• 제목/요약/키워드: Effective size

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한우에서 전장의 유전체 정보를 활용한 연관불평형 및 유효집단크기 추정에 관한 연구 (Estimation of Linkage Disequilibrium and Effective Population Size using Whole Genome Single Nucleotide Polymorphisms in Hanwoo)

  • 조충일;이준호;이득환
    • 생명과학회지
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    • 제22권3호
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    • pp.366-372
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    • 2012
  • 본 연구는 한우 유전체 전장에 존재하는 고밀도 단일염기다형을 DNA chip을 이용하여 각각의 유전자형을 구명하고, 동일염색체 내에 존재하는 각 표지인자쌍의 연관불평형을 성 염색체를 제외한 모든 상염색체에서 추정하여 물리적 거리별 연관불평형의 정도를 확인하고 이러한 결과를 이용하여 한우 집단의 유효집단 크기를 추정하기 위하여 실시하였다. 한우개량사업소에서 2005년부터 2008년까지 후대검정에 공시된 후보종모우 및 후대 검정우 288두에 대해 혈액을 채취하고 Bovine SNP 50 DNA Chip을 이용하여 유전자형을 분석하였으며, 총 51,582 표지인자 중 결측률이 10% 이상인 표지인자 1개 및 다형성이 없는 표지인자 10,730개에 대해 사전제거를 실시하고 남은 40,851개의 SNP표지인자를 본 분석에 활용하였다. 연구 결과, 성 염색체를 제외한 상 염색체의 총 SNP표지인자의 길이는 2,541.6 Mb였으며, 염색체별 평균 SNP표지인자간 거리는 0.55에서 0.74로 분포하였으며, EM알고리즘을 이용하여 염색체별 연관불평형을 추정해 보았을 때, 기존의 보고된 연구와 유사하게 표지인자간 거리가 짧을수록 높게 나타나는 지수형태의 그래프를 나타냈으며, SNP표지인자간 거리에 따른 $r^2$를 보면, 0 Mb에서 0.1 Mb일 때 0.136, 0.1-0.2 Mb에서 0.06로 나타났다. Luo (1998)의 연구결과를 한우에 적용시켰을 때, 전체분산의 5%이상 설명하는 양적형질좌위 발굴을 위해서 약 2,000두의 표현형 자료가 필요할 것으로 사료되었다. 또한 한우의 세대별 유효집단 크기에 대해 추정해 본 결과, 현재 한우의 유효집단크기는 84두로 추정되었고, 지금으로부터 약 50세대 이전의 유효집단 크기는 1,150두로 추정되었다. 가축에서 인공수정이 도입(1960년대)된 이 후 개량의 가속화로 인해 한우의 유효집단 크기가 급격히 감소한 것으로 사료되었다.

한우 씨수소의 근교계수와 유효집단크기의 추정 (Estimation of Inbreeding Coefficients and Effective Population Size in Breeding Bulls of Hanwoo (Korean Cattle))

  • 당창권;이중재;김내수
    • Journal of Animal Science and Technology
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    • 제53권4호
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    • pp.297-302
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    • 2011
  • 본 연구는 지금까지 보증 및 후보씨수소로 선발된 씨수소에 대하여 연도별 평균 근교 및 혈연계수를 추정하고 씨수소의 유효집단크기를 추정하여 현재 한우개량 체계의 문제를 도출하여 발전된 대안을 제시하고자 실시하였다. 분석에 이용된 자료는 한우개량사업소로부터 1983년부터 2008년까지 1,128두의 당 후대검정 씨수소자료와 한국종축개량협회로부터 3,760두에 대한 혈통자료를 받아 이용하였다. 보증 및 후보씨수소의 평균 근교계수는 0.04에서 0.97%의 분포로 추정되었으며, 평균 혈연계수는 0.10에서 6.82%의 분포로 추정되었다. 유효집단 크기는 1983년부터 2008년까지 26년간 평균 근교비율을 이용하였을 때 220두로 추정되었다. 근교수준은 최근 2년간 급격히 증가하였고, 평균 혈연계수 역시 점차 증가하는 추세이다. 유효집단크기도 최근 5년의 근교비율로 추정하였을 때 47두로 작게 추정되었다. 보증씨수소 선발시 후대검정우의 도체성적에 의한 유전능력평가 자료의 활용뿐만 아니라, 근교 및 혈연계수를 고려하고 한우의 유전적 다양성의 보존과 근교를 피하기 위하여 현행의 보증씨수소 두수를 증가시켜 유효집단크기를 높여야 될 필요성이 있다고 사료된다.

