• Title/Summary/Keyword: DhGI1

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Isolation and Characterization of a Doritaenopsis Hybrid GIGANTEA Gene, Which Possibly Involved in Inflorescence Initiation at Low Temperatures

  • Luo, Xiaoyan;Zhang, Chi;Sun, Xiaoming;Qin, Qiaoping;Zhou, Mingbin;Paek, Kee-Yoeup;Cui, Yongyi
    • Horticultural Science & Technology
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    • v.29 no.2
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    • pp.135-143
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    • 2011
  • In the Doritaenopsis hybrid, like most of the orchid species and hybrids, temperature is crucial for the vegetative-to-reproductive transition, and low temperature is required for bud differentiation. To understand the molecular mechanism of this process, an orchid GIGANTEA (GI) gene, DhGI1, was isolated and characterized by using the rapid amplification of cDNA ends (RACE) PCR technique. Sequence analysis showed that the full-length cDNA is 4,022 bp with a major open reading frame of 3,483 bp, and the amino acid sequence showed high similarity to GI proteins in Zea mays, Oryza sativa, Arabidopsis thaliana and other plants. Semi-quantitative RT-PCR revealed that DhGI1 was expressed throughout development and could be detected in roots, stems, leaves, peduncles and flower buds. The expression level of DhGI1 was higher when the plants were flowering at low temperature (22/$18^{\circ}C$ day/night) than the other growth stages. Further analysis indicated that the accumulation of DhGI1 transcripts was significantly increased at low temperature, and concomitantly, initiation of the peduncle was observed. However, DhGI1 levels were low under high temperature (30/$25^{\circ}C$) conditions, and flower initiation was inhibited. These results indicate that the expression of DhGI1 is regulated by low temperature and that DhGI1 may play an important role in inflorescence initiation in this Doritaenopsis hybrid at low temperatures.

Development of the breeding materials with diverse grain size and shape in japonica rice

  • Park, Hyun-Su;Shin, Woon-Chul;Baek, Man-Kee;Nam, Jeong-Kwon;Jeong, Jong-Min;Park, Seul-Gi;Kim, Choon-Song;Cho, Young-Chan;Kim, Bo-Kyeong
    • Proceedings of the Korean Society of Crop Science Conference
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    • 2017.06a
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    • pp.67-67
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    • 2017
  • We developed the breeding materials with diverse grain size and shape in japonica rice. Grain size and shape are important factors affecting consumer preference and choice. However, most of Korean japonica rice cultivars have small, short, and round grain. To diversify the grain size and shape of japonica rice, we conducted the breeding program using donor parents, Jizi1560 and Jizi1581. Jizi1560 and Jizi1581 are japonica germplasm with extremely large grain. Four crosses between the each donor parents and high yielding japonica rice cultivars, Deuraechan and Boramchan, were constructed and then anther culture method was applied. We obtained 290 doubled-haploid (DH) lines with appropriated morphological traits and selected 91 DH lines with diverse grain size and shape. The grain related-traits of the selected DH lines showed a higher diversity when compared with 319 cultivars developed by NICS (264 japonica, 13 black, and 32 Tongil type cultivars). We designated the selected DH lines, four parents, and Daeripbyeo 1, large grain japonica cultivar, as the breeding materials for further analysis. The breeding materials were classified into five groups, A to E, based on the grain-related traits. Group A (including Jizi1581) and Group B (including Daeripbyeo 1) showed similar grain width, whereas Group A exhibited longer grain length and heavier grain weight. Group C (including Deuraechan and Boramchan) showed shorter and rounder grain shape and smaller grain size than any other groups. Group D including solely Jizi1560 had extremely large grain, such as the longest grain length, width, and thickness and heaviest grain weight. Group E including only two DH lines had long and slender grain shape, so that showed the highest ratio of length to width. The grain size and shape of the breeding materials exhibited beyond the characteristics of previously developed Korean japonica cultivars. The breeding materials will be applied in the breeding programs to diversify the grain size and shape of japonica rice.

