• Bulletin of the Korean Chemical Society
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• 제31권4호
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• pp.1038-1040
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• 2010

• 한국작물학회지
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• 제38권3호
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• pp.275-282
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• 1993

본 연구는 한국 옥수수의 $\alpha$-amylase의 유전자 클로닝을 주된 목표로 하여 수행되었다. 이를 위하여 여러 식물체의 $\alpha$-amylase 염기서열로 부터 잘 보존된 부분을 참고로 oligonucleotlde probe 및 PCR primer를 설계, 합성하고, 옥수수의 유묘로부터 전체 RNA를 분리하여 northern blot analysis를 통하여 확인한 다음, 이로부터 첫 번째 가닥 cDNA를 만든 후, 여기서 얻은 RNA : DNA hybrid를 주형으로 한 polymerase chain reaction을 통하여 길이 가 약 500bp되 는 PCR 산물을 얻었다. 이를 클로닝하기 위해 pUC19을 클로닝 백터로 사용하여 재조합 플라스미드인 $\ulcorner$pZM$\alpha$'$\lrcorner$를 만들었다. 합성 probe를 이용, Southern blot analysis한 결과, $\ulcorner$pZM$\alpha$'$\lrcorner$가 옥수수 mRNA로 부터 증폭된 DNA의 일부분을 갖고 있음을 확인하였으며, 그 길이는 PCR 산물과 같은 500bp가량 되는 것으로 나타났다.

• 생명과학회지
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• 제23권11호
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• pp.1311-1316
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• 2013

hnRNP L은 pre-mRNA에 결합하는 단백질들 중에서 핵심이 되는 단백질이다. hnRNP L은 양이 아주 많은 핵 단백질로서 핵과 세포질을 왕복하는 특성을 지니고 있다. 이 단백질은 염색질 변형(chromatin modification), pre-mRNA 스플라이싱, 인트론이 없는 유전자들에서 유래한 mRNA들의 세포질로의 반출(export), IRES-매개성 번역, mRNA의 안정성 조절, 정자형성과정 등, 세포 내의 여러 가지 과정에 관여하고 있는 것으로 알려져 있다. 이 논문에서는 hnRNP L과 결합하는 세포 내 단백질을 찾아내기 위하여 사람의 간세포 cDNA library를 사용하여 이스트 two-hybrid 탐색 실험을 수행하였다. 그 결과 사람의 간세포에서 IGFBP-4가 hnRNP L과 상호결합하는 새로운 파트너라는 것을 발견하였다. 본 연구를 통하여 hnRNP L이 이스트 two-hybrid 시스템에서 IGFBP-4와 특이적으로 상호 결합한다는 것을 처음으로 발견하였다. 본 연구에서는 또한 이스트 two-hybrid 시스템에서 hnRNP L이 IGFBP-4와 상호결합한다는 점을 in vitro pull-down 실험을 통하여 재확인하였다.

• 미생물학회지
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• 제21권4호
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• pp.229-237
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• 1983

Aspergillus nidulans의 tRNA 유전자의 구성과 발현기착을 연구하기 위하여 우선 Aspergillus의 총 tRNA 유전자를 cloning 하였다. Aspergillus의 핵 DNA롱 포자로 부터 분리해 내고 본질 형성에서 분리한 BamHI과 T4 DNA ligase를 사용하여 pBR322플라스미드에 재조합시켜서 cloning하였다. 15벤의 transformation을 하여 30,000개 의 transformants 얻었고, 이 중 Aspergillus DNA를 가지고 있는 colony는 5,300켜개였다. In vivo에 서 S2p로 표지 된 total tRNA를 probe로 하여 colony hybridization 실험 결과, 105개의 total tRNA유전자 clone을 얻었다. 위의 결과와 cohybridization 실험 결과를 분석해 보면, Asprgillus의 tRNA 유전자는 yeast의 그것보다는 좀 더 밀집되어 존재한다고 생각된다.

