Rimal, Hemraj;Yu, Sang-Cheol;Jang, Jong Hwa;Oh, Tae-Jin
Journal of Microbiology and Biotechnology
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v.25
no.9
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pp.1417-1424
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2015
In this study, we tried to characterize Streptomyces peucetius CYP157C4 with homology modeling using three cytochrome P450 (CYP) structures (CYP157C1, CYP164A2, and CYP107L1), having discovered that CYP157C4 lacks the ExxR motif that was considered invariant in all CYPs. We used Discovery Studio 3.5 to build our model after first assessing the stereochemical quality and side-chain environment, and a 7-ethoxycoumarin substrate was docked into the final model. The model-substrate complex allowed us to identify functionally important residues and validate the active-site architecture. We found a distance of 4.56 Å between the 7-ethoxycoumarin and the active site of the heme, and cloning and an in vitro assay of the CYP157C4 showed the dealkylation of the substrate. Since the details regarding this group of CYP structures are still unknown, the findings of this study may provide elucidation to assist with future efforts to find a legitimate substrate.
V2O5/TiO2-ZrO2 catalyst modified with V2O5 was prepared by adding Ti(OH)4-Zr(OH)4 powder into an aqueous solution of ammonium metavanadate followed by drying and calcining at high temperatures. The characterization of prepared catalysts was performed using XRD, DSC, solid-state 51V NMR, and FTIR. In the case of calcination temperature of 500 oC, for the catalysts containing low loading V2O5 below 25 wt % vanadium oxide was in a highly dispersed state, while for catalysts containing high loading V2O5 equal to or above 25 wt % vanadium oxide was well crystallized due to the V2O5 loading exceeding the formation of monolayer on the surface of TiO2-ZrO2. The strong acid sites were formed through the bonding between dispersed V2O5 and TiO2-ZrO2. The larger the dispersed V2O5 amount, the higher both the acidity and catalytic activities for acid catalysis.
Glucoraphanin is the main glucosinolate found in broccoli and other cruciferous vegetables (Brassicaceae). The objective of the study was to evaluate whether glucoraphanin and its breakdown product sulforaphane, are potent modulators of various phase I and phase II enzymes involved in carcinogen-metabolising enzyme systems in vitro. The glucosinolate glucoraphanin was isolated from cruciferous vegetables and exposed to human hepatoma cell line HepG2 at various concentrations (0-25 ${\mu}M$) for 24 hours. Glucoraphanin at higher concentration (25 ${\mu}M$) decreased dealkylation of methoxyresorufin, a marker for cytochrome P4501 activity; supplementation of the incubation medium with myrosinase (0.018 U), the enzyme that converts glucosinolate to its corresponding isothiocyanate, showed minimal induction in this enzyme activity at concentration 10 ${\mu}M$. Quinone reductase and glutathione S-transferase activities were unaffected by this glucosinolate; however, supplementation of the incubation medium with myrosinase elevated quinone reductase activity. It may be inferred that the breakdown product of glucoraphanin, in this case sulforaphane, is superior than its precursor in modulating carcinogen-metabolising enzyme systems in vitro and this is likely to impact on the chemopreventive activity linked to cruciferous vegetable consumption.
Yoon, Jee-Hee;Seo, Mi-Sook;Kim, Young-Mee;Kim, Sung-Jin;Yoon, Sung-Ho;Jang, Ho G.;Nam, Won-Woo
Bulletin of the Korean Chemical Society
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v.30
no.3
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pp.679-682
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2009
Utilizing a planar five coordinating N3S2 ligand, 2,6-bis(2-methylthiophenyliminomethyl)pyridine, a pseudo 7-coordinated manganese(II) complex with two labile triflate anions in the axial positions was synthesized. The reaction of the manganese(II) complex with an oxidant, iodosylbenzene, produced a metastable high-valent manganese(IV)-oxo species at 0 ${^{\circ}C}$. The high-valent Mn(IV)-oxo intermediate was characterized with a UV-vis spectrophotometer and an electrospray ionization mass spectroscopy. Reactivity studies of the Mn(IV)=O species revealed that the intermediate is capable of oxygenating $PPh_3$ and N-dealkylating N,N-dimethyl-toludine.