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PWR 원전환경에서 오스테나이트 스테인리스강의 피로균열성장특성에 미치는 질소의 영향

  • Min, Gi-Deuk;Kim, Dae-Hwan;Lee, Bong-Sang;Kim, Seon-Jin
    • Proceedings of the Materials Research Society of Korea Conference
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    • 2011.10a
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    • pp.39.1-39.1
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    • 2011
  • 가압경수로의 압력경계기기는 약 $300^{\circ}C$, 150기압의 고온고압수환경에서 가동되고 있다. 특히 가압기 밀림관은 고온수와, 저온수가 교차하는 부분으로 열성층 형성으로 열적, 기계적 피로 및 수화학환경이 더해진 부식피로 등에 의하여 손상을 받는다. PWR 원전에서 수화학환경은 대표적으로 용존산소(DO) 5ppb, pH 6~8, 용존수소(DH) <30 cc/kg, 온도 $316^{\circ}C$의 환경을 유지하게 된다. 가압기 밀림관에는 오스테나이트계 스테인리스강이 사용되는데, 오스테나이트계 스테인리스강은 고온 수화학환경에 민감한 것으로 알려져 있다. 따라서 오스테나이트계 스테인리강을 공기중에서의 기계적특성 및 피로특성을 향상시키기 위하여 질소를 첨가한 스테인리스강을 제조하여 PWR 원전환경에서의 피로균열성장특성을 평가하였다. 실험에 사용된 재료는 PWR 원전 가압기 밀림관 소재인 Type 347 스테인리스강에 0.0005 wt%가 첨가된 상용재와 0.11 wt% 질소가 첨가된 재료이다. 사용된 시편형상은 두께 5 mm, 폭 25.4 mm의 CT 시편이다. 수화학환경은 150기압, 온도 $316^{\circ}C$, 용존산소(DO) 5ppb, 용존수소(DH) 30 cc/Kg, pH는 약 7로 유지 하였으며, 응력비 0.1, 하중 반복속도 10Hz의 기계적 조건에서 하중제어로 시험을 진행하였다. 균열길이는 직류전위차법(Direct Current Potential Drop: DCPD)을 이용하여 측정하였다. 질소함량이 증가할수록 동일 사이클에서 균열길이가 늦게 성장하였고, 피로균열성장속도도 약간 늦어지는 것으로 나타났다. 각 스테인리스강의 피로파면 관찰결과 상용재는 약 1 ${\mu}m$의 산화물들이 생성되는 반면 질소첨가 스테인리스강은 약 0.1 ${\mu}m$정도 산화물이 생성되었다. 산화막의 두께도 질소가 첨가됨으로써 상용재에 비해 얇게 생성되었다. 따라서 질소가 첨가됨으로써 부식환경에서 내산화성이 향상되었으며, 이는 피로균열성장특성에 영향을 미치는 것으로 판단된다.

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Properties of Zeolite A Synthesized by Natural Bentonite (천연 벤토나이트로부터 합성된 제올라이트 A의 특성)

  • Lee, Jae-Yeong;Jo, Seung-Rae;Lee, Hong-Gi;Sim, Mi-Ja;Lee, Ju-Seong;Kim, Sang-Uk
    • Korean Journal of Materials Research
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    • v.5 no.8
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    • pp.1035-1039
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    • 1995
  • Synthetic zeolite was prepared by using of natural bentonite from Kampo area and the application of detergent builder was investigated. The optimum synthetic condition was SiO$_2$/Al$_2$O$_3$= 2, Na$_2$O/A1$_2$O$_3$=1, H$_2$O/A1$_2$O$_3$=30 at 90$^{\circ}C$ for 3hr and it was found by XRD analysis that the zeolite synthesized under this condition was type A. When the zeolite A synthesized under the optimum condition was contacted with 40$^{\circ}$Dh CaCl$_2$solution at 30$^{\circ}C$ for 15min, the cation exchange capacity was 264.9mg CaO/g-zeolite. And the whiteness of the sample was 89% and the mean particle size was 9.95$\mu\textrm{m}$.

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Immunization with Brucella abortus recombinant proteins protects BALB/c mice from Brucella abortus 544 infection

  • Arayan, Lauren Togonon;Tran, Xuan Ngoc Huy;Reyes, Alisha Wehdnesday Bernardo;Huynh, Tan Hop;Vu, Hai Son;Min, WonGi;Lee, Hu Jang;Kim, Suk
    • Journal of Preventive Veterinary Medicine
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    • v.42 no.4
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    • pp.157-162
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    • 2018
  • This study evaluated the protective effects of a combination of eight B. abortus recombinant proteins that were cloned and expressed into a pMal vector system and $DH5{\alpha}$: nucleoside diphosphate kinase (rNdk), 50S ribosomal protein (rL7/L12), malate dehydrogenase (rMDH), DNA starvation/stationary phase protection protein (rDps), elongation factor (rTsf), arginase (rRocF), superoxide dismutase (rSodC), and riboflavin synthase subunit beta (rRibH). The proteins were induced, purified, and administered intraperitoneally into BALB/c mice. The mice were immunized three times at weeks 0, 2, and 5 and then infected intraperitoneally (IP) with $5{\times}10^4CFU$ of virulent B. abortus 544 one week after the last immunization. The spleens were collected and the bacterial burden was evaluated at four weeks post-infection. The results showed that this combination produced a significant reduction of the bacterial burden in the spleen with a log reduction of 1.01 compared to the PBS group. Cytokine analysis revealed induction of the cell-mediated immune response in that TNF (tumor necrosis factor) and proinflammatory cytokines IL-6 (Interleukin 6) and MCP-1 (macrophage chemoattractant protein-1) were elevated significantly. In summary, vaccination with a combination of eight different proteins induced a significant protective effect indicative of a cell mediated immune response.

