• 제목/요약/키워드: Garlic virus

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Leek Yellow Stripe Virus Can Adjust for Host Adaptation by Trimming the N-Terminal Domain to Allow the P1 Protein to Function as an RNA Silencing Suppressor

  • Sasaki, Jun;Kawakubo, Shusuke;Kim, Hangil;Kim, Ok-Kyung;Yamashita, Kazuo;Shimura, Hanako;Masuta, Chikara
    • The Plant Pathology Journal
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    • 제38권4호
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    • pp.383-394
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    • 2022
  • In Japan, the P1 protein (S-type) encoded by leek yellow stripe virus (LYSV) isolates detected in Honshu and southward is shorter than the P1 (N-type) of LYSV isolates from garlic grown in Hokkaido due to a large deletion in the N-terminal half. In garlic fields in Hokkaido, two types of LYSV isolate with N- and S-type P1s are sometimes found in mixed infections. In this study, we confirmed that N- and S-type P1 sequences were present in the same plant and that they belong to different evolutionary phylogenetic groups. To investigate how LYSV with S-type P1 (LYSV-S) could have invaded LYSV with N-type P1 (LYSV-N)-infected garlic, we examined wild Allium spp. plants in Hokkaido and found that LYSV was almost undetectable. On the other hand, in Honshu, LYSV-S was detected at a high frequency in Allium spp. other than garlic, suggesting that the LYSV-S can infect a wider host range of Allium spp. compared to LYSV-N. Because P1 proteins of potyviruses have been reported to promote RNA silencing suppressor (RSS) activity of HC-Pro proteins, we analyzed whether the same was true for P1 of LYSV. In onion, contrary to expectation, the P1 protein itself had RSS activity. Moreover, the RSS activity of S-type P1 was considerably stronger than that of N-type P1, suggesting that LYSV P1 may be able to enhance its RSS activity when the deletion is in the N-terminal half and that acquiring S-type P1 may have enabled LYSV to expand its host range.

Development of a New Process for Mass-Production of Virus-Free Seed Bulbs of Garlic(Allium sativum L.) Through Plant Tissue Culture Technique

  • Kim, Joo-Hag
    • 한국생물환경조절학회:학술대회논문집
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    • 한국생물환경조절학회 1996년도 국제심포지움 21세기 첨단식물생산시스템의 실용화
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    • pp.117-128
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    • 1996
  • A garlic (Allium sativum L.) is an important and useful vegetable such that it is not only most used for spices but also exploited for health foods and pharmaceuticals. The garlic is a kind of vegetable propagated vegetatively through cloves. Therefore, development of new varieties of garlics is possible only through selection breeding because cross breeding is impossible. (omitted)

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사료 내 마늘 추출액 첨가가 넙치(Paralichthys olivaceus)의 비특이적 면역반응 및 질병저항성에 미치는 영향 (Effects of Dietary Supplementation with Garlic Extract on Immune Responses and Diseases Resistance of Olive Flounder, Paralichthys olivaceus)

  • 김승민;전려진;여인규;전유진;이경준;정현도;정준범
    • 한국어병학회지
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    • 제27권1호
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    • pp.35-45
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    • 2014
  • 본 연구에서는 1% 마늘 추출액을 사료에 첨가하여 항균력 시험, 혈액학적 분석 및 어류질병 원인체들 (Viral Hemorrhagic Septicemia Virus, Vibrio anguillarum, Streptococcus iniae, Edwardsiella tarda)에 대한 비특이적 면역반응을 조사하였다. 사료에 1% 마늘 추출액을 첨가하여 4주간 넙치에 섭이시킨 후 V. anguillarum, S. iniae, E. tarda을 인위 감염시켜 2주간 누적 폐사율을 관찰하였다. 공격 실험 결과 E. tarda를 제외한 모든 시험구에서 대조구에 비해 낮은 누적 폐사율이 관찰되었다. Hematocrit, glucose, total protein, lysozyme activity 및 macrophage activity에서는 대조구에 비해 유의적으로 높은 수치를 관찰하였다. 3가지 어병세균 (V. anguillarum, S. iniae, E. tarda)을 이용하여 마늘 항균력 및 MIC를 측정한 결과, 이전에 보고된 마늘 분말보다 1% 마늘 추출물에서 더 효과적인 결과를 관찰하였다. 이러한 결과는 마늘 추출물이 넙치의 V. anguillarum, S. iniae, E. tarda에 대한 비특이적 면역반응 및 질병저항력을 증가시키는 것으로 사료된다.

