• International Journal of Internet, Broadcasting and Communication
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• 제14권3호
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• pp.1-7
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• 2022

This paper aims to compare the mean object size of M/G/1/PS model with that of M/BP/1 model used in the web service. The mean object size is one of important measure to control and manage web service economically. M/G/1/PS model utilizes the processor sharing in which CPU rotates in round-robin order giving time quantum to multiple tasks. M/BP/1 model uses the Bounded Pareto distribution to describe the web service according to file size. We may infer that the mean waiting latencies of M/G/1/PS and M/BP/1 model are equal to the mean waiting latency of the deterministic model using the round robin scheduling with the time quantum. Based on the inference, we can find the mean object size of M/G/1/PS model and M/BP/1 model, respectively. Numerical experiments show that when the system load is smaller than the medium, the mean object sizes of the M/G/1/PS model and the M/BP/1 model become the same. In particular, when the shaping parameter is 1.5 and the lower and upper bound of the file size is small in the M/BP/1 model, the mean object sizes of M/G/1/PS model and M/BP/1 model are the same. These results confirm that it is beneficial to use a small file size in a web service.

• Journal of Gastric Cancer
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• 제17권1호
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• pp.43-51
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• 2017

Purpose: This study aimed to analyze G3BP1 and VEZT expression profiles in patients with gastric cancer, and examine the possible relationship between the expressions of each gene and clinicopathological factors. Materials and Methods: Expression of these genes in formalin-fixed paraffin embedded (FFPE) tissues, collected from 40 patients with gastric cancer and 40 healthy controls, was analyzed. Differences in gene expression among patient and normal samples were identified using the GraphPad Prism 5 software. For the analysis of real-time polymerase chain reaction products, GelQuantNET software was used. Results: Our findings demonstrated that both VEZT and G3BP1 mRNA expression levels were downregulated in gastric cancer samples compared with those in the normal controls. No significant relationship was found between the expression of these genes and gender (P-value, 0.4835 vs. 0.6350), but there were significant changes associated with age (P-value, 0.0004 vs. 0.0001) and stage of disease (P-value, 0.0019 vs. 0.0001). In addition, there was a direct relationship between VEZT gene expression and metastasis (P-value, 0.0462), in contrast to G3BP1 that did not demonstrate any significant correlation (P-value, 0.1833). Conclusions: The results suggest that expression profiling of VEZT and G3BP1 can be used for diagnosis of gastric cancer, and specifically, VEZT gene could be considered as a biomarker for the detection of gastric cancer progression.

• 생명과학회지
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• 제27권10호
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• pp.1191-1198
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• 2017

세포 내 소기관들과 소포들은 세포 내에서 미세소관을 따라 적절한 구획으로 수송된다. 이러한 세포 내 수송과정은 분자 모터단백질인 kinesin과 dynein에 의하여 이루어진다. Kinesin 1은 오징어 축삭돌기 세포질로부터 처음 분리되었으며 2개의 중쇄단위체(KHCs, 또는 KIF5s) 및 이와 결합하는 경쇄단위체(KLCs)의 복합체를 형성한다. KIF5s는C-말단 고리 영역을 통해 많은 다양한 단백질과 결합하는데, 아직 그 결합단백질들은 충분히 밝혀지지 않았다. 본 연구에서는 KIF5A 결합단백질을 분리하기 위하여 효모 two-hybrid 탐색을 수행하여 스트레스 과립형성과 mRNP 위치결정에 관여하는 Ras-GTPase-activating protein (GAP) Src homology3 (SH3)-domain-binding protein 2 (G3BP2)를 분리하였다. G3BP2는 KIF5A의 C-말단 고리 영역에 존재하는 73개 아미노산을 포함하는 영역과 결합하였다. 그러나 G3BP2는 KIF5B, KIF5C, KLC1, KIF3A와는 결합하지 않았다. KIF5A는 G3BP2의 arginine-glycine-glycine(RGG)/Gly-rich 도메인과 결합하지만 G3BP1과는 결합하지 않았다. HEK-293T세포에 G3BP2와 KIF5A를 발현하여 면역침강한 결과 G3BP2와 KIF5A는 같이 침강하였다. 또한 HEK-293T 세포 내의 전체에서 두 단백질은 같은 부위에 존재하였다. 이러한 결과들은 세포 내에서 G3BP2는 KIF5A와 결합하는 결합단백질로 확인 되었다.