대두단백질 가수분해물의 쓴맛 펩타이드 구조와 특징

  • Lee, Cheol-Ho
    • Proceedings of the Korean Society of Life Science Conference
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    • 2001.06a
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    • pp.3-41
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    • 2001
  • 단백질의 부분 가수분해는 산성 음료에서의 용해도 증가, 환자들의 소화력과 알러지 내성의 개선, 다른 기능적 특성의 개발 등을 위하여 식품산업에 널리 이용되고 있다. 그러나 우유 단백질이나 대두 단백질과 같은 몇 가지 단백질들은 가수분해에 의하여 강한 쓴맛을 형성한다, 단백질 가수분해물의 쓴맛에 관한 연구는 1950년대 초에 시작되었으며, 여러 가지 원료로부터 쓴맛물질이 분리되었다. 이들 단백질 가수분해물의 쓴맛 물질은 올리고펩타이드로 알려져 있으며, 펩타이드 분자를 구성하는 소수성 아미노산의 존재와 밀접한 관계가 있는 것으로 보고되고 있다. 본 연구에서는 최근에 발달된 분석기술과 생명공학적 기법으로 E. coli에서 생산한 콩 단백질 단일 subunit를 이용하여 효소적 가수분해물의 분자구조를 확인하고자 하였다. 탈지대두박으로부터 115 glycinin와 E.coli떼서 발현된 proglycinin을 각각 90%, 97%의 정제도로 분리하여 이들 단백질을 trypsin으로 각각 가수분해하였다. 115 glycinin은 효소/기질 비 3%에서 4시간 가수분해에 의해 $14.0{\times}10^{-5}$ M quinine-HCI equivalent의 강한 쓴맛을 나타내었으며, 12%의 가수분해도(DH)를 나타내었다. 대두 단백질의 쓴맛 성분을 확인 위하여 이미 아미노산 서열이 밝혀진 11S glycinin과 proglycinin 가수분해물에서 GP-HPLC, $C_{18}$ RP-HPLC 등을 통하여 쓴맛 peptide들을 분리하였다. 각각의 분획은 다시 21개의 peptide로 분리되어 그 서열이 결정되었으며 이중 RP와 GI는 이미 알려진 쓴맛 dipeptide였고, LAGNQEQE, SAEFG, NALPE, KLHENIAR, GMIYPG 등이 주된 쓴맛 Peptide로 확인되었다. 이들은 11S glycinin의 5개의 subunit 중에서 그 위치가 확인되었다. Proglycinin 가수분해물에서도 11S glycinin과 같은 방법으로 7개의 쓴맛 peptide가 분리되었다. 이들은 $A_{1a}B_{1b}$의 아미노산 서열 중에서 37-42, 103-110, 164-167, 323-327, 367-373의 위치에 분포하고 있었으며, NALKPD, IYPGCPST, SlDT, HNIGQT, NAMFVPH의 서열을 나타내었다. 분리된 쓴맛 peptide 중에서 가장 쓴 두 분회의 peptide를 합성하여 관능 검사한 결과, NALPE는 매우 쓴맛을 내는 peptide로 확인되었다.

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Molecular Cloning and Expression of a Cellulolytic Xylanase Gene from Bacillus circulans in Escherichia coli (Bacillus circulans 기원의 Cellulolytic Xylanase 유전자의 대장균에서의 클로닝 및 발현)

