Fatty acid binging proteins(FABP) are distinct but related gene productes which are found in many mamalian cell types. FABP bind long chain fatty acids in vitro. However, their functions and mechanisms of action, in vivo, remain unknown . Also not known is whether all FABP function similaryly in their respective cell types. or whether different FABP have unique functions. The puropose of the present study was to assess whether different members of the FABP family exhibit different structural and function properties. A comparison was made between heart(H-FABP) and liver (L-FABP). The results show that the binding sites of both FABP are hydrophobic in nature, although the L-FABP site is more nonpolar than the H-FABP site. Additionally, the bound ligand experiences less motional constraint within the H-FABP binding site than within the L-FABP binding site. In accordance with these differences in structural properties, it was found that anthroyloxy-fatty acid transfer from H-FABP to membranes is markedly faster than from L-FABP. moreover, the mechanism of fatty acid transfer to phospholipid membranes appears to occur via transient collisional interactions between H-FABP and membranes. In contrast , transfer of fatty acid from L-FABP occurs via an aqueous diffusion mechanism.
There is limited information of the genetic effect for fatty acid composition in chicken meat. This study assessed the association of FABP3 and FABP4 genes affecting fatty acid composition in broilers. Two single nucleotide polymorphisms (SNPs) were detected in FABP3 gene and five SNPs were identified in FABP4 gene. The SNPs located in intron 1 and exon 1 of FABP3 and FABP4, respectively, were used for genotyping using PCR-RFLP method. The SNPg.285C >T in FABP4 showed suggestive association with high arachidonic acid (C20 : 4) in CT genotypes (P = 0.068). However, the SNP g.508C > T in FABP3 showed no significant associations with fatty acid composition. These results are the first report to investigate the SNPs in FABP3 and FABP4 genes and their associations with fatty acid composition, although we only found the possible association of FABP4 SNP with fatty acid composition. These results should provide valuable information for further investigation of the genes affecting fatty acid composition in chicken.
지방산 결합 단백질(FABP)은 LCFA 수송, 지질 합성, 저장을 용이하게 하고, 염증을 포함한 다양한 경로에 영향을 미치는 신호 분자로 작용한다. 특히 FABP4는 혈관 및 심장관련 질환과 관련이 있으며, 대식세포 매개 염증 반응에서 역할을 한다. 이전의 연구들은 FABP4를 지방 생성을 위한 대표적인 바이오 마커일 뿐만 아니라, 면역 반응과도 상관관계가 있는 것으로 확인하였다. 본 연구는 톨-유사 수용체 3(TLR3) 활성화에 의한 닭 FABP4(chFABP4) 유전자의조절을 조사하고 chFABP4 전사 조절에 관여하는 신호 경로를 결정하는 것을 목표로 한다. 우리는 TLR3 자극 DF-1 세포에서 chFABP4의 전사 조절을 분석하였다. 결과는 TLR3 리간드인 폴리이노신-폴리시티딜산(PIC)으로 자극 시 chFABP4가 상향 조절되었음을 보여주었다. 특히 chFABP4 전사는 NF-κB 신호 경로에서 독립적으로 조절되었다. p38 억제에서 상향 조절되어 p38 신호 경로가 TLR3 활성화 DF-1 세포 내에서 chFABP4 전사를 억제할 수 있음을 보여주었다. 이와는 대조적으로, JNK 신호 경로 억제에서는 chFABP4 발현이 하향 조절되었으며, 이는 대식세포의 연구 결과와 일치하며, TLR3 활성화에 반응하여 DF-1 세포에서 chFABP4 전사를 위한 JNK 신호 전달 경로의 긍정적인 조절을 시사한다. MEK 경로 억제는 NF-κB 신호 전달과 유사한 조절을 초래하였다. 이러한 결과는 각 MAPK가 TLR3 활성화에 반응하여 DF-1 세포에서 chFABP4의 전사 조절에 차별적으로 기여함을 시사한다.
