Ryu, Chun-Jeih;Whitehurst, Charles E.;Chen, Jianzhu
BMB Reports
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제41권8호
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pp.575-580
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2008
Thymocyte-specific transcriptional regulatory systems can be used to better understand the relationship between transcription and V(D)J recombination during early T cell development. In this study, we generated transgenic mice expressing the transactivator Gal4-VP16 or the Gal4 DNA binding domain (Gal4-DBD) under the control of the lck proximal promoter, which is only active in immature thymocytes. From these studies Gal4-VP16 and Gal4-DBD expression was shown to significantly alter thymic cellularity and differentiation without significantly changing the $CD3^+$ thymocyte distribution. Furthermore, the presence of Gal4-VP16 or Gal4-DBD in the transgenic thymocytes retarded the mobility of the Gal4 DNA binding motif as determined by a gel mobility shift assay, suggesting that the developmental alteration did not affect the functional property of the transgenic proteins. These results indicated that lck promoter-driven Gal4-VP16 or Gal4-DBD expression did not affect $CD3^+$ mature thymocytes, thus this system can be applied to study transcriptional regulation of transresponder genes in bigenic mouse model thymocytes.
전사개시전 복합체(preinitiation complex)에서 단백질간의 상호작용을 연구하시 위해 zero-Iength croessinking방법을 이용하였다. DNA template가 결합한 금속 지지체를 이용하여 in vitro에서 전사개시전 복합체를 형성시키고, 이렇게 만든 복합체를 1-ethyl-3-(3-dimethylaminopropyl) carbodlimide(EDC)로 croessinking시켰다. $\beta$-mercaptoethanol를 첨가하여 croessinking반응을 멈추게 한 다음, EDC로부터 전사개시전 복합체를 분리하였다. TBF,TFIIB,GAL4-AH등으로 구성된 전사개시전 복합체에 이러한 방법을 적용함으로써 TBF가 GAL4-AH,TFIIB와 각각 직접적으로 결합하고 있음을 규명하였다. 반면에 GAL4-AH와 TFIIB가 croessinking된 산물은 확인할 수 없었다. 이러한 결과들은 GAL4-AH,TFIIB,TBP,DNA로 구성된 전사개시전 복합체에서 GAL4-AH는 TFIIB와 안정적인 결합을 하고 있지 않음을 암시한다.
재조합 대장균의 ${\beta}-galactosidase$ (${\beta}-gal$)을 이용하여 transgalactosylation 반응으로 1, 2-hexanediol galactoside (HD-gal) 합성을 수행하였다. 먼저, 합성 반응을 수행할 때의, ${\beta}-gal$의 양, 1, 2-hexanediol(HD)의 양, 반응 pH, 반응 온도 등 반응조건을 최적화하였다. ${\beta}-Gal$은 4.8 U/mL, HD는 75 mM, pH는 7.0, 온도는 $37^{\circ}C$의 조건이 최적 합성 조건이었으며, 이때, 약 96%의 HD가 HD-gal로 conversion 되었다. 그리고, 돼지 epidermis를 이용하여 HD와 HD-gal의 water holding capacity (WHC)를 비교 측정하여 보았는데, 이때, epidermis 표면에 HD와 HD-gal을 84.4, 126.6, 168.8, 211.0 mM을 처리하였으며, 84.4, 126.6, 168.8 mM의 HD와 HD-gal을 처리하였을 경우 HD-gal이 HD보다 더 큰 WHC 값을 보여 주었고, 168.8 mM의 경우에는 HD-gal이 HD와 비교하여 최대 약 20% 정도의 더 큰 WHC 값을 보여 주었다. 그러나, HD-gal의 MIC (minimal inhibitory concentration) 값을 측정해 본 결과, Enterococcus faecalis의 경우에는 HD의 MIC와 같았으나, Escherichia coli, Pseudomonas aeruginosa, Staphylococcus aureus의 경우에는 약 3배에서 10배까지 HD-gal의 MIC 값이 HD에 비하여 증가되는 현상이 관찰되었다. 결론적으로, HD의 transgalactosylation 반응으로 인하여 합성된 HD-gal의 보습력은 HD에 비하여 증가되고, HD-gal의 항균력은 HD와 비교하여 감소하는 현상을 관찰하였다.