  • 이동석;김지연;김한복
    • Korean Journal of Microbiology
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    • v.36 no.3
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    • pp.196-202
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    • 2000
  • A gene for cellulolytic xylanase of Bacillus circulnns ATCC21365 was cloned on pUC 19 in Eschwichia coli. The recombinant plasniid pXLI80 contained an 1.8 id, inselt composed of0.5 kb and 1.3 kb PslI fragments derived from B, circulans. The 0.5 kh fragment in the upstream region of 1.3 kb one was confirmed lo be indispensable for not only expression but also hyperexpression of the cloned gene. The transformant overproduced the xylanase 135 times greater than that produced by the orlginal B circulnns. The optimum pH and temperature of the cloned enzyme we]-e pH 5.2 and $60^{\circ}C$, respectively. Heal pretl-eatment at TEX>$55^{\circ}C$C for 1 Indid not cause inhibition of the activity of this enzyme. The elm.ynie could hydl-olyre CMC and lichenan as well as xylan to produce xylose(or GI), xylohiose(or G2) and xylolnose(or G3) as inah products. Hence We defined the cloned enzyme as a cellulolytic xylanase. The SDS-PAG electrophoretic mobility and zyiiogram of this enzyme derived from whole cell extracts or c~~lture supematants or E. coli(pXL180) indicated a molecular weight of 45,000 and nonprocessing of the enzyme in the peilplasln of E. coli.

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Synthesis and Structural Characterization of β-Carboline Compounds (β-카볼린 화합물의 합성 및 구조분석)

  • Byeon, Hong-Ju;Han, Min-Hui;Moon, Gi-Seong;Jung, Kyung-Hwan;Lee, Hyang-Yeol
    • Journal of the Korean Applied Science and Technology
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    • v.36 no.2
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    • pp.676-684
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    • 2019
  • The Pictet-Spengler reactions have widely known for the organic synthesis or biosynthesis of biologically active compounds, tetrahydro-${\beta}$-carbolines. We have developed the simple and efficient synthetic method for the synthesis of ${\beta}$-carbolines in water. Their chemical structures were characterized by nmr and UPLC/MS/QTOF. Calculated masses of compound 1 ($C_{17}H_{17}N_2$ 249.1392), 2 ($C_{17}H_{23}N_2$ 255.1861), 3 ($C_{19}H_{21}N_2O_3$ 325.1552) and 4 ($C_{19}H_{19}N_2O$ 279.1497) were almost identical with the detected masses of compound 1 (249.1315), 2 (255.1789), 3 (325.1460) and 4 (279.1364) respectively. Those synthesized four compounds showed strong antibiotic activity against the common E. coli.

