• 제목/요약/키워드: Dual specificity

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Dual positional substrate specificity of rice allene oxide synthase-1: insight into mechanism of inhibition by type II ligand imidazole

  • Yoeun, Sereyvath;Rakwal, Randeep;Han, Oksoo
    • BMB Reports
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    • 제46권3호
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    • pp.151-156
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    • 2013
  • Phylogenetic and amino acid sequence analysis indicated that rice allene oxide synthase-1 (OsAOS1) is CYP74, and is clearly distinct from CYP74B, C and D subfamilies. Regio- and stereo-chemical analysis revealed the dual substrate specificity of OsAOS1 for (cis,trans)-configurational isomers of 13(S)- and 9(S)-hydroperoxyoctadecadienoic acid. GC-MS analysis showed that OsAOS1 converts 13(S)- and 9(S)-hydroperoxyoctadecadi(tri)enoic acid into their corresponding allene oxide. UV-Visible spectral analysis of native OsAOS1 revealed a Soret maximum at 393 nm, which shifted to 424 nm with several clean isobestic points upon binding of OsAOS1 to imidazole. The spectral shift induced by imidazole correlated with inhibition of OsAOS1 activity, implying that imidazole may coordinate to ferric heme iron, triggering a heme-iron transition from high spin state to low spin state. The implications and significance of a putative type II ligand-induced spin state transition in OsAOS1 are discussed.

Quercetin induces dual specificity phosphatase 5 via serum response factor

  • Kanokkan Boonruang;Ilju Kim;Chaeyoung Kwag;Junsun Ryu;Seung Joon Baek
    • BMB Reports
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    • 제56권9호
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    • pp.508-513
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    • 2023
  • The phytochemical quercetin has gained attention for its anti-inflammatory and anti-tumorigenic properties in various types of cancer. Tumorigenesis involves the aberrant regulation of kinase/phosphatase, highlighting the importance of maintaining homeostasis. Dual Specificity Phosphatase (DUSP) plays a crucial role in controlling the phosphorylation of ERK. The current study aimed to clone the DUSP5 promoter, and investigate its transcriptional activity in the presence of quercetin. The results revealed that quercetin-induced DUSP5 expression is associated with the serum response factor (SRF) binding site located in the DUSP5 promoter. The deletion of this site abolished the luciferase activity induced by quercetin, indicating its vital role in quercetin-induced DUSP5 expression. SRF protein is a transcription factor that potentially contributes to quercetin-induced DUSP5 expression at the transcriptional level. Additionally, quercetin enhanced SRF binding activity without changing its expression. These findings provide evidence of how quercetin affects anti-cancer activity in colorectal tumorigenesis by inducing SRF transcription factor activity, thereby increasing DUSP5 expression at the transcriptional level. This study highlights the importance of investigating the molecular mechanisms underlying the anti-cancer properties of quercetin, and suggests its potential use in cancer therapy.

이중과제를 활용한 노인인지기능 선별검사 개발 (Development of Dual-task Based Cognitive Function Screening Test for the Elderly)

  • 곽호성;유은영;박혜연;이서현;한대성;박지혁
    • 재활치료과학
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    • 제9권4호
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    • pp.69-81
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    • 2020
  • 목적 : 본 연구의 목적은 인지기능저하 노인을 선별할 수 있는 이중과제를 활용한 노인인지기능 선별검사를 개발하는 것이다. 연구방법 : 2019년 5월부터 8월까지 경기도 및 충청도에 있는 지역사회 기관에서 60세 이상 노인 229명을 대상으로 개발된 Y-DuCog(Yonsei Dual Task Cognitive Screening Test)의 신뢰도 및 타당도 검증과 인지기능저하 노인의 분류 기준점을 확인하였다. 결과 : MMSE-K, MoCA-K와 Y-DuCog와의 상관분석을 실시한 결과 Y-DuCog의 이중과제 효과와 이중과제 초당 정답 수에서 상관관계를 보였다. 내적 일치도 분석 결과 이중과제 효과와 이중과제 초당 정답 수의 Cronbach's-α 값은 각각 .848(p<.01), .916(p<.01)의 신뢰도를 보였고, 검사-재검사 신뢰도는 ICCs가 .969~.996으로 높게 나타났다. 선별기준점은 총 수행시간 DTE에서 31.76초를 기준으로 88.7%의 민감도와 83.5%의 특이도를, 총 이중과제 CRR에서 0.38개를 기준으로 84.5%의 민감도와 76.6%의 특이도를 보였다. 결론 : 본 연구를 통해 Y-DuCog의 신뢰도 및 타당도가 검증되었다. Y-DuCog는 기존 지필 평가의 제한점인 교육수준과 문자에 영향을 받지 않으며 간편하고 빠르게 검사를 시행할 수 있어 노인의 인지기능 평가 및 중재 방법에 대한 효과성 검증 시 사용될 수 있을 것으로 기대한다.

