Journal of the Korea Academia-Industrial cooperation Society
/
v.15
no.9
/
pp.5675-5682
/
2014
As oral diseases are developed by mixed infections, not by any single element, an accurate analysis of the causative microorganisms related to dental caries and periodontal diseases is required. In this study, saliva was collected from selected adults to determine if the bacteria that are well known as the causative microorganisms of dental caries and periodontal diseases would be detected in their saliva. In addition, this study examined whether there would be any differences among adults according to age, smoking, drinking and presence or absence of diseases in the distribution of oral bacteria to determine the risk factors for oral bacteria. The study subjects were 120 adults ranging in age from 20 to 65 years. The experiment data was collected from March 15, to May 2014. The gDNA was collected from the saliva, and the distribution of bacteria for oral diseases was investigated by PCR. The findings of the study were as follows. S. mutans was detected from 72 adults, and P. intermedia was detected from 88 adults. Both bacteria were detected from 54 adults, and no oral bacteria was detected in 14 adults. An analysis of the risk factors of oral bacteria showed that smokers had a 2.8-fold higher risk of S. mutans than nonsmokers, and the former had a 3.5-fold higher risk of P. intermedia than the latter. Drinkers had a 3.3-fold higher risk of S. mutans than nondrinkers. Patients who suffered from systemic diseases had a 4.1-fold higher risk of P. intermedia than those with no diseases. Therefore, smoking, drinking and systemic diseases are factors that increase the likelihood of oral bacteria detection. More periodontal disease bacteria were detected from older adults, and more oral bacteria were found in adults who were in their 20s, as dental caries and periodontal diseases were more common in this age group. The adults in which oral bacteria were detected are more likely to have dental caries or periodontal diseases, and they should try to keep their mouth cavity clean and make regular visits to a dental clinic to prevent possible oral diseases.
Kim, Dong-Ho;Yun, Hye-Jeong;Song, Hyun-Pa;Lim, Sang-Yong;Jo, Min-Ho;Jo, Cheo-Run
Food Science and Preservation
/
v.16
no.6
/
pp.965-970
/
2009
PCR technology has been widely used to detect and quantify microbial pathogens in foodstuffs, because the technique is rapid, sensitive, and selective. In this study, detection of contaminating pathogenic bacteria on shells of chicken eggs was performed using both a commercial multiplex polymerase chain reaction (PCR) kit and a viable count method employing a selective medium. The PCR kit was capable of detecting Campylobacter jejuni, Escherichia coli O157:H7, Staphylococcus aureus, Bacillus cereus, Vibrio parahaemolyticus, Listeria monocytogenes, Yersinia enterocolitica, Salmonella species, and Shigella species. Using the PCR method, five bacterial species were detected from 30 samples (33.3%) of 90 batches of eggs commercially available in a market. PCR products from B. cereus, S. aureus, L. monocytogenes, Y. enterocolitica, and E. coli O157:H7 were detected, and the numbers and frequencies of positive samples were 17 (18.8%), 12 (13.3%), 15 (16.6%), 16 (17.7%),and 4 (4.4%), respectively. None of any Salmonella species, C. jejuni, V. parahaemolyticus, or Shigella species was detected in this study. The results of PCR testing were confirmed using a typical viable count method employing a selective medium. We suggest that the multiplex polymerase chain reaction (mPCR) assay is a rapid and reliable method for detection of pathogenic bacteria contaminating eggs.
Journal of the Korea Academia-Industrial cooperation Society
/
v.17
no.6
/
pp.537-545
/
2016
This research examined the oral environmental factors to identify the risk factors for oral bacteria detection. This study comprised of 60 office workers aged between 20 and 65 years, and was performed from January 15 to February 28, 2015. The study variables measured were the stimulated and unstimulated salivary flow rates, salivary buffering, saliva pH, dry mouth at the dorsum of the tongue and the sublingual region, halitosis, and the degree of tongue-coating as oral environmental factors. To identify the presence of oral bacteria, pathogens were detected by extracting the gDNA of the resting salivary flow rate. The risk of S.mutans detection was 15 times higher with smokers, 1.3~1.6 times higher when the resting or stimulated salivary flow rate was reduced by 1 mm. The risk of P.intermedia detection was 13 times higher in smokers, 4.3 times higher as the severity of oral dryness was lowered, and 4 times higher for adults with a tongue coating than those without. In addition, the risk of detecting TM7 was 5.5 times higher as sublingual dryness was decreased by 1mm. The oral bacterial count will be reduced considerably by smoking cessation education and habits that facilitate a salivary flow rate. Furthermore, adults with good and well-managed dental hygiene are anticipated to have less oral bacteria and fewer dental diseases.