Mortierella sp. 유래 효소 정제는 CM-sephadex C-50 column chromatography와 Sephadex G-100 column에 의해 수행하여 SDS-전기영동에서 단일밴드를 확인하였고 분자량은 57kDa로 결정되었다. melibiose, raffinose 및 stachyose의 세 종류의 기질에 대한 특이성에서는 Mortierella sp. 유래 정제 ${\alpha}$-galactosidase는 세 종류 기질의 비환원말단에 위치하고 있는 galactose를 모두 유리하는 특이성이 있음을 확인하였다. Bacillus sp. 유래의 $Gal^3Man_4$에 대해서 반응초기 3시간부터 가수분해가 진행되어 반응말기에서는 galactose, mannotetraose 그리고 분해되지 않고 일부 남아있는 $Gal^3Man_4$의 spot이 출현된 반면, 중합도 7의 $Gal^{2,3}Man_5$에 대해서는 반응초기부터 말기까지 전혀 특이성이 없음을 시사하였다. Trichoderma harzianum 유래의 $Gal^2Man_3$에 대해서는 반응초기 3시간부터 가수분해가 진행되어 일부 galactose와 mannotriose spot이 출현되고 있는 반면, 중합도 7의 $Gal^2Man_6$에 대해서는 Bacillus sp. 유래의 중합도 7의 $Gal^{2,3}Man_5$와 동일하게 galactose를 절단하는 능력이 없는 특이성을 보이고 있다. Xylogone sphaerospora 유래의 $Gal^2Man_3$는 Trichoderma harzianum 유래의 중합도 4와 동일한 구조로서 가수분해 시간 경과에 따른 반응말기에서 역시 galactose, mannotriose 및 잔존하는 $Gal^2Man_3$ spot이 출현하고 있는 반면 중합도 6인 $Gal^2Man_5$에 대해서는 mannopentaose의 환원말단부터 2번 mannose에 결합하고 있는 galactose에 대해서는 역시 특이성을 나타내지 않아 반응 초기부터 말기까지 가수분해 pattern에 대한 변화를 보이지 않고 있다.
The gene (galE) encoding UDP-galactose-4-epimerase, operative in the galactose metabolic pathway, was cloned together with the $\beta$-galactosidase gene (lacZ) from Lactococcus lactis ssp. lactis ATCC7962 (L. lactis 7962). galE was found to have a length of 981 bps and encoded a protein with a molecular mass of 36,209 Da. The deduced amino acid sequence showed a homology with GalE proteins from several other microorganisms. A Northern analysis demonstrated that galE was constitutively expressed by its own promoter. When galactose or lactose was added into medium, the galE transcription was induced by several upstream promoters. The structure of the gal/lac operon of L. lactis 7962 was partially characterized and the gene order around galE was galT-lacA-lacZ-galE-orfX.
