• Toxicological Research
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• 제24권1호
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• pp.37-44
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• 2008

The in vitro cell transformation assays (CTA) were performed using BALB/3T3 murine fibroblasts and HaCaT human keratinocytes in order to evaluate concordance between both in vitro CTAs and carcinogenicity with compounds differing in their genotoxic and carcinogenic potential. Six test articles were evaluated, two each from three classes of compounds: genotoxic carcinogens (2-amino-5-nitrophenol and 4-nitroquinoline-N-oxide), genotoxic noncarcinogens (8-hydroxyquinoline and benzyl alcohol), and nongenotoxic carcinogens (methyl carbamate and N-nitrosodiphenylamine). Any foci of size $\geq$2 mm regardless of invasiveness and piling was scored as positive in CTA with BALB/3T3. As expected, four carcinogens regardless of their genotoxicity had positive outcomes in two-stage CTA using BALB/3T3 cells. However, of the two genotoxic noncarcinogens, benzyl alcohol was positive CTA finding. We concluded that, of the 6 chemicals tested, the sensitivity for BALB/3T3 system was reasonably high, being 100%. The respective specificity for BALB/3T3 assay was 50%. We also investigated the correlation between results of BALB/3T3 assay and results from HaCaT assay in order to develop a reliable human cell transformation assay. However, evaluation of staining at later time points beyond the confluency stage did not yield further assessable data because most of HaCaT cells were detached after $2{\sim}3$ days of confluency. Thus, after test article treatment, HaCaT cells were split before massive cell death began. In this modified protocol for this HaCaT system, growing attached colonies were counted instead of transformed foci 3 weeks since last subculture. Compared to BALB/3T3 assay, HaCaT assay showed moderate low sensitivity and high specificity. Despite these differences in specificity and sensitivity, both cell systems did exhibit same good concordance between in vitro CTA and rodent carcinogenicity findings (overall 83% concordant results). At present the major weakness of these in vitro CTA is lack of validation for regulatory acceptance and use. Thus, more controlled studies will be needed in order to be better able to assess and quantitatively estimate in vitro CTA data.

• 식물병연구
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• 제16권3호
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• pp.224-231
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• 2010

1999년부터 2004년 사이에 벼흰잎마름병의 원인균인 Xanthomonas oryzae pv. oryzae를 전국적으로 분리하여 Biolog와 지방산 분석법을 이용하여 동정하였다. 한국의 벼 판별품종을 기준으로 분류한 결과 1999년도와 2002에 각각 분리된 벼흰잎마름병균은 모두 K1 레이스에 속하였다. 2003년도에 분리된 벼흰잎마름병균의 경우는 50% 이상이 K3 레이스에 속하였으며 대부분 전라도 지역에서 분리된 균주였다. 분리 년도 별로 단인자 벼 저항성 품종에 대한 균들의 반응을 보았을 때 많은 K1 레이스로 분류된 균주들이 단인자 저항성 품종에 대해 달리 반응을 보였다. Southern bolt 결과, 동일한 레이스에서도 다양한 비병원성 유전자들을 가지고 있었다. 이러한 결과들은 하나의 레이스가 여러 개의 벼 저항성 유전자와 반응한다는 것을 제시한다. 전남과 전북에서 분리된 모든 K3 레이스들은 Xa3 단인자 저항성 품종을 침해하였는데 이러한 결과는 전남과 전북에 Xa3 저항성원을 지닌 벼 품종의 과다한 재배로 인하여 Xa3 침해 균주의 선별적 증식이 유도된 것으로 추측된다. 이러한 다양한 비병원성 유전자 패턴 및 단인자 저항성 유전자에 대한 반응을 고려하여 국내 분리된 벼흰잎마름병균들을 19개의 병원형으로 분류하였다. 새롭게 분류된 병원형들은 국내의 새로운 저항성 품종을 육종하는데 도움이 될 것이다.

• Journal of Plant Biotechnology
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• 제44권4호
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• pp.394-400
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• 2017

