• 제목/요약/키워드: Genetic evaluation

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발효기간이 버섯 발효액의 품질과 생리 기능성에 미치는 영향 (Effect of Fermentation Periods on the Qualities and Physiological Functionalities of the Mushroom Fermentation Broth)

  • 김나미;이종수
    • 한국균학회지
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    • 제31권1호
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    • pp.28-33
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    • 2003
  • 설탕을 이용한 고부가가치의 버섯 발효식품 제조시 최적 발효기간을 설정하기 위하여 발효기간의 경과에 따른 버섯 발효액의 품질특성과 효소활성 및 생리기능성의 변화를 조사하였다. 점도와 색상을 나타내는 L값, a값, b값 모두 3개월까지 급격히 감소한 후 증가하는 경향이었다. 관능특성은 발효기간이 증가함에 따라 고유의 냄새와 맛은 감소하고, 다른 맛과 냄새는 증가하는 경향이었으며, 전체적인 기호도는 발효 3개월 버섯 발효액이 제일 좋은 것으로 평가되었다. 버섯 발효액 중의 ${\alpha}-amylase$ 활성은 발효 1개월까지 급격히 증가하였고, invertase와 cellulose는 대부분 활성이 낮거나 없었다. 항산화할성은 발효 4개월에 가장 높았고 그 이후에는 약간 감소하는 경향이었으며 tyrosinase 저해활성은 모든 시료에서 높은 활성을 나타내었고, 발효기간의 경과에 따라 변화가 없었다. SOD 유사활성은 팽이버섯 발효액에서 비교적 높은 활성을 나타내었으며, 발효기간에 따라서는 큰 변화가 없었다. 이상의 결과를 종합해 볼 때 설탕을 이용한 버섯 발효액 재품 생산시 최적 발효기간은 3-4개월 정도가 적합할 것으로 판단된다.

진단법의 임상시험연구와 진단정확도 (Clinical Trials and Accuracy of Diagnostic Tests)

  • 이유경;이상무
    • Journal of Genetic Medicine
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    • 제8권1호
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    • pp.28-34
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    • 2011
  • 대부분의 의사들은 임상시험을 치료약제개발 후 의료현장에서 사용하기 위해 진행되는 과정으로 생각할 것이다. 실험실에서 개발된 기술이 진단검사로써 도입되기 위해서는 치료약제의 경우와 유사한 임상시험 과정을 거쳐 그 안정성과 유효성에 대한 검증을 필요로 한다. 치료약제의 효과검증에서 가장 우수한 근거를 얻을 수 있는 연구방법은 무작위대조연구 방법이지만, 이를 검체진단검사에 그대로 적용하기는 어렵다. 검체진단검사의 경우 비교연구가 진단정확도의 검증을 위해 현실적으로 사용할 수 있는 연구방법이지만 대상군의 모집 방법과 구분 방법, 질환대상자의 질환 심각도, 참고표준의 선택과 적용, 눈가림 여부 등 여러 요인들이 진단정확도 지표에 직접적인 영향을 주기 때문에, 좋은 근거수준의 연구결과를 얻기 위해서는 이러한 요소들을 고려한 잘 고안된 연구디자인이 중요하다. 또한 검체진단검사는 치료약제의 경우와 달리 결과를 얻기 위한 검사과정이 사용자인 일선 검사실에 의해 계속 생산되어야 하고, 검사의 개발과 발전의 속도가 빠르며, 일선검사실이 최종사용자이자 개발자인 경우가 흔하다는 특성이 있다. 저자들은 이러한 검사의 특성을 고려하여 검사법 자체의 수행능력에 대한 검증으로부터 검사법 성능평가를 위한 질환확진군과 정상군에 대한 비교연구, 일련의 질환의심자 대상의 진단정확도 평가와 임상 효과성 평가, 도입 후 일상감시로 이어지는 임상시험의 진행단계를 제안하고자 한다.

