• 제목/요약/키워드: Extraction reagent

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식품으로부터 식중독 세균 검출을 위한 Real-time PCR에 적합한 DNA 추출 방법 비교 (Comparison of DNA isolation methods for detection of foodborne pathogens by real-time PCR from foods)

  • 구은정;김동호;오세욱
    • 한국식품과학회지
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    • 제48권4호
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    • pp.335-340
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    • 2016
  • 본 연구에서는 다양한 식품으로부터 식중독 세균의 DNA를 추출하는 효율을 비교 하였다. 사용된 DNA 추출 방법은 TaKaRa Kit를 이용하는 방법, PrepMan reagent를 이용하는 방법, boiling method, PEG를 이용한 alkaline method가 사용되었다. 비용절감이나 시간절약 면에서 boiling method나 PrepMan method도 고려할 수 있지만, column kit를 이용하는 TaKaRa kit가 효율적이라고 판단되었다. 또한 정성 시험법에서 적은 양의 균을 검출하기 위해 증균배양을 거치게 되는데 이때 사용되는 증균배지의 성분이 DNA 추출 후에도 잔류하여 saline과 비교하였을 때 DNA 추출효율이 낮은 결과를 나타내었다. 따라서 증균배지의 성분을 제거한 뒤 DNA를 추출하는 것이 PCR의 효율을 높일 수 있을 것으로 예상된다. 정량 시험법에서는 증균과정을 거치지 않아 균을 검출할 때 DNA의 추출 효율이 중요하기 때문에 DNA 추출 효율을 높이기 위한 가장 좋은 버퍼를 선정하고자 하였다. 그 결과 E. coli O157:H7에서는 saline이, S. aureus에서는 증류수를 버퍼로 사용했을 때 DNA 추출 효율이 가장 높은 것으로 나타났다.

Novel Approach of a Phage-Based Magnetoelastic Biosensor for the Detection of Salmonella enterica serovar Typhimurium in Soil

  • Park, Mi-Kyung;Chin, Bryan A.
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제26권12호
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    • pp.2051-2059
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    • 2016
  • To date, there has been no employment of a magnetoelastic (ME) biosensor method to detect Salmonella enterica serovar Typhimurium in soil. The ME biosensor method needs to be investigated and modified for its successful performance. The filtration method, cation-exchange resin method, and combinations of both methods were employed for the extraction of S. Typhimurium from soil. The number of S. Typhimurium and the resonant frequency shift of the ME sensor were then compared using a brilliant green sulfa agar plate and an HP 8751A network analyzer. A blocking study was performed using bovine serum albumin (BSA), polyethylene glycol (PEG), and casein powder suspension. Finally, the modified ME biosensor method was performed to detect S. Typhimurium in soil. The number of S. Typhimurium was significantly decreased from 7.10 log CFU/soil to 4.45-4.72 log CFU/soil after introduction of the cation-exchange resin method. The greatest resonant frequency shift of the measurement sensor was found when employing centrifugation and filtration procedures. The resonant frequency shift of the PEG-blocked measurement sensor was $3,219{\pm}755Hz$, which was significantly greater than those of the BSA- and casein-blocked ME sensor. The optimum concentration of PEG was determined to be 1.0 mg/ml after considering the resonant shift and economic issue. Finally, the modified ME biosensor method was able to detect S. Typhimurium in soil in a dose-response manner. Although these modifications of the ME biosensor method sacrificed some advantages, such as cost, time effectiveness, and operator friendliness, this study demonstrated a novel approach of the ME biosensor method to detect S. Typhimurium in soil.

황금(Scutellaria Radix)의 에타놀 추출물이 백서 치조골 형성에 미치는 영향 (Effects of Ethanolic Extracts of Scutellaria Radix on the alveolar bone formation in the extract socket of rat)

