7.1 per primer, were observed in the Chinese population. The hierarchical dendrogram indicates three main branches: cluster 1 (GUNSAN 01$\sim$GUNSAN 05, PAJU 06$\sim$PAJU 10 and NAMPO 11$\sim$NAMPO 15) and cluster 2 (CHINESE 16, 17, 18, 19 and 20). Conclusively individual no. 20 of the PAJU 10 freshwater crab was most distantly related to CHINESE no. 20 (genetic distance = 0.667). Taken together, these results demonstrate the potential of RAPD analysis to identify diagnostic markers for the identification of four freshwater crab populations.

• 한국어류학회지
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• 제18권4호
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• pp.300-310
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• 2006

한국 서해안의 서천 및 고창지역과 남해안의 부산지역으로부터 채취한 전어(Konosirus punctatus) 3개 집단의 개체로부터 genomic DNA를 분리 추출하여 PCR로 반복해서 증폭시켰다. 8개의 decamer와 20-mer를 사용하여 전체적으로 서천의 전어집단에서 713개의 loci, 부산집단에서 791개 및 고창 전어집단으로부터 732개의 100 bp에서 2,800 bp의 크기에 해당되는 total loci를 얻어냈다. 우리는 서천 전어집단에서 독특한 50개의 unique loci, 부산 전어집단으로부터 70개의 unique loci 그리고 고창의 전어집단으로부터 130개의 unique loci를 각각 확인하였고, 또한 3개 전어집단 모두에 대해서 공통적으로 가지고 있는 120개의 shared loci도 확인하였다. 특이한 specific loci를 확인한 결과 서천 전어집단에서는 108개(15.1%), 부산집단에서는 74개(9.4%) 그리고 고창 전어집단에서는 67개(9.2%)를 각각 얻어냈다. 또한 8개의 primer를 통해서 서천 전어집단에서 48개 (6.7%), 부산 전어집단에서는 26개 (3.3%) 그리고 고창 전어집단에서 16개 (2.2%)의 polymorphic loci를 얻어냈다. Similarity matrix를 통해서 볼 때 서천 전어집단에서 0.756에서 0.936까지, 부산집단에서 0.800에서 0.938까지 그리고 고창 전어집단에서 0.731에서 0.959까지의 공유가(bandsharing value)를 확인하였다. 8개의 primer를 이용하여 얻어진 dendrogram을 통해서 볼 때 genetic cluster는 cluster 1 (SEOCHEON 01~SEOCHEON 10), cluster 2 (BUSAN 11~BUSAN 20과 GOCHANG 23~GOCHANG 24) 그리고 cluster 3 (GOCHANG 21, 22, 25, 26, 27, 28, 29 및 30)와 같이 3개의 cluster로 나누어졌다. 위에서와 같이 고창 전어집단의 일부 개체는 부산 전어집단에 속하는 것으로 나타났으며, 따라서 2 전어집단의 일부 개체들은 부분적으로 오고 가는 이주현상을 나타내는 것으로 사려된다. 이러한 결과를 볼 때 RAPD-PCR 분석 방법을 통해서 우리는 지리적으로 떨어져 있는 3개의 전어 집단에 존재하는 유의성이 있는 유전적 거리를 확인할 수 있었다. 여러 가지 decamer와 20-mer를 이용한 RAPD-PCR 분석 방법은 종 및 지리적 집단과 지리적 전어집단에 존재하는 유전적 다양성, 다형성 및 유전적 유사성을 확인하는데 필요로 하는 독특한 specific/polymorphic marker를 확인할 수 있는 이용 가능한 방법이라고 할 수 있다.

• 한국동물학회지
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• 제32권3호
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• pp.242-251
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• 1989

한국 특산종 Cobitis kireensis의 두 아종 C. k. koreensis와 C. k. pumilus의 지리적 변이 및 아종의 위치를 규명하기 위하여 남한의 6개 집단에서 채집된 457개체를 대상으로 형태 형질 분석 및 전기영동법에 의한 유전적 변이를 조사하였다. 형태형질의 계측, 계수 및 discriminant function 분석에서 집단 간 및 아종 간의 유의한 차이는 발견되지 않았다. 각 집단 간 유전적 변이는 평균 A=1.5, P =37.3%, HD=0.053, 및 HG=0.097로 타 어류군이 변이정도보다 다소 높은 편이었으나 C. k. pumilus는 A= 1.2, P=19.0%, HD=0.029, 및 HG=0.078로 변이정도가 매우 낮았다. 두 아종 간의 평균 유전적 근연치는 S=0.894로 C. k. koreensis 5개 집단간 평균 유전적 근연치 S=0.894와 거의 동일하였으며 아종 간에 유전적 차이가 없었다. 따라서 C. k. pumilus를 아종으로 분류하는 것은 부적합하다고 사료된다.

