• 제목/요약/키워드: Domain combination

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Identification of the Calcium Binding Sites in Translationally Controlled Tumor Protein

  • Kim, Moon-Hee;Jung, Yoon-Wha;Lee, Kyung-Lim;Kim, Choon-Mi
    • Archives of Pharmacal Research
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    • 제23권6호
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    • pp.633-636
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    • 2000
  • Translationally controlled tumor protein (TCTP), also known as IgE-dependent histamine-releasing factor, is a growth-related tumor protein. Although the primary sequence of rat TCTP does not reveal any recognizable $Ca^{2+}$ -binding motif, previous studies have demonstrated that rat TCTP consisting of 172 amino acids is a $Ca^{2+}$ -binding protein. However. the region of TCTP required for $Ca^{2+}$ interaction has not been mapped to the molecule. Here, we reported that the $Ca^{2+}$ binding region of TCTP which was mapped by using a combination of deletion constructs of rat TCTP and $^{45}Ca^{2+}$-overlay assay. was confined to amino acid residues 81-112. This binding domain did not show any peculiar loop of calcium- binding motif such as CaLB domain and EF hand motif and it seems to be constituted of random coil regions neighboring the a helix. Thus, our data confirm that TCTP is a novel family of $Ca^{2+}$ -binding protein.

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온톨로지 기반 메타데이터 명명 규칙에 관한 연구 (A Study on the Naming Rules of Metadata based on Ontology)

  • 고영만;서태설
    • 정보관리학회지
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    • 제22권4호통권58호
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    • pp.97-109
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    • 2005
  • 본 연구에서는 정보자원의 메타데이터 작성시 메타데이터 간 의미의 일관성을 유지하기 위한 메타데이터 명명 방법론과 이를 실제 분야에 적용할 수 있는 메타데이터 명명 규칙의 실험적 모형을 제시하였다. 이를 위해 우선적으로 ISO/IEC 11179에서 제시하고 있는 메타데이터 레지스트리 메타모형과 데이터의 기본 속성 및 개념을 논의하였으며, 이러한 논의를 토대로 객체용어(object term)와 속성용어(property term) 및 표현(presentation)에 관한 명명 규칙의 실제 적용 사례를 제시하였다. 객체용어의 생성은 자료유형의 엔터티-관계(I-R) 모형에 근거한 휴리스틱 분석을 통해 이루어졌으며, 속성용어의 명명은 더블린코어의 메타데이터 셋을 기반으로, 표현은 SHOE 1.0 버전을 기반으로 하였다.

Inter-Species Validation for Domain Combination Based Protein-Protein Interaction Prediction Method

  • Jang, Woo-Hyuk;Han, Dong-Soo;Kim, Hong-Soog;Lee, Sung-Doke
    • 한국생물정보학회:학술대회논문집
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    • 한국생물정보시스템생물학회 2005년도 BIOINFO 2005
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    • pp.243-248
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    • 2005
  • 도메인 조합에 기반한 단백질 상호작용 예측 기법은 효모와 같은 특정 종에 대하여 우수한예측 정확도를 보이는 것으로 알려졌으나, 인간과 같은 고등 생명체의 단백질에 대한 상호작용 예측을 수행하기 위하여는 여러종에 대한 기법의 적절성검증과 최적의 학습집단 구성 방안에 대한 연구가 선행되어야 한다. 본 논문에서는, 초파리 단백질을 이용한 예측 정확도 검증으로 도메인 조합 기법의 일반화 가능성을 타진 하고 이종간의 상호작용 예측실험 및 정확도 검증을 통하여 비교적 연구가 덜 되어진 종의 단백질 상호작용 예측을 위한 학습집단 구성 방법에 대하여 기술한다. 초파리 실험에서는 10351개의 상호작용이 있는 단백질 쌍 가운데, 80%와 20%를 각각 학습집단 및 실험집단으로 사용하였으며, 상호작용이 없는단백질 쌍의 학습집단은 1배에서 5배까지 변화시키면서 예측 정확도를 관찰하였다. 이 결과77.58%의 민감도와 92.61%의 특이도를 확인하였다. 이종간의 상호작용 예측 실험은 효모, 초파리, 효모, 초파리에 해당하는 학습집단 각각을 바탕으로 Human, Mouse, E. coli, C. elegans 등의 단백질 상호작용 예측을 수행하였다. 실험 곁과 학습집단의 도메인이 실험집단의 도메인과 많이 겹칠수록 높은 정확도를 보여주었으며, 도메인 집단간의 유사도를 나타내기 위해 고안한 Domain Overlapping Rate(DOR) 는 상호작용 예측 정확도의 중요한 요소임을 찾아내었다.