Characterization and Comparative Evaluation of Milk Protein Variants from Pakistani Dairy Breeds

  • Yasmin, Iqra;Iqbal, Rabia;Liaqat, Atif;Khan, Wahab Ali;Nadeem, Muhamad;Iqbal, Aamir;Chughtai, Muhammad Farhan Jahangir;Rehman, Syed Junaid Ur;Tehseen, Saima;Mehmood, Tariq;Ahsan, Samreen;Tanweer, Saira;Naz, Saima;Khaliq, Adnan
    • 한국축산식품학회지
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    • 제40권5호
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    • pp.689-698
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    • 2020
  • The aim of study was to scrutinize the physicochemical and protein profile of milk obtained from local Pakistani breeds of milch animals such as Nilli-Ravi buffalo, Sahiwal cow, Kajli sheep, Beetal goat and Brela camel. Physicochemical analysis unveiled maximum number of total solids and protein found in sheep and minimum in camel. Buffalo milk contains the highest level of fat (7.45%) while camel milk contains minimum (1.94%). Ash was found maximum in buffalo (0.81%) and sheep (0.80%) while minimum in cow's milk (0.71%). Casein and whey proteins were separated by subjecting milk to isoelectric pH and then analyzed through sodium dodecyl sulphate-polyacrylamide gel electrophoresis (SDS-PAGE). The results showed heterogeneity among these species. Different fractions including αS1, αS2, κ-casein, β-casein and β-lactoglobulen (β-Lg) were identified and quantitatively compared in all milk samples. Additionally, this electrophoretic method after examining the number and strength of different protein bands (αS1, αS2, β-CN, α-LAC, BSA, and β-Lg, etc.), was helpful to understand the properties of milk for different processing purposes and could be successfully applied in dairy industry. Results revealed that camel milk was best suitable for producing allergen free milk protein products. Furthermore, based on the variability of milk proteins, it is suggested to clarify the phylogenetic relationships between different cattle breeds and to gather the necessary data to preserve the genetic fund and biodiversity of the local breeds. Thus, the study of milk protein from different breed and species has a wide range of scope in producing diverse protein based dairy products like cheese.

Computational Optimization of Bioanalytical Parameters for the Evaluation of the Toxicity of the Phytomarker 1,4 Napthoquinone and its Metabolite 1,2,4-trihydroxynapththalene

  • Gopal, Velmani;AL Rashid, Mohammad Harun;Majumder, Sayani;Maiti, Partha Pratim;Mandal, Subhash C
    • 대한약침학회지
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    • 제18권2호
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    • pp.7-18
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    • 2015
  • Objectives: Lawsone (1,4 naphthoquinone) is a non redox cycling compound that can be catalyzed by DT diaphorase (DTD) into 1,2,4-trihydroxynaphthalene (THN), which can generate reactive oxygen species by auto oxidation. The purpose of this study was to evaluate the toxicity of the phytomarker 1,4 naphthoquinone and its metabolite THN by using the molecular docking program AutoDock 4. Methods: The 3D structure of ligands such as hydrogen peroxide ($H_2O_2$), nitric oxide synthase (NOS), catalase (CAT), glutathione (GSH), glutathione reductase (GR), glucose 6-phosphate dehydrogenase (G6PDH) and nicotinamide adenine dinucleotide phosphate hydrogen (NADPH) were drawn using hyperchem drawing tools and minimizing the energy of all pdb files with the help of hyperchem by $MM^+$ followed by a semi-empirical (PM3) method. The docking process was studied with ligand molecules to identify suitable dockings at protein binding sites through annealing and genetic simulation algorithms. The program auto dock tools (ADT) was released as an extension suite to the python molecular viewer used to prepare proteins and ligands. Grids centered on active sites were obtained with spacings of $54{\times}55{\times}56$, and a grid spacing of 0.503 was calculated. Comparisons of Global and Local Search Methods in Drug Docking were adopted to determine parameters; a maximum number of 250,000 energy evaluations, a maximum number of generations of 27,000, and mutation and crossover rates of 0.02 and 0.8 were used. The number of docking runs was set to 10. Results: Lawsone and THN can be considered to efficiently bind with NOS, CAT, GSH, GR, G6PDH and NADPH, which has been confirmed through hydrogen bond affinity with the respective amino acids. Conclusion: Naphthoquinone derivatives of lawsone, which can be metabolized into THN by a catalyst DTD, were examined. Lawsone and THN were found to be identically potent molecules for their affinities for selected proteins.

