Objective: REPS2 plays important roles in inhibiting cell proliferation, migration and in inducing apoptosis of cancer cells, now being identified as a useful biomarker for favorable prognosis in prostate and breast cancers. The purpose of this study was to assess REPS2 expression and to explore its role in esophageal squamous cell carcinoma (ESCC). Methods: Protein expression of REPS2 in ESCCs and adjacent non-cancerous tissues from 120 patients was analyzed by immunohistochemistry and correlated with clinicopathological parameters and patient outcome. Additionally, thirty paired ESCC tissues and four ESCC cell lines and one normal human esophageal epithelial cell line were evaluated for REPS2 mRNA and protein expression levels by quantitative RT-PCR and Western blotting. Results: REPS2 mRNA and protein expression levels were down-regulated in ESCC tissues and cell lines. Low protein levels were significantly associated with primary tumour, TNM stage, lymph node metastasis and recurrence (all, P < 0.05). Survival analysis demonstrated that decreased REPS2 expression was significantly associated with shorter overall survival and disease-free survival (both, P < 0.001), especially in early stage ESCC patients. When REPS2 expression and lymph node metastasis status were combined, patients with low REPS2 expression/lymph node (+) had both poorer overall and disease-free survival than others (both, P < 0.001). Cox multivariate regression analysis further revealed REPS2 to be an independent prognostic factor for ESCC patients. Conclusions: Our findings demonstrate that downregulation of REPS2 may contribute to malignant progression of ESCC and represent a novel prognostic marker and a potential therapeutic target for ESCC patients.
Background: Esophageal squamous cell carcinoma (ESCC) accounts for most esophageal cancer in Asia, and is the sixth common cause of cancer-related deaths worldwide. Previous studies indicated HOXB7 is overexpressed in ESCC tissues, but data on prognostic value are limited. Methods: A total of 76 advanced ESCC cases were investigated. Immunohistochemistry (IHC) was used to detect the expression levels of HOXB7 and Kaplan-Meier curves and Cox regression models to determine prognostic significance. Stratified analysis was also performed according to lymph node (LN) status. Results: Kaplan-Meier curve analysis indicated that HOXB7 positive patients had significantly shorter overall survival (OS) than HOXB7 negative patients. Multivariate analysis using the Cox proportional hazards model indicated only TNM stage and HOXB7 expression to be independent predictors of overall survival of advanced ESCC patients. HOXB7 indicated poor OS in both lymph node negative (LN-) and lymph node positive (LN+) patients. Conclusion: HOXB7 predicts poor prognosis of advanced ESCC patients and can be applied as an independent prognostic predictor.
Esophageal squamous cell carcinoma (ESCC) is the most common histologic subtype of esophageal cancer and is characterized by a poor prognosis. Determining gene changes in ESCCs should improve understanding of putative risk factors and provide potential targets for therapy. We sequenced about 55 million pair-end reads from a pair of adjacent normal and ESCC samples to identify the gene expression level and gene fusion. Sanger sequencing was used to verify the result. About 17 thousand genes were expressed in the tissues, of which approximately 2400 demonstrated significant differences between tumor and adjacent non tumor tissue. GO and KEGG pathway analysis revealed that many of these genes were associated with cellular adherence and movement, simulation responses and immune responses. Notably we identified and validated one fusion gene, HLA-E and HLA-B, located 1 MB apart. We also identified thousands of remarkably expressed transcripts. In conclusion, a novel fusion gene HLA-E and HLA-B was identified in ESCC via whole transcriptome sequencing, which would be a biomarker for ESCC diagnosis and target for therapy, shedding new light for better understanding of ESCC tumorigenesis.
