WebChemDB is an integrated chemical database retrieval system that provides access to over 8 million publicly available chemical structures, including related information on their biological activities and direct links to other public chemical resources, such as PubChem, ChEBI, and DrugBank. The data are publicly available over the web, using two-dimensional (2D) and three-dimensional (3D) structure retrieval systems with various filters and molecular descriptors. The web services API also provides researchers with functionalities to programmatically manipulate, search, and analyze the data.
본 논문은 유통정보 네트워크 활성화 방안에 대하여 효율적인 NDB(Network Data Base)을 설계하였다. NDB(Network Data Base)의 구조는 논리 구조, 격납 구조, 물리 구조로 형성되어 데이터는 하나의 레코드로서 표현되고 데이터들 간의 관계는 링크로서 표현되었다. 또한 데이터베이스의 논리적 구조를 표현한 자료 구조도(Data Structure Diagram:DSD)가 계층 모델로 나타내었다. 각 노드는 레코드 타입을 나타내었고, 타입들을 연결하는 방향을 지닌 링크, 논리적인 격납 형태로 구성되어 데이터베이스를 설계하는데 물리 매체상 서로 연관성 있게 설계되어 자료의 검색과 억세스 효율에 큰 영향을 미쳤다. 또한 설계된 시스템에 네트워크를 형성하고, 네트워크 표준화를 위해 OSI 환경하에서 POS(Point Of Sale)시스템을 이용하여 효율적인 유통 정보 네트워크를 활성화시켰다.
본 연구는 한국학 연구 논문 텍스트의 의미 구조를 기반으로 하는 메타데이터를 적용한 학술정보시스템을 구축하여 기존 유사 시스템과의 비교를 통해, 텍스트 구조 기반 메타데이터의 활용 가능성을 확인해 보고자 하는 것을 목적으로 한다. 이를 위해 한국학술지인용색인(Korea Citation Index, KCI)에서 일정 기준을 충족하는 한국학 분야 연구 논문 데이터를 대상으로 의미 구조 메타데이터 항목을 적용한 시범적 검색 시스템(Korean Studies Metadata Database, KMD)을 구축하였으며, 동일한 검색 키워드를 적용하여 기존의 KCI 시스템과 비교했을 때 어떤 특징과 차이점을 갖는지 비교해 보았다. 연구 결과, KMD 시스템이 KCI에 비해 이용자의 검색 의도에 맞는 결과를 보다 효율적으로 보여주는 것으로 확인되었다. 즉 검색하고자 하는 키워드의 조합이나 조건식이 기존 시스템과 동일하더라도 검색 결과를 통해 최종적으로 연구 진행과 관련해 찾고자 하는 연구 목적, 연구의 대상 데이터나 시공간적 배경 등에 따른 검색 결과를 다양하게 보여줄 수 있는 것으로 나타났다.
인터넷을 구성하는 논리적인 도메인들의 규모가 확대됨에 따라 개체들간 보안 정책 협상이 복잡해지고 다양한 특성을 갖는 각 도메인들의 구성요소와 환경 등의 요인으로 각 시스템에 대한 보안 정책 설정 및 제어가 어려운 문제로 등장하고 있다. 이 논문에서는 이러한 현실적인 문제점을 해결하기 위해 대상 네트워크를 계층적 구조 구성한 후 그결과를 바탕으로 안전한 통신을 위한 보안 정책을 적용하기 위한 데이터베이스 스키마를 설계한다. 계층적 구조에서 서로 다른 도메인간에 보안정책은 보안정책 데이터 구조를 이용하여 효율적으로 데이터를 관리하고 보안정책 메커니즘을 이용하여 안전한 통신을 가능하게 한다.
Emerging modem database applications require multi-dimensional index structures to provide high performance for data retrieval. In order for a multi-dimensional index structure to be integrated into a commercial database system, efficient techniques that provide transactional access to data through this index structure are necessary. The techniques must support all degrees of isolation offered by the database system. Especially degree 3 isolation, called "no phantom read," protects search ranges from concurrent insertions and the rollbacks of deletions. In this paper, we propose a new phantom protection method for multi-dimensional index structures that uses a multi-level grid technique. The proposed mechanism is independent of the type of the multi-dimensional index structure, i.e., it can be applied to all types of index structures such as tree-based, file-based, and hash-based index structures. In addition, it has a low development cost and achieves high concurrency with a low lock overhead. It is shown through various experiments that the proposed method outperforms existing phantom protection methods for multi-dimensional index structures.