관상동맥질환 진단에서 Thallium-201과 Technetium-99m MIBI를 이용한 Dual-Isotope SPECT 영상 (Dual-Isotope SPECT Imaging with Thallium-201 and Technetium-99m MIBI in Detecting Coronary Artery Disease)

  • 이규광;조인호;이형우;박종선;원규장;신동구;김영조;심봉섭
    • Journal of Yeungnam Medical Science
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    • 제16권1호
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    • pp.101-107
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    • 1999
  • 휴식 Tl-201/부하 Tc-99m MIBI 심근관류 SPECT를 흉통을 주소로 내원한 24명의 환자를 대상으로 시행하고, 관상동맥조영술에서 관상동액의 내경이 50%이상 협착이 있는 경우를 유의한 것으로 보고 SPECT결과와 관상동맥조영술의 결과를 비교하였다. 관상동맥질환 진단의 민감도와 특이도는 모두 91.7%였고, 협착이 있는 관상동맥 분지수에 따른 민감도는 단일혈관질환이 75%, 다중혈관질환이 100% 였다. 관상동맥분지 각각에 대한 전단의 민감도는 좌전하행동맥 78%, 좌회선동맥 80%, 우관상동맥 86%였다. 이 연구의 절과와 기존의 Tl-201 이나 Tc-99m MIBI를 단독으로 사용한 경우와 비교했을 때 관상동맥질환 진단의 민감도와 특이도는 비슷하거나 오히려 더 좋은 결과를 보였다. 또한 이 방법은 진정한 의미의 휴식기영상을 얻을 수 있고 휴식기와 부하기 영상 사이에 남아있는 방사능으로 인한 오차에서 벗어날 수 있으며, 휴식기 촬영 후 바로 부하기 촬영을 하므로 전체 검사시간이 줄어 환자에게 편리하고 효율이 높은 검사법이라 생각된다.

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Dual Priming Oligonucleotide (DPO) system을 이용한 듀시엔/베커형 근이영양증 진단법 (Diagnostic testing for Duchenne/Becker Muscular dystrophy using Dual Priming Oligonucleotide (DPO) system)

  • 김주현;김구환;이진주;이대훈;김종기;유한욱
    • Journal of Genetic Medicine
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    • 제5권1호
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    • pp.15-20
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    • 2008
  • 목 적 : 듀시엔/베커형 근이영양증(Duchenne and Becker type muscular dystrophy; DMD/BMD)은 남아에게 나타나는 일반적인 X 염색체 연관 유전성 근육 질환으로 DMD(dystrophin) 유전자의 돌연변이로 인해 생긴다. 그 중 큰 exon 결실이 전체 DMD 환자의 약 50-60%에서 발견된다. 이 유전자의 돌연변이를 찾기 위해 여러 방법들이 사용되고 있지만 결실 돌연변이를 찾아내기 위한 가장 일반적인 방법으로 복합적 중합효소연쇄반응을 이용하고 있다. 하지만 이 방법의 단점은 하나의 시험관 안에 복합적인 시발체가 존재하여 정확한 반응 조건을 찾기 힘들 뿐 아니라 시발체 상호간의 간섭으로 중합효소 연쇄반응의 비특이적 생성물을 빈번하게 일으켜 잘못된 음성 또는 양성 결과를 가져올 수 있다. 이런 문제를 보완하고자 Dual Primer Oligonucleotide(DPO) 방법을 도입하였다. DPO는 polydeoxyinosine 연결에 의해 두 영역으로 분리된 올리고뉴클레오티드(oligonucleotide)로 표적 DNA 염기서열과의 교잡반응에 높은 특이적 반응을 보여 복합 중합효소 연쇄반응의 정확도를 높여준다. 본 연구에서는 3 그룹을 대상군으로 DMD 유전자의 결실돌연변이 검색을 위한 DPO-복합 중합효소 연쇄반응법의 특이성과 민감성을 알아보고자 하였다. 방 법 : 50명의 건강한 남자 대조군, 50명의 결실 돌연변이를 갖고 있는 양성반응 환자그룹 그리고 20명의 결실 돌연변이를 가지고 있지 않은 음성반응 환자 그룹으로 구성된 3 그룹을 대상으로 DPO-복합 중합효소 연쇄반응법을 이용하여 실험하였다. 이들 120명의 실험군 모두 PMter영역과 exon 3, 4, 6, 8, 12, 13, 17, 19, 43-48, 50-52, 60을 포함하는 18개의 exon에서의 결실의 여부와 결실 범위를 확인하였다. 결 과 : DPO-복합 중합효소 연쇄반응법은 결실 여부를 발견하는데 100%의 특이성과 민감성을 보였다. 하지만 결실 범위의 결정에는 97.1%의 민감성과 특이성을 보였다. 결 론 : DPO-복합 중합효소 연쇄반응법은 기존의 복합 중합효소 연쇄반응법 보다 높은 분석 확실성을 보일뿐 아니라 빠르고 저렴한 비용으로 쉽게 할 수 있기 때문에 듀시엔/베커형 근이영양증 환자의 DMD 유전자의 결실돌연변이 여부를 확인하는데 유용한 방법이다.