This study was to detect the expression of heart fatty acid-binding protein (H-FABP) and adipocyte fatty acid-binding protein (A-FABP) gene mRNA in different tissues of Rugao and Luyuan chickens at 56 d and 120 d by real-time fluorescence quantitative reverse transcription polymerase-chain reaction (FQ-RT-PCR). The primers were designed according to the sequences of HFABP, A-FABP and GAPDH genes in Gallus gallus, which were used as target genes and internal reference gene, respectively. The levels of H-FABP and A-FABP gene expression were detected by SYBR Green I FQ-RT-PCR. The relative H-FABP and A-FABP gene mRNA expression level was calculated with 2-$^{{\Delta}Ct}$. Melting curve analysis showed a single peak of three genes. Intramuscular fat (IMF) content in breast muscle and leg muscle of the two chicken breeds at 120 d was higher than at 56 d. IMF content in breast muscle and leg muscle at 56 d and 120 d in Luyuan was significantly higher than in Rugao, however, abdominal fat of Luyuan was significantly lower than that of Rugao. The relative H-FABP gene mRNA expression level in cardiac muscle was the highest in both chicken breeds. The relative H-FABP and A-FABP gene expression of different tissues in Luyuan was higher than in Rugao. H-FABP gene mRNA expression had a negative effect on IMF of leg and breast muscles, and was significantly negatively correlated with IMF content. The relative A-FABP gene mRNA level in abdominal fat was higher than in liver. The A-FABP gene mRNA was not expressed in leg, breast and cardiac muscles. A-FABP gene mRNA expression level was significantly positively correlated with abdominal fat and had a significant effect on abdominal fat but not IMF content.
간성 지방생성과 지방 대사에 있어서 FABP5의 역할에 대하여 알아보고자 하였다. 마우스에 바이러스 입자를 이용하여 간에서 FABP5를 과발현 그리고 침묵시켜 이용하였다. 마우스에 서양식 또는 일반 사료를 1주일간 섭취시키고 24시간 동안 금식한 후 희생하였다. 간을 기계적으로 분쇄하여 웨스턴 블?으로 단백질 농도를 측정하였고, mRANA 분석에는 RT-PCR을 이용하였다. 간과 혈청의 지질 분석에는 박층 크로마토그래피를 이용하였다. 서양식이나 고농도 포화 지방식을 급식한 쥐에서 FABP5 발현이 높은 증가를 보였으나, FABP5 mRNA 발현은 급식에 비해 단식조건에서 급격히 감소하였다. FABP5를 과발현 시킨 상태에서 급식과 금식을 실시한 결과 간성 TG가 중요하게 증가하였다. 간성 유리 콜레스테롤은 급식상태에서 현저히 감소하였다. FABP5 발현 억제 시 간성 TG가 상당히 감소하였다. 결과들에서 보듯이, FABP5가 간지질 생성에 중요한 역할을 하며, 정상 상태 및 탄수화물 유도 조건에서 간성 TG 저장형성에 관여할 것으로 사료된다. FABP5는 비알코올성 지방간 질환, 대사증후군, 비만 치료에 활용될 수 있을 것으로 사료된다. 더 나아가, FABP5 발현에 어떤 전사인자가 관여하는지에 대한 연구가 필요하다.
The bovine fatty acid binding protein 4 and 5 (FABP4 and 5) is a major positional and physiological candidate gene for the bovine marbling and carcass weight. The aim of this study was to evaluate the association between economic traits of Korean cattle (Hanwoo) and genetic variation in fatty acid binding protein 4 and 5 (FABP4 and 5) genes within carcass/meat quality traits and the before/after of fatting in breed Hanwoo. Here, we characterized the nucleotide polymorphism of FABP4 and 5 in 86 cattle. We were detected the variability of three types (GG, AG, and AA) by PCR, and economic traits were analyzed by the mixed regression model implemented in the ASReml program. As the result of statistical and supersonic analysis, FABP4 gene was highly showed significant effect (p<0.006) on marbling score (MS), in contrast FABP5 gene was lowed (p<0.084) on MS before fatting. But, FABP4 gene was highly showed significant effect (p<0.0054) on MS, in contrast FABP5 gene lowest (p<0.0899) on MS in the after of fatting. Compare to supersonic result before fatting in FABP4 gene, it was detected type GG: (p<7.18), AG: (p<8.50), and AA: (p<10.50) (n=50), showed type GG: (p<4.88), AG: (p<2.33), and AA: (p<0.00) after weed out (n=20). Futhermore, it was detected type GG: (p<9.30), AG: (p<7.95), and AA: (p<7.40) (n=50) before fatting in the FABP5 gene. It was shown type GG: (p<2.67), AG: (p<3.50), and AA: (p<5.00) after weed out (n=50). Our results indicate that FABP4 and 5 gene transcription is regulated by the environment of feeding and management, and suggest that feeding and management could be potential key in determining FABP4 and 5 genes transcription for carcass/meat quality traits in breed Hanwoo.
