• Molecules and Cells
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• 제26권2호
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• pp.131-139
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• 2008

Expression of the seven open reading frames (ORFs) of single-stranded DNA Curtoviruses such as Beet curly top virus (BCTV) and Beet severe curly top virus (BSCTV) is driven by a bi-directional promoter. To investigate this bidirectional promoter activity with respect to viral late gene expression, transgenic Arabidopsis plants expressing a GUS reporter gene under the control of either the BCTV or BSCTV bi-directional promoter were constructed. Transgenic plants harboring constructs showed higher expression levels when the promoter of the less virulent BCTV was used than when the promoter of the more virulent BSCTV was used. In transgenic seedlings, the reporter gene constructs were expressed primarily in actively dividing tissues such as root tips and apical meristems. As the transgenic plants matured, reporter gene expression diminished but viral infection of mature transgenic plants restored reporter gene expression, particularly in transgenic plants containing BCTV virion-sense gene promoter constructs. A 30 base pair conserved late element (CLE) motif was identified that was present three times in tandem in the BCTV promoter and once in that of BSCTV. Progressive deletion of these repeats from the BCTV promoter resulted in decreased reporter gene expression, but BSCTV promoters in which one or two extra copies of this motif were inserted did not exhibit increased late gene promoter activity. These results demonstrate that Curtovirus late gene expression by virion-sense promoters depends on the developmental stage of the host plant as well as on the number of CLE motifs present in the promoter.

• 한국미생물·생명공학회지
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• 제29권2호
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• pp.72-77
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• 2001

Strong promoter로 밝혀진 alginate lyase 유전자의 promoter 부위에 대한 특성을 검토하기 위해 alginate lyase 유전자의 46개 N-terminal amino acid가 포함된 promoter 부분과, 같은 균으로부터 분리한 $\beta$-agarase의 유전자를 연결시켜 agarase의 activity를 평판배지상에서 보다 쉽게 확인하는 방법으로 promoter의 활성을 측정한 결과 alginate lyase 유전자 promoter에 의해서 $\beta$-agarase 유전자의 대량발현이 유도되고 있었으며 glucose의 존재하에서 $\beta$-agarase 유전자 발현이 일어나지 않는 catabolite repression 양상을 나타내고 있다. PCR로써 alginate lyase의 46개 N-terminal amino acid 부분이 순차적으로 제거된 plasmid를 제조하여 대량발현을 조사한 결과 46개의 아미노산이 제거된 후에도 $\beta$-agarase의 활성에는 변화가 없어 46개의 N-말단이 정상적인 상태에서 발현에는 영향을 미치고 있지 않음을 확인할 수 있었다. 또한 alginate lyase 유전자의 promoter region에 존재하는 가능한 2개의 promoter consensus sequence PI, PII를 subcloning한 결과 promoter PII만이 존재할 때도 대량발현이 유도되고 있음을 확인할 수 있었으며 동시에 glucose가 존재할 때 catabolite repression이 역시 나타나고 있어 이 부분이 발현 및 glucose에 의한 regulation에 매우 중요하게 작용하는 부분이라는 것을 확인할 수 있었다.

• 한국동물번식학회:학술대회논문집
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• 한국동물번식학회 2004년도 춘계학술발표대회
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• pp.194-194
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• 2004

Tissue-specific expression of the desired gene product in the targrt tissue is central to the concept of bioreactor. One approach is to use a tissue-specific promoter to drive desired gene. To investigate the feasibility of tissue-specific gene expression for bladder using the porcine uroplakin(UPII) promoter and its transcriptional control the efficacy of this promoter as well as well as fragments in regulating gene expression were cell lines using DNA transfection. (omitted)

• 생명과학회지
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• 제18권10호
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• pp.1395-1399
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• 2008

