• 대한약학회:학술대회논문집
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• 대한약학회 2002년도 Proceedings of the Convention of the Pharmaceutical Society of Korea Vol.2
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• pp.331.3-332
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• 2002

A novel penicillin G acylase (PGA)-producing bacterial strain was isolated from soil by using the Serratia marcescens overlay technique. The isolated strain was identified as Leclercia adecarboxylata based on the analyses of the biochemical characteristics (API 20E). the cellular fatty acid profile. and the 16S rDNA sequences. The gene encoding the PGA (pac gene) was cloned into the pHSG399 vector and the recombinant E. coliHB101 clones harboring the pac gene were isolated on agar plates containing phenylacetyl-L -leucine and penicillin G. (omitted)

• IMMUNE NETWORK
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• 제5권3호
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• pp.144-149
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• 2005

Background: Fc receptor-mediated phagocytosis is a complex process involving the activation of kinases and phosphatases. FcgammaRIIB has been known to transduces inhibitory signals through an immunoreceptor tyrosine-based inhibitory motif (ITIM) in cytoplasmic domains. In this study, we examined the involvement of inositol-phosphatase in the Fc receptor-mediated phagocytosis. Methods: J774 cells were infected using vaccinia viral vector containing SH2 domain-containing inositol-phosphatase (SHIP) cDNA and stimulated with the sensitized sheep red blood cells. Results: Stimulation of J774 cells induced the tyrosine phosphorylation of SHIP which was maximal at 5 minutes. Phosphatidylinositol-3 (PI-3) kinase inhibitor (wortmannin) inhibits J774 cell phagocytosis of sensitized sheep red blood cells in a dose-dependent manner. Heterologious expression of SHIP in J774 cells inhibits phagocytosis of sensitized sheep red blood cells in a dose-dependency manner, but catalytically dead mutants of SHIP has no effect on phagocytosis. Conclusion: These results strongly suggest that the active signals mediated by PI-3 kinase are opposed by inhibitory signals through SHIP in the regulation of Fc receptor-mediated phagocytosis.

• 한국미생물학회:학술대회논문집
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• 한국미생물학회 2002년도 추계학술대회
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• pp.109-115
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• 2002

Gene therapy is to treat and cure diseases by an introduction of therapeutic genes in defective cells or tissues of human body. Gene delivery system, gene expression system, and therapeutic gene are three core elements for gene therapy. The efficient delivery of therapeutic genes and appropriate gene expression are the crucial issues for therapeutic outcome of gene delivery. Because it can be used in common for the treatment and cure of various diseases, gene delivery system is the most important core element for a successful gene therapy. Viruses are naturally evolved to transfer their genomes into host cells efficiently. This ability has made vectorologists exploit viruses as attractive vehicles for the delivery of therapeutic genes. Viral vectors based on adenovirus (Ad) and adeno-associated virus (AAV) have been often used for gene delivery in laboratory. Ad and AAV vectors derived from human DNA viruses differ greatly in their life cycle, expression level and duration of transgenes, immunogenicity, and vector preparation. Both vectors can be used as effective tools for gene therapy and more recently in functional genomics. Here, the characteristics of Ad and AAV vectors are discussed.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제15권2호
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• pp.451-454
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• 2005

Introduction of foreign genes into brain cells, such as neurons and astrocytes, is a powerful approach to study the gene function and regulation in the neuroscience field. Calcium phosphate precipitates have been shown to cause cytotoxicity in some mammalian cells and brain cells, thus leading to low transfection efficiency. Here, we describe a retrovirus-mediated gene delivery method to transduce foreign genes into brain cells. In an attempt to achieve higher gene delivery efficiency in these cells, we made several changes to the original method, including (1) use of a new packaging cell line, Phoenix ampho cells, (2) transfection of pMX retroviral DNA, (3) inclusion of 25 mM chloroquine in the transduction, and (4) 3- 5 h incubation of retroviruses with target cells. The results showed that the modified protocol resulted in a range of 40- 60% gene delivery efficiency in neurons and astrocytes. Furthermore, these results suggest the potential of the retrovirus-mediated gene delivery protocol being modified and adapted for other transfection-refractory cell lines and primary cells.

