• 제목/요약/키워드: Genetic evaluation

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한우 거세우의 도체형질에 대한 유전모수 추정 (Genetic Parameter Estimation of Carcass Traits of Hanwoo Steers)

  • 황정미;김시동;최연호;윤호백;박철진
    • Journal of Animal Science and Technology
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    • 제50권5호
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    • pp.613-620
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    • 2008
  • 본 연구에서는 국가단위 한우 유전능력평가에 적용하고 있는 유전력이 적절한지를 검토하기 위하여 그간의 검정자료를 활용하여 유전모수를 추정하였으며, 향후 보증씨수소 선발지수의 개선 등을 위하여 다형질 개체모형을 활용하기 위한 기초자료로 다형질 모형을 적용하여 도체형질간 유전상관을 추정하였다. 연구결과 도체형질의 유전모수 추정치는 단형질과 다형질에서 매우 유사한 유전력을 나타냈으며 그간 연구자들이 보고한 유전력 범위 안에 있는 것으로 나타나, 아직까지는 국가단위 한우유전능력평가에 적용하고 있는 유전력을 변경할 필요는 없는 것으로 나타났다. 다만, 본 연구에서 추정한 형질 중 근내지방도 형질의 유전력이 그간 추정한 값보다 낮게 추정된 것은 근내지방도판정기준이 변경되어 기존의 1~7등급이 1~9등급체계로 변경한 문제와 8, 9등급을 7등급으로 조정하여 분석한 것에 의한 것일 수도 있을 것으로 보여 근내지방도를 변경 전과 변경 후를 다른 형질로 보아 다형질 분석을 실시하는 등 추가연구가 필요한 것으로 보인다. 한편, 도체중과 배장근단면적 간의 유전상관이 0.63으로 추정되어 현 보증씨수소 선발지수에 포함된 두 형질 중 어느 한 형질은 제거하여도 될 것으로 나타났으며, 현재와 같이 단형질 모형으로 추정한 육종가를 이용하여 선발지수를 구성할 경우 형질간의 유전상관이 고려되지 못하여 선발이 목표와 다르게 이루어질 수 있으므로 다형질 모형을 적용하여 육종가를 추정하고 이를 선발지수에 적용하는 것이 바람직할 것으로 사료된다. 또한 당대검정에서 1차 선발한 가축의 자손에 대하여 능력검정을 실시하는 체계에서는 선택된 자료만 활용하게 되므로 유전모수 추정에 영향을 미칠 수 있으므로 당대검정과 후대검정자료를 동시에 활용하여 유전모수를 추정하는 등에 대한 추가 연구가 필요한 것으로 사료된다.

한국재래닭(오계)의 원시 생식 세포의 냉동 보존에 있어서 여러 조건의 평가 (The Evaluation of Various Conditions in the Cryopreservation of Primordial Germ Cells on Korean Native Chicken (Ogye))

  • 김현;조영무;한재용;최성복;변미정;김영신;고응규;성환후;김성우
    • 한국가금학회지
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    • 제41권4호
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    • pp.249-259
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    • 2014
  • 동결 닭 원시 생식 세포의 생식계열 키메라를 이용한 생체에의 복원을 실용화 하기 위해서는, 닭 원시 생식 세포의 동결 보존 기술의 향상에 의해 동결 및 융해 후의 많은 생존세포를 확보하는 것이 반드시 필요하다. 닭 원시 생식 세포는 배양 5.5일령의 닭 원시 생식선으로부터 채취하고, MACS 방법에 의해서 순수 닭 원시 생식 세포를 분리했다. 15% 각각의 EG를 동결 보호제로 사용한 처리군이 각 군의 농도에 상관없이 유의적(p<0.05)으로 PG 처리군보다 동결 및 융해 후의 세포의 생존율이 높음을 확인하였다. 특히, 동결 보호제로 10% EG를 이용한 유리화 처리군에서 85.63%로 동일한 농도의 PG 처리군(66.81%)보다 유의적(p<0.05)으로 가장 높은 생존율을 보였다. 한편, 10% EG를 이용한 완만 동결 처리군에서 66.14%로 동일한 농도의 PG 처리군(50.11%)보다 유의적(p<0.05)으로 가장 높은 생존율을 보였다. 이상의 결과들로부터 유리화 동결에 있어서 가장 높은 생존율을 보인 10% EG이 최적의 동결 보호제로서 사용 가능함을 확인하였고, 이는 한국재래닭(오계)의 원시 생식 세포의 동결 보존의 실용화가 보다 더 향상될 수 있는 또 하나의 방법이 될 수 있음을 시사한다.