포도나무 피어스병에 대한 품종간 저항성을 검정하는 데에 이용되는 병원균 접종법이나 포장저항성 검정법을 대체할 수 있는 방법으로 병원균(Xylella fastidiosa)이 생산하는 배양여액을 이용할 수 있는 검정법을 개발하고자 하였다. 상처를 가한 포도나무 잎에 병원균의 배양여액을 처리한 결과 독성이 발현되었으며 품종간에 차이가 나타났다. 병원균 배양여액의 에틸아세테이트 추출물은 공시한 포도나무에서 배양여액 처리와 동일한 반응을 유도하였다. 병원균 배양여액의 독성과 감수성은 에틸아세테이트 추출물과 동일하였다. 감수성 품종은 높은 비율로 희석된 배양여액에도 감수성을 나타내었으며, 저항성품종은 원액에서도 반응하지 않았다. 감수성 품종은 희석된 배양여액보다 원액에서 감수성이었으나 저항성 품종은 원액에도 저항성을 나타내었다. 본 연구에서 유럽종 포도 품종이 중도 감수성이었으나, 배양여액을 이용한 피어스병해 저항성 검정은 병해에 저항성인 유전자원 선발과, 교배조합의 저항성 실생의 조기에 선발에 중요한 기술로서, 향후 병해에 저항성인 포도품종 육성에 크게 기여할 것으로 여겨진다.

• Journal of Animal Science and Technology
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• 제50권5호
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• pp.581-590
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• 2008

한우암소의 도축형질에 대한 월령별 발육성장경향을 알아보고 종축으로 활용한 한우 암소의 유전평가에 사전 보정을 위한 참고자료를 제공하기 위하여 한우 초음파 성적 27,410기록을 이용하여 분석하였다. 분석에 고려한 형질은 초음파 측정 시 조사된 흉위 및 신체충실지수 및 도축성적으로써 배장근단면적, 등지방두께 및 근내지방도 등 이었다. 분석결과 번식우로써 활용되는 생후 15개월령 이상부터 약 7년령까지 흉위, 배장근단면적, 등지방두께 및 근내지방도는 신체충실지수에 대한 곱의 보정을 실시함이 유전분석의 편의성을 배제하여 분석의 정확도를 높일 수 있을 것으로 사료되었으며 월령별 발육특성에서는 흉위의 경우 성 성숙이 완전 이루어지고 번식우로서 공용되는 3세 이전에 99% 이상의 발육이 진행되는 것으로 판단되었으며, 배장근단면적의 경우에는 흉위의 발육곡선보다는 다소 성장이 늦었지만 흉위와 유사한 발육성장특성을 보였다. 반면에 등지방두께의 경우에는 환경요인에 의한 영향이 많았으며 7년령까지 꾸준히 증가하고 있는 경향을 보였고 근내지방도의 경우에 5년생까지 거의 성숙이 완료되었지만 개체간 변이가 상당히 있는 것으로 평가되었다. 본 연구를 통하여 추정된 성장곡선 함수식은 한우 암소의 유전평가를 실시할 때 월령에 대한 환경요인의 사전 선형보정을 위한 함수식으로 사용할 수 있을 것으로 판단된다.

• Clinical and Experimental Pediatrics
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• 제56권6호
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• pp.247-253
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• 2013

Purpose: In children with acute leukemia, bone marrow genetic abnormalities (GA) have prognostic significance, and may be the basis for minimal residual disease monitoring. Since April 2007, we have used a multiplex reverse transcriptase-polymerase chain reaction tool (HemaVision) to detect of GA. Methods: In this study, we reviewed the results of HemaVision screening in 270 children with acute leukemia, newly diagnosed at The Catholic University of Korea from April 2007 to December 2011, and compared the results with those of fluorescence in situ hybridization (FISH), and G-band karyotyping. Results: Among the 270 children (153 males, 117 females), 187 acute lymphoblastic leukemia and 74 acute myeloid leukemia patients were identified. Overall, GA was detected in 230 patients (85.2%). HemaVision, FISH, and G-band karyotyping identified GA in 125 (46.3%), 126 (46.7%), and 215 patients (79.6%), respectively. TEL-AML1 (20.9%, 39/187) and AML1-ETO (27%, 20/74) were the most common GA in ALL and AML, respectively. Overall sensitivity of HemaVision was 98.4%, with false-negative results in 2 instances: 1 each for TEL-AML1 and MLL-AF4. An aggregate of diseases-specific FISH showed 100% sensitivity in detection of GA covered by HemaVision for actual probes utilized. G-band karyotype revealed GA other than those covered by HemaVison screening in 133 patients (49.3%). Except for hyperdiplody and hypodiploidy, recurrent GA as defined by the World Health Organizationthat were not screened by HemaVision, were absent in the karyotype. Conclusion: HemaVision, supported by an aggregate of FISH tests for important translocations, may allow for accurate diagnosis of GA in Korean children with acute leukemia.