To overcome the hyperacute immune rejection during pig-to-non-human primates xenotranasplantation, we have produced and bred ${\alpha}$-1,3-galactosyltransferase knock-out ($GalT^{-/-}$) pigs. In this study, the somatic cells and tissues from the $GalT^{-/-}$ pigs were characterized by an analysis of the expression of Gal${\alpha}$-1,3-Gal (${\alpha}-Gal$) epitope. Briefly, ear fibroblast cell lines of 19 homozygous $GalT^{-/-}$ pigs were established and cryopreserved. The expression of ${\alpha}-Gal$ epitope in the cells was measured by fluorescence activated cell sorter (FACS) analysis using BS-I-B4 lectin. Also, the homozygous ($GalT^{-/-}$) cells and tissues samples were immunostained with BS-I-B4 lectin for analysis of ${\alpha}-Gal$ epitope expression. The results showed that the expression of ${\alpha}-Gal$ epitope in $GalT^{-/-}$ cells (0.2 %) were significantly (p<0.05) down-regulated to the range of cynomolgus monkey fibroblast (0.2 %) cells compared to heterozygous ($GalT^{-/+}$) (9.3 %) and wild type ($GalT^{+/+}$) (93.7 %) fibroblast cells. In the immunostaining results, while the expression of ${\alpha}-Gal$ epitope was detected a partly in $GalT^{-/+}$ cells and mostly in $GalT^{+/+}$ cells, it was almost not detected in the $GalT^{-/-}$ cells. Also, immunostaining results from various tissues of the $GalT^{-/-}$ pig showed that the expression of ${\alpha}-Gal$ epitope was not detectable, whereas various tissues from $GalT^{+/+}$ pig showed a strong expression of ${\alpha}-Gal$ epitope. Our results demonstrated that ${\alpha}-Gal$ epitope expressions from $GalT^{-/-}$ pigs were successfully knocked out to prevent hyperacute immune rejection for further study of xenotransplantation.
항균력과 보습력을 동시에 가지고 있는 화장품용 첨가제인 1, 2-octanediol (OD)의 피부 문제점을 개선하기 위하여 galactoside 유도체인 1, 2-octanediol galactoside (OD-gal)를 대장균 β-galactosidase (β-gal)을 이용하여 합성하였다. 이 때, β-gal은 4.5 U/ml, OD 농도는 150 mM, pH는 7.0, 그리고, 온도는 37℃가 OD로부터 OD-gal을 합성하는 최적 조건이었다. 이 조건에 24 시간 동안 150 mM의 OD로부터 약 55.9 mM의 OD-gal이 합성되었고, 이 때, conversion 수율(mole 기준)은 약 37.2% 였다. 또한, 9 ml의 반응액에서 67.4 mg의 순수한 OD-gal을 정제할 수 있었으며, 반응액에 들어 있는 OD에서부터 정제를 포함하는 전체 합성수율은 weight 기준으로는 약 34.1% 이고, mole 기준으로는 약 16.2% 정도였다. 이러한 연구결과는 보다 안전한 화장품용 첨가제로서 OD-gal의 산업화에 기초자료로서 도움을 줄 것으로 생각된다.
본 연구에서는 GALl, GALl, GALlO 및 GAP promoter 하류에 reporter 유전자인 K. marxianus의 inulinase 유전자(lNUl)를 연결하여 각각의 재조합 plasmid들을 구축하고, 이들로 형질전환된 S. cerevrswe를 회분배양(YPOG 배지 )하여 외래 유전자 발현에 미치는 promoter의 영향을 비교.검토하 였다. 재조합 효모의 최종 균체농도는 36-39 00600 값을 보여 promoter에 따른 큰 차이를 보이지 않았으나, 포도당 소모기간 동안 비증식속도는 평균 $0.24 h^{-1}$로 유지되다가 galactose 소모기간 동안에 GAL promoter 함유 효모배양의 경우 $0.04-0.06 h^{-1}$, pYIGP 함유 재조합 효모배양은 $0.10 h^{-1}$로 감소하였다. 포도당 고갈 후 inulinase 발현은 시작되었고 균체외 inulinase의 발현 수준은 배양 72시간에 4.3 (GALl promoter), 4.0 (GAL7 promoter), 3.8 (GAL10 promoter) 및 1.6 (GAP promoter) unit/mL에 도달하였다. 평판배지상에서의 활성염색과 회분배양의 결과(최종발현양 및 초기 inulinase 말현속도), inulinase 발현에 미치는 promoter 세기 는 GALl > GALlO > GAL7 > GAP 순임을 알 수 있었다. GAL promoter가 배양말기까지 78 % 이상의 높은 plasmid 안정성을 보인 반면에, GAP promoter의 경우 55%의 낮은 plasmid 안정성을 보였다. 또한, 재조합 inulinase는 promoter 종류에 상관없이 98% 이상 배양액으로 분비되였다.