젖소 과배란 처리시 PEG(Polyethylene Glycol) 처리가 수정란 생산에 미치는 영향 (Effects of PEG on Embryo Production in Superovulated Hostein Cows)

  • 최선호;류일선;한만희;조상래;최창용;김현종;손동수;김영근;이종완
    • 한국수정란이식학회지
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    • 제20권3호
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    • pp.317-322
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    • 2005
  • 본 연구는 젖소에 있어서 다량의 수정란을 생산하여, 고능력의 유전인자를 조기에 확산할 수 있도록, 젖소에 있어서 PEG를 이용하여 과배란 처리기법 확립을 위해 실시하였으며, 그 결과는 다음과 같다. 1. 성선자극호르몬의 처리 방법에 따른 황체반응은 Folltropin 단독처리시 $5.8\%$, Folltropin+EB는 $20.6\%$, Folltropin+PEG는 $24.0\%$로 나타났으며, 유의적인 차이를 보였다(p<0.01). 2. 성선자극호르몬의 처리 방법에 따른 이식 가능 수정란 수에 미치는 영향은 Folltropin V 단독처리시 3.6개, Folltropin +EB 처리시 3.3개, Folltropin +PEG 8,000 처리시 2.8개이었으며, 유의적인 차이를 나타내지 않았다(p<0.01). 3. 성선자극호르몬의 처리방법에 따른 퇴행란과 미수정 란 Folltropin+EB와 Folltropin+PEG 처리구에서 Folltropin 단독처리보다 많이 회수되었으며,배반포 수정란의 수에 있어서는 처리간에 유의적인 차이를 보이지 않았다. 이상의 결과는 임의의 발정주기에 CIDR 삽입후 Folltropin의 1일 2회 4일간의 분할 투여법 뿐만 아니라 Folltropin을 PEG로 용해하여 1회 투여법을 이용한 과배란 처리기법도 젖소 공란우에서 수정란의 생산이 가능함을 보여준다.

근적외선 분광분석법을 이용한 벼 유전자원의 아밀로스 함량과 단백질 함량 정량분석 (Quantitative Analysis of Amylose and Protein Content of Rice Germplasm in RDA-Genebank by Near Infrared Reflectance Spectroscopy)

  • 김정순;조양희;곽재균;마경호;최유미;김정봉;이정희;김태산;조종구;이석영
    • 한국작물학회지
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    • 제53권2호
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    • pp.217-223
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    • 2008
  • 본 시험은 종자은행이 보유하고 있는 다양한 벼 유전자원의 활용을 촉진하기 위하여 비파괴적인 분석방법의 하나인 근적외선 분광분석법을 이용한 유용유전자원의 대량 선발체계 구축을 위해 실시하였다. 1. NIR스펙트럼은 700 nm 이하의 가시광선 범위에서 다양한 범위의 spectrum을 보였으며, 700 nm에서 2500 nm의 근적외선 파장에서도 spectrum의 차이가 크게 나타났고, 1400 nm에서 전체 spectrum의 정점을 나타냈으며 그 이상의 spectrum에서는 포화현상을 나타내었다. 2. NIR 검량식 작성에 이용된 144점의 선발자원이 가지는 단백질함량의 범위는 $6.5{\sim}9.5%$였으며, 134점의 선발자원이 가지는 아밀로스함량의 범위는 $18.1{\sim}21.7%$이었다. 3. 단백질함량과 아밀로스함량의 실험치(Lab data)와 NIR 데이터의 모집단 분포의 해석과 상관관계에 관한 통계분석 결과, 단백질함량과 아밀로스함량의 $R^2$(RSQ) 값은 각각 0.786과 0.865로 높게 보였으며, 검량식 표준오차(SEC)는 각각 0.442와 2.078로 유의한 값을 보였고, 또한 검량식 검정 표준오차(SECV)도 각각 0.541과 3.106으로 유의한 값을 보였지만 검증시 상관정도(1-VR)는 0.68과 0.70로 검량식 작성시보다 낮은 유의성을 보였다.

한국의 산림습원 유형 구분 및 인벤토리 구축 (A Study on Classification of Forest Wetlands Types and Inventory Establishment in Korea)