NiO supported on zirconia modified with $MoO_3$ for acid catalysis was prepared by drying powdered $Ni(OH)_2-Zr(OH)_4$ with ammonium heptamolybdate aqueous solution, followed by calcining in air at high temperature. The characterization of prepared catalysts was performed using FTIR, Raman, XRD, and DSC. $MoO_3$ equal to or less than 15 wt% was dispersed on the surface of catalyst as two-dimensional polymolybdate or monomolybdate, while for $MoO_3$ above 15 wt%, crystalline orthorhombic phase of $MoO_3$ was formed, showing that the critical dispersion capacity of $MoO_3$ on the surface of catalyst is 0.18 g/g NiO-$ZrO_2$ on the basis of XRD analysis. Acidity and catalytic activities for acid catalysis increased with the amount of dispersed $MoO_3$. The high acid strength and acidity was responsible for the Mo=O bond nature of the complex formed by the interaction between $MoO_3$ and $ZrO_2$. The catalytic activity for acid catalysis was correlated with the acidity of the catalysts measured by the ammonia chemisorption method.
The modulation of cytochrome P450(P450) activities and glutathione S-transferase (GST) was investigated after i.p. administration of glucose-diethyldithiocarbamate (Glu-DDTC) to rats. P450 1 A2 and 2El activities were inhibited by 60% 4 hr after the administration of 200 mg Glu-DDTC/kg and those activities were recovered to original levels 24 hr after dosing. In contrast, GST activities were enhanced up to 24 hr after dosing. These results seem to be due to the bifunctional activity of Glu-DDTC. Glu-DDTC acts as an inhibitor of P450 enzymes as well as inducer of GST enzyme. Glu-DDTC inhibited PNP hydroxylation (P450 2El) and ethoxycoumarin O-deethylation (P450 1A2) in a dose-dependent manner up to 200 mg/kg wherease it did not affect testosterone 6$\beta$-hydroxylation (P450 3A) and pentoxyresorufin O-dealkylation (P450 2B) activities. Induction of GST activity toward 1-chloro-2,4-dinitrobenzene (CDNB) and 1,2-dichloro-4-nitrobenzenen (DCNB) was dependent on the dose of Glu-DDTC and no species difference in the GST induction was seen between rat and mouse. Amoung GST subunits, Ya, Yb1 and partially Yb2 were induced by Glu-DDTC as conjugated by western blotting. The levels Yp, Yk and Yc subunits were not affected by Glu-DDTC treatment. Therefore the enhanced activity of GST toward CDNB and DCNB might be due to the induction of Ya, Ybl and partially Yb2 subunits. In conclusion, Glu-DDTC selectively inhibited P45O 1A2 and P450 2El activities whereas it enhanced Ya, Ybl subunits and partially Yb2 subunits of GST and the antimutagenic activity of this compound might be attributed from the modulation of these enzyme activities in animals.
Kim, Kyoung-Ah;Park, Ji-Young;Lee, Ji-Suk;Lim, Sabina
Archives of Pharmacal Research
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v.26
no.8
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pp.631-637
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2003
Chloroquine has been used for many decades in the prophylaxis and treatment of malaria. It is metabolized in humans through the N-dealkylation pathway, to desethylchloroquine (DCQ) and bisdesethylchloroquine (BDCQ), by cytochrome P450 (CYP). However, until recently, no data are available on the metabolic pathway of chloroquine. Therefore, the metabolic pathway of chloroquine was evaluated using human liver microsomes and cDNA-expressed CYPs. Chloroquine is mainly metabolized to DCQ, and its Eadie-Hofstee plots were biphasic, indicating the involvement of multiple enzymes, with apparent $K_m and V_{max}$ values of 0.21 mM and 1.02 nmol/min/mg protein 3.43 mM and 10.47 nmol/min/mg protein for high and low affinity components, respectively. Of the cDNA-expressing CYPs examined, CYP1A2, 2C8, 2C19, 2D6 and 3A4/5 exhibited significant DCQ formation. A study using chemical inhibitors showed only quercetin (a CYP2C8 inhibitor) and ketoconazole (a CYP3A4/5 inhibitor) inhibited the DCQ formation. In addition, the DCQ formation significantly correlated with the CYP3A4/5-catalyzed midazolam 1-hydroxylation (r=0.868) and CYP2C8-catalyzed paclitaxel 6$\alpha$-hydroxylation (r = 0.900). In conclusion, the results of the present study demonstrated that CYP2C8 and CYP3A4/5 are the major enzymes responsible for the chloroquine N-deethylation to DCQ in human liver microsomes.