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MDCT를 이용한 관상동맥협착 진단의 정확성 평가 (Evaluate the diagnostic accuracy in the assessment of coronary artery stenoses using MDCT)

  • 양원석;신성규;박재홍
    • 한국방사선학회논문지
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    • 제6권4호
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    • pp.275-279
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    • 2012
  • 16MD CT(n=93) and dual source CT(n=100)를 이용해 촬영된 심장 CT 중 그 결과 협착으로 진단되어 심장영화 촬영을 시행한 환자를 대상으로 심장영화 촬영과의 협착 유무에 대한 비교를 하였다. 그 결과 16MDCT의 경우 가장 높은 민감도, 특이도, 양성예측도, 음성예측도는 LAD(73.5%), RCA(74.5%), LAD(66.7%), LCX(75%), LCX(67.7%)로 나타났고, 16Slice MDCT에서 각 관상동맥 혈관별 정확도는 평균67%로 다소 떨어지는 것으로 나타났고, Somatom Definition dual source CT의 경우 평균 정확도 84%로 16Slice MDCT보다는 17%더 높은 정확도를 나타내었다. 관상동맥영역별(segaments) 구분에서는 16Slice MDCT와 Somatom Definition 모두 근위부(proximal)보다는 원위부로 갈수록 더 높은 정확도를 나타내었다. 하지만 그 결과 값이 10% 오차 범위 내에 있어 명확한 차이라 보기는 힘들 것 이다. 또한 Dual source CT의 경우 역시 관상동맥 영역별 구분에서 큰 차이를 보이지 않았다.

Development of Two Quantitative Real-Time PCR Diagnostic Kits for HPV Isolates from Korea

  • Jeeva, Subbiah;Kim, Nam-Il;Jang, In-Kwon;Choi, Tae-Jin
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제22권10호
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    • pp.1350-1358
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    • 2012
  • Viral pathogens, alongside other pathogens, have major effects on crustacean aquaculture. Hepatopancreatic parvovirus (HPV) is an emerging virus in the shrimp industry and has been detected in shrimp farms worldwide. The HPV genome has greater diversity than other shrimp viruses owing to its wide host range and geographical distribution. Therefore, developing diagnostic tools is essential to detect even small copy numbers from the target region of native HPV isolates. We have developed two easy to use quantitative real-time PCR kits, called Green Star and Dual Star, which contain all of the necessary components for real-time PCR, including HPV primers, using the primers obtained from the sequences of HPV isolates from Korea, and analyzed their specificity, efficiency, and reproducibility. These two kits could detect from 1 to $1{\times}10^9$ copies of cloned HPV DNA. The minimum detection limits obtained from HPV-infected shrimp were $7.74{\times}10^1$ and $9.06{\times}10^1$ copies in the Green Star and Dual Star assay kits, respectively. These kits can be used for rapid, sensitive, and efficient screening for HPV isolates from Korea before the introduction of postlarval stages into culture ponds, thereby decreasing the incidence of early development of the disease.