  • 이종원;안종빈;황태영;윤호근
    • 한국습지학회지
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    • 제24권1호
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    • pp.1-24
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    • 2022
  • 본 연구는 국내 산림에 분포하는 습원을 대상으로 유형을 구분한 후 평가체계에 따라 등급을 부여하여 효율적인 보전 및 관리 체계를 구축하고자 2015년부터 2019년까지 수행되었다. 2005년부터 2014년까지 제 1차 전국 산림습원 조사를 통해 도출된 1,264개소와 추가로 발굴된 16개소 총 1,280개소의 산림습원 중 습원의 기능과 가치가 있는 455개소를 구분하여, 평가를 진행하였다. 산림습원은 자연형, 묵논형, 인공형, 변형 등 4개 유형으로 구분되고, 이를 세부적으로 재분류하여, 총 11개의 세부적 습지 유형으로 구분할 수 있었다. 이를 토대로 식물 및 생태, 수문·수리, 인문사회, 교란정도 등 다양한 항목에 따라 평가한 후 등급화한 결과, 산림습원의 가치가 매우 높은 A 등급은 30개소, 비교적 높은 수준의 가치를 지닌 B등급 201개소, 보통 수준의 가치인 C등급 184개소, 낮은 수준의 가치인 D등급 40개소를 확인하였다. 평가에서 A 또는 B로 높은 등급을 받은 231개소에 대해 산림유전자원보호구역과 기타 효과적인 지역 기반 보전 수단을 지정하고, 또한 장기적인 모니터링 체계 시스템을 구축하여 산림생물다양성의 핫스팟 지역인 산림습원을 범국가적인 차원에서 보다 더 효과적이고 체계적으로 관리할 수 있을 것으로 판단된다.

Assessing weediness of herbicide tolerant genetically modified soybean

  • Ko, Eun Mi;Kim, Do Young;Kim, Hye Jin;Chung, Young Soo;Kim, Chang-Gi
    • 농업과학연구
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    • 제43권4호
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    • pp.560-566
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    • 2016
  • Imports of genetically modified (GM) soybeans (Glycine max) for food or feed consumption in Korea have been increasing. Although the cultivation of GM soybeans has not yet been allowed in Korea, the number of field tests for GM soybeans has also been rising. This study was conducted to investigate whether herbicide tolerant GM soybean can survive and persist in uncultivated environments when they escape from transportation routes or from isolated fields. Seeds of GM and non-GM soybeans and wild soybeans (Glycine soja) were buried in 2 and 15 cm soil depths and their viability was examined after 1, 2, 6, and 10 months. GM and non-GM soybean seeds completely lost their viability within six months of burial, whereas seeds of wild soybean maintained their viability during the study period. Seeds of soybean and wild soybeans that were sown on the soil surface germinated and grew to vegetative cotyledon stage. Seedlings of GM and non-GM soybean did not compete well with weeds, including Cerastium glomeratum, Alopecurus aequalis var. amurensis, Capsella bursa-pastoris, Conyza canadensis, Stellaria aquatica, and Erigeron annuus. Also, GM soybean did not survive through winter. However, wild soybeans competed well with the weeds and became dominant in August. Herbicide tolerant GM soybean is unlikely to persist under uncultivated environments and to become weeds.

진화연산과 적응적 ${\alpha}$-cut 기반 평가를 이용한 유전자 발현 데이타의 퍼지 클러스터 분석 (Fuzzy Cluster Analysis of Gene Expression Profiles Using Evolutionary Computation and Adaptive ${\alpha}$-cut based Evaluation)

  • 박한샘;조성배
    • 한국정보과학회논문지:소프트웨어및응용
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    • 제33권8호
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    • pp.681-691
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    • 2006
  • 유전자 데이타의 클러스터링은 방대한 유전자 정보를 발현 정도에 따라 비슷한 그룹으로 나누어 분석하는 방법으로 유전자의 기능을 분석하는데 사용되어 왔다. 클러스터링의 한 종류인 퍼지 클러스터링은 하나의 샘플이 소속정도에 따라 여러 그룹에 동시에 소속되도록 나누는 방법으로, 하나의 유전자 데이타는 여러가지 유전 정보를 가칠 수 있기 때문에 유전자 발현 데이타의 분석에 보다 적절한 방법이다. 그러나 보통 클러스터링 방법은 초기 값에 민감하고, 지역해에 빠질 수 있는 단점을 갖는다. 이런 단점을 해결하기 위해 본 논문에서는 진화 연산을 이용한 퍼지 클러스터링 방법을 제안한다. 이때, 적합도 평가를 위해서 모든 데이타에 대해 동일한 기준을 적용하는 베이지안 검증방법의 단점을 개선하여, 데이타의 특성 을 고려하여 결정된 적용적 ${\alpha}$-cut 기반 평가방법을 사용한다. SRBCT 데이타와 효모 세포주기 데이타를 이용해 실험을 하고 결과를 분석하여 제안하는 방법의 유용성을 확인하였다.