• 한국산림과학회지
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• 제102권1호
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• pp.122-128
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• 2013

우리나라에 분포하는 가침박달 9개 집단의 유전다양성과 유전구조를 ISSR 표지자를 이용하여 분석하였다. 선발된 6개 ISSR primer에서 다형성 band는 35개로 primer당 평균 5.8개(S.D.=2.32), 집단별 다형적 유전자좌의 비율은 평균 78.7%로 나타났다. AMOVA에서 전체 유전변이의 27.8%는 집단간 차이에 기인하며, 72.2%는 집단내 개체 간 차이로 설명할 수 있었다. 베이즈 방법에 따른 유전분화는 ${\theta}^{11}$와 $G_{ST}$가 각각 0.249와 0.227로 추정되었으며, 전체 집단에 대한 근친교배율은 0.412로 계산되었다. 집단간의 지리적 거리와 유전적 거리에 대한 상관성 분석에서 지리적 거리가 멀수록 유전적으로 상이한 것으로 나타났다. 베이즈 군집분석에서 가침박달 집단은 유전변이 분포에 따라서 1) 대구 지역의 2집단 및 안동, 청송, 예천 집단이 하나의 구역으로, 그리고 2) 단양, 영월 집단과 3) 임실, 청주 집단이 각각 하나의 구역으로 묶여서 총 3개 구역으로 나눌 수 있었다. 구역의 유전변이는 백두대간과 정맥의 산줄기를 경계로 분포하는 것으로 생각되며, AMOVA에서 전체 유전변이량의 10.0%는 구역간, 19.7%는 집단간, 나머지 70.3%는 집단내 개체간 차이로 설명되었다. 아울러 가침박달의 현지내 유전자원보존을 위한 유전다양성 평가와 유전구조 분석결과의 적용에 대하여 살펴보았다.

• 한국지리정보학회지
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• 제26권4호
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• pp.1-16
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• 2023

2005년에 전국적으로 10개 혁신도시의 위치 선정이 완료되었으며, 2013년부터는 공공기관이 혁신도시로 이전하기 시작하였다. 국토의 균형발전을 위해 시행되었던 정책이니만큼 지역에서 기대도 작지 않았다. 하지만 혁신도시 건설로 이전해 오는 인구는 늘었지만 과연 수도권에서 얼마나 유입되는지, 그리고 국토 공간적으로 어떤 특징이 있는지 분석해 봄으로써 혁신도시가 제대로 그 역할을 하는지를 알아보고, 향후 혁신도시의 정책방향을 재검토해 보고자 한다. 이에 본 연구에서는 통계청의 MDIS(Microdata Integrated Service)를 이용하여 2013년부터 2021년까지 혁신도시에서 인구이동의 공간적 특성을 분석하였다. 총 10개 혁신도시 중 기존 시가지에 건설되어 혁신도시만의 인구 데이터 구축이 어려운 경우를 제외하고 3개 혁신도시만을 대상으로 분석해 보았다. 그 결과 혁신도시 개발 초기에는 수도권으로부터의 인구 유입이 많아 수도권 인구분산과 국토균형 발전에 일부 효과가 있었으나 시간이 지남에 따라 오히려 수도권으로 다시 유출되는 인구가 더 많아지는 현상이 나타나 문제점으로 지적된다. 또한 경북혁신도시와 광주전남혁신도시는 전입사유, 세대주연령, 세대원수 등에서 유사하였지만 경남혁신도시와 다른 특징이 나타났다. 그 이유는 다양하겠으나 현재 상태로는 혁신도시를 통해 '균형있는 국토발전' 목표를 달성하기 한계에 도달했으므로 지역 특성을 고려한 혁신도시 개선 방안 마련이 필요하다. 아울러 최근 논의되고 있는 제2차 공공기관 이전 계획도 이와 같은 문제를 반복하지 않기 위해 보다 신중하게 설계되어야 할 것이다.