Proceedings of the Korean Society of Veterinary Pathology Conference
/
2003.10a
/
pp.33-33
/
2003
There prevalence of $\beta$-lactamases bacteria in animals has been increased since 1990s [1]. The resistance in E coli which is mediated by $\beta$-lactamases hydrolyze the $\beta$-lactam ring eventually inactivate the antibiotics [2]. Generally, $\beta$-lactamases can be classified into four main groups and eight subgroups according to their functional and structural characteristics [3]. The detection of $\beta$-lactam antibiotic-resistant bacteria by DNA chip has been described [4]. The chip has a specific probe DNAs that contained the $\beta$-lactam antibiotic-resistant genes which was labeled by multiplex PCR reaction with a mixture of primer sets that were designed to amplify specific gene. Here we report the susceptibility of enteropathogenic E. coli isolated from pigs in Korea using the DNA chip in detecting $\beta$-lactam antibiotic-resistant genes. (omitted)
The cells of Vibrio vulnificus can be induced to the viable but nonculturable (VBNC) state by natural environmental parameters. The V. vulnificus cells in the VBNC state can not be recovered by ordinary laboratory techniques. This nonculturability could often hamper development of effective processing strategies to minimize the number of V. vulnificus in seafoods. Even with V. vulnificus cells in a culturable state, the length of time required to identify the bacteria in contaminated food by phenotyphic characterization may prevent appropriate in-time responses by public health agencies to infections of the bacteria. In the present study, we used polymerase chain reaction (PCR) to develop a rapid and direct detection method for V. vulnificus in small octopus (Octopus variabilis) which is consumed as a raw food in Korea. The region targeted was a 704-base pair (bp) portion of the hemolysin gene, vvhA, of V. vulnificus. The primers designed for PCR amplification were specific for all V. vulnificus sp. tested. Several methods were examined to extract total DNA directly from V. vulnificus seeded into the octopus homogenate and the guanidine isothiocyanate (CITC) method appeared to be most effective. From the octopus homogenate seeded by V. vulnificus at an initial level of $10^2$ CFU/ml of the homogenate and then incubated for 12 h, the targeted sequence was successfully amplified by PCR and the 704-bp DNA fragment was observed by gel electrophoresis. The total completion of this assay requires less than one day.
Park, Dae Keun;Kim, Soohyun;Yun, Kum-Hee;Pyo, Hanna;Kang, Aeyeon;Kim, Daehee;Lee, Cho Yeon;Yun, Wan Soo
Proceedings of the Korean Vacuum Society Conference
/
2016.02a
/
pp.353.2-353.2
/
2016
We studied electrochemical detection of Botulinum neurotoxin, Vaccinia virus, and Streptococcus Pneumoniae based on nanogap device. Target bio substances were employed as representative targets of protein, virus, and bacteria, respectively. Redox current generated by ferri/ferrocyanide as an electroactive probe was enhanced according to gap distance which was controlled by surface-catalyzed chemical deposition. We found that enhanced electrochemical signal leads more sensitive signal changes according to selective interaction of target and its complementary elements on the electrode or gap area. In case of Botulinum neurotoxin, the redox signal showed a time-dependent increase due to cleavage of the immobilized peptide which blocked redox cycling. Redox cycling was also hindered by Vaccinia virus and Streptococcus Pneumoniae which were selectively immobilized in the gap area.
The use of the polymerase chain reaction (PCR) method was described using two sets of primers based on the ceuN gene (JEJ 1 and JEJ 2) which encodes a protein involved in siderophore transport and 16S rRNA gene (pA and pB) for the sensitive and specific detection of enteropathogen Campylobacter jejuni. Six oligonucleotides were utilized in an amplification experiment and PCR products of predicted sizes were generated from whole cells and boiled cell lysates at the same intensity. Two sets of the primer pairs, JEJ and pAB, were specific enough for all C. jejuni strains tested for the direct use of whole cells without DNA extraction or lysis steps. In the PCR using the pAB primer pair, the detection limit, as determined by the ethidium bromide staining of the amplification products on agarose gels, was at the level of $10^1$ bacteria cells or less in both the pure culture and artificially inoculated milk and chicken enrichment samples, whereas the detection limit with the JEJ primer pair was relatively low, i.e. $10^3$ cells or more in the same PCR samples. The PCR method using either a primer JEJ or pAB was both repeatable and specific for the detection of C. jejuni in food. This method is simply completed within 4 h.