Background: Cytochrome P450 enzymes catalyze a wide range of reactions in plant metabolism. Besides their physiological functions on primary and secondary metabolites, P450s are also involved in herbicide detoxification via hydroxylation or dealkylation. Ginseng as a perennial plant offers more sustainable solutions to herbicide resistance. Methods: Tissue-specific gene expression and differentially modulated transcripts were monitored by quantitative real-time polymerase chain reaction. As a tool to evaluate the function of PgCYP736A12, the 35S promoter was used to overexpress the gene in Arabidopsis. Protein localization was visualized using confocal microscopy by tagging the fluorescent protein. Tolerance to herbicides was analyzed by growing seeds and seedlings on Murashige and Skoog medium containing chlorotoluron. Results: The expression of PgCYP736A12 was three-fold more in leaves compared with other tissues from two-year-old ginseng plants. Transcript levels were similarly upregulated by treatment with abscisic acid, hydrogen peroxide, and NaCl, the highest being with salicylic acid. Jasmonic acid treatment did not alter the mRNA levels of PgCYP736A12. Transgenic lines displayed slightly reduced plant height and were able to tolerate the herbicide chlorotoluron. Reduced stem elongation might be correlated with increased expression of genes involved in bioconversion of gibberellin to inactive forms. PgCYP736A12 protein localized to the cytoplasm and nucleus. Conclusion: PgCYP736A12 does not respond to the well-known secondary metabolite elicitor jasmonic acid, which suggests that it may not function in ginsenoside biosynthesis. Heterologous overexpression of PgCYP736A12 reveals that this gene is actually involved in herbicide metabolism.
Journal of Environmental Analysis, Health and Toxicology
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v.21
no.4
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pp.243-251
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2018
Pharmaceuticals in wastewater effluents have been recognized as emerging pollutants threatening freshwater organisms. To extend understanding for bioaccumulation and toxicity in those organisms, information on biotransformation products (or metabolites) and their metabolic pathway are crucial. The aim of the present study is to identify and elucidate metabolites of pharmaceuticals formed in exposed organisms using suspect and nontarget screening approach using LC-HRMS. As the target pharmaceuticals, carbamazepine, ketoprofen, metoprolol, propranolol, and verapamil were selected whereas Daphnia magna and Gammarus pulex were used as test organisms. After 24h exposure, metabolites formed in the organisms were identified using LC-HRMS. The structures of metabolites were elucidated via analysis of MS/MS fragment pattern and the comparison with fragment database. As the results, a total of 10 metabolites were identified for 5 parent compounds (C253/C356 for carbamazepine, K211 for ketoprofen, M256 for metoprolol, P218/P276/P306 for propranolol, V196/V291/V441 for verapamil). Among them, the presence of C253 and V291 was confirmed using standard materials. Most of the identified metabolites were formed through oxidative reactions such as hydroxylation, N-demethylation, and dealkylation. Cysteine conjugation (phase II reaction) metabolite (C356) for carbamazepine was found in daphnia. The metabolic pathway of verapamil showed similar metabolic pathways and metabolic pathways for both species. Although the toxicological information on the identified metabolites could not be confirmed, the molecular structure information of the proposed metabolites can be used for future evaluation and prediction of toxicity.
Metolachlor may pose a threat to surface and ground water qualities due to its high solubility in water, Zerovalent iron (ZVI) releases $e^-$ which can degrade the organochlorinated compounds. The objective of this research was to evaluate the kinetics of metolachlor degradation as affected by ZVI sources [Peerless unannealed (PU) and Peerless annealed (PA)] and ZVI levels (1 and 5%) under batch conditions at different metolachlor concentrations (200 and 1000 mg/l) and temperatures (15, 25, and $35^{\circ}C$). The effectiveness of ZVI on metolachlor degradation was assessed by characterizing the dechlorinated metolachlor byproduct molecules. Metolachlor degradation by ZVI followed the first-ordered kinetics with a higher rate constant at higher level of ZVI treatment. At 5% (w/v) of PU and PA treatment, the half-lives of metolachlor degradation were 9.93 and 6.51 h and all of the initial metolachlor were degraded in 72 and 48 h, respectively. Rate constants (k) of metolachlor degradation were higher at the lower initial metolachlor concentration. The metolachlor degradation by ZVI was temperature dependent showing that the rate constant (k) at 15, 25, and $35^{\circ}C$ were 0.0805, 0.1017, and 0.3116 /h, respectively. The ZVI-mediated metolachlor degradation yielded two byproduct molecules identified as dechlorinated metolachlor $(C_{13}H_{18}NO)$ and dechlorinated-dealkylated metolachlor $(C_{12}H_{17}NO)$. The PA ZVI was more effective than PU ZVI in metolachlor degradation.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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