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Structural identification based on incomplete measurements with iterative Kalman filter

  • Ding, Yong;Guo, Lina
    • Structural Engineering and Mechanics
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    • 제59권6호
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    • pp.1037-1054
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    • 2016
  • Structural parameter evaluation and external force estimation are two important parts of structural health monitoring. But the structural parameter identification with limited input information is still a challenging problem. A new simultaneous identification method in time domain is proposed in this study to identify the structural parameters and evaluate the external force. Each sampling point in the time history of external force is taken as the unknowns in force evaluation. To reduce the number of unknowns for force evaluation the time domain measurements are divided into several windows. In each time window the structural excitation is decomposed by orthogonal polynomials. The time-variant excitation can be represented approximately by the linear combination of these orthogonal bases. Structural parameters and the coefficients of decomposition are added to the state variable to be identified. The extended Kalman filter (EKF) is augmented and selected as the mathematical tool for the implementation of state variable evaluation. The proposed method is validated numerically with simulation studies of a time-invariant linear structure, a hysteretic nonlinear structure and a time-variant linear shear frame, respectively. Results from the simulation studies indicate that the proposed method is capable of identifying the dynamic load and structural parameters fairly accurately. This method could also identify the time-variant and nonlinear structural parameter even with contaminated incomplete measurement.

분자생물학적 방법을 이용한 Moniliella 속과 Trichosporonoides 속의 분류학적 고찰 (Are the genus Moniliella and Trichosporonoides closely related in molecular taxonomic relationship\ulcorner)

  • 신기선;신용국;태경환;권오유;이상한
    • 생명과학회지
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    • 제11권2호
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    • pp.133-137
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    • 2001
  • The molecular taxonomic relationship of nine species in the genus Moniliella Stolk & Dakin and Trichosporonoides Haskins & Spencer and six species of other yea나-like fungi was examined by sequencing analysis of large subunit rDNA D1/D2 variable domain. The fifteeen species fell into two major groups corresponding with their genetic relationships. The nine species of the genus Moniliella and Trichosporonoides were placed at the same cluster. similarity values based on the D1/D2 domain sequences were 45.4-100% among species of genus Moniliella, 45.2-84.4% among genus Trichosporonoides species, and 45.6-90.1% among species of genus Moniliella and Trichosporonoides. Identical sequence similarity was observed between M. suaveolens var. nigra and M. suaveolens. A colse relationship of M. mellis. and M. acetoabutens is observed. The result of this study provided and insight into the genetic origins of genus Moniliella and Trichosporonoides species as well as their genetic relationships. Genus Moniliella and Trichosporonoides are closely related to each other based on sequence analysis of the large subunit rDNA D1/D2 region and we suggest combination of the genus Moniliella and Trichosporonoides to single genus.

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기상청 현업 지역통합모델 물리과정 최적화를 통한 예측 성능 향상 (The Improvement of Forecast Accuracy of the Unified Model at KMA by Using an Optimized Set of Physical Options)

  • 이주원;한상옥;정관영
    • 대기
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    • 제22권3호
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    • pp.345-356
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    • 2012
  • The UK Met Office Unified Model at the KMA has been operationally utilized as the next generation numerical prediction system since 2010 after it was first introduced in May, 2008. Researches need to be carried out regarding various physical processes inside the model in order to improve the predictability of the newly introduced Unified Model. We first performed a preliminary experiment for the domain ($170{\times}170$, 10 km, 38 layers) smaller than that of the operating system using the version 7.4 of the UM local model to optimize its physical processes. The result showed that about 7~8% of the improvement ratio was found at each stage by integrating four factors (u, v, th, q), and the final improvement ratio was 25%. Verification was carried out for one month of August, 2008 by applying the optimized combination to the domain identical to the operating system, and the result showed that the precipitation verification score (ETS, equitable threat score) was improved by 9%, approximately.

초음파 진동자를 이용한 알루미늄 와이어 용접에 관한 연구 (A Study on the Aluminum Wire Bondingby Using Ultrasonic Vibrator)

  • 김희수;이건복
    • 한국정밀공학회:학술대회논문집
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    • 한국정밀공학회 1994년도 추계학술대회 논문집
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    • pp.571-576
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    • 1994
  • In recent years, ultrasonic has been widely applied in measurement and industrial fields and its application range has been expanded as a result of continuous research and development. Wire Bonding Machine, an instrument fabricating semi-conductor, makes use of ultrasonic bonding method. In order to improve the currently used wire bonding machine using ultrasonic energy, technical accumulation is needed steadily through development of exciting device of ultrasonic composed of piezoelectic vibrator and horn. This study investigates the design conditions affecting the dynamic characteristics through the theoretical and experimental analysis of piezoelectric vibrator and horn, The study conducts separately the system identification of piezoelectric vibrator in time domain and the modal analysis of horn in frequency domain. In theoretical model, the integrated modeling is conducted via a combination of dynamic identification of piezoelectric vibrator and theoretical analysis of horn. Hence comparison is made for theoretical and experimental results of the dynamic characteristics of the ultrasonic transducer composed of piezoelectric vibrator and horn. Form the results of this study we develop the design technique of ultrasonic transducer using dynamic characteristic analysis and propose the possibility of ultrasonic welding considering the optimal condition of the natural frequency and vibration mode of horn.