Kim, Ki-Yeon;Lee, Chang-Rae;Kim, Chi-Nyon;Won, Jong Uk;No, Jaehoon
Journal of Korean Society of Occupational and Environmental Hygiene
/
v.16
no.2
/
pp.101-109
/
2006
The objective of this study is to provide fundamental data for pertinent management of indoor air quality through investigating the size-based characteristics of bioaerosol distributed in the general hospital. Measurement sites are main lobby, ICU, ward and laboratory and total five times were sampled with six-stage cascade impactor. Based on the result of this study, concentrations of airborne bacteria and fungi were the highest in main lobby as followed by an order of ward, ICU and laboratory. Concentrations of airborne bacteria was generally higher than those of airborne fungi and the ratio of indoor and outdoor concentration of both exceeded 1.0 in all the measurement sites of the general hospital. The predominant genera of airborne bacteria identified in the general hospital were Staphylococcus spp.(50%), Micrococcus spp.(15-20%), Corynebacterium spp.(5-20%), and Bacillus spp.(5-15%). On the other hand, the predominant genera of airborne fungi identified in the general hospital were Cladosporium spp.(30%), Penicillium spp.(20-25%), Aspergillus spp.(15-20%), and Alternaria spp.(10-20%). In regard to size distribution of bioaerosol, the detection rate was generally highest on 5 stage($1.1-2.1{\mu}m$) for airborne bacteria and on 1 stage(>$7.0{\mu}m$) for airborne fungi. Cleanliness of facilities in the general hospital and condition of HVAC system should be monitored regularly to prevent indoor air contamination by airborne microorganisms.
Objectives: To ensure the microbiological safety of groundwater, it was confirmed whether waterborne pathogenic bacteria in groundwater samples tested positive for total coliforms in the Chungcheongnam-do Province region. Methods: Total colony counts, total coliforms and fecal coliforms were tested according to the process mandated by the drinking water quality testing standards of Korea. DNA was extracted from the samples, tested positive for total coliforms, and then subjected to real-time PCR to detect waterborne pathogenic bacteria. Results: A total of 115 samples were inadequate for drinking water. Thirty-one cases (27%) showed positive for fecal coliforms and nine cases (7.8%) showed total colony counts exceeding drinking water standards. Twenty-seven cases (23.5%) showed three items (total colony counts, total coliforms and fecal coliforms). Using the real-time PCR method, waterborne pathogens were detected in 57 cases (49.6%) in 115 samples. Seventy-eight cases of waterborne pathogenic bacteria were detected (including duplications): 27 cases of pathogenic E. coli (EPEC (19), ETEC (5), EHEC (1), EAEC (1) and EIEC (1)); 45 of Bacillus cereus; two of Yersinia spp.; two of Salmonella spp.; one of Staphylococcus aureus; one of Clostridium perfringens. Conclusion: The real-time PCR method can offer rapid and accurate detection of waterborne pathogenic bacteria. Therefore, this assay could be an alternative to conventional culture methods and can further ensure the microbiological safety of groundwater.
본 웹사이트에 게시된 이메일 주소가 전자우편 수집 프로그램이나
그 밖의 기술적 장치를 이용하여 무단으로 수집되는 것을 거부하며,
이를 위반시 정보통신망법에 의해 형사 처벌됨을 유념하시기 바랍니다.
[게시일 2004년 10월 1일]
이용약관
제 1 장 총칙
제 1 조 (목적)
이 이용약관은 KoreaScience 홈페이지(이하 “당 사이트”)에서 제공하는 인터넷 서비스(이하 '서비스')의 가입조건 및 이용에 관한 제반 사항과 기타 필요한 사항을 구체적으로 규정함을 목적으로 합니다.
제 2 조 (용어의 정의)
① "이용자"라 함은 당 사이트에 접속하여 이 약관에 따라 당 사이트가 제공하는 서비스를 받는 회원 및 비회원을
말합니다.