• Biotechnology and Bioprocess Engineering:BBE
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• 제5권5호
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• pp.327-331
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• 2000

The application of LFH-PCR(long flanking homology region-PCR) for Bacillus subtilis gene disruption is presented. Without plasmid- or phage-vector construction, only by PCR, based on a DNA sequence retrieved from B. subtilis genome data base, kanamycin resistance gene was inserted into two genes of B. subtilis involved in sporulation, spoIIIE and spoIIIG. The effect of gene disruption on subtilisin expression was examined and the sporulation frequency of two mutants was compared to that of the host strain. For this purpose, only 2 or 3 rounds of PCR were required with 4 primers. We first demonstrated the possibility of LFH-PCR for rapid gene disruption to characterize an unknown functional gene of B. subtilis or other prokaryote in the genomic era.

• 한국정보처리학회:학술대회논문집
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• 한국정보처리학회 2006년도 추계학술발표대회
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• pp.69-72
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• 2006

최근 생명 정보학 기술의 발달로 마이크로 단위의 실험조작이 가능해짐에 따라 하나의 chip상에서 전체 genome의 expression pattern을 관찰할 수 있게 되었고, 동시에 수 만개의 유전자들 간의 상호작용도 연구가능하게 되었다. 이처럼 DNA 마이크로어레이 기술은 복잡한 생물체를 이해하는 새로운 방향을 제시해주게 되었다. 따라서 이러한 기술을 통해 얻어진 대량의 유전자 정보들을 효과적으로 분석하는 방법이 시급하다. 본 논문에서는 마이크로어레이 실험에서 다양한 원인에 의해 발생하는 잡음(noise)을 줄이거나 제거하는 과정인 정규화과정을 거쳐 특징 추출방법인 SVM(Support Vector Machine) 방법을 이용하여 데이터를 2개의 클래스로 나누고, 표준화 방법들의 성능 비교를 위해 Adaptive Simulated Annealing 알고리즘으로 정확도를 평가하는 분류 시스템을 설계 구현하였다.

• Clinical and Experimental Pediatrics
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• 제64권7호
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• pp.328-338
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• 2021

Humanity has been suffering from the global severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 pandemic that began late in 2019. In 2020, for the first time in history, new vaccine platforms-including mRNA vaccines and viral vector-based DNA vaccines-have been given emergency use authorization, leading to mass vaccinations. The purpose of this article is to review the currently most widely used coronavirus disease 2019 vaccines, investigate their immunogenicity and efficacy data, and analyze the vaccine safety profiles that have been published, to date.

• 원예과학기술지
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• 제29권2호
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• pp.116-122
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• 2011

본 연구에서는 지리산에서 자생하는 한국 특산종인 노각나무(Stewartia koreana Nakai)의 EST library를 제작하고 서열을 분석하였다. 노각나무의 유엽을 재료로 cDNA library 만들었고 1,392개의 cDNA에 대한 부분 서열 분석을 진행하였다. EST와 unigene 서열의 분석은 컴퓨터를 기반으로한 filtering과 수작업 그리고 NCBI의 BLAST 분석을 통해 수행하였다. 벡터 서열과 100bp 이하의 서열을 제거한 후 1,301개의 EST를 분석하였다. 전체 150개의 contig와 743개의 singleton을 분리하여 총 893개의 unigene을 분리해냈으며 서열 분석을 통해 95개의 microsatellite를 확인하였다. NCBI 데이터베이스의 BLASTX로 상동성을 검색한 결과 EST의 65%는 기능을 알고 있는 유전자와 11.6%의 EST는 아직까지 기능이 보고되지 않은 유전자와 높은 상동성을 보였다. 남아 있는 23.2%의 EST는 기존에 데이터베이스에 보고된 유전자와 상동성을 보이지 않는 유전자로 밝혀졌다. 다양한 데이터베이스를 기반으로 한 유사성 기반 기능 분석은 노각나무의 EST가 포도나무와 포플러와 높은 유사성을 보인 것을 확인하였다. 기능에 따른 분류에 있어 molecular function은 nucleotide binding, biological process는 transport, cellular component는 plastid가 가장 높은 비율로 나왔다. 본 연구를 통해 얻어진 EST 자료는 노각나무의 새로운 유전자원에 대한 연구의 기본 자료로 유용하게 활용될 것이다.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제14권5호
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• pp.1052-1056
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• 2004

A secretion signal sequence-selection vector (pGS40) was constructed based on an $\alpha$-amylase gene lacking a secretion signal and employed for selecting secretion signals from Lactococcus lactis ssp. cremoris LM0230 chromosomal DNA. Six fragments were identified based on their ability to restore $\alpha$-amylase secretion in E. coli, and among these, a fragment, S405, conferred the highest secretion activity (84%) in E. coli. Meanwhile, S407, which conferred poor secretion activity in E. coli, was quite active in L. lactis. The results suggested that the efficiency of a secretion signal depended on the host. All six fragments had an open reading frame (ORF) fused to the reporter gene, and the potential Shine-Dalgamo (SD) sequence and putative promoter sequences were located upstream of the ORF. Deduced amino acid sequences from the six fragments did not show any homology with known secretion signals. However, they contained three distinguished structural features and cleavage sites, commonly found among typical secretion signals. The characterized secretion signals could be useful for the construction of food-grade secretion vectors and gene expression in LAB.

