• 대한수의학회지
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• 제43권1호
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• pp.103-112
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• 2003

A multiplex PCR assay, which allows simultaneous detection of vancomycin resistant genotypes and Enterococcus species-specific genes, was developed. Vancomycin resistant enterococci (VRE) from chickens and humans could be detected for vanA, vanB, vanC-1, vanC-2, $ddl_{E.faecium}$ and $ddl_{E.faecalis}$ by multiplex PCR. Eight isolates of VRE from humans (n=11) had $ddl_{E.faecium}$ and vanA, and 3 isolates of the VRE had $ddl_{E.faecium}$ and vanB. One isolate of VRE from chickens (n=6) had $ddl_{E.faecium}$ and vanA, and 5 isolates of the VRE had only vanA. E. faecium, E. faecalis, E. gallinarum and E. casseliflavus were also confirmed for the species-specific gene by multiplex PCR. This multiplex PCR could detect E. faecium, E. faecalis, E. gallinarum, E. casseliflavus, vanA, vanB, vanC-1 and vanC-2, simultaneously. The PCR assay established in the present study can be an alternative to time-consuming biochemical tests and antibiotic susceptibility tests of Enterococcus spp.

• 대한임상검사과학회지
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• 제49권4호
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• pp.407-412
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• 2017

본 연구에서는 계대배양과 세균 동정 시험에 소요되는 시간을 단축하고, 혈류감염의 새로운 검사 방법을 모색하여 간단하고 신속 정확한 동정 결과를 도출할 목적으로 질량분석기를 이용하여 다음과 같은 결과를 얻었다. 혈액배양에서 한 가지 세균만 배양된 검체는 총 254개였으며, Vitek 2에서 208주(81.8%)의 세균을 동정되었으며, 45주는 동정되지 않았다. 동정된 세균 중 그람양성 세균이 146개(57.5%), 그람음성 세균이 108개(42.5%)이었다. 전체적으로 233개는 종(species) 수준까지 동정 되었으며, 21개는 속(genus)수준까지 동정 되었다. 동정 오류는 Propionibacterium acnes를 Clostridium bifermentans로 동정 되었다. 균종별로는 enterobacteriaceae, glucose non-fermentative bacilli (GNFB), staphylococci의 정확도는 각각 81/83 (97.6%), 12/15 (80.0%), 72/85 (84.7%)로 나타났다. Vitek 2에 의한 표준법과 Vitek MS에 의한 직접법에 의한 동정의 일치율은 81.8%이었으며, 45주는 동정되지 않았다. 동정되지 않은 세균들의 대부분은 그람양성 세균(n=37)이었고, 그람양성 세균은 streptococci (14), coagulase-negative staphylococci (CNS) (11), enterococci (3), Staphylococcus aureus (2), Micrococcus spp. (2), Bacillus spp. (2) 그리고 Actinomyces odontolyticus, Finegoldia mag na, Peptostreptococcus spp.가 각각 1건씩 이었다. 결과 보고 시간은 기존의 검사 방법보다 24~72시간까지 단축되었다. 산소성 배양과 무산소성 배양 사이의 동정률의 차이는 없었으나 무산소성 배양을 사용하면 용해 과정이 필요 없어 검체 준비 시간을 단축할 수 있었다. 이상의 연구 결과로 혈액배양병에서 직접 동정하는 방법은 정확하고 결과 보고 시간이 신속하여 환자의 치료에 매우 유용할 것이라 생각된다. 향후 추가적인 연구에서는 본 연구에서 정확성이 부족했던 사슬알균(streptococci)과 혈장응고효소 음성 포도알균(CNS)을 동정하기 위한 방법을 더욱 개선할 필요가 있을 것으로 사료된다.