• International journal of advanced smart convergence
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• 제11권3호
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• pp.1-6
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• 2022

In this paper, we estimate the mean number of objects in the M/H₂/1 model for web service when the mean object size in the M/H₂/1 model is equal to that of the M/G/1/PS and M/BP/1 models. To this end, we use the mean object size obtained by assuming that the mean latency of deterministic model is equal to that of M/H₂/1, M/G/1/PS, and M/BP/1 models, respectively. Computational experiments show that if the shape parameter of the M/BP/1 model is 1.1 and the system load is greater than 0.35, the mean number of objects in the M/H₂/1 model when mean object size of M/H₂/1 model is the same as that of M/G/1/PS model is almost equal to the mean number of objects in the M/H₂/1 model when the mean object size of M/H₂/1 model is the same as that of M/BP/1 model. In addition, as the upper limit of the M/BP/1 model increases, the number of objects in the M/H₂/1 model converges to one, which increases latency. These results mean that it is efficient to use small-sized objects in the web service environment.

• Journal of Plant Biology
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• 제39권1호
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• pp.57-61
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• 1996

Thermal denaturation, reassociation kinectics 및 핵부피 측정 방법으로 고추 게놈의 염기 조성, kinetic component 및 게놈 크기를 조사하였다. 변성온도(Tm)에 근거한 고추 게놈의 염기 조성은 37% (G＋C)였으며, Cot 커브에 근거한 고추 게놈은 카피수가 10,754, 178 및 1이고 kinetic complexity가 $5.6{\times}10^{3}\;bp,\;1.9{\times}10^{6}\;bp\;및\;1.9{\times}10^{8}\;bp$인 3개의 성분이 게놈의 4.2%, 26% 및 65%를 차지하고 있었다. 이로부터 계산한 고추 게놈의 크기는 $1.25{\times}10^{9}\;bp/C$인데, 이는 핵부피($62.4\;\mu\textrm{m}^3/C$)로부터 계산한 $4.053{\times}10^{9}\;bp/C$의 약 33%에 해당한다.

• 생명과학회지
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• 제16권7호
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• pp.1158-1163
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• 2006

BPA는 에폭시 수지 및 플라스틱 생산의 단량체로서 사용되어 왔으며, 접착제, 페인트, 광학렌즈, 건축자재, 전자제품 소재 등 다양한 제품을 생산하는 데 사용되고 있다. 그러나 BPA의 급성세포독성 및 내분비교란활성이 보고되면서 BPA의 분해에 대한 연구가 집중되고 있다. 본 연구에서는 BPA의 광분해 및 화학적 분해의 문제점을 극복하고, 실제적 BPA의 생물학적 분해를 목표로 BPA분해균을 플라스틱 공장의 토양으로부터 분리하였다. 분리균주 중 가장 활성이 우수한 BP-2는 5mM의 BPA처리에서 성장할 수 있었으며, pH 7, $30^{\circ}C$의 최적 배양조건에서 $53.3{\mu}g\;ml^{-1}\;day^{-1}$의 분해속도를 나타내었다. 균주 동정결과 BP-2는 Acinetobacter calcoaceticus로 확인되었으며, 3.5g-건조중량$1^{-1}$의 고농도 휴식 세포 반응 결과 $89.7{\mu}g\;ml^{-1}\;h^{-1}$의 BPA분해속도를 나타내었다. 이러한 결과는 고농도 세포농도를 유지하는 경우, BP-2균주가 실제적 BPA분해를 위한 생물촉매로 사용될 수 있음을 제시하고 있다.