한국 금은광산에서 산출되는 유비철석의 조성변화 (Compositional Variations of Arsenopyrite from Gold-Silver Deposits in Korea)

  • 최선규;최인식
    • 자원환경지질
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    • 제31권2호
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    • pp.89-99
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    • 1998
  • 한국의 금은광화작용은 쥬라기 대보화성활동 (121~183 Ma) 및 백악기 불국사화성활동 (60~110 Ma)과 밀접한 연관성을 보이며, 이러한 열수광맥형 금은 광산에서 산출된 유비철석은 광물공생관계 또는 생성환경에 따라 현저한 조성 변화를 나타내고 있다. 쥬라기 금광단일형 광상에서 산출된 유비철석은 비교적 높은 As함량 (29.68~33.46 atomic %)으로 균질한 조성을 나타내며, 유비철석 지질온도계에 적용하면 생성온도 및 유황분압은 $370{\sim}450^{\circ}C$$10^{-8}{\sim}10^{-6}$이다. 또한 백악기 금은혼합형 광상과 은광단일형 광상의 유비철석을 쥬라기 광상에 비하여 상대적으로 심한 조성변화 (27.47~32.74 atomic %)를 보이며, $25{\sim}30^{\circ}C$$10^{-12}{\sim}10^{-10}$의 환경 조건하에서 정출된 것으로 추정된다. 한편, 금은광맥의 산출상태, 유비철석 지질온도계, 에렉트럼-섬아연석 지질온도계, 유체포유물 연구자료 및 화성암의 정체심도 등을 종합적으로 비교검토한 결과, 쥬라기 금광화작용 (Group IIA)은 심부조건 (약 4~5 kbar)에서 $300{\sim}500^{\circ}C$의 정출환경에서 진행되었지만, 백악기 금은광화작용 (Group III, IV, V)은 1 kbar 미만의 천부조건하에서 $170{\sim}370^{\circ}C$의 온도조건하에서 형성된 것으로 사료된다.

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안동-임하 연결도수로 설치에 따른 가용 수자원량에 관한 연구 (Study on Potential Water Resources of Andong-Imha Dam by Diversion Tunnel)

  • 추연문;지홍기;권기대;김철영
    • 한국산학기술학회논문지
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    • 제15권2호
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    • pp.1126-1139
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    • 2014
  • 도시화 및 산업화에 따른 온실가스의 증가로 전 세계적인 이상기후 현상이 빈번하게 발생하고 있으며, 국내에서도 이러한 현상의 하나로 홍수와 가뭄의 영향이 지속적으로 심화되고 있다. 기후변화는 이수, 치수, 환경 등 다양한 측면에서 물 관리 전반에 걸쳐 복잡성을 가중시키고 불확실성을 확대시키는 등 많은 영향을 초래한다. 또한 과거와는 달리 하천유지수량, 환경용수량 등 다양한 용수수요의 증가에 따라 제한된 가용수자원의 추가적인 확보를 위한 분석과 연구가 필요하다. 본 연구에서는 안동댐과 임하댐 유역을 대상으로 기후변화 시나리오와 토양수분 저류구조 Tank 모형을 이용하여 장기 유출량을 산정하였고, 연결도수로를 통해 병렬 연결된 안동댐과 임하댐의 저수지 연결모의운영을 수행하여 임하댐에서 안동댐으로 전환되는 추가 가용 수자원량을 분석, 비교함으로서 미래 기후변화가 가용수자원 확보에 미치는 영향을 정량적으로 평가하였다. 대표농도경로 기후변화 시나리오 중 RCP 6.0과 RCP 8.5를 이용하여 대상유역의 상세 수문자료를 생산하여 과거 유역의 관측 강수량 자료와 경향성을 분석한 결과 시나리오별 모두 5%~9%의 범위로 강수량이 증가하는 것으로 분석되었으며, 목적함수를 이용한 민감도 분석을 통해 가장 높은 적합도를 나타낸 개체군의 크기는 1000 이었으며 교차비율은 80% 이었다. 본 연구의 결과를 이용하여 미래 기후변화에 대응한 물 관리 측면에서 저수지 운영의 효과를 극대화하고 장기적으로 안정적이고 풍부한 용수공급 계획을 수립하는데 도움이 될 것으로 기대된다.