$100^{\circ}C$에서 반응시켜 2, 4, 6, 8시간의 갈변도 변화는 ${\beta}-1,4-mannobiose$와 urea의 반응혼합물이 시간의 경과함에 따라 강한 착색도의 증가를 나타냈으나 phenylthiourea, thiourea의 반응액은 착색속도가 늦었다. 같은 조건하에서 $Gal^3Man_4$와 urea 관련화합물의 각 반응혼합물의 갈변도를 나타낸 것으로 urea가 강한 착색도의 중가를 보였고 phenylthiourea, thiourea의 반응액은 비교적 높은 착색도를 보였다. DP 7의 galactosyl mannooligosaccharide와의 각 반응혼합물의 갈변도는 urea의 반응액이 강한 착색을 보였으며 phenylthiourea, thiourea의 반응액의 순으로 착색를 나타내었다. 반응혼합물의 TLC 결과에서 ${\beta}-1,4-mannobiose$와 urea의 반응혼합물 이외에 phenylthiourea, thiourea의 반응액은 새로운 화합물이 생성되었고, $Gal^3Man_4$와 D.P 7 galactosyl manooligosaccharide와의 반응혼합물에서는 모든 반응액에서 새로운 화합물이 출현되었다. 반응혼합물의 환원력은 urea관련화합물 중에서 특히 phenylthiourea, thiourea가 ${\beta}-1,4-mannobiose,\;Gal^3Man_4$, DP 7의 galactosyl manooligosaccharide와의 반응혼합물에서 강한 환원력이 나타났다. Linoleic acid에 대한 반응혼합물의 항산화력 측정에서 ${\beta}-1,4-mannobiose$와 thiourea의 반응혼합물의 항산화력이 Ascorbic acid(AsA)수준의 항산화력을 나타내었고, $Gal^3Man_4$와 thiourea, phenylthiourea의 반응혼합물은 AsA와 유사한 항산화능을 나타내었다. DP 7의 galactosyl manooligosaccharide와 thiourea, phenylthiourea의 반응혼합물의 항산화력은 AsA에 미치지는 못하였다. ${\beta}-1,4-Mannobiose$와 thiourea, phenylthiourea의 반응혼합물이 강한 전자공여능을 나타내고 있고, $Gal^3Man_4$와 phenylthiourea의 반응혼합물 및 D.P 7의 galactosyl manooligosaccharide와 phenylthiourea와의 반응혼합물이 전자공여능을 나타내고 있다.
Kim, Kyoung-Sook;Kim, Cheorl-Ho;Shin, Deug-Yong;Lee, Young-Choon
BMB Reports
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제30권2호
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pp.95-100
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1997
Two kinds of cDNA encoding mouse $Gal{\beta}$1,3(4)GlcNAc ${\alpha}$2,3-sialyltransferase (mST3Gal III) and $Gal{\beta}$1,4(3)GlcNAc ${\alpha}$2,3-sialyltransferase (mST3Gal IV) were isolated from mouse brain cDNA library by means of a PCR-based approach. The cDNA sequences included an open reading frame coding for proteins of 374 and 333 amino acids, respectively, and the primary structure of these enzymes suggested a putative domain structure consisting of four regions, like that in other glycosyltransferases. The deduced amino acid sequences of mST3GaI III and IV showed a 98% and 89% identity with rat ST3GaI III and human ST3Gal IV, respectively. Northern analysis indicated that the expression of mST3Gal III mRNA was abundant in heart, liver and adult brain, while that of mST3GaI IV mRNA was detected in all tissues tested except for testis, but the level was the highest in liver. Soluble forms of mST3GaI III and IV transiently expressed in COS cells exhibited enzyme activity toward acceptor substrates containing the terminal either $Gal{\beta}$1,3GlcNAc or $Gal{\beta}$1,4GlcNAc sequences. The substrate preferences of both enzymes were stronger for tetrasaccharides than for disaccharides.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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