The aim of this study was to determine whether single nucleotide polymorphisms (SNP) in the beef cattle adipocyte fatty-acid binding protein 3 and 4 (FABP3 and FABP4) genes are associated with carcass weight (CW) and back fat thickness (BF) of beef cattle. By direct DNA sequencing in 24 unrelated Korean native cattle, we identified 20 SNPs in FABP3 and FABP4. Among them, 10 polymorphic sites were selected for genotyping in our beef cattle. We performed SNP, haplotype and linkage disequilibrium studies on 419 Korean native cattle with the 10 SNPs in the FABP genes. Statistical analysis revealed that 220A>G (I74V) and 348+303T>C polymorphisms in FABP4 showed putative associations with BF traits (P=0.02 and 0.01, respectively). Our findings suggest that the polymorphisms in FABP4 may play a role in determining one of the important genetic factors that influence BF in beef cattle.
Purpose: Gastric cancer (GC) is the second most lethal cancer globally and is associated with poor prognosis. Fatty acid-binding proteins (FABPs) can regulate biological properties of carcinoma cells. FABP5 is overexpressed in many types of cancers; however, the role and mechanisms of action of FABP5 in GC remain unclear. In this study, we aimed to evaluate the clinical and biological functions of FABP5 in GC. Materials and Methods: We assessed FABP5 expression using immunohistochemical analysis in 79 patients with GC and evaluated its biological functions following in vitro and in vivo ectopic expression. FABP5 targets relevant to GC progression were determined using RNA sequencing (RNA-seq). Results: Elevated FABP5 expression was closely associated with poor outcomes, and ectopic expression of FABP5 promoted proliferation, invasion, migration, and carcinogenicity of GC cells, thus suggesting its potential tumor-promoting role in GC. Additionally, RNA-seq analysis indicated that FABP5 activates immune-related pathways, including cytokine-cytokine receptor interaction pathways, interleukin-17 signaling, and tumor necrosis factor signaling, suggesting an important rationale for the possible development of therapies that combine FABP5-targeted drugs with immunotherapeutics. Conclusions: These findings highlight the biological mechanisms and clinical implications of FABP5 in GC and suggest its potential as an adverse prognostic factor and/or therapeutic target.
본 연구는 돼지 4번 염색체에서 FAT1 좌위의 후보유전자인 Adipocyte Fatty-Acid 결합단백질 (FABP4) 유전자에서 8개의 Single Nucleotide Polymorphisms (SNPs)를 발견하였다. Duroc, Landrace, Berkshire, Yorkshire를 기초 축으로 이용한 800두에 대해 FABP4 유전자의 단일염기 분석과 PCR-RFLP를 이용하여 그 다형성을 조사하고 돼지의 일당증체량, 등지방두께, 사료요구율, 정육율과 그 유전자형간의 연관성을 규명하고자 실시하였다. FABP4 유전자에 대해 각 단일염기에 관한 PCR-RFLP를 이용하여 $400{\sim}800\;bp$ 산물을 증폭한 후 각각의 제한효소로 사용하여, 얻어진 FABP4 유전자의 빈도는 품종별로 다르게 나타났다. 통계적 분석을 통하여 각 유전자형에 대한 경제 형 질과 연관성을 분석한 결과 일당증체량, 등지방두께, 정육율, 사료요구량은 다른 유전자형을 가진 개체들이 유의적으로 우수한 능력을 보였다 (P<0.05). FABP4유전자는 일당증체량, 정육율, 등지방두께에 높은 연관성이 있음을 관찰하였다. 따라서 돼지의 성장과 정육율에 관련된 선발력을 높이기 위해서 FABP4 유전자의 다형성 분석에서 검증된 PCR marker를 우량돼지육종 계획에 있어 분자생물학적 선발 marker로 사용할 수 있을 것으로 사료된다.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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