• 미생물학회지
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• 제30권6호
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• pp.466-471
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• 1992

HTLV-I 의 gag-pro 유전자 중첩영역내에서 -1 ribosomal frameshifting 이 일어나는 자리를 결정하기 위하여 gag-pro 중첩영역의 일부를 SP6 promoter 를 가진 백터내에 클로닝하였다. 그 결과 닭의 prelysozyme 에서 유래한 5개의 아미노산을 코드하는 합성유전자와 141 bp 로된 gag-pro 중첩영역의 뒤에 Straphylococcus aureus 의 protein A 유전자단편이 연결된 hybrid 유전자를 보유한 플라스미드를 제작하였다. 이 DNA 클론을 주형으로 SP6 RNA polymerase 의 작용에 의해 한종류의 mRNA 를 다량으로 합성하였다. Invitro 에서 합성된 mRNA 로 무세포계에서 단백질을 합성한 결과 21 kDal 의 단백질이 생성되었고 IgG-Sepharose 를 사용한 affinity chromatography 로 합성된 단백질을 순수하게 정제할 수 있었다. 본연구에서 설명한 in vitro 실험계는 Gag-Pro transframe 단백질의 신속한 정제 및 일차구조의 결정에 유익하게 사용될 것으로 보이며 이와 같은 실험의 결과 mRNA 에서 ribosomal frameshifting 이 일어나는 정확한 site 를 결정할 수 있을 뿐 같은 실험의 결과 mRNA 에서 ribosomal frameshifting 이 일어나는 정확한 site 를 결정할 수 있을 뿐 아니가 pro 유전자의 발현에 필요한 frameshift 를 유도하는 tRNA 의 동정도 가능하게 될 것이다.

• 한국산학기술학회논문지
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• 제9권6호
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• pp.1795-1799
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• 2008

hnRNP K 단백질은 hnRNP 복합체를 구성하는 핵단백질들 중의 하나이며 시토신이 많은 RNA/DNA sequence에 잘 결합한다. 이 단백질은 핵 내에서만 머무르지 않고 핵과 세포질을 왕복하는 특징을 지니고 있다. hnRNP K의 기능을 조사하기 위하여 우선 hnRNP K와 상호 결합하는 세포내 단백질을 찾아내고자 하였다. 이를 위하여 본 연구에서는 이스트 two-hybrid 시스템을 사용하여 HeLa CDNA librar를 탐색하였다. 그 결과 얻은 클론들 중에는 사람의 hnRNP E1 (poly(rC) binding protein 1) cDNA (GenBank accession number XM_031585) 클론이 포함되어 있었다. 본 논문에서는 이스트 two-hybrid 시스템과 in vitro에서의 생화학적 실험을 통하여 hnRNP E1은 hnRNP K와 특이적으로 상호 결합한다는 것을 밝혔다.

• 한국어류학회지
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• 제22권3호
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• pp.201-205
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• 2010

2008년 8월 경남 통영에서 강담돔과 돌돔의 자연교잡종 1개체가 발견되어 형태 및 유전적 특정을 강담돔 및 돌돔과 비교하였다. 형태적으로 본 총은 체측에 선명한 검은색 둥근 점을 많이 가지며 동시에 4개의 연한 가로줄을 가져 강담돔과 비슷하였다. 강담돔 및 돌돔의 계수 계측형질이 거의 일치하였으나, 체장에 대한 배지느러미길이 비에서 자연교잡종(26.7%)은 돌돔(17.2~23.6%)보다 강담돔(26.4%)에 더욱 가까웠다. 미토콘드리아 DNA 16S rRNA 510 bp를 이용한 분자분석에서 자연교잡종은 형태결과와는 달리 강담돔(d=0.020)보다 돌돔(d=0.000~0.010)에 더욱 가까웠다. 본 연구결과를 통해 경남 통영에서 발견된 자연교잡종은 암컷 돌돔과 수컷 강담돔 사이에서 태어난 것으로 추정된다.

• Animal cells and systems
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• 제12권3호
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• pp.143-148
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• 2008

Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein E1(hnRNP E1) is one of the primary pre-mRNA binding proteins in human cells. It consists of 356 amino acid residues and harbors three hnRNP K homology(KH) domains that mediate RNA-binding. The hnRNP E1 protein was shown to play important roles in mRNA stabilization and translational control. In order to enhance our understanding of the cellular functions of hnRNP E1, we searched for interacting proteins through a yeast two-hybrid screening while using HeLa cDNA library as target. One of the cDNA clones was found to be human ribosomal protein L18a cDNA(GenBank accession number BC071920). We demonstrated in this study that human ribosomal protein L18a, a constituent of ribosomal protein large subunit, interacts specifically with hnRNP E1 in the yeast two-hybrid system. Such an interaction was observed for the first time in this