• 한국진공학회:학술대회논문집
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• 한국진공학회 2013년도 제44회 동계 정기학술대회 초록집
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• pp.110-111
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• 2013

FcBP consisting of 13 amino acids specifically binds to Immunoglobulin G Fc domain. Initially, we utilized this peptide for preparation of antibody chip as a PEG composite for enhanced solubility. After then, the peptide conjugate was immobilized on agarose resin, resulting in highly efficient affinity column for antibody purification. The efficiency was comparable to commercial Protein A column. Recently, this peptide was conjugated with cell penetrating peptide (CPP) on a backbone of GFP, affording antibody transducer, which carries antibody into live cells by simple mixing of antibody and the transducer in cell culture media. Antibody transduction into cells was monitored by live cell imaging. More recently, the FcBP was fused to ferritin cage, which consists of 24 ferritin protein molecules. The FcBP-ferritin cage showed greatly increased binding affinity to human IgG. Its binding was analyzed by QCM and SPR analysis. Finally, it was selectively delivered by Herceptin to SKBR3, a breast cancer cell, over MCF10A, non-tumorigenic cells (Fig. 1). Fig. 1. Fluorescent microscopic images of SKBR3 breast cancer cells (A~C) and MCF10A breast cells (D~F) treated with Cy3-trastuzumab/fFcBP-Pf_Fn complexes. Trastuzumab and FcBP-Pf_Fn, which were labeled with Cy3 (Cy3-trastuzumab) and fluorescein (fFcBP-Pf_Fn), respectively, selectively targeted SKBR3 over MCF10A.

• 한국식품과학회지
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• 제44권1호
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• pp.48-54
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• 2012

본 연구에서는 강정의 포장방법 및 포장재질이 강정의 저장 중 품질특성에 미치는 영향을 조사하기 위해서 포장방법별로 개별포장, 대형포장 및 봉지포장의 3가지 방법과 8개의 포장재질을 사용하였다. 강정 포장은 (1) IP: OPP/PE+종이, (2) LP1: OPP/PE+종이, (3) LP2: OPP/PE+관, (4) LP3: OPP/PE+플라스틱, (5) BP1: OPP/PE, (6) BP2: OPP/DL/CPP, (7) BP3: PET/PE/CPP, (8) BP4: OPP/PVDC/PE/CPP로 구분하였다. 강정의 저장초기 지방산 조성은 linoleic acid(54.2%), oleic acid(24.1%), palmitic acid (11.2%) linoleic acid(6.0%) and stearic aicd(3.8%)이었으며, 저장중 수분함량, 수분활성도, 경도, 산가, 과산화물가를 측정하였다. 저장 중 수분함량의 변화가 늦게 나타난 시료는 LP2, BP4 > IP > LP3, BP1, BP2 > LP1 > BP3 순이었다. 수분활성도는 큰 차이를 보이지 않았으며, 경도는 IP, BP3 및 BP4는 저장 60일에 증가의 폭이 가장 크게 나타났다. 산가는 IP, LP1, LP2, LP3, BP1 및 BP2 경우 저장 40일에 기준치인 2.0 mg KOH/g 이하이었으며, 과산화물가는 IP, LP1, LP2 및 BP1의 경우 기준치인 40.0 meq/kg 미만이 20일째인 것으로 나타났다. 결론적으로 포장재질별로는 LP2와 BP1이 저장성이 우수하였으며 포장방법별로는 대형포장 >봉지포장 >개별포장 순으로 나타났다.

• 한국식품과학회지
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• 제20권5호
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• pp.659-665
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• 1988

식품에서의 쓴 맛 펩타이드의 형성 기작 및 분해에 의한 제거 방법을 알아보기 위하여 카제인 가수 분해물에서 쓴 맛 펩타이드를 분리하여 그 특성을 조사하였다. Bacillus subtilis가 생산하는 염기성 단백부내 효소를 순수 분리된 ${\alpha}_{s1}$-카세인과 ${\beta}$-카제인에 처리하여 카제인 가수 분해물을 만들고, 이 가수 분해물에서 용매 추출, Sephadex G-25 겔 크로마토그래피, 고성능 액체 크로마토그래피를 이용해 쓴 맛 펩타이드를 순수 분리했다. 고성능 액체 크로마토그래피는 역상 칼럼인 octadecylsilica 칼럼을 사용했고, 0.1% TFA와 80% $CH_3CN$의 linear gradient 방법을 이용했다. ${\alpha}_{s1}$-카제인 가수분해물에서 3가지 쓴 맛 펩타이드를 분리하였는데, BP-I은 $CH_3CN$ 34%에서, BP-II는 35%, BP-III는 26%에서 각각 용출되었다. ${\beta}$-카제인 가수 분해물에서 2가지 쓴 맛 펩타이드를 분리했는데, BP-IV는 $CH_3CN$ 40%에서, BP-V는 42%에서 용출되었다. 분리된 다섯 가지 펩타이드 중 BP-V가 가장 소수도가 높았으며, 쓴 맛은 BP-I과 BP-II가 가장 강했다.