Aim: To study the contribution of genetic variation in RAD51 to risk of esophageal squamous cell carcinoma (ESCC). Methods: Three single nucleotide polymorphisms (SNPs) in RAD51 (rs1801320, rs4144242 and rs4417527) were genotyped in 316 ESCC patients and 316 healthy controls in Anyang area of China using PCR-RFLP (polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism). Demographic variables between cases and controls were statistically compared by T test and Chi-square test. Hardy-Weinberg equilibrium was evaluated by the Chi-square test. Odds ratios (ORs) and 95% confidence intervals (CIs) were calculated to measure any association with ESCC. Haplotype frequencies were estimated by Phase 2.1. Result: The genotype frequencies of rs1801320, rs4144242 and rs4417527 in patients with ESCC demonstrated no significant differences from those in control group (P>0.05). When the haplotypes of these three SNPs were constructed and their relationships with ESCC risk investigated, however, CGG was observed to increase the risk (P=0.020, OR=2.289). Conclusions: There was no association between the three SNPs of RAD51 and ESCC susceptibility in our Chinese population. However, the CGG haplotype might be a risk factor.
Background: Oesophageal squamous cell carcinoma (ESCC) is endemic in the Eastern Anatolian region of Turkey. The present study was performed to identify risk factors for ESCC that specifically reflect the demography and nutritional habits of individuals living in this region. Materials and Methods: The following parameters were compared in 208 ESCC patients and 200 control individuals in the Eastern Anatolian region: age, sex, place of living, socioeconomic level, education level, smoking, alcohol intake, nutritional habits, and food preservation methods. Results: The mean age of ESCC patients was 56.2 years, and 87 (41.8%) were 65 years-old or older. The ratio of women to men in the patient group was 1.39/1. ESCC patients consumed significantly less fruit and yellow or green vegetables and more hot black tea, 'boiled yellow butter', and mouldy cheese than did control individuals. Residence in rural areas, smoking, and cooking food by burning animal manure were also significantly associated with ESCC. Conclusions: The consumption of boiled yellow butter and mouldy cheese, which are specific to the Eastern Anatolian region, and the use of animal manure for food preparation were identified as risk factors in this region. Further studies are required to potentially identify the carcinogenic substances that promote the development of ESCC in this region.
Xiu Wang;Zhenhu Zhang;Yamin Shi;Wenjuan Zhang;Chongyi Su;Dong Wang
Journal of Microbiology and Biotechnology
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제34권5호
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pp.1164-1177
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2024
Esophageal squamous cell carcinoma (ESCC) is among the most common malignant tumors of the digestive tract, with the sixth highest fatality rate worldwide. The ESCC-related dataset, GSE20347, was downloaded from the Gene Expression Omnibus (GEO) database, and weighted gene co-expression network analysis was performed to identify genes that are highly correlated with ESCC. A total of 91 transcriptome expression profiles and their corresponding clinical information were obtained from The Cancer Genome Atlas database. A mitochondria-associated risk (MAR) model was constructed using the least absolute shrinkage and selection operator Cox regression analysis and validated using GSE161533. The tumor microenvironment and drug sensitivity were explored using the MAR model. Finally, in vitro experiments were performed to analyze the effects of hub genes on the proliferation and invasion abilities of ESCC cells. To confirm the predictive ability of the MAR model, we constructed a prognostic model and assessed its predictive accuracy. The MAR model revealed substantial differences in immune infiltration and tumor microenvironment characteristics between high- and low-risk populations and a substantial correlation between the risk scores and some common immunological checkpoints. AZD1332 and AZD7762 were more effective for patients in the low-risk group, whereas Entinostat, Nilotinib, Ruxolutinib, and Wnt.c59 were more effective for patients in the high-risk group. Knockdown of TYMS significantly inhibited the proliferation and invasive ability of ESCC cells in vitro. Overall, our MAR model provides stable and reliable results and may be used as a prognostic biomarker for personalized treatment of patients with ESCC.