• Animal Systematics, Evolution and Diversity
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• 제28권4호
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• pp.279-290
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• 2012

Plecoglossus altivelis (ayu) is an amphidromous fish widely distributed in Northeastern Asia from the East China Sea to the northern Japanese coastal waters, encompassing the Korean Peninsula within its range. The shore lines of northeastern region in Asia have severely fluctuated following glaciations in the Quaternary. In the present study, we investigate the population genetic structure and historical demographic change of P. altivelis at a population level in East Asia. Analysis of molecular variance (AMOVA) based on 244 mitochondrial control region DNA sequences clearly showed that as the sampling scope extended to a larger geographic area, genetic differentiation began to become significant, particularly among Northeastern populations. A series of hierarchical AMOVA could detect the genetic relationship of three closely located islands between Korea and Japan that might have been tightly connected by the regional Tsushima current. Neutrality and mismatch distribution analyses revealed a strong signature of a recent population expansion of P. altivelis in East Asia, estimated at 126 to 391 thousand years ago during the late Pleistocene. Therefore it suggests that the present population of P. altivelis traces back to its approximate demographic change long before the last glacial maximum. This contrasts our a priori expectation that the most recent glacial event might have the most crucial effect on the present day demography of marine organisms through bottleneck and subsequent increase of effective population size in this region.

• Animal cells and systems
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• 제15권1호
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• pp.37-43
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• 2011

The Korean freshwater crayfish, Cambaroides similis, has recently suffered from range reduction and habitat degradation caused by environmental changes and water pollution. For the conservation and restoration of this species, it is necessary to understand the current population structures of Korean C. similis using estimation of their genetic variation. In this study, eight micro satellite loci were developed and characterized from 49 individuals collected from four locations: one population from Mt. Bukhan (BH) and three populations from Mt. Gwanak (GA) in Seoul, Korea. As a result, the number of alleles per locus ranged from 2 to 12. The observed heterozygosities and expected heterozygosities ranged from 0.000 to 0.833 and from 0.125 to 0.943, respectively, and the former values were significantly lower than the latter ones expected under the Hardy-Weinberg equilibrium. No significant linkage disequilibrium was revealed between any of the locus pairs after Bonferroni correction. From the pairwise Fst results over all samples, higher differentiation between GA-BH population pairs (mean 0.1789) was observed than between GA population pairs (mean 0.0454). This was also supported by Mantel's test showing that the genetic distances of these crayfish populations were significantly correlated with geographic distances. This result may show the regional differentiation caused by restricted gene flow between northern (BH) and southern (GA) populations within Seoul. These micro satellite markers have the potential for use in analyses of the genetic diversity and population structure of C. similis species, with implications for its conservation and management plans.

• International Journal of Industrial Entomology and Biomaterials
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• 제22권2호
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• pp.65-74
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• 2011

The Scarites aterrimus (Coleoptera: Carabidae), is one of the carabid beetles dwelling exclusively on coastal sandy dunes. Habitat deterioration and equivalent activity have greatly concerned population declines in several species dwelling on the coastal sandy dunes. As a first step to establish long-term conservation strategy, we investigated the nation-wide magnitude and nature of genetic diversity of the species. As a first step, we sequenced a portion of mitochondrial COI gene, corresponding to "DNA Barcode" region (658 bp) from a total of 24 S. aterrimus individuals collected over nine sandy dunes belonging to four Korean provinces. The sequence analysis evidenced moderate to low magnitude of sequence diversity compared with other insect species distributed in Korean peninsula (0.152% to 0.912%). The presence of closely related haplotypes and relatively high gene flow estimate collectively suggest that there had been no historical barriers that bolster genetic subdivision. Population decline was postulated on the basis of several missing haplotypes that are well found in the species with a large population size. This interpretation is consistent with field observation of small population size in the coastal sandy dune habitats. The highest genetic diversity estimates were found in the coastal sand dune population of Seogwipo, Jeju Island, justifying a prior attention to the population, in order to sustain overall genetic diversity of the species. Further scrutinized study might be required for further robust conclusion.

• 한국정보관리학회:학술대회논문집
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• 한국정보관리학회 2000년도 제7회 학술대회 논문집
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• pp.129-132
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• 2000

GIS(Geographic Information System) tool has been applied to determine a spatial difference of weed population density in paddy field and it has introduced to rice yield difference among counties as well as to rice blast in Korea. There was highly difference between sampling sites in terms of spatial analysis which may imply to be able to apply this tool for the precesion agriculture in the 21 century.

• Journal of the Korean Statistical Society
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• 제34권1호
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• pp.73-83
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• 2005

Thompson's (1990) adaptive cluster sampling is a promising sampling technique to ensure effective representation of rare or localized population units in the sample. We consider the problem of simultaneous estimation of the numbers of earners through a number of rural unorganized industries of which some are concentrated in specific geographic locations and demonstrate how the performance of a conventional Rao-Hartley-Cochran (RHC, 1962) estimator can be improved upon by using auxiliary information in the form of generalized regression (greg) estimators and then how further improvements are also possible to achieve by adopting adaptive cluster sampling.