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임의 유전체 경계면의 FDTD 모델링을 위한 새로운 적합법 (A Novel Conformal FETD Method for Modeling Arbitrary Dielectric Surfaces)

  • 이재용;명노훈
    • 한국전자파학회논문지
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    • 제10권2호
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    • pp.180-186
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    • 1999
  • 임의 유전체 경계변을 FDTD (finite-difference time-domain)해석할 경우 계단 끈사 방법이나 유효 유전율 방법 등의 적합법이 널리 사용된다. 그러나 계단 큰사 방법은 부정확하고 유효 유전율 방법은 주파수 분산 매질과 같은 다양한 종류의 매질에 적용하기 어려운 단점이 었다. 본 논문에서는 입의 유전체 경계변의 해석 을 위한 새로운 적합법을 소개하였다. 이러한 다양한 종류의 경계변은 불균일하게 분포된 FDTD 셀틀을 만 든다. 임의 유전체가 불균일하게 분포된 FDTD 셀을 매질 경계변과 전계(자계) 방향이 수직과 수평으로 균 일하게 분포된 두 가지 종류의 젤 조합으로 간주하여 셀 내부의 전계(자계)를 해석하는 새로운 적합법을 제 시하였다. 제시된 방법을 FDTD 정규 격자 구조에 대해서 비스듬히 놓여진 2차원 구형 유전체 실린더와 페 라이트 실린더의 해석에 적용하여, 본 논문의 방법이 간단하면서도 정확한 해를 얻을 수 있음을 보였다.

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의사의 공중보건 역량 개발을 위한 교육주제 (Education Topics for the Development of Doctors' Public Healthcare Competencies)

  • 안덕선
    • 의학교육논단
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    • 제24권1호
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    • pp.35-45
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    • 2022
  • Needs for public healthcare have recently increased. This paper proposes education topics for competency development in public healthcare in line with the needs of the times. In Korea, various lifelong education providers have already provided public health-related education. For example, the Research Institute for Health Policy (RIHP) under the Korean Medical Association provided an "executive course for physicians' public health care competencies" in 2019 and 2020. At the end of the course, the RIHP published a comprehensive report, entitled "Curricular development and evaluation for doctors' public healthcare competencies." This article is based on a summary of that report. To develop a curriculum for public healthcare, the RIHP adopted the following methodologies for a needs analysis; reviewing already-existing education subjects, evaluating end-of-course reports, and conducting in-depth focused group interviews and questionnaire surveys with doctors at public healthcare-related institutions. The results from the needs analysis can be categorized into two domains of education topics for public healthcare. The first domain includes education subjects related to the theory and practice of public healthcare, as follows: a general overview, community or population health, organizational administration, planning and evaluation, budget and finance, responses to disasters such as infectious diseases, health policy, and the legal system. The second domain contained education topics related to general professional competencies: leadership, communication, cooperation, teamwork, and professionalism. In conclusion, the curricular content for public healthcare will be an appropriate combination of competencies specific to public healthcare and core competencies for health professionals.

2차원 확산을 사용하는 다중전송률 MC-DS/CDMA 시스템 (Multirate Multicarrier DS/CDMA with 2-Domain Spreading)

  • 김남선
    • 한국산업정보학회논문지
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    • 제16권4호
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    • pp.27-35
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    • 2011
  • 직교 주파수분할 다중(OFDM)시스템과 직접확산 코드분할다중접속(DS/CDMA)시스템이 결합된 다중반송파(MC) DS/CDMA 시스템은 대역폭 효율, 고 전송률과 페이딩에 강한 특성으로 많은 주목을 받고 있다. 본 논문에서는 시간영역과 주파수영역에서 확산을 수행하는 다중전송률 MC-DS/CDMA 시스템에서 복잡성이 감소된 다중사용자 검출기를 살펴본다. 여기서 시간영역과 주파수영역의 확산부호로는 2차원 직교 가변확산부호(OVSF)로부터 만들어진 1차원 OVSF 코드를 사용한다. 제안된 시스템에서는 다중사용자간섭(MUI)을 감소시키기 위해 코드그룹 간섭제거(CGIC) 수신기를 사용하는데, 이 CGIC 수신기는 1차원 OVSF 코드들의 상관특성을 이용하여 코드 그룹이라는 개념을 사용하여 다른 사용자들의 정보 없이도 사용자 선호를 검출할 수 있는 수신기이다. CGIC를 갖는 다중사용자 검출기가 시간 및 주파수영역에 따로 또는 같이 적용될 것이다. AWGN 채널 환경 하에서 시스템의 성능을 분석하며, 단일(다중) 전송률, 다중사용자를 갖는 시간/주파수 영역에서 확산된 MC-DS/CDMA과 비교할 것이다. 이러한 결과로서 기존의 정합검출기에 비해 제안된 시스템의 성능이 향상됨을 알 수 있다.