② "회원"이라 함은 서비스를 이용하기 위하여 당 사이트에 개인정보를 제공하여 아이디(ID)와 비밀번호를 부여
받은 자를 말합니다.
③ "회원 아이디(ID)"라 함은 회원의 식별 및 서비스 이용을 위하여 자신이 선정한 문자 및 숫자의 조합을
말합니다.
④ "비밀번호(패스워드)"라 함은 회원이 자신의 비밀보호를 위하여 선정한 문자 및 숫자의 조합을 말합니다.
제 3 조 (이용약관의 효력 및 변경)
① 이 약관은 당 사이트에 게시하거나 기타의 방법으로 회원에게 공지함으로써 효력이 발생합니다.
② 당 사이트는 이 약관을 개정할 경우에 적용일자 및 개정사유를 명시하여 현행 약관과 함께 당 사이트의
초기화면에 그 적용일자 7일 이전부터 적용일자 전일까지 공지합니다. 다만, 회원에게 불리하게 약관내용을
변경하는 경우에는 최소한 30일 이상의 사전 유예기간을 두고 공지합니다. 이 경우 당 사이트는 개정 전
내용과 개정 후 내용을 명확하게 비교하여 이용자가 알기 쉽도록 표시합니다.
제 4 조(약관 외 준칙)
① 이 약관은 당 사이트가 제공하는 서비스에 관한 이용안내와 함께 적용됩니다.
② 이 약관에 명시되지 아니한 사항은 관계법령의 규정이 적용됩니다.
제 2 장 이용계약의 체결
제 5 조 (이용계약의 성립 등)
① 이용계약은 이용고객이 당 사이트가 정한 약관에 「동의합니다」를 선택하고, 당 사이트가 정한
온라인신청양식을 작성하여 서비스 이용을 신청한 후, 당 사이트가 이를 승낙함으로써 성립합니다.
② 제1항의 승낙은 당 사이트가 제공하는 과학기술정보검색, 맞춤정보, 서지정보 등 다른 서비스의 이용승낙을
포함합니다.
제 6 조 (회원가입)
서비스를 이용하고자 하는 고객은 당 사이트에서 정한 회원가입양식에 개인정보를 기재하여 가입을 하여야 합니다.
제 7 조 (개인정보의 보호 및 사용)
당 사이트는 관계법령이 정하는 바에 따라 회원 등록정보를 포함한 회원의 개인정보를 보호하기 위해 노력합니다. 회원 개인정보의 보호 및 사용에 대해서는 관련법령 및 당 사이트의 개인정보 보호정책이 적용됩니다.
제 8 조 (이용 신청의 승낙과 제한)
① 당 사이트는 제6조의 규정에 의한 이용신청고객에 대하여 서비스 이용을 승낙합니다.
② 당 사이트는 아래사항에 해당하는 경우에 대해서 승낙하지 아니 합니다.
- 이용계약 신청서의 내용을 허위로 기재한 경우
- 기타 규정한 제반사항을 위반하며 신청하는 경우
제 9 조 (회원 ID 부여 및 변경 등)
① 당 사이트는 이용고객에 대하여 약관에 정하는 바에 따라 자신이 선정한 회원 ID를 부여합니다.
② 회원 ID는 원칙적으로 변경이 불가하며 부득이한 사유로 인하여 변경 하고자 하는 경우에는 해당 ID를
해지하고 재가입해야 합니다.
③ 기타 회원 개인정보 관리 및 변경 등에 관한 사항은 서비스별 안내에 정하는 바에 의합니다.
제 3 장 계약 당사자의 의무
제 10 조 (KISTI의 의무)
① 당 사이트는 이용고객이 희망한 서비스 제공 개시일에 특별한 사정이 없는 한 서비스를 이용할 수 있도록
하여야 합니다.
② 당 사이트는 개인정보 보호를 위해 보안시스템을 구축하며 개인정보 보호정책을 공시하고 준수합니다.
③ 당 사이트는 회원으로부터 제기되는 의견이나 불만이 정당하다고 객관적으로 인정될 경우에는 적절한 절차를
거쳐 즉시 처리하여야 합니다. 다만, 즉시 처리가 곤란한 경우는 회원에게 그 사유와 처리일정을 통보하여야
합니다.