• 한국축산식품학회지
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• 제38권2호
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• pp.391-402
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• 2018

The aim of the present work was to provide information about Enterococcus strains isolated from pre-packaged chicken samples in Ankara (Turkey), focusing on their prevalence, phenotypic and genotypic characteristics, and antibiotic resistance. We report the first study on the occurrence of antibiotic resistant enterococci in pre-packaged chicken samples in Ankara. A total of 97 suspicious enterococcal isolates were identified from 122 chicken samples. All isolates were identified to species level by phenotypic and molecular methods. In the 16S rDNA sequence analysis, Enterococcus faecium (61.85%) and Enterococcus faecalis (38.15%) were found to be the most frequently detected Enterococcus spp. Of the 97 isolates tested for hemolytic activity, 12.37% enterococcal strains were ${\beta}$-hemolytic. ${\beta}$-Hemolysin was most prevalent among E. faecium (58.33%) compared to E. faecalis (41.66%). Disk diffusion method was used for determining of antibiotic resistance. The analysis of the antimicrobial resistance of the 97 Enterococcus isolates revealed that the resistance to kanamycin (98.96%), rifampicin (80.41%) and ampicillin (60.82%) was most frequent. Furthermore, resistance to erythromycin (38.14%) and ciprofloxacin (34.02%) was also observed. The frequencies of resistance to tetracycline (9.27%), penicillin G (8.24%), and chloramphenicol (3.09%), gentamicin (2.06%) and streptomycin (1.03%) were low. None of the isolates was resistant to vancomycin. Multi-drug resistance was found in 97.93% of Enterococcus strains. E. faecium strains showed a more resistant phenotype than E. faecalis strains according to the antibiotic resistance levels. The results of this study indicated that chicken meat is a potential reservoir for the transmission of antibiotic resistance from animals to humans.

• 한국식품위생안전성학회지
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• 제33권6호
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• pp.447-452
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• 2018

유해 미생물에 오염된 농업용수는 배추의 재배기간 동안 지속적인 식중독세균 오염의 주원인이 될 수 있다. 농업용수는 야생동물 및 가축의 분변에 의해 오염되고 있다. 따라서 본 연구는 야생동물의 출입이 농업용수의 미생물학적 안전성에 미치는 영향을 조사하기 위하여 수행하였다. 이를 위하여 산악지대에 위치한 배추 재배농가에 사용되는 농업용수의 상류에서부터 하류까지 시기별 위생지표세균 오염도와 수원 상류의 야생동물의 출입 빈도를 조사하였다. 배추를 재배하는 기간 동안 멧돼지, 고라니 등 총 37회의 야생동물들이 농업용수 수원 근처에서 관찰되었다. 농업용수의 위생지표세균을 조사한 결과, 3종의 위생지표세균 모두 사람의 출입이 없는 상류에서부터 검출되었으며 대장균군, 대장균, 장구균의 오염도는 각각 2.13~4.32 log MPN/100mL, 0.26~2.03 log MPN/100mL, 1.43~3.49 log MPN/100mL 수준이었다. 대장균군과 대장균의 오염수준은 배추 이식기 보다 수온이 낮은 수확기에 낮았으나 장구균은 시기별로 큰 차이가 없었다. 본 연구의 결과로 미루어 볼 때 농업용수의 오염은 야생동물의 출입과 관련이 있을 것으로 판단된다.

• 한국식품위생안전성학회지
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• 제32권2호
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• pp.135-140
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• 2017

본 연구는 서울시내에서 시판중인 식육에서 E. faecalis를 분리하고 이 균들의 항생제 내성 패턴, 항생제 유출 펌프 유전자 및 병독성 유전자의 분포를 분석하였다. 총 277개의 식육시료에서 93균주의 E. faecalis 를 분리하였다. 이 균주들의 항생제 내성비율은 ampicillin에는 35.5%, chloramphenicol에 6.4%, ciprofloxacin에 4.3%, eryhtromycin에 18.3%, quinupristin-dalfopristin에 76.3%, tetracycline에 45.2%의 내성이었으며 levofloxacin, teiconplanin 및 vancomycin에는 모든 균이 감수성이었다. 약물 유출펌프인 MFS 타입의 eme(A)와 ABC 타입의 efr(A)유전자는 모든 균주(100%)에서 확인되었으며 efr(B)는 98.9%, lsa는 91.4%의 균주에서 확인되었다. 병독성 인자인 gel(E)는 68.8%, ace는 90.3%, asa1는 47.3%, efaA는 91.4%, esp는 12.9%의 균주에서 확인되었다. 본 연구는 시판 식육에서 분리한 지표 미생물의 하나인 E. faecalis의 항생제 내성, 약물유출 펌프 및 병독서 유전자의 분포를 분석한 연구로 지속적인 모니터링을 하여야 할 것으로 사료된다.