• Journal of Animal Science and Technology
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• 제50권5호
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• pp.601-612
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• 2008

본 연구는 한우의 체형과 체중이 일령에 따라 어떻게 변화하며, 선발형질인 도체형질과의 상관 또한 체중 및 체형의 변화에 따라 어떠한 형태로 변화하는지 알아보기 위하여 실시하였다. 분석에 이용한 형질은 체중, 체형 및 도체형질을 포함하여 모두 17가지 형질이며 거세우 161두의 자료를 이용하였다. 성장곡선 추정은 logistic 모형을 이용하였고, 추정한 모수를 토대로 변곡일령 및 변곡일령에서의 특성을 다시 계산하였다. 각 형질에 대한 성장곡선 모수를 분석한 결과 좌골폭은 조숙성, 흉위는 만숙성 형질인 것으로 나타났다. 등지방두께에 대한 흉심, 흉폭 및 요각폭의 순위상관계수는 6~24개월까지 꾸준히 증가하는 반면 다른 체형형질들은 18개월령 이후에 감소하는 것으로 나타났다. 본 연구는 표현형 자료에 대한 분석만이 이뤄졌으나, 한우 성장 단계에 따른 유전적 변화를 살펴보기 위해 유전모수 추정과 같은 추가적인 연구가 이뤄진다면 체형형질을 한우개량에 충분히 이용이 가능할 것으로 생각된다.

• Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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• 제22권9호
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• pp.1234-1240
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• 2009

Gene flow, genetic structure and differentiation of Kutchi, Mehsana and Sirohi breeds of goat from North-Western India were evaluated based on 25 microsatellite markers so as to support breed conservation and improvement decisions. The microsatellite genotyping was carried out using an automated DNA sequencer. The gene diversity across the studied loci for the Kutchi breed varied from 0.57 (ILST 065) to 0.93 (OarFCB 304, OMHC 1, ILSTS 058) with an overall mean of 0.79${\pm}$0.02. The corresponding values for Mehsana and Sirohi breeds were 0.16 (ILST 008) to 0.93 (OMHC 1, ILSTS 058) with an average of 0.76${\pm}$0.04, and 0.50 (ILSTS 029) to 0.94 (ILSTS 058) with an average of 0.78${\pm}$0.02, respectively. The Mehsana breed had lowest gene diversity among the 3 breeds studied. All the populations showed an overall significant heterozygote deficit ($F_{is}$). The Fis values were 0.26, 0.14 and 0.36 for Kutchi, Mehsana and Sirohi goat breeds, respectively. Kutchi and Mehsana were more differentiated (16%) followed by Mehsana and Sirohi (13%).The measures of standard genetic distance between pairs of breeds indicated that the lowest genetic distance was between Kutchi and Sirohi breeds (0.73) and the largest genetic distance was between Mehsana and Kutchi (1.0) followed by Sirohi and Mehsana (0.75) breeds. Mehsana and Kutchi are distinct breeds and this was revealed by the estimated genetic distance between them. All measures of genetic variation revealed substantial genetic variation in each of the populations studied, thereby showing good scope for their further improvement.

• Journal of Animal Science and Technology
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• 제55권1호
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• pp.1-6
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• 2013

본 연구는 국내 국가단위 평가결과의 문제점을 해결하면서 유전 능력평가시스템을 고도화하고 우리나라가 국제유전평가에 참여하기 위하여 국제평가기구에서 요구하는 검증작업을 통과하기 위하여 수행하였다. 본 연구에 이용된 자료는 농협중앙회 젖소개량부에서 수집한 분만일이 2001년부터 2009년까지의 검정성적으로 총 1,416,589개이며 산차는 5산으로 제한하였으며, 누적착유일은 75~305일로 제한하였고, 전체 혈통자료는 2,279,741개이며 부모를 갖는 개체는 535,409개이고 아비소는 2,467두로 구성되어 있는 기록들을 이용하였다. 유량, 유지방, 유단백에 대한 육종가는 신규로 개발한 다형질모형(Multiple traits model)을 이용하여 육종가를 구하였으며 기초작업은 SAS version 9.2와 R프로그램을 이용하였으며 유전모수를 추정하기 위하여 VCE 6.0을 이용하였다. 전반적으로 유전적 추세는 꾸준히 지속되어 오고 있으며 산차별 차이가 두드러지게 나타나지는 않았다. 유지방을 제외하고 유량과 유단백 형질의 추세가 잘 추정되었음을 알 수 있다. 유전평가분석결과 상위 1000두의 랭킹안에 최근의 생년을 갖는 딸소가 기존에 사용한 모수로 분석한 결과보다 딸소가 증가했음을 알 수 있다. 국제유전평가모형을 통해 새로 평가한 결과 씨수소상위 100두를 기존 평가모형에 의한 평가결과와 비교했을 때, 2006년생은 23두에서 28두로 2007년생은 12두에서 20두로 2008년생은 2두에서 8두로 증가하였다. 이는 최근의 딸소나 씨수소의 유전능력이 우수함에도 불구하고 상위에 랭크되지 못했던 결과가 새 모형의 적용으로 보완하여 새로운 평가분석에 적용할 수 있을 것으로 판단된다. 따라서 기존의 단형질 모형 대신 다형질 모형을 이용한 분석방법으로 평가를 실시하고 국제유전평가에도 다형질 모형을 이용한 육종가를 제시함으로써 다형질 선발의 정확도가 향상될 수 있을 것이다.

• Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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• 제33권5호
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• pp.704-711
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• 2020

Objective: Muscle fiber types, numbers and area are crucial aspects associated with meat production and quality. However, there are few studies of pig muscle fibre traits in terms of the detection power, false discovery rate and confidence interval precision of whole-genome quantitative trait loci (QTL). We had previously performed genome scanning for muscle fibre traits using 183 microsatellites and detected 8 significant QTLs in a White Duroc×Erhualian F₂ population. The confidence intervals of these QTLs ranged between 11 and 127 centimorgan (cM), which contained hundreds of genes and hampered the identification of QTLs. A whole-genome sequence imputation of the population was used for fine mapping in this study. Methods: A whole-genome sequences association study was performed in the F₂ population. Genotyping was performed for 1,020 individuals (19 F₀, 68 F₁, and 933 F₂). The whole-genome variants were imputed and 21,624,800 single nucleotide polymorphisms (SNPs) were identified and examined for associations to 11 longissimus dorsi muscle fiber traits. Results: A total of 3,201 significant SNPs comprising 7 novel QTLs showing associations with the relative area of fiber type I (I_RA), the fiber number per square centimeter (FN) and the total fiber number (TFN). Moreover, one QTL on pig chromosome 14 was found to affect both FN and TFN. Furthermore, four plausible candidate genes associated with FN (kinase non-catalytic C-lobe domain containing [KNDC1]), TFN (KNDC1), and I_RA (solute carrier family 36 member 4, contactin associated protein like 5, and glutamate metabotropic receptor 8) were identified. Conclusion: An efficient and powerful imputation-based association approach was utilized to identify genes potentially associated with muscle fiber traits. These identified genes and SNPs could be explored to improve meat production and quality via marker-assisted selection in pigs.

• Journal of Animal Science and Technology
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• 제51권2호
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• pp.111-122
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• 2009

비유일수별로 변화하는 유생산기록을 305일로 보정하기 위하여, 분만 시 나이와 분만계절, 산차를 고려한 305일 보정계수를 개발하였고, 비선형적 특성에 적합하고 사용을 용이하게 하는 거듭제곱 함수 형태의 보정 공식을 개발하였다. 각각의 보정계수가 얼마나 정확하게 기록을 보정 할 수 있는 지 측정하기 위하여 실제 305일 누적 착유량 및 개체별 누적 착유량 평균과의 오차를 비교 분석 한 결과 새롭게 개발된 보정계수의 오차가 가장 적게 나타났으며, 이를 토대로 한 보정공식 역시 작은 오차를 나타냈다. 유생산량의 평균치가 최근까지 많이 증가하였음에도 불구하고 2산 이상의 개체에서 2002년에 개발된 보정계수의 오차가 낮게 나타난 것으로 보아 앞으로의 보정계수 개발에는 2002년 보정계수 개발에 사용되었던 건유효과에 대한 부분을 추가해야 더 정확하게 보정할 수 있을 것으로 사료된다. 유량에서의 보정계수 개발 및 보정식 개발 방법으로 유지방, 유단백, 무지고형분량에 대해서도 비유 일수 305일째의 누적량으로 보정할 수 있는 보정 공식을 개발하였다.

• Journal of Animal Science and Technology
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• 제50권2호
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• pp.157-166
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• 2008

• Journal of Forest and Environmental Science
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• 제25권2호
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• pp.111-118
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• 2009

Multiple shoot induction and plant regeneration using apical bud and nodal explants of 100 year old tree of Anthocephalus cadamba, an important sacred and medicinal tree in India was achieved for the first time. Aseptic explants cultured in Murashige and Skoog (MS) medium augmented with different concentrations of BAP (0.1, 0.5, 1.0, 2.5, 5.0 and 10 mg/l), when maintained for 60 days, healthy shoots were induced in presence of BAP (1 mg/l). Lower concentrations of BAP (0.1 - 0.5 mg/l) induced only one shoot per explant. Increase in number of shoots per explant was observed in presence of higher concentrations of BAP (2.5, 5.0 and 10 mg/l). However, elongation of shoots was completely inhibited. Bud break and shoot regeneration was largely associated with seasonal factors. Apical buds cultured during June to August exhibited early bud break within two weeks of initial culture. In rest of the months, bud break and shoot regeneration was very slow irrespective of the various concentrations of BAP used in the medium. Explants sourced from three different maturity levels of shoots indicated that actively growing shoots from the mother plant with 1 - 2 nodal segments was more suitable for culture initiation than the explants collected from mature shoots at dormant stage. Regenerated shoots with 2 - 3 pairs of leaves when transferred to half strength MS medium fortified with IBA (1 mg/l), 60% of the shoots induced healthy roots, indicating the possibility of large scale micropropagation.