마늘의 Callus 배양에 관한 연구 (Studies on the Callus)

  • 장무웅;이갑랑;조수열;정희돈
    • 한국응용곤충학회지
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    • 제19권2호
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    • pp.91-95
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    • 1980
  • 마늘의 바이러스 무감염주 생산과 종자 비용절감을 위한 기초적연구를 행하고저 마늘인편의 보통엽조직의 callus배양을 행하여 다음과 같은 결과를 얻었다. 1. 마늘 callus의 유도 Linsmaier & Skoog는 기본배지에 Benzyladenine $10^{-5}M$$2,4-D\;10^{-5}M$에서 가장 양호한 결과를 얻었다. 2. callus생장은 Linsmaier & Skoog 기본배지에 kinetin $10^{-6}M$과, $2,4D\;10^{-6}M$을 함유한 것이 가장 양호하였다. 3. callus조직내의 바이러스 소장을 조사한 결과 투명하고 부드러운 callus조직을 8대 계대배양을 하였을 때 바이러스는 제거되었다. 4. 바이러스무감염이 확인된 마늘 callus조직을 Murashing & Skoog 기본배지에 kinetin $10^{-5}M$$NAA\;5\times10^{-6}M$을 함유한 배지에 다식하였을 때 재분화 되어 소식물체를 형성하였다.

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적외선 촬영 영상 기반의 작물 병해 모니터링 가능성 타진을 위한 실내 감염 실험 (Preliminary growth chamber experiments using thermal infrared image to detect crop disease)

  • 정회정;정래동;류재현;오도혁;최선웅;조재일
    • 한국농림기상학회지
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    • 제21권2호
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    • pp.111-116
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    • 2019
  • 세균과 바이러스에 감염된 작물의 생물적 스트레스 탐지를 원격탐지 기술 기반의 열적외 센서를 이용하여 실내 생육 챔버에서 실험하였다. 감염으로 인한 엽온의 증가와 감염 농도에 따른 엽온 차이를 확인했다. 또한 엽온 기반으로 산출한 CWSI 값은 감염 잎에서 증가하였고, 그러한 현상은 육안으로 병징을 발견하기 하루 전에 시작되었다. 따라서 스마트팜 시스템의 작물 모니터링에 열적외 센서를 이용한다면, 병해의 탐지는 물론 피해 등급 평가, 조기 알람 등에 활용될 수 있을 것이다. 하지만 실제 스마트팜 적용을 위해서는 향후 엽온 측정 정확도 향상 기술, 자료 해석 방법, 생물 비생물적 스트레스 구별 알고리즘 연구 등이 추가로 필요할 것이다.

Plant RNA Virus Sequences Identified in Kimchi by Microbial Metatranscriptome Analysis