고추 유전자원의 탄저병(Colletotrichum acutatum) 저항성 평가 (Evaluation of Resistance to Colletotrichum acutatum in Pepper Genetic Resources)

  • 김상규;노나영;허온숙;고호철;곽재균;허윤찬
    • 식물병연구
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    • 제18권2호
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    • pp.93-100
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    • 2012
  • 농업유전자원센터에 보존하고 있는 896점의 고추(C. annuum 430점, C. baccatum 219점, C. chacoense 14점, C. frutescens 70점, C. pubescens 2점, 미동정 8점)에 C. acutatum을 접종 후 $28^{\circ}C$에서 14일간 배양 후 탄저병 발병 정도를 평가하였다. 무상처 분무 접종에서 총 49점이 C. acutatum에 저항성을 나타내었으며, 그 중 9점은 고도의 저항성을 나타내었다. 고도의 저항성을 나타내는 자원들은 C. baccatum 4점, C. chacoense 1점, C. frutescens 4점이었다. 무상처 분무 접종에서 탄저병 저항성을 나타내는 자원 중 42점을 상처 접종법으로 탄저병균을 접종하였다. 그 중 5점은 접종 5일 후에도 병반의 크기가 3%미만으로 나타나 저항성을 나타내었으며, 이들은 모두 C. baccatum이었다. 저항성을 보이는 5점은 탄저병 저항성 육성을 위한 자원으로 이용가능 할 것이다.

The Effect of Transformation on the Virulence of Streptococcus pneumoniae

  • Zhang Xue-Mei;Yin Yi-Bing;Zhu Dan;Chen Bao-De;Luo Jin-Yong;Deng Vi-Ping;Liu Ming-Fang;Chen Shu-Hui;Meng Jiang-Ping;Lan Kai;Huang Yuan-Shuai;Kang Ge-Fei
    • Journal of Microbiology
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    • 제43권4호
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    • pp.337-344
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    • 2005
  • Although pneumococcus is one of the most frequently encountered opportunistic pathogen in the world, the mechanisms responsible for its infectiveness have not yet been fully understood. In this paper, we have attempted to characterize the effects of pneumococcal transformation on the pathogenesis of the organism. We constructed three transformation-deficient pneumococcal strains, which were designated as Nos. 1d, 2d, and 22d. The construction of these altered strains was achieved via the insertion of the inactivated gene, comE, to strains 1, 2 and 22. We then conducted a comparison between the virulence of the transformation-deficient strains and that of the wild-type strains, via an evaluation of the ability of each strain to adhere to endothelial cells, and also assessed psaA mRNA expression, and the survival of hosts after bacterial challenge. Compared to what was observed with the wild-type strains, our results indicated that the ability of all of the transformation-deficient strains to adhere to the ECV304 cells had been significantly reduced (p < 0.05), the expression of psaA mRNA was reduced significantly (p < 0.05) in strains 2d and 22d, and the median survival time of mice infected with strains Id and 2d was increased significantly after intraperitoneal bacterial challenge (p < 0.05). The results of our study also clearly indicated that transformation exerts significant effects on the virulence characteristics of S. pneumoniae, although the degree to which this effect is noted appears to depend primarily on the genetic background of the bacteria.