A novel meso-mechanical model for concrete fracture

  • Ince, R.
    • Structural Engineering and Mechanics
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    • 제18권1호
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    • pp.91-112
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    • 2004
  • Concrete is a composite material and at meso-level, may be assumed to be composed of three phases: aggregate, mortar-matrix and aggregate-matrix interface. It is postulated herein that although non-linear material parameters are generally used to model this composite structure by finite element method, linear elastic fracture mechanics principles can be used for modelling at the meso level, if the properties of all three phases are known. For this reason, a novel meso-mechanical approach for concrete fracture which uses the composite material model with distributed-phase for elastic properties of phases and considers the size effect according to linear elastic fracture mechanics for strength properties of phases is presented in this paper. Consequently, the developed model needs two parameters such as compressive strength and maximum grain size of concrete. The model is applied to three most popular fracture mechanics approaches for concrete namely the two-parameter model, the effective crack model and the size effect model. It is concluded that the developed model well agrees with considered approaches.

각종 첨가제가 다공성 Aluminum Titanate Ceramics의 미세구조 및 기계적 특성에 미치는 영향 (Effects of Additives on the Microstructure and Mechanical Properties in Porous Aluminum Titanate Ceramics)

  • 김병훈;나용한
    • 한국세라믹학회지
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    • 제31권2호
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    • pp.137-146
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    • 1994
  • This experiments were focused on a modification of mechamical properties and structure in porous aluminum titanate ceramics by new additives which have been not researched yet. These were consisted of four kinds of additives i.e. Bi2O3, FeO, ZnO and NiO by addition amount of 1 wt% and 5 wt% respectively. The addition of Bi2O3 retarded a degree of syntehsis of aluminum titanate and accelerated in FeO, ZnO, NiO additives. Also, the most effective accelerator in synthesis of alunium titanate was FeO. A additives for the most effective of modification of microstructure, sharp distribtion of pore size and mechanical proterties was on ZnO addition and showed the lowest average pore size and narrowed pore size distribution. In order to improve of microstructure and pore size distribution in porous aluminum titanate ceramics was desired the addition amount of 1 wt% compare to 5 wt%.

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유전자 집단의 크기 조절을 통한 Genetic Algorithm의 조기 포화 방지 (Preventing Premature Convergence in Genetic Algorithms with Adaptive Population Size)

  • 박래정;박철훈
    • 전자공학회논문지B
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    • 제32B권12호
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    • pp.1680-1686
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    • 1995
  • GAs, effective stochastic search algorithms based on the model of natural evolution and genetics, have been successfully applied to various optimization problems. When population size is not large, GAs often suffer from the phenomenon of premature convergence in which all chromosomes in the population lose the diversity of genes before they find the optimal solution. In this paper, we propose that a new heuristic that maintains the diversity of genes by adding some chromosomes with random mutation and selective mutation into population during evolution. And population size changes dynamically with supplement of new chromosomes. Experimental results for several test functions show that when population size is rather small and the length of chromosome is not long, this method is effective.

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Effective Partitioning of Static Global Buses for Small Processor Arrays

  • Matsumae, Susumu
    • Journal of Information Processing Systems
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    • 제7권1호
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    • pp.85-92
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    • 2011
  • This paper shows an effective partitioning of static global row/column buses for tightly coupled 2D mesh-connected small processor arrays ("mesh", for short). With additional O(n/m (n/m + log m)) time slowdown, it enables the mesh of size $m{\times}m$ with static row/column buses to simulate the mesh of the larger size $n{\times}n$ with reconfigurable row/column buses ($m{\leq}n$). This means that if a problem can be solved in O(T) time by the mesh of size $n{\times}n$ with reconfigurable buses, then the same problem can be solved in O(Tn/m (n/m + log m)) time on the mesh of a smaller size $m{\times}m$ without a reconfigurable function. This time-cost is optimal when the relation $n{\geq}m$ log m holds (e.g., m = $n^{1-\varepsilon}$ for $\varepsilon$ > 0).

이성분 나노유체를 이용한 암모니아/물 기포 흡수기 설계 (Design of an Ammonia/water Bubble Absorber with Binary Nanofluids)

  • 김진경;김성수;강용태
    • 설비공학논문집
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    • 제18권7호
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    • pp.556-562
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    • 2006
  • The objectives of this paper are to analyze simultaneous heat and mass transfer performance for a plate type bubble absorber with binary nanofluids numerically and to investigate the effects of binary nanofluids and surfactants on the size of the bubble absorber. The effective absorption ratio represents the effect of binary nanofluids and surfactants on the absorption performance. The kinds and concentrations of nano-particles and surfactants are considered as the key parameters. The results show that the addition of surfactants can reduce the size of absorber up to 74.4%, the application of binary nanofluids does the size up to 63.6%. Combination of binary nanofluids and surfactants can reduce the size of absorber up to 77.4%.

Effect of some welding parameters on nugget size in electrical resistance spot welding

  • Savas, Omer
    • Steel and Composite Structures
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    • 제18권2호
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    • pp.345-355
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    • 2015
  • In this study, the effects of weld parameters on nugget size and tensile-shear strength of welding joint in electrical resistance spot welding of galvanized DP 600 steel sheets having 1.2 mm were investigated. Taguchi design method has been employed to examine the effects of five parameters of welding current, electrode pressure, welding time, clamping time and holding time by using the $L_{27}(5^3)$ orthogonal array. Results showed that the most effective parameters on tensile shear strength and the nugget size ratio (hn/dn) were found as welding current and welding time, whereas electrode pressure, clamping time and holding time were less effective factors. Max. 545 MPa strength was obtained through proposed optimum conditions by Taguchi technique.