• Journal of Animal Science and Technology
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• 제44권2호
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• pp.207-212
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• 2002

본 연구에서는 제주 재래흑돈의 모색에 관여하는 MC1R 유전자를 이용하여, 모색유전자 빈도를 조사함으로써, 제주 재래흑돈군 확보를 위한 선발계획 수립에 기초자료를 제공하고자 수행하였다. 공시동물은 랜드레이스, 대요크셔, 듀록 각 품종별 20두와 제주흑돈 93두 등 총 153두를 공시하여 수행하였다. 품종별 MC1R 유전자형을 설정하기 위하여 genbank에 등록되어 있는 돼지 MC1R 유전자(AF181964)를 참고로 하여 두 쌍의 primer (MERL1-EPIG2, EPIG1-EPIG3)를 제작 PCR 증폭을 수행하였다. 먼저 primer MERL1-EPIG2를 이용하여 428bp의 PCR 산물을 얻었으며, primer EPIG1-EPIG3를 이용하여 405bp의 PCR산물을 얻었다. 이들 증폭된 PCR 산물은 서로 다른 2개의 제한효소를 이용하여 PCR-RFLP를 실시하였다. 먼저 primer MERL1-EPIG2를 이용하여 증폭한 428bp의 PCR산물은 제한효소 BspHⅠ(TCATG|A)을 이용하여 절단하였으며, primer EPIG1-EPIG3으로 증폭한 405bp의 PCR산물은 제한효소 AccⅡ(CGC|G)를 이용하여 절단하였다. 이들 절단된 DNA 단편은 TBE buffer에서 전기영동 후 EtBr로 염색하거나 Silver stain 염색을 하여 다형현상을 관찰하였으며, 본 연구의 결과를 요약하면 다음과 같다. 1. 제한효소 BspHⅠ을 이용하여 PCR-RFLP을 수행한 결과 백색의 랜드레이스와 대요크셔는 전 개체 모두가 2개의 밴드(256bp, 172bp)가 확인되었으며, 듀록은 절단되지 않은 하나의 밴드(428bp)가 확인 되었다. 그러나 제주 흑돈에서는 3개의 서로 다른 형태의 밴드가 발견되었는데, 전체 93두중 밴드가 하나인 개체는(428bp)는 29두(31.2%), 밴드가 두 개인 개체는(256bp, 172bp)는 19두(20.4%), 밴드가 3개인(428bp, 256bp, 172bp) 개체는 전체의 절반 정도인 45두(48.4%)이었다. 2. AccⅡ를 이용하여 PCR-RFLP를 실시한 결과 랜드레이스와 대요크셔 종에서는 2개의 밴드(222bp, 183)가 확인 되었으며, 듀록은 한 개의 밴드(405bp)만이 관찰되었다. 그러나 제주흑돈에서는 3개의 서로 다른 형태의 밴드가 확인되었으며, 분포빈도는 BspHⅠ을 이용한 PCR- RFLP 결과와 동일하였다. 3. 이상의 결과를 MC1R 유전자형으로 분류하면 백색품종인 랜드레이스와 대요크셔 품종은 MC1R*3 allele이었으며, 적색의 듀록은 MC1R*4 allele로서 도입종의 모색유전자는 한가지 형태로 고정되어 있었다. 그러나 제주 재래흑돈에 있어서 MC1R*2 allele과 MC1R*3 allele 모두 다 나타났으며, 대부분은 이들의 헤테로 형태였다. 따라서 제주 재래흑돈의 모색고정을 위하여 종모돈 선정시 MC1R 유전자를 이용하면, 짧은 기간 내에 모색이 고정될 것으로 추정되며, 명확한 유전양상 구명을 위해서는 agouti 유전자의 추가 연구가 필요할 것으로 사료된다.