Detection of mcr-1 Plasmids in Enterobacteriaceae Isolates From Human Specimens: Comparison With Those in Escherichia coli Isolates From Livestock in Korea

  • Yoon, Eun-Jeong;Hong, Jun Sung;Yang, Ji Woo;Lee, Kwang Jun;Lee, Hyukmin;Jeong, Seok Hoon
    • Annals of Laboratory Medicine
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    • 제38권6호
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    • pp.555-562
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    • 2018
  • Background: The emerging mobile colistin resistance gene, mcr-1, is an ongoing worldwide concern and an evaluation of clinical isolates harboring this gene is required in Korea. We investigated mcr-1-possessing Enterobacteriaceae among Enterobacteriaceae strains isolated in Korea, and compared the genetic details of the plasmids with those in Escherichia coli isolates from livestock. Methods: Among 9,396 Enterobacteriaceae clinical isolates collected between 2010 and 2015, 1,347 (14.3%) strains were resistant to colistin and those were screened for mcr-1 by PCR. Colistin minimum inhibitory concentrations (MICs) were determined by microdilution, and conjugal transfer of the mcr-1-harboring plasmids was assessed by direct mating. Whole genomes of three mcr-1-positive Enterobacteriaceae clinical isolates and 11 livestock-origin mcr-1-positive E. coli isolates were sequenced. Results: Two E. coli and one Enterobacter aerogenes clinical isolates carried carried IncI2 plasmids harboring mcr-1, which conferred colistin resistance (E. coli MIC, 4 mg/L; E. aerogenes MIC, 32 mg/L). The strains possessed the complete conjugal machinery except for E. aerogenes harboring a truncated prepilin peptidase. The E. coli plasmid transferred more efficiently to E. coli than to Klebsiella pneumoniae or Enterobacter cloacae recipients. Among the three bacterial hosts, the colistin MIC was the highest for E. coli owing to the higher mcr-1-plasmid copy number and mcr-1 expression levels. Ten mcr-1-positive chicken-origin E. coli strains also possessed mcr-1-harboring IncI2 plasmids closely related to that in the clinical E. aerogenes isolate, and the remaining one porcine-origin E. coli possessed an mcr-1-harboring IncX4 plasmid. Conclusions: mcr-1-harboring IncI2 plasmids were identified in clinical Enterobacteriaceae isolates. These plasmids were closely associated with those in chicken-origin E. coli strains in Korea, supporting the concept of mcr-1 dissemination between humans and livestock.

한우 거세우 성장형질과 도체형질에 대한 환경효과 분석 (Analysis of Environment Effects on the Growth and Carcass Traits in Hanwoo Steers)

  • 이재구;최연호;박병호;최재관;나종삼;최태정
    • 농업생명과학연구
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    • 제45권6호
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    • pp.109-114
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    • 2011
  • 본 논문은 한우 거세우의 각 월령별 체중과 18개월 체척, 도체형질에 대하여 출생지, 후대검정차수, 측정일령, 도축일, 도축일령등의 환경효과가 영향을 미치는지 알아 보기위하여 실시하였다. 이 연구에 사용된 자료는 농협중앙회 한우개량사업소에서 2004년부터 2008년까지 후대 검정한 38차에서 47차까지의 거 세우 1,838두의 성장형질과 도체형질 자료를 이용하였고, 성장형질은 18개월령 체척자료와 6개월, 12개월, 18개월, 24개월 체중을, 도체형질은 24개월령 도축성적을 이용하였다. 각 형질에 대한 환경효과 분석을 위해 각 월령별 체중에 대해서는 고정효과를 출생지, 후대검정차수로 하였고 공변량을 측정일령으로 하였다. 도체형질은 도축일을 고정효과로 도축일령을 공변량으로 하였다. 18개월 체척의 경우는 고정효과를 출생지, 후대검정차수로 하였고, 공변량을 18개월 체척측정일령으로 하였다. 분석결과 24개월 체중에서는 출생지 효과가 유의성이 낮은 것으로 나타났다. 도체형질인 도체중, 등심단면적, 육량지수, 등지방 두께는 도축일에 따른 유의적인 차이가 존재하는 것으로 나타났지만 도축일령에 따른 유의적인 차이는 없었다. 근내지방도에 대해서는 도축일령과 도축일 모두 영향을 미치는 것으로 나타났다. 또한 체척형질은 흉심, 고장폭, 흉위에서 출생지 효과는 영향이 없는 것으로 나타났다. 따라서 본 연구결과는 한우 유전평가 모형 설정 시 활용 가능한 것으로 예상된다.