젖산균의 Plasmid DNA 분리방법 및 Electroporation에 의한 젖산균의 형질전환에 관한 연구

  • Kim, Seon-Gi
    • 한국유가공학회:학술대회논문집
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    • 1997.05a
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    • pp.41-61
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    • 1997
  • 젖산균의 유전자 연구를 촉진하기 위해 간단하고 신속한 plasmid DNA의 분리방법과 electro-poration을 이용하여 vector plasmid의 간단하고 신속한 전이방법을 얻기 위해 젖산균의 형질전환에 영향하는 요인에 대하여 연구하였으며 연구결과는 다음과 같다. 1. O'Sullivan과 Klaenhammer의 방법을 개선하여 젖산균 plasmid DNA의 분리에 좋은 결과를 얻을 수 있는 신속하고 쉬운 방법을 고안하였으며, genomic DNA 분리에 이용되는 guanidium thio-cyanate 처리방법을 plasmid의 분리에 적용할 수 있었다. 2. L. casei, L. acidophilus. L. delbruekii var. bulgaricus. L. brevis와 L. plantarum 균주에서 plasmid를 확인하였으며, 돼지 분에서 분리된 L. lactis ssp. lactis. L. fermentum과 L. plantarum에서도 plasmid를 분리 확인하였다. 3. Lactococci의 plasmid분리는 lactobacilli와는 달리 mutanolysin의 처리없이도 잘 되었으며, L. lactis ssp. lactis와 Ent. faecalis에서 plasmid를 확인하였다. 4. E. coli plasimd 분리에 이용되는 MPS membrane filter 방법으로 젖산균 plasmid pLZ12의 분리가 가능하였으나, 세포파편이 filter를 막아 사용에 어려움이 있는 것으로 확인되었다. 5. Plasmid 분리없이 electroporation을 이용한 세포 대 세포 전이법으로 간편하고 빠르게 E. coli DH5${\alpha}$에 E. coli Jm109의 plasmid pBX19, pBR322를 전이시켰다. 6. L. lactis ssp. lactis 균주에 lysozyme 처리시 30${\sim}$80%의 생존율을 보였으며, 대부분의 L. acidophilus 균주의 경우 약 70%의 생존율을 보였다. L. casei 102S의 경우는 45분간 처리 시에도 100%의 생존율을 보였다. 8. L. lactis ssp. lactis 균주에 pLZ12를 6.0kV에서 전이시킨 결과 12.5kV에서보다 형질전환 효율이 훨씬 높았으며 lysozyme 처리에 의해 형질전환 효율이 증가되었다. 9. L. acidophilus 균주에 pLZ12를 전이시 6.0kV에서는 전이가 모두 이루어졌으나, 12.5kV에서는 L. acidophilus WIESBY와 NCFM에서 전이가 이루어지지 않았으며, lysozyme 처리 후 pLZ12를 전이시켰을 때 12kV보다 6.0kV에서 형질전환 효율이 증가되었다. 10. Gene Pulser와 Progenitor II를 사용하여 pLZ12를 L. lactis ssp. lactis 균주에 전이하였을 때 Gene Pulser에 비해 Progenitor II의 형질전환 효율이 현저히 떨어졌다. L. acidophilus HY7008과 HY7001은 두 기기 모두 형질전환이 이루어졌으나, L. acidophilus WEISBY와 NCFM은 Progeni-tor II에서 전이가 일어나지 않았으며, Gene Pulser에서 전이균주를 얻어 두 electroporator간에 형질전환 효율의 차이를 보였다. 11. L. casei 102S에 pLZ12를 electroporation시 낮은 전압에서 형질전환 효율이 비교적 좋았으며, 배양 시기를 달리하여 전이시켰을 때 대수생장 말기의 세포가 형질전환 효율이 좋았다. 12. L. casei 102S세포를 각각 10% glycerol, EB, 2차 증류수 등에 녹여 electroporation을 실시하였을 때 각각 $3.8{\times}10^3$, $5.0{\times}10^2$,1.5${\times}10^2$cfu의 형질전환 효율을 보였으며, 1.0mM HEPES, TE buffer를 사용하였을 때에는 전이가 이루어지지 않았다. 13. Plasmid pLZ12의 농도를 달리하여 electroporation을 하였을 때 형질전환 효율이 농도에 비례하여 증가하였다. 14. L. casei 102S에 대수생장 말기의 세포를 채취하여 10% glycerol, 200 Ohms, 25 ${\mu}$FD, 10kV/cm로 plasmid pLZ12를 electroporation할 때 최대 형질전환 효율인 3.8${\times}$10$^{3}$cfu를 얻었으며, lysozyme 처리가 다른 젖산균과는 달리 형질전환 효율을 증가시키지 못하였다. 15. L. casei 102S 세포를 10% glycerol과 EB에 녹여 -20$^{\circ}C$에서 냉동시킨 다음 1일과 7일 후의 세포를 electroporation한 결과 냉동시 세포에 손상을 주는 것으로 인식되었다.

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Substantial Protective Immunity Conferred by a Combination of Brucella abortus Recombinant Proteins against Brucella abortus 544 Infection in BALB/c Mice

  • Arayan, Lauren Togonon;Huy, Tran Xuan Ngoc;Reyes, Alisha Wehdnesday Bernardo;Hop, Huynh Tan;Son, Vu Hai;Min, WonGi;Lee, Hu Jang;Kim, Suk
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • v.29 no.2
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    • pp.330-338
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    • 2019
  • Chronic infection with intracellular Brucella abortus (B. abortus) in livestock remains as a major problem worldwide. Thus, the search for an ideal vaccine is still ongoing. In this study, we evaluated the protective efficacy of a combination of B. abortus recombinant proteins; superoxide dismutase (rSodC), riboflavin synthase subunit beta (rRibH), nucleoside diphosphate kinase (rNdk), 50S ribosomal protein (rL7/L12) and malate dehydrogenase (rMDH), cloned and expressed into a pMal vector system and $DH5{\alpha}$, respectively, and further purified and applied intraperitoneally into BALB/c mice. After first immunization and two boosters, mice were infected intraperitoneally (IP) with $5{\times}10^4CFU$ of virulent B. abortus 544. Spleens were harvested and bacterial loads were evaluated at two weeks post-infection. Results revealed that this combination showed significant reduction in bacterial colonization in the spleen with a log protection unit of 1.31, which is comparable to the average protection conferred by the widely used live attenuated vaccine RB51. Cytokine analysis exhibited enhancement of cell-mediated immune response as IFN-${\gamma}$ is significantly elevated while IL-10, which is considered beneficial to the pathogen's survival, was reduced compared to control group. Furthermore, both titers of IgG1 and IgG2a were significantly elevated at three and four-week time points from first immunization. In summary, our in vivo data revealed that vaccination with a combination of five different proteins conferred a heightened host response to Brucella infection through cell-mediated immunity which is desirable in the control of intracellular pathogens. Thus, this combination might be considered for further improvement as a potential candidate vaccine against Brucella infection.