  • 박준봉;허익;권영혁;배기환;정종평
    • Journal of Periodontal and Implant Science
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    • 제27권3호
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    • pp.443-457
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    • 1997
  • The purpose of this study was to evaluate the effects of ethanolic extracts of Scutellaria Radix on the alveolar bone formation in the extract socket of rat. Thirty-six Sprague-dawley rats were used in this study. Mean body weight of rat was $130{\pm}5g$. Experimental animal were administered 0.4% ,${\beta}-aminopropionitril$(Sigma, USA) with the solid commercial food for 5 days. All the maxillary 1st molar of the rats were extracted by using of the tissue forcep under the general anesthesia with Pentobarbital sodium(Tokyo Chemical Co, Japan) injection into intraperitoneal space. All the extracted rats were divided into two group, experimental group which were feeded the solid food mixed ethanolic extracts of Scutellaria Radix, and control group which were feeded same food without reagent. At 1, 3, 5, 7, 9 and 14th days after tooth extraction, rats in both groups were serially sacrificed respectively. All the specimen were treated as usual method and prepared Hematoxylin-eosin stain for the light microscopic observation. The results were as follows : 1. Bone formation of extracted socket starts from the area on remained periodontal ligament than other area. 2. In the case of administration of the extracted Scutellaria Radix showed rapid healing process of connective tissue than non-administrated group. 3. In the case of administration of the extracted Scutellaria Radixshowed rapid osteogenesis than non-administrated With above results, it was concluded that ethanolic extracts of Scutellaria Radix may play a favorable role on the healing process of exatraction socket after extraction in rats. It was suggested that further study to evaluate the different concentration and administration method of ethanolic extracts of the Scutellaria Radix into same experimental model.

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참조기의 천연색소와 인위적으로 착색된 황색색소류 판별법에 관한 연구 (Studies on the Rapid Discrimination of Yellow Pigments Colored on Yellow Croakers and Natural Yellow Pigment of Croakers)

  • 김희연;홍진환;김동술;한상배;이은주;이정성;강길진;정형욱;송경희;박혜경;박종석;권용관;진명식;박희옥;오세화;신일식;이창국;박희열;하상철;조재선
    • 한국식품과학회지
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    • 제34권6호
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    • pp.977-983
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    • 2002
  • 식용색소 및 공업용 염료의 인공적 착색여부를 조사한 결과, 심황색소, 식용희석황색소, 마리골드색소, 식용황색 4호, 안나토색소, 카로틴색소는 유사한 색으로 착색되었으며 다른 색소는 착색되지 않았다. 물에 의한 추출시험에서는 참조기 색소와 식용색소황색 제4호는 물에서 용출되지 않았다. 착색 후 색소의 물성실험을 한 결과 물 젖은 가제수건이나 휴지로 색소부위 표피를 문지를 경우 참조기 색소는 표면에 전혀 묻어 나오지 않으나 인공적으로 착색된 색소의 경우에는 물에 의해 색이 뚜렷하게 묻어 나왔으며 참조기의 착색 부위 표피를 아세톤으로 추출할 경우 참조기 색소는 아세톤에 옅은 황색용액으로 추출되었다. 또한, 참조기의 색소처럼 물에 용출되지 않도록 염착이 가능한 공업적 합성염료인 반응성 염료와 분산염료의 착색거동에 대해 실험한 결과, 반응성 염료는 조기에 착색되지만 물 젖은 휴지로 착색부위를 문지를 경우 색소가 용출되었고, 아세톤에는 추출되지 않아 참조기 색소와는 쉽게 판별되었으며 분산염료는 염료가 고르게 착색되지 않고 염료가 입자를 형성하며, 물 적신 휴지로 색소부위를 문지를 경우 색소가 용출됨을 알 수 있었다. 카로틴색소(참조기 색소와 구조가 유사한 색소)와 azo염료의 산화 환원 반응에 따른 소색 반응에서는 산화반응에서 azo염료는 sodium percarbonate와 peracetic acid에서는 소색이 되지 않았으나, fenton시약에서는 1시간 후 소색되었고, sodium hypochlorite에서는 바로 소색되었다. 이에 비하여 카로틴색소는 sodium percarbonate 및 fenton시약에서는 소색되지 않았으나, sodium hypochlorite에서는 2시간 후 소색되었고, peracetic acid에서는 바로 소색되었다. 또한, sodium hydrosulfite, sodium carbonate를 사용한 환원반응시험에서는 azo염료는 소색되었으나, 카로틴색소는 소색되지 않았다. 이러한 결과를 통해 두 색소의 특징적 group을 제거할 때 나타나는 소색 결과를 토대로 진품참조기와 모조참조기의 판별에 이용할 수 있을 것으로 사료된다.