• 대한유전성대사질환학회지
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• 제15권2호
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• pp.78-86
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• 2015

목적: 호모시스틴뇨증은 cystathionine ${\beta}$-synthase의 결핍으로 유발되는 질환이다. 본원에서 치료받고 있는 총 6명 환자들의 임상양상과 유전자 분석을 시행하였다. 방법: 1992년 1월부터 2015년 3월까지 본원에서 전형적 호모시스틴뇨증으로 진단되어 치료 중인 총 6명의 환자들을 대상으로 후향적으로 임상적, 생화학적, 유전자적 분석을 하였다. 결과: 총 6명의 환자가 본 연구에 포함되었으며 이 중 3명은 영아기에 발견되었고, 나머지 3명은 7세 이후에 진단되었다. 영아기에 진단되어 치료를 받은 환자들은 정상 인지기능을 보였고, 7세 이후에 진단된 환자들은 다양한 정도의 지적 장애가 있었다. 골감소증이 6명 중 2명의 환자에서 발견되었다. 혈전 색전증이나 경련, 수정체 탈구 같은 주요한 합병증은 7세 이후에 진단된 군에만 있었다. 유전자 검사에서 모두 cystathionine ${\beta}$-synthase 유전자의 돌연변이를 확인하였다. 본 연구에 포함된 6명은 현재 메티오닌 제한 식이를 하면서 엽산과 베타인, 비타민 B6, 메틸코발라민을 복용 중이다. 결론: 6명의 전형적 호모시스틴뇨증 환자들을 길게는 23년 동안 추적 관찰하였다. 신생아 대사 이상 검사에서 발견된 환자들은 합병증 없이 성장하고 있으나, 7세 이후에 진단된 환자들은 100% 수정체 탈구가 있었고 각종 합병증이 동반되었다. 따라서 전형적 호모시스틴뇨증의 예후에는 무엇보다 조기 진단이 중요하며 이는 현재 국내에서 시행되는 신생아 대사 이상 검사의 중요성을 설명하는 것이라 하겠다.

• Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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• 제18권5호
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• pp.671-676
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• 2005

A total of 50 individual catfish, the Tra (Pangasius hypophthalmus) cultivated in either floating cages (Tra-c) or in ponds (Tra-p) and the Basa (Pangasius bocourti) raised in three floating cages, were collected in two of the Mekong Delta provinces. The caudal fin of each individual fish was used for protein electrophoresis employing the SDS-PAGE method. The one fillet sides were used as a representative sample to determine the dry matter (DM), crude protein (CP), ether extract (EE) and amino acids (AAs). The catfish oil was extracted from the belly fats, and the fatty acid (FA) composition was analyzed. There were 21 bands of the Tra and the Basa. Protein bands of the two varieties were 28.6-33.3% polymorphic, while polymorphic individuals of the Tra ranged from 80.0 to 100.0%, and the Basa was 90.0% polymorphic. The phenotypic diversity (Ho) of the Tra ranged from 1.71 to 1.80, while the Basa ranged as high as 2.14%. Diversity values (H$_{EP}$) for genetic diversity markers were equal in the Tra and the Basa. The sum of the effective number of alleles (SENA) of both varieties ranged from 3.40 to 3.83 for the Basa and the Tra, respectively. The lower values of Ho and SENA, as compared with those of the fresh water prawn (Macrobrachium equidens) in the area, would suggest that the species with the low values will become extinct due to inbreeding; the gene pools of each observed population were below a suitable threshold. Many of the differences in the nutritional values of the Tra-c, the Tra-p and the Basa were measured; their nutrient values were comparable to fishmeal or fish oil. Most of the DM, CP, and EE were higher in the Tra, especially in the Tra-c. The essential AA content, especially that of lysine, was highest in the Tra-c, next highest in the Tra-p, and lowest in the Basa. Therefore, the amino acid patterns were closer to the ideal patterns in the same sequences. In contrast, the essential FAs were concentrated in the Basa fish oil. It was found that suitable selection of parents for seed production is required to avoid inbreeding. Catfish may be valuable sources of nutrition for both humans and animals, and the differences in their nutritional values by variety and/or management must be taken into account.

• Journal of Animal Science and Technology
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• 제60권5호
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• pp.14.1-14.12
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• 2018