Wang, Tian-Yan;Xu, Zhi-Wen;Wang, Kun-Hao;Wang, Ning
Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
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제16권9호
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pp.3677-3683
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2015
Abnormally expressed microRNAs (miRNAs) and genes have been found to play key roles in esophageal squamous cell carcinoma (ESCC), but little is known about the underlying mechanisms. The aim of this paper was to assess inter-relationships and the regulatory mechanisms of ESCC through a network-based approach. We built three regulatory networks: an abnormally expressed network, a related network and a global network. Unlike previous examples, containing information only on genes or miRNAs, the prime focus was on relationships. It is worth noting that abnormally expressed network emerged as a fault map of ESCC. Theoretically, ESCC might be treated and prevented by correcting the included errors. In addition, the predicted transcription factors (TFs) obtained by the P-match method also warrant further study. Our results may further guide gene therapy researchers in the study of ESCC.
In this study, we designed an embedded system for automatic condensation control(ESCC) of the car. This system heats the car glasses as and when it is needed that makes driving safer and convenient. The system was built on an ATmega128L central processing unit(CPU), using high-performance electrically erasable programmable read-only memory(EEPROM) complex programmable logic device(CPLD) ATF1504AS, using which an ESCC algorithm has been proposed. The source code was written in C language. The algorithm of work was written using the dew-point table. This system not only clears the condensation on the glass but also averts condensation. The designed ESCC system begins working once the input information comes close to the dew-point table information. This device enables a wider field of view, thereby increasing safety.
Runt-related transcription factor 3 (RUNX3) is a tumor suppressor gene whose reduced expression may play an important role in the development and progression of esophageal squamous cell cancer (ESCC). The aim of this study was to investigate the clinical relevance of RUNX3 in ESCC patients and effects of overexpression on biological behaviour of Eca109 cells in vitro and in vivo. Immunohistochemistry was performed to detect the clinical relevance of RUNX3 and lymph node metastasis in 80 ESCC tissues and 40 non-cancerous tissues using the SP method. RT-PCR and Western blotting were applied to assess the RUNX3 level and verify the Eca109 cell line with stable overexpression. Localization of RUNX3 proteins was performed by cell immunofluorescence. CCK-8 and Scrape motility assays were used to determine proliferation and migration and the TUNEL assay to analyze cell apoptosis. Invasive potential was assessed in cell transwell invasion experiments. In nude mice, tumorigenesis in vivo was determined. Results showed decreased expression of RUNX3 in esophageal tissue to be significantly related to lymph node metastasis (LNM) (P<0.01). In addition, construction of a recombinant lentiviral vector and transfection into the human ESCC cell line Eca109 demonstrated that overexpression could inhibit cell proliferation, migration and invasion, and induce apoptosis. The in vivo experiments in mice showed tumorigenicity and invasiveness to be significantly reduced. Taken together, our studies indicate that underexpression of RUNX3 in human ESCC tissue is significantly correlated with progression. Restoration of RUNX3 expression significantly inhibits ESCC cells proliferation, migration, invasion and tumorigenesis.
Background: The STK15 gene located on chromosome 20q13.2 encodes a centrosome-associated kinase critical for regulated chromosome segregation and cytokinesis. Recent studies have demonstrated STK15 to be significantly associated with many tumors, with aberrant expression obseved in many human malignancies. The purpose of this study was to investigate expression of STK15 in esophageal squamous cell carcinomas (ESCCs) in a Mongolian population. Methods: Two non-synonymous single nucleotide polymorphisms in the coding region of STK15, rs2273535 (Phe31Ile) and rs1047972 (Val57Ile) were assessed in 380 ESCC patients and 380 healthy controls. We also detected STK15 mRNA expression in 39 esophageal squamous cell carcinomas and corresponding adjacent tissues by real time PCR. Results: rs2273535 showed a significant association with ESCC in our Mongolian population (rs227353, P allele = 0.0447, OR (95%CI) = 1.259 (1.005~1.578)). Real time PCR analysis of ESCC tissues showed that expression of STK15 mRNA in cancer tissues was higher than in normal tissues (p = 0.013). Conclusions: Our study showed that functional SNPs in the STK15 gene are associated with ESCC in a Mongolian population and up-regulation of STK15 mRNAoccurs in ESCC tumors compared adjacent normal tissues. STK15 may thus have an important role in the prognosis of ESCC and be a potential therapeutic target.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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