X-선관 초점 크기와 확대도에 따른 디지털 일반촬영 시스템의 유효검출양자효율 평가 (Effective Detective Quantum Efficiency (eDQE) Evaluation for the Influence of Focal Spot Size and Magnification on the Digital Radiography System)

  • 김예슬;박혜숙;박수진;김희중
    • 한국의학물리학회지:의학물리
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    • 제23권1호
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    • pp.26-32
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    • 2012
  • 확대촬영은 일반촬영뿐 아니라 미세골촬영, 유방촬영 및 다른 진단 영역에서 널리 사용되고 있다. 유한한 X선 초점의 크기로 인해 확대촬영은 분해능, 노이즈, 대조도 등 영상 시스템 전체에 영향을 미친다. 본 연구의 목적은 유효검출양자효율(effective detective quantum efficiency, eDQE)을 이용하여 영상시스템에 있어서 확대도와 초점크기의 영향을 알아보고자 함이다. 전체적인 영상 시스템 특성을 반영하는 eDQE는 초점에 의한 흐림 현상, 확대, 산란 그리고 격자 반응 등의 영향을 고려한다. 본 실험에서는 Food and Drug Administration (FDA)에서 고안된 흉부 팬텀을 사용하여 실제 가슴 촬영조건에서 측정된 유효변조전달함수(effective modulation transfer function, eMTF), 유효잡음력스펙트럼(effective noise power spectrum, eNPS), 산란율(scatter fraction, SF) 및 투과율(transmission fraction, TF)을 통해 eDQE 값을 도출하였다. 연구 결과를 통해 살펴보면 소초점을 사용했을 경우, eMTF의 값이 10%일 때의 공간주파수는 확대도가 1.2, 1.4, 1.6, 1.8, 2.0일때 각각 2.76, 2.21, 1.78, 1.49 그리고 1.26 lp/mm이었다. 대초점을 사용했을 경우, MTF의 값이 10%일 때의 공간주파수는 확대도가 1.2, 1.4, 1.6, 1.8, 2.0일 때 각각 2.21, 1.66, 1.25, 0.93 그리고 0.73 lp/mm이었다. 확대도가 증가할수록 eMTF 값이 떨어지고, 소초점을 사용했을 때가 대초점을 사용했을 때보다 eMTF가 전체적으로 높다는 것을 확인할 수 있었다. 초점의 크기에 따른 zero frequency에서의 eDQE 값의 변화는 크게 보이지 않았다. 그러나 대초점을 사용했을 경우, 소초점을 사용했을 때보다 저 주파수에서 고 주파수로 갈수록 eDQE가 급격하게 감소하는 것을 확인할 수 있었다. 일반적으로 확대촬영은 작은 병변을 확대시키고 낮은 유효잡음과 air-gap에 의한 산란선의 감소로 인해 대조도를 증가시킨다. 이로 인해 크기가 작은 병변을 고대조도로 확대시킴으로써 진단율을 높일 수 있다. 그러나 초점 크기로 인한 흐림 현상이 확대도에 따라 공간 분해능에 더 큰 영향을 미친다. 이러한 결과를 바탕으로, 디지털 일반촬영 시스템에서의 확대촬영을 시행하기 위한 적절한 초점크기와 확대도가 확립되어야 한다.

도농복합형 중소도시의 중소기업육성정책 개선방안;경기도 화성시 중소기업인의 인식을 중심으로 (Policy Suggestions to the Urban-rural Form City Governments' Policy for Small and Medium-size Firms;Based on the Entrepreneurs' Perceptions in Hwaseong City, Kyonggi-do Province)

  • 윤의영
    • 농촌지도와개발
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    • 제12권2호
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    • pp.163-172
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    • 2005
  • Since the financial turmoil in 1997, both the national and local governments have initiated a variety of policy measures to support small and medium-size firms to strengthen the national and regional economies. It is no doubt that such policies contributed to establish better business environment for them. However, many analytical reports and academic studies in recent years diagnose that the economy conditions for the small and medium-size firms are in crisis because many policy measures are made based on the supply-side approach rather than demand-side consideration. In order for the governments' efforts to be more realistic and effective, it is necessary to see what the policy target groups(that is. the small and medium-size entrepreneurs) want. This study surveyed entrepreneurs in Hwaseung city, Kyonggi-do, which has more than three-thousands of small and medium-size firms. It finds that in spite of locational advantages and a variety of policy supports from the provincial and local governments, they need more financial supports, more effective mass transportation system for commuting workers. less bureaucratic barriers, and so on.

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