제 11 조 (회원의 의무)
① 이용자는 회원가입 신청 또는 회원정보 변경 시 실명으로 모든 사항을 사실에 근거하여 작성하여야 하며,
허위 또는 타인의 정보를 등록할 경우 일체의 권리를 주장할 수 없습니다.
② 당 사이트가 관계법령 및 개인정보 보호정책에 의거하여 그 책임을 지는 경우를 제외하고 회원에게 부여된
ID의 비밀번호 관리소홀, 부정사용에 의하여 발생하는 모든 결과에 대한 책임은 회원에게 있습니다.
③ 회원은 당 사이트 및 제 3자의 지적 재산권을 침해해서는 안 됩니다.
제 4 장 서비스의 이용
제 12 조 (서비스 이용 시간)
① 서비스 이용은 당 사이트의 업무상 또는 기술상 특별한 지장이 없는 한 연중무휴, 1일 24시간 운영을
원칙으로 합니다. 단, 당 사이트는 시스템 정기점검, 증설 및 교체를 위해 당 사이트가 정한 날이나 시간에
서비스를 일시 중단할 수 있으며, 예정되어 있는 작업으로 인한 서비스 일시중단은 당 사이트 홈페이지를
통해 사전에 공지합니다.
② 당 사이트는 서비스를 특정범위로 분할하여 각 범위별로 이용가능시간을 별도로 지정할 수 있습니다. 다만
이 경우 그 내용을 공지합니다.
제 13 조 (홈페이지 저작권)
① NDSL에서 제공하는 모든 저작물의 저작권은 원저작자에게 있으며, KISTI는 복제/배포/전송권을 확보하고
있습니다.
② NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 상업적 및 기타 영리목적으로 복제/배포/전송할 경우 사전에 KISTI의 허락을
받아야 합니다.
③ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 보도, 비평, 교육, 연구 등을 위하여 정당한 범위 안에서 공정한 관행에
합치되게 인용할 수 있습니다.
④ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 무단 복제, 전송, 배포 기타 저작권법에 위반되는 방법으로 이용할 경우
저작권법 제136조에 따라 5년 이하의 징역 또는 5천만 원 이하의 벌금에 처해질 수 있습니다.
제 14 조 (유료서비스)
① 당 사이트 및 협력기관이 정한 유료서비스(원문복사 등)는 별도로 정해진 바에 따르며, 변경사항은 시행 전에
당 사이트 홈페이지를 통하여 회원에게 공지합니다.
② 유료서비스를 이용하려는 회원은 정해진 요금체계에 따라 요금을 납부해야 합니다.
제 5 장 계약 해지 및 이용 제한
제 15 조 (계약 해지)
회원이 이용계약을 해지하고자 하는 때에는 [가입해지] 메뉴를 이용해 직접 해지해야 합니다.
제 16 조 (서비스 이용제한)
① 당 사이트는 회원이 서비스 이용내용에 있어서 본 약관 제 11조 내용을 위반하거나, 다음 각 호에 해당하는
경우 서비스 이용을 제한할 수 있습니다.
- 2년 이상 서비스를 이용한 적이 없는 경우
- 기타 정상적인 서비스 운영에 방해가 될 경우
② 상기 이용제한 규정에 따라 서비스를 이용하는 회원에게 서비스 이용에 대하여 별도 공지 없이 서비스 이용의
일시정지, 이용계약 해지 할 수 있습니다.
제 17 조 (전자우편주소 수집 금지)
회원은 전자우편주소 추출기 등을 이용하여 전자우편주소를 수집 또는 제3자에게 제공할 수 없습니다.
제 6 장 손해배상 및 기타사항
제 18 조 (손해배상)
당 사이트는 무료로 제공되는 서비스와 관련하여 회원에게 어떠한 손해가 발생하더라도 당 사이트가 고의 또는 과실로 인한 손해발생을 제외하고는 이에 대하여 책임을 부담하지 아니합니다.
제 19 조 (관할 법원)
서비스 이용으로 발생한 분쟁에 대해 소송이 제기되는 경우 민사 소송법상의 관할 법원에 제기합니다.
[부 칙]
1. (시행일) 이 약관은 2016년 9월 5일부터 적용되며, 종전 약관은 본 약관으로 대체되며, 개정된 약관의 적용일 이전 가입자도 개정된 약관의 적용을 받습니다.