SCR 폐촉매 침출액으로부터 습식제련법에 의한 바나듐, 텅스텐의 회수 (Recovery of the Vanadium and Tungsten from Spent SCR Catalyst Leach Solutions by Hydrometallurgical Methods)

  • 최인혁;문경혜;전종혁;이진영;라제쉬 쿠마 죠티
    • 자원리싸이클링
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    • 제29권2호
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    • pp.62-68
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    • 2020
  • 2000년대에 접어들면서 선택적 촉매 환원(SCR) 촉매에 대한 광범위한 수요가 점차 증가하고 있다. SCR 촉매는 환경보호를 위해 질소산화물(NOx)의 배출 방지에 사용 된다. 일반적으로 SCR 촉매의 주성분은 TiO2(70~80 %), WO3(7~10 %), V2O5(~1 %) 등으로 구성되어있다. SCR 폐촉매는 대개 매립되어 폐기 되는데, 분해도가 극히 낮아 매립지에 영구적으로 남아있게 된다는 문제점을 가지고 있다. 따라서 환경을 보호하고 페촉매에 함유되어 있는 유가금속의 회수를 위하여 새로운 첨단기술의 개발이 필요하다. 이러한 SCR 폐촉매의 처리를 위해 침출 및 액-액 추출과 같은 습식제련법이 설계되고 개발되었다. 첫 번째 단계에서 SCR 폐촉매로부터 바나듐과 텅스텐을 선택적으로 침출한 후, 액-액 추출 공정에 의해 처리되었다. 바나듐과 텅스텐의 선택적 추출을 위해 D2EHPA, PC 88A, TBP, Cyanex 272, Aliquat 336과 같은 다양한 상용 용매추출제를 이용한 실험을 수행하였다. 바나듐과 텅스텐의 추출 및 분리를 위해 세정(scrubbing) 및 탈거(stripping) 연구가 수행되고 최적화 되었다. 3상의 생성을 억제하기 위해 iso-decanol 시약을 사용하여 최적화 하였다.

염산용액에서 Cyanex 572에 의한 희토류 원소(La, Ce, Pr, Nd, Sm)의 용매추출 (Solvent Extraction of Rare Earth Elements (La, Ce, Pr, Nd, Sm) from Hydrochloric Acid Solutions using Cyanex 572)

  • 조연철;강명식;안재우;이진영
    • 자원리싸이클링
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    • 제25권6호
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    • pp.50-57
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    • 2016
  • 염산용액에서 Cyanex 572에 의한 La, Ce, Pr, Nd, Sm의 추출 및 탈거 거동을 조사하여 PC88A를 추출제로 사용한 실험 결과와 비교하였다. 평형 pH, 추출제 농도, 탈거제 농도 변화에 대한 실험을 통하여 추출율, 분배계수, 탈거율 및 분리계수 값을 조사하였다. 실험 결과, Cyanex 572를 사용하였을 경우 PC88A 보다 희토류 원소들의 추출 시에 $pH_{50}$ 값이 더 높았고, 추출제 농도가 증가할수록 분배계수 값이 증가하였다. 희토류 원소가 추출된 유기상에서 염산용액으로 탈거 시 Cyanex 572의 경우는 탈거율이 85 ~ 95%로, PC88A의 탈거율 80 ~ 87%보다 높았고, 2성분계 혼합용액에서 Ce/La, Ce/Pr, Pr/Nd, Nd/Sm의 분리계수 값이 Cyanex 572를 사용한 경우가 PC88A에 비해 1.0 ~ 5.0 정도 커서 분리성이 개선되었다.

Rapid Detection of Ammonia-oxidizing Bacteria in Activated Sludge Based on 16S-rRNA Gene by Using PCR and Fluorometry

  • Hikuma, Motohiko;Nakajima, Masanori;Hirai, Toshiaki;Matsuoka, Hiroshi
    • Biotechnology and Bioprocess Engineering:BBE
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    • 제7권5호
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    • pp.323-326
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    • 2002
  • To detect whole ammonia-oxidizing bacteria in the activated sludge, group-specific primers targeting the 16S-rRNA gene of ammonia-oxidizing bacteria were used. The electrophoresis pattern of the PCR products seemed to produce a single band of approximately 1.0 k bp for the bacteria in activated sludge and Nitrosomonas europaea. No band was observed for nitrite-oxidizer Nitrobacter winogradskyi and heterotrophs such as Pseudomonas putida. Then direct measurement of the PCR product was made by fluorometry using the reagent Hoechist 33258, so that the fluorescent intensity was in proportional to the cell number of the sample up to 240. Total time required for the test was about 4 h including DNA extraction. The DNA fragments produced were cloned and their sequences showed high similarity to those of Nitrosomonas spp. This study showed the feasibility to detect ammonia-oxidizing bacteria and to esti-mate their population rapidly for the control of the nitrogen elimination process.