Background: Sheep production is a major component of the livestock sector in Ethiopia. The country owing to the large population of 30.70 million estimated numbers of sheep in the country and out of which about 72.14% are females, and 27.86% are males with diverse genetic resources. The real value of indigenous breeds was often under-estimated mostly due to their poor appearance and relatively low productivity. Developing countries in most cases opt for exotic breeds to increase animal productivity through crossbreeding or breed substitution without properly investigating the production potential of the indigenous breeds. The main objective of the research was to identify sheep flock composition and structure, farmers' traits of interest and breeding objective of Wollo highland sheep, and their $F_1$ crossbreed progenies. Results: Smallholder farmers' flock synthesized from breeding ewes, breeding rams, pre-weaned ewe lambs, pre-weaned ram lambs, unproductive ewes, castrated and fattened rams, with the percentage coverage of 29.2, 13.3, 15.5, 16.5, 12.4, and 12.5%, respectively. The maximum number of flock size was 289.0 sheep per flock and higher in the third stratum. The off-take rate percentage of the three strata presented as 21.9% in 1st stratum, 12% in the 2nd stratum, and 16.4% in the 3rd stratum and higher off-take rate recorded in the first stratum. Sheep producer's traits of interest ranked by growth rate (first), body size (second) and marketing value was third rank. Communal breeding (random mating), village based controlled breeding, mixed type and private ram controlled breeding practice were comprised of 39.7, 61.7, 52 and 71.3%, respectively. The percentages of ewes per flock composition were presented as 36.5, 27.1 and 25.5%, respectively in the 3rd stratum, 2nd stratum and 3rd stratum in the order of their importance's. Conclusion: Genetic improvement practices at smallholder sheep producers situation was showing promising outcome with indigenous Washera $F_1$ crossbred lambs and which designated for weaning rate, body size, marketing age, age at first lambing, good temperament and large litter size in the order of their rank. The contemporary breeding practice tendency indicated that, reduced flock size to improve flock productivity via crossbreeding practices.

• Toxicological Research
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• 제29권4호
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• pp.263-278
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• 2013

The silkworm extract powder contain 1-deoxynojirimycin (DNJ), a potent ${\alpha}$-glycosidase inhibitor, has therapeutic potency against diabetes mellitus. Therefore, natural products containing DNJ from mulberry leaves and silkworm are consumed as health functional food. The present study was performed to evaluate the safety of the silkworm extract powder, a health food which containing the DNJ. The repeated toxicity studies and gentic toxicity studies of the silkworm extract powder were performed to obtain the data for new functional food approval in MFDS. The safety was evaluated by a single-dose oral toxicity study and a 90 day repeated-dose oral toxicity study in Sprague-Dawley rats. The silkworm extract powder was also evaluated for its mutagenic potential in a battery of genetic toxicity test: in vitro bacterial reverse mutation assay, in vitro chromosomal aberration test, and in vivo mouse bone marrow micronucleus assay. The results of the genetic toxicology assays were negative in all of the assays. The approximate lethal dose in single oral dose toxicity study was considered to be higher than 5000 mg/kg in rats. In the 90 day study, the dose levels were wet at 0, 500, 1000, 2000 mg/kg/day, and 10 animals/sex/dose were treated with oral gavage. The parameters that were monitored were clinical signs, body weights, food and water consumptions, ophthalmic examination, urinalysis, hematology, serum biochemistry, necropsy findings, organ weights, and histopathological examination. No adverse effects were observed after the 90 day administration of the silkworm extract powder. The No-Observed-Adverse-Effect-Level (NOAEL) of silkworm extract powder in the 90 day study was 2000 mg/kg/day in both sexes, and no target organ was identified.

• Journal of Animal Science and Technology
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• 제45권1호
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• pp.13-22
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• 2003

성장호르몬 유전자는 하나의 작은 공통 선조 유전자로부터 아주 오랜 기간동안 유전자 중복에 의해 진화되어 온 그룹들 중의 하나이다. 이들에 속하는 유전자들은 동물 종간에 구조적인 상동성과 기능적 공통성 등 유사성이 비교적 높게 나타난다. 이런 연구결과들을 근거로 하여 소 성장호르몬 유전자에서 아미노산을 암호화하는 영역으로부터 새로운 아미노산의 변이(missense mutation)를 검출하였고, 이 변이의 대립유전자 빈도는 소(cattle)의 종(species) 및 품종의 지리적 분포에 따라 일정한 경향 치를 보여 주었다. 한편 변경되어진 아미노산은 Tryptophan으로 이는 생물체에 존재하는 많은 단백질들을 구성하는 아미노산중에서도 그 출현빈도가 가장 낮은 것이다. 또한 검출된 변이는 성장호르몬이 그의 수용체와 강하게 결합하는 부위로서, 성장호르몬의 구조적 변이를 초래하여 수용체와의 결합이 비정상적으로 이루어져, 이후 성장호르몬이 표적세포로의 신호전달과 같은 역할을 제대로 수행치 못하게 되고, 이로 인하여 가축의 표현되어지는 경제형질에 영향을 미칠 것으로 추정된다. 그러므로 이러한 대립유전자를 보유하는 개체는 집단에서 제거하는 방법에 의한 개량이 가능할 것으로 사료된다.