그리드 데이터베이스는 그리드 컴퓨팅 환경에서 분산된 데이터의 효율적 처리와 사용을 위한 데이터 베이스 관리 시스템이다. 공간 데이터는 일반적인 데이터에 비해 지역적 특성에 따른 이용도가 높으며, 대용량의 저장 공간을 필요로 하는 특징을 포함한다. 그리드 데이터베이스는 이러한 공간 데이터의 관리를 위한 최적의 시스템으로 적용 가능하다. 그러나, 기존의 분산 데이터베이스 시스템과는 달리 지역적 자율성을 보장하기 때문에 단일 관리자에 대한 적용이 불가능하거나 비효율적인 시스템 구성이 이루어질 가능성이 있다. 또한 동적으로 변화되는 환경에 유동적인 대응을 위해서는 효율적인 재조직 연산이 필요하다. 본 논문에서는 그리드 데이터베이스에서 계층 구조를 이용한 동적 재조직 기법을 제안한다. 제안 기법은 재조직 수행 시 데이터베이스들의 정보를 논리적으로 취합하는 오가나이저를 생성한다. 또한, 오가나이저를 계층적 구조로 구성을 함으로써 단계적인 정보 전파 및 재조직 연산 수행을 지원하게 된다. 이를 통해 지역적인 재조직 연산의 지원 및 효율적 균형 조정이 가능해진다. 부가적으로 불필요한 재조직 연산의 제거가 가능하다. 성능평가를 통해 제안 기법이 재조직 수행 후에 전체적인 처리량을 향상시킴을 보인다.
한국전자거래학회 2001년도 International Conference CALS/EC KOREA
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pp.591-596
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2001
To deliver new products to market in a due time, companies often develop their products with numerous partners distributed around the world. Internet technologies can provide a cheap and efficient basis of collaborative product development among distributed partners. This paper provides a framework and its product database model that can support consistent product data during collaborative product development. This framework consists of four components for representing consistent product structure: the product configuration, assembly structure, multiple representations and engineering changes. A product database model realizing the framework is designed and implemented as a system that supports collaborative works in the areas of product design and technical publication. The system enables participating designers and technical publishers to complete their tasks with shared and consistent product data. It also manages the propagation of engineering changes among different representations for individual participants. The Web technologies introduced in this system enable participants to easily access and operate shared product data in a standardized and distributed computing environment.
In the computational molecular analysis, 3D structural comparison for protein searching plays a very important role. As protein databases have been grown rapidly in size, exhaustive search methods cannot provide satisfactory performance. Because exhaustive search methods try to handle the structure of protein by using sphere set which is converted from atoms set, the similarity calculation about two sphere sets is very expensive. Instead, the filter-and-refine paradigm offers an efficient alternative to database search without compromising the accuracy of the answers. In recent, a very fast algorithm based on the inter-atomic distance has been suggested by Ballester and Richard. Since they adopted the moments of distribution with inter-atomic distance between atoms which are rotational invariant, they can eliminate the structure alignment and orientation fix process and perform the searching faster than previous methods. In this paper, we propose a new 3D shape descriptor. It has properties of the general shape distribution and useful property in screening the molecular database. We show some experimental results for the validity of our method.
최근에 기존의 2차원적인 지리정보시스템에 시간차원을 포함하는 다차원 지리정보 데이터를 저장하기 위한 연구가 진행되고 있지만 대부분이 실제 구현에는 적용하기 어려운 개념적인 데이터모델의 설계단계에 머물고 있다. 본 논문에서는 기존 모델들의 문제점인 데이터 중복을 최소로 하고, 시간을 포함하는 질의에 대한 연산을 빠르게 수행할 수 있는 저장 기법인 MBNF기법을 설계하고, 데이터의 시간적 특성을 고려해서 과거 데이터베이스와 현재 데이터베이스에 분리하여 저장하는 분리된 저장구조를 설계하며, 분리된 데이터베이스간의 데이터 이동 알고리즘과 시간을 포함하는 질의를 효율적으로 수행하기 위한 검색 알고리즘을 설계한다.
Recently, database technologies have been used commonly. But, ordinary technologies aren't suitable to construct a complicated database such as a classical literature database or an archaeological relic's database. Because this kinds of data are semi-structured data that doesn't have regular structures, database schema can't be defined before databases. We have proposed DREAM model for semi-structured databases. In this model, a database consists of five elements and the model has operations similar to operation of set theory. And further we have introduced dynamic schema "shape" showing structure of each element. We have already realized a prototype of DBMS adopting DREAM model (DREAM DBMS) and constructing function of shapes. However, shape is imperfect to describe database structures because it can't explain nested structures of elements. In this paper, we will profuse a "shape graph"that is dynamic schema showing database structures more exactly and extend the DREAM DBMS. Further we will evaluate the performance of constructing function of shapes and shape graphs.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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