• Tuberculosis and Respiratory Diseases
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• 제44권6호
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• pp.1353-1365
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• 1997

연구배경 : 종양괴사인자(tumor necrosis factor ; TNF)는 다양한 생물학적 기능을 가지고 있는 바, 그 중 생체 외에서 증명된 뚜렷한 항암 효과로 말미암아 최근 항암 유전자요법의 중요한 대상으로 관심을 모으고 있다. 현재 유전자 이입의 기술적 문제로 생체 외에서 암세포에 유전자 이입을 시행한 후 이를 다시 환자의 생체내로 이식하는 방법이 연구의 주종을 이루고 있다. 그러나 저자들의 과거의 연구를 포함한 여러 연구에서 TNF가 이입된 암세포는 TNF에 대해 내성을 보이는 이에는 새로이 방어 단백질을 합성하는 것이 관여할 것이라는 시사가 있었다. 이 획득내성의 기전을 밝히는 것이 종양생물학의 이해를 넓히고 보다 효과적인 항암 유전자요법을 개발하기위한 매우 중요한 과제로 생각된다. 저자들은 TNF 유전자 이입에 따른 암세포의 TNF에 대한 획득내성에, 일부 세포에서 TNF에 의해 발현이 유도된다는 것이 밝혀진, 항산화효소의 하나인 MnSOD의 발현의 변화가 관여하는 지를 규명하고자 본 실험을 수행하였다. 방 법 : TNF에 다양한 감수성을 보이는 인체 및 생쥐 기원의 4가지 암세포주(WEHI164, NCI-H2058, A549, ME180)에 TNF-$\alpha$ 유전자를 retroviral 이용하여 이입하고 TNF의 발현을 시도하여 PCR, ELISA, MTT assay로 확인하였고, TNF 유전자가 이입된 세포(WEHI164-TNF, NCI-H2058-TNF, A549-TNF, ME180-TNF)는 TNF에 내성을 보이는지 역시 MTT assay로 검증하였다. TNF 유전자 이입 전후의 MnSOD mRNA 발현의 차이는 Northern blot analysis를 통하여 비교하였다. 결 과 : 1) TNF-$\alpha$ 유천자 이입 및 발현 확인 PCR을 시행한 결과 TNF 유전자가 이입된 각 세포 790 base pair 표기의 진한 DNA band를 보인 반면 모세포주는 보이지 않아서 retroviral vector를 이용한 유전자 이입이 DNA 수준에서 이루어 있었다. 그리고 TNF 유전자가 이입된 세포의 배양상층액에서 TNF양을 ELISA로 측정한 결과 TNF를 세포에 따라 1.91ng/24hr/$10^6\;cells$에서 3.91ng/24hr/$10^6\;cells$ 생산함을 알 수 있었다. 2) TNF 유전자 이입 전후, 암세포의 TNF에 대한 감수성 비교 TNF 농도 100ng/ml에서 WEHI164-TNF와 ME180-TNF 세포는 통계적으로 유의하게 (p<0.01) TNF에 대한 내성을 획득함을 알 수 있었다. 3) TNF 유전자 이입 전후외 MnSOD mRNA 발현양상 TNF에 감수성을 보이는 WEHl164와 ME180세포는 TNF 유전자 이입 후에 MnSOD mRNA 발현이 증가되지 않았으며, TNF에 내성을 보이는 NCIH2058과 A549 세포는 TNF 유전자 이입 후에 MnSOD mRNA 발현의 증가가 관찰되었으나 이는 모세포에 외부에서 TNF를 주었을 때도 관찰되었다. 결 론 : 세포주에 TNF 유전자를 이입하여 TNF를 발현하게 하였을때 세포 자신은 TNF에 대해 내성을 하게 되는데, 이 획득내성은 MnSOD 발현 능력의 향상에 의한 것은 아닐 것으로 판단되나 각 세포주의 자연 상태의 TNF에 대한 감수성 여부는 MnSOD의 발현 차이가 관련될 것으로 생각된다.