Isoforms of Glucose 6-Phosphate Dehydrogenase in Deinococcus radiophilus

  • Sung, Ji-Youn;Lee, Young-Nam
    • Journal of Microbiology
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    • 제45권4호
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    • pp.318-325
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    • 2007
  • Glucose 6-phosphate dehydrogenase (G6PDH, EC 1.1.1.49) in Deinococcus radiophilus, an extraordinarily UV-resistant bacterium, was investigated to gain insight into its resistance as it was shown to be involved in a scavenging system of superoxide $(O_2^{-1})$ and peroxide $(O_2^{-2})$ generated by UV and oxidative stresses. D. radiophilus possesses two G6PDH isoforms: G6PDH-1 and G6PDH-2, both showing dual coenzyme specificity for NAD and NADP. Both enzymes were detected throughout the growth phase; however, the substantial increase in G6PDH-1 observed at stationary phase or as the results of external oxidative stress indicates that this enzyme is inducible under stressful environmental conditions. The G6PDH-1 and G6PDH-2 were purified 122- and 44-fold (using NADP as cofactor), respectively. The purified G6PDH-1 and G6PDH-2 had the specific activity of 2,890 and 1,033 U/mg protein (using NADP as cofactor) and 3,078 and 1,076 U/mg protein (using NAD as cofactor), respectively. The isoforms also evidenced distinct structures; G6PDH-1 was a tetramer of 35 kDa subunits, whereas G6PDH-2 was a dimer of 60kDa subunits. The pIs of G6PDH-1 and G6PDH-2 were 6.4 and 5.7, respectively. Both G6PDH-1 and G6PDH-2 were inhibited by both ATP and oleic acid, but G6PDH-1 was found to be more susceptible to oleic acid than G6PDH-2. The profound inhibition of both enzymes by ${\beta}-naphthoquinone-4-sulfonic$ acid suggests the involvement of lysine at their active sites. $Cu^{2+}$ was a potent inhibitor to G6PDH-2, but a lesser degree to G6PDH-1. Both G6PDH-1 and G6PDH-2 showed an optimum activity at pH 8.0 and $30^{\circ}C$.

자궁경부 이형성증과 암의 진단을 위한 액상세포 검체에서 p16INK4a/Ki-67 이중면역염색의 평가 (Evaluation of p16INK4a/Ki-67 Dual Immunostaining in Liquid-based Cytology for Diagnosis of Uterine Cervical Dysplasia and Cancer)

  • 성미희;이훈택;신민식;오서영;김욱연
    • 대한임상검사과학회지
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    • 제47권3호
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    • pp.132-139
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    • 2015
  • 최근 $p16^{INK4a}$/Ki-67 이중면역염색은 액상세포검사에서 자궁경부 이형성증과 암을 조기에 발견하기 위한 새로운 생체 표지자로 대두되고 있다. 저자들은 자궁경부질도말의 액상세포검체 총 109례에서 CINtec$^{(R)}$ PLUS kit를 사용하여 $p16^{INK4a}$/Ki-67 이중면역염색을 시행하였고, 그 결과를 액상세포검사, HPV hybrid capture II (HC II) 검사 그리고 조직학적 진단과 서로 비교하였다. $p16^{INK4a}$/Ki-67 양성 발현은 세포학적 진단에서 저등급 편평상피내병변 이상의 증례 그리고 조직학적 진단에서 자궁경부 상피내종양 1등급 이상의 증례에서 유의미하게 높았다. 액상세포검사상 비정형 편평 상피세포 소견을 보이는 46례 중, 31례 (67.4%)가 $p16^{INK4a}$과 Ki-67 양성 소견을 보였고, 이러한 양성 증례들은 조직검사에서도 대부분 자궁경부 상피내종양 1등급 이상의 병변에 해당하였다. 자궁경부 상피내종양 1등급 이상의 병변을 발견하기 위한 $p16^{INK4a}$/Ki-67 이중면역염색의 민감도는 액상세포검사보다 높은 89.0%였고, 특이도는 73.5%로 HC II 검사보다 높게 분석되었다. 따라서, $p16^{INK4a}$/Ki-67 이중면역염색 방법은 액상세포검사법의 민감도와 HC II 검사법의 특이도를 보완하기 위한 진단적 검사로 유용하다고 할 수 있다.