• Journal of Animal Science and Technology
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• 제55권1호
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• pp.7-11
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• 2013

본 연구의 목적은 여러 산차를 이용한 모델을 사용하여 유전평가 분석을 하기위하여 3개의 유량생산 형질에 대한 (공)분산 성분을 추정하고자 하였다. 모수추정을 위한 자료는 2001년부터 2009년까지의 검정자료를 이용하였고 원시자료수는 1,416,589개이며 5개의 산차형질에 대해 각각 다른 형질로 가정하여 추정하였다. 동기그룹 내 10두 이하 및 씨수소의 딸소가 10두 미만인 개체는 삭제를 하였으며 305일 유량생산이 15,000 kg을 초과하는 비유개체에 대하여 사전 데이터 가공을 실시하였다. 혈통파일은 총292,382개의 혈통자료와 1,456두의 씨수소로 구성되어진 혈통자료가 연구에 사용되었다. Sire 모형은 herd-year-season의 동기그룹과 분만월령 그리고 혈통과 5산까지 상가적 유전효과들이 적용되었으며 VCE를 이용하여 유전 (공)분산이 추정되었다. 유전율과 유전상과 그리고 잔차상관은 R 패키지를 이용하여 계산하였다. 유량에 대한 산차간 유전 상관은 0.76에서 0.98였고, 유지방량은 0.79~0.10, 유단백질량은 0.75~1.00로 나타났다. 각 산차별 유량, 유지방량, 유단백질량은 상대적으로 낮은 유전력인 0.14~0.23, 0.13~0.20이 추정되었으며 산차에 가중치로 결합된 유전력은 각 형질에서 0.29, 0.28, 0.26로 나타났다. 본 연구에서 추정된 모수들은 국가단위 유전평가분석에 사용될 수 있을 것으로 판단된다.

• 한국가금학회지
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• 제50권3호
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• pp.187-191
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• 2023

Korean native ducks (KNDs) continue to have a high preference from consumers due to their excellent meat quality and taste characteristics. However, due to low productivity and fixed plumage color phenotype, it could not secure a large share in the domestic market compared to imported species. In order to improve the market share of KNDs, the genetic characteristics of the breed should be identified and used for improvement and selection. Therefore, this study was conducted to identify the genetic information of colored and white KNDs using next-generation resequencing data and screening for differences between the two groups. As a result of the analysis, the genetic variants that showed significant differences between the colored and white KND groups were mainly identified as mutations related to tyrosine activity. The variants were located in the genes that affect melanin synthesis and regulation, such as EGFR, PDGFRA, and DDR2, and these were reported as the candidate genes related to plumage pigmentation in poultry. Therefore, the results of this study are expected to be useful as a basis for understanding and utilizing the genetic characteristics of KNDs for genetic improvement and selection of white broiler KNDs.

• Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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• 제16권6호
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• pp.794-799
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• 2003

A study was conducted on 2102 records of 808 crossbred cows of various genetic groups maintained under 'All India Coordinated Research Project on Cattle' at C C S Haryana Agricultural University, Hisar, over 25 years period (1968-1993) with an objective to assess and compare the amount of percent improvement and heterotic effect for different performance traits in various genetic groups produced under this programme. Survivability sharply and significantly declined from 1/2 to $3/4^th$ bred and further from $3/4^th$ to inter-se bred. This may be due to periodic and management differences in addition to the higher level of exotic inheritance and decreased heterotic effect over the filial generations. Jersey and Holstein Friesian crosses among 1/2 breds and their 50% inheritance among $3/4^th$ and inter-se breds had highest improvement and heterosis in reproduction and production traits respectively. Among inter se bred genetic groups, BFH (I) had no recombination loss in SP and CI, while FJH (I), JFH (I) and FBH (I) had on recombination loss in AFC, LY, LL and PE. The crossbreeding of zebu cows with exotic breeds brings about spectacular improvement in comparison to the performance of zebu breed, while conventional selection over several generation would lead to only modest improvement. In addition to additive effect, there was sufficient heterosis in Jersey crosses for reproduction and Holstein Friesian crosses for production performance. Three breed crosses with exotic inheritance between 50 and 75 percent incorporating genes (25 to 50%) from both of these breeds is the best combination for stabilization.