  • Kim, Dong Seon;Jung, Ji Young;Wang, Yao;Oh, Hye Ji;Choi, Dongjin;Jeon, Che Ok;Hahn, Yoonsoo
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제24권7호
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    • pp.979-986
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    • 2014
  • Plant pathogenic RNA viruses are present in a variety of plant-based foods. When ingested by humans, these viruses can survive the passage through the digestive tract, and are frequently detected in human feces. Kimchi is a traditional fermented Korean food made from cabbage or vegetables, with a variety of other plant-based ingredients, including ground red pepper and garlic paste. We analyzed microbial metatranscriptome data from kimchi at five fermentation stages to identify plant RNA virus-derived sequences. We successfully identified a substantial amount of plant RNA virus sequences, especially during the early stages of fermentation: 23.47% and 16.45% of total clean reads on days 7 and 13, respectively. The most abundant plant RNA virus sequences were from pepper mild mottle virus, a major pathogen of red peppers; this constituted 95% of the total RNA virus sequences identified throughout the fermentation period. We observed distinct sequencing read-depth distributions for plant RNA virus genomes, possibly implying intrinsic and/or technical biases during the metatranscriptome generation procedure. We also identified RNA virus sequences in publicly available microbial metatranscriptome data sets. We propose that metatranscriptome data may serve as a valuable resource for RNA virus detection, and a systematic screening of the ingredients may help prevent the use of virus-infected low-quality materials for food production.

Molecular Cloning of the 3'-Terminal Region of Garlic Potyviruses and Immunological Detection of Their Coat Proteins

  • Song, Sang-Ik;Song, Jong-Tae;Chang, Moo-Ung;Lee, Jong-Seob;Park, Yang-Do
    • The Plant Pathology Journal
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    • 제15권5호
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    • pp.270-279
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    • 1999
  • cDNAs complementary to the 3'-terminal regions of two potyvirus genomes were cloned and sequenced. The clone G7 contains one open reading frame (ORF) of 1,338 nucleotides and a 3' untranslated region (3'-UTR) of 403 nucleotides at the 3'-end excluding the 3'end poly(A) tail. The putative viral coat protein (CP) shows 55%-92% amino acid sequence homology to those of Allium potyviruses. The genome size of the virus was analyzed to be about 9.0 kb by Northern blot analysis. Five cDNA clones were screened out using GPV2 oligonucleotide as a probe. One of these clones, DEA72, which has a longest cDNA insert, contains one ORF of 1,459 nucleotides and a 3'-UTR of 590 nucleotides at the 3'-end excluding the 3'-end poly(A) tail. The putative viral CP shows 57%-88% amino acid sequence homologies to those of Allium potyviruses. The genome size of the virus was analyzed to be about 9.6 kb by Northern blot analysis. The results of immunoblot and Northern blot analyses suggest that almost all of the tested garlic plants showing mosaic or streak symptoms are infected with DEA72-potyvirus in variable degrees but rarely infected with G7-potyvirus in variable degrees but rarely infected with DEA72-potyvirus in variable degrees but rarely infected with G7-potyvirus. Immunoelectron microscopy using anti-DEA72 CP antibody shows that this potyvirus is about 750 nm long and flexuous rod shaped.

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마늘 잠복 바이러스의 순수분리 및 증식 (Purification and Amplification of Garlic Latent Virus)

  • 최진남
    • Journal of Plant Biology
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    • 제35권3호
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    • pp.259-263
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    • 1992
  • 한국 마늘에 감염되어 있는 주된 바이러스 중의 하나로 알려진 마늘 잠복 바이러스 (GMV)의 분자 구조와 병 발생 메카니즘을 이해하기 위하여, 국부 감염 숙주 식물인 Vicia faba에 연속적으로 감염시킴으로써 마늘 잠복 바이러스를 정제하였고, GMV에 대한 전신 감염성 숙주 식물로 생각되는 leek에서 GLV를 대량으로 증식시켰다. 투과전자현미경을 이용하여 바이러스 입자를 관찰한 결과, 마늘 바이러스들의 입자의 길이는 200-2000 nm의 분포를 보였으나 입자의 대부분은 600-900 nm의 범위 안에 존재하였다. 반면 순수 분리된 GLV 입자는 평균 690 nm의 길이를 보여주었고, 유연한 실 모양이었다. SDS-PAGE 분석으로 혼합 감염된 마늘 잎으로부터 분리된 마늘 바이러스의 구조 단백질은 분자량 24,500-38,000 Da의 분포를 나타내었으나, GLV 껍질 단백질의 분자량은 34,000 Da으로 나타났다.

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