Analysis of Soil Total Nitrogen and Inorganic Nitrogen Content for Evaluating Nitrogen Dynamics

  • Lee, Seul-Bi;Sung, Jwa-Kyung;Lee, Ye-Jin;Lim, Jung-Eun;Song, Yo-Sung;Lee, Deog-Bae;Hong, Suk-Young
    • 한국토양비료학회지
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    • 제50권2호
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    • pp.100-105
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    • 2017
  • Various methods for assessing soil total nitrogen (TN) and inorganic N content have been developed to manage nutrient and to understand N cycle in soil. This paper address the technical procedures in arable soil samples to conduct soil sampling, sample preparation, and measuring total N and inorganic N. Among various methods for measuring soil total nitrogen contents, Kjeldahl distillation and Indophenol blue method have widely used due to reliability and economic advances. Also, two methods can analyze more samples at the same time compared with other nitrogen measuring methods. For evaluating inorganic N content, mainly in forms of nitrate-N ($NO_3{^-}-N$) and ammonium-N ($NH_4{^+}-N$), extraction with a single reagent such as 2M KCl has been employed, followed by Kjeldahl distillation or indophenol blue methods.

국내토양에서 분리한 혐기성 세균 Streptococcus sp. An-21-1 이 생성하는 항생물질 II. 항생물질을 생성하는 혐기성 세균의 발효 및 항생물질의 분리 정제 (Antibiotics produced by anaerobic fermentation of Streptococcus sp. An-21-1 isolated from domestic soil, Fermentation and purification of antibiotics from anaerobe)

  • 박승춘;윤효인;오태광
    • 대한수의학회지
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    • 제33권1호
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    • pp.61-69
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    • 1993
  • In order to search for new antibiotics from anaerobic bacteria, a large number of samples from domestic soil were collected and processed by apropriate methods. A potential strain, Streptococcus sp. An-21-1, was found to produce antimicrobial compounds. The Results were as follows; 1. During fermentation, the bacteria grew rapidly up to 20hr, thereafter entered the death phase. The optimal temperature and pH for the bacterial growth were $37^{\circ}C$ and pH 7.0, respectively. 2. Antibiotics were purified from culture broth by solvent extraction, silica gel column chromatography and Sepadex L.H 20 column. 3. Physicochemical properties of Ap-1 and Ap-2 were similar ; Their melting points were between $234-237^{\circ}C$. Color reactions of ninhydrin, 2,7-dichlorofluorescein, 4-dimethylaminobenzaldehyde, Dragendroffs reagent and 20% $H_2SO_4$, were positive. Therefore, we assumed that these antibiotics have amine group, immine group, alkaloid, and lipid components. These were stable to heat. UV spectrophotometry showed two peaks at 210 nm and 260 nm. From above results, we assumed these antibiotics are belong to the peptide antibiotic family.

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Fiber내 유도체화/HS-SPME를 이용한 수용액 시료 중 휘발성 지방산의 분석 (Determination of Volatile Fatty Acids in Aqueous Samples by HS-SPME with In-Fiber Derivatization)

  • 안윤경;이지연;김지형;홍종기
    • 분석과학
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    • 제16권6호
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    • pp.458-465
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    • 2003
  • 수용액 시료 중 휘발성 지방산을 HS (headspace)-SPME (Solid phase microextraction)를 이용하여 간편하고 빠르게 분석하는 방법에 대하여 연구하였다. 1-Pyrenyldiazomethane (PDAM)을 이용한 화이버 내 유도체화를 통하여 휘발성 지방산의 검출감도를 향상시킬 수 있었으며, SPME 추출조건으로 pH, 염 효과 및 초음파 추출에 대하여 조사하였다. 본 연구에서 개발된 방법을 기반으로 실제 폐수 중 휘발성 지방산을 추출하여 기체크로마토그래피/질량분석기-선택이온검색법으로 정량 분석하였다.