우리는 최근에 PRC1 프로모터가 유방암 유전자치료를 위하여 전사 표적이 된 유전자의 발현을 조절할 수 있는 후보 프로모터임을 보고하였다. 우리는 본 실험에서 PRC1이 폐암유전자 치료에서도 적용이 가능한지 조사하였다. 특정 프로모터가 루시퍼라제 유전자와 연결된 플라스미드를 이용한 형질전환 assay에서 PRC1 프로모터는 정상폐세포주에서는 활성을 보이지 않으나 폐암세포주에선 약 30 배의 활성을 보였다. 이는 이미 암특이적인 발현으로 알려진 BIRC5 (survivin) 프로모터와 유사한 결과였다. 또한, 바이러스 벡터를 이용한 실험에서 PRC1은 CMV 프로모터에 비해 아데노부속바이러스에서 약 75%, 아데노바이러스에서 약 66%의활성을 보였다. 이와 대조적으로, PRC1 프로모터를 함유한 이 들 두 종류의 바이러스는 정상 폐세포에서는 20%정도의 낮은 활성을 보였다. 흥미롭게도, 인간 폐종양세포를 이식한 생쥐모델을 사용한 결과에서는 PRC1 프로모터가 CMV 프로모터와 비슷한 생체 활성을 보였다. 종합하면, 이상의 결과는 PRC1이 폐암 유전자치료를 위한 전사표적 유전자의 발현을 위한 프로모터로 사용 가능함을 암시한다.

• 식물조직배양학회지
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• 제25권4호
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• pp.237-243
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• 1998

야생종 토마토의 자가불화합성에 관여하는 S RNase유전자의 조직특이적 발현 양상을 조사하기 위하여 $\textrm{S}_{11}$ 및 $\textrm{S}_{12}$ allele에 속하는 RNase 유전자의 Promoter영역에 대한 염기 서열을 비교 분석한 결과, 전사개시점에서 상류측으로 350-500bp사이에서 양쪽 allele의 Promoter간에 상동성을 나타내는 3부분과 direct repeat sequence를 발견하였다. Promoter영역에서 이러한 부분이 S RNase 유전자가 화주특이적으로 발현하는데 영향을 줄 것으로 예상하고, 이들 영역을 중심으로 6종류의 deletion fragment를 만들어 GUS 유전자에 연결하여, 토마토의 생식조직에 microprojectile bombardment를 수행하였다. 그 결과 토마토 자가불화합성에 관여하는 S RNase 유전자의 promoter는 TATA box를 포함한 127 bP만으로도 화주조직 특이적 발현을 조절할 수 있었다. 또한 S RNase 유전자의 promoter영역내에는 토마토 화변, 자방과 심피조직들에서 negative 혹은 positive로 유전자의 발현을 유도하는 부분이 발견되었다.

• 한국정보과학회:학술대회논문집
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• 한국정보과학회 1999년도 가을 학술발표논문집 Vol.26 No.2 (2)
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• pp.12-14
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• 1999

Promoter는 transcript start site 앞부분에 위치하여 RNA polymerase가 높은 친화성을 보이며 바인당하는 DNA상의 특별한 부위로서 여기서부터 DNA transcription이 시작된다. function이나 tissue-specific gene들의 그룹별로 그 promoter들의 특이한 패턴들의 조합을 발견함으로써 Specific한 transcription을 조절하는 것으로 알려져 있어 promoter로 인한 그 gene의 정보를 어느 정도 알 수가 있다. 사람의 housekeeping gene promoter들을 EPD(eukaryotic promoter database)와 EMBL nucleic acid sequence database로부터 수집하여 이것들 간에 의미 있게 나타나는 모든 패턴들을 optimization algorithm으로 알려진 genetic algorithm을 이용해서 찾아보았다.