Antimicrobial Resistance Profile of Acinetobacter spp. Isolates from Retail Meat Samples under Campylobacter-Selective Conditions

  • Cha, Min-Hyeok;Kim, Sun Hee;Kim, Seokhwan;Lee, Woojung;Kwak, Hyo-Sun;Chi, Young-Min;Woo, Gun-Jo
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제31권5호
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    • pp.733-739
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    • 2021
  • Acinetobacter strains are widely present in the environment. Some antimicrobial-resistant strains of this genus have been implicated in infections acquired in hospitals. Genetic similarities have been reported between Acinetobacter strains in nosocomial infections and those isolated from foods. However, the antimicrobial resistance of Acinetobacter strains in foods, such as meat, remains unclear. This study initially aimed to isolate Campylobacter strains; instead, strains of the genus Acinetobacter were isolated from meat products, and their antimicrobial resistance was investigated. In total, 58 Acinetobacter strains were isolated from 381 meat samples. Of these, 32 strains (38.6%) were from beef, 22 (26.5%) from pork, and 4 (4.8%) from duck meat. Antimicrobial susceptibility tests revealed that 12 strains were resistant to more than one antimicrobial agent, whereas two strains were multidrug-resistant; both strains were resistant to colistin. Cephalosporin antimicrobials showed high minimal inhibitory concentration against Acinetobacter strains. Resfinder analysis showed that one colistin-resistant strain carried mcr-4.3; this plasmid type was not confirmed, even when analyzed with PlasmidFinder. Analysis of the contig harboring mcr-4.3 using BLAST confirmed that this contig was related to mcr-4.3 of Acinetobacter baumannii. The increase in antimicrobial resistance in food production environments increases the resistance rate of Acinetobacter strains present in meat, inhibits the isolation of Campylobacter strains, and acts as a medium for the transmission of antimicrobial resistance in the environment. Therefore, further investigations are warranted to prevent the spread of antimicrobial resistance in food products.

Allele Frequencies of the Single Nucleotide Polymorphisms Related to the Body Burden of Heavy Metals in the Korean Population and Their Ethnic Differences

  • Eom, Sang-Yong;Lim, Ji-Ae;Kim, Yong-Dae;Choi, Byung-Sun;Hwang, Myung Sil;Park, Jung-Duck;Kim, Heon;Kwon, Ho-Jang
    • Toxicological Research
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    • 제32권3호
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    • pp.195-205
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    • 2016
  • This study was performed to select single nucleotide polymorphisms (SNPs) related to the body burden of heavy metals in Koreans, to provide Korean allele frequencies of selected SNPs, and to assess the difference in allele frequencies with other ethnicities. The candidate-gene approach method and genome-wide association screening were used to select SNPs related to the body burden of heavy metals. Genotyping analysis of the final 192 SNPs selected was performed on 1,483 subjects using the VeraCode Goldengate assay. Allele frequencies differences and genetic differentiations between the Korean population and Chinese (CHB), Japanese (JPT), Caucasian (CEU), and African (YIR) populations were tested by Fisher's exact test and fixation index ($F_{ST}$), respectively. The Korean population was genetically similar to the CHB and JPT populations ($F_{ST}$ < 0.05, for all SNPs in both populations). However, a significant difference in the allele frequencies between the Korean and CEU and YIR populations were observed in 99 SNPs (60.7%) and 120 SNPs (73.6%), respectively. Ten (6.1%) and 26 (16.0%) SNPs had genetic differentiation ($F_{ST}$ > 0.05) among the Korean-CEU and Korean-YIR comparisons, respectively. The SNP with the largest $F_{ST}$ value between the Korean and African populations was cystathionine-${\beta}$-synthase rs234709 ($F_{ST}$: KOR-YIR, 0.309; KOR-CEU, 0.064). Our study suggests that interethnic differences exist in SNPs associated with heavy metals of Koreans, and it should be considered in future studies that address ethnic differences in heavy-metal concentrations in the body and genetic susceptibility to the body burden of heavy metals.

한우의 주요 경제형질에 대한 보증씨수소와 후보씨수소의 능력비교 (Comparison of Hanwoo Proven and Young Bulls for Major Economic Traits)

  • 박병호;최태정;조광현;최재관;이승수;정호영;김시동;김효선;황정미;이성수
    • Journal of Animal Science and Technology
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    • 제52권4호
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    • pp.253-258
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    • 2010
  • 2004년부터 2006년까지 상 하반기에 후대검정에 공시한 후보씨수소와 동일 시점에 판매한 보증씨수소의 표현형 및 유전 능력을 비교하였다. 12개월령 체중, 도체중 및 등심단면적의 표현형 능력의 경우 대부분 후보씨수소가 유의하게 우수하였으며, 등지방두께 표현형 능력의 경우 후보씨수소가 유의하게 두꺼웠다. 12개월령 체중, 도체중, 등심단면적, 등지방두께 및 근내지방도의 유전능력과 선발지수를 비교한 결과 후보씨수소와 보증씨수소 사이에 대부분 유의한 차이가 없었다. 후보씨수소와 1등급 보증씨수소의 유전능력을 비교한 결과 등심단면적을 제외하고는 유의한 차이가 없었다.