• Mycobiology
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• 제46권4호
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• pp.429-439
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• 2018

To develop a convenient promoter analysis system for fungi, a null-pigment mutant (NPG) of Aspergillus nidulans was used with the 4'-phosphopantetheinyl transferase (PPTase) gene, npgA, which restores the normal pigmentation in A. nidulans, as a new reporter gene. The functional organization of serially deleted promoter regions of the A. nidulans trpC gene and the Cryphonectria parasitica crp gene in filamentous fungi was representatively investigated to establish a novel fungal promoter assay system that depends on color complementation of the NPG mutant with the PPTase npgA gene. Several promoter regions of the trpC and crp genes were fused to the npgA gene containing the 1,034-bp open reading frame and the 966-bp 3' downstream region from the TAA, and the constructed fusions were introduced into the NPG mutant in A. nidulans to evaluate color recovery due to the transcriptional activity of the sequence elements. Serial deletion of the trpC and crp promoter regions in this PPTase reporter assay system reaffirmed results in previous reports by using the fungal transformation step without a laborious verification process. This approach suggests a more rapid and convenient system than conventional analyses for fungal gene expression studies.

• 생명과학회지
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• 제14권4호
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• pp.657-663
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• 2004

고추에서 클로닝된 sesquiterpene cyclase (CASC) promoter에 cinnamic acid 4-hydroxylase (C4H)유전자를 클로닝하여 담배에 형질전환하였다. 형질전환체의 분석은 PCR, Southern blot분석으로 하였으며, CASC promoter의 작동여부를 조사하기 위하여 GUS histochemical assay를 하였다. 스트레스에 반응한다고 알려진 CASC promoter를 C4H gene과 fusion하여 C4H activity를 조사하여 스트레스에 반응하는 정도를 조사하였다. 최종적인 형질전환체로 확인된 개체는 평균 16.4% 정도였으며, 각 promoter별로 약간의 편차를 보였다. C4H activity 조사시 스트레스를 주지 않았을 때 대조구가 비슷한 양상을 나타내었다. 스트레스를 주었을 때 대조구와 비교하여 promoter 3번은 1.3배 activity가 높아졌으며 4번은 1.4배, 6은 2배, cyc 600은 1.1배 높아졌다. 이런 결과로 보아 이 promoter들은 UV에 반응하는 promoter이며 앞으로 stress에 저항하는 유전자의 적당한 promoter로, 타작물에 적용하여 stress저항성 작물의 육성 시 매우 유용하게 사용될 것으로 사료된다.

• 미생물학회지
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• 제29권5호
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• pp.290-295
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• 1991

N4 phage, which infects E. coli K-12 strains, could not infect E. coli K-12 strains containing rtn(resistant to N4) gene on plasmids, which was isolated from Proteus vulgaris ATCC 13315. The region of rtn gene for Rtn phenotype was reduced to the 1.7 kb HincII-AccI fragment, and rtn gene seemed to have its own promoter. This putative promoter was present in 107 bp HindII-DraI fragment, and known to be functional in E. cole K-12, which is supported by the fact that phenotype of a subclone, pRMG103A1B which does not contain the 107 bp fragment, was dependent on the existance of a functional promoter in the upstream of rtn gene, and that the 107 bp fragment had promoter activity when located in the upstream of structural gene of galactodinase of E. coli. The promoter-bearing fragment contains two overlapping putative promoter sequences, both of which show a fit in eight of twelve nucleotides with consensus sequences of E. coli promoters at the -35 and -10 regions.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제1권1호
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• pp.37-44
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• 1991

A shuttle promoter-probe vector, pEB203, was derived from pBR322, pPL703 and pUB110. Using the vector, a useful DNA fragment, 319 bp EcoRI fragment, having strong promoter activity has been cloned from Bacillus subtills chromosomal DNA. Selection was based on chloramphenicol resistance which is dependent upon the introduction of DNA fragments allowing expression of a chloramphenicol acetyl transferase gene. The nucleotide sequence of the 319 bp fragment has been determined and the putative -35 and -10 region, ribosome binding site, and ATG initiation codon were observed. This promoter was named EB promoter and the resultant plasmid which can be used as an expression vector was named pEBP313. The crystal protein gene from B. thuringiensis subsp. kurstaki HD-73 was cloned downstream from the EB promoter without its own promoter. When the resultant plasmid, pBT313, was introduced into Escherichia coli and B. subtilis, efficient synthesis of crystal protein was observed in both cells, and the cp gene expression in B. subtilis begins early in the vegetative phase. The cell extracts from both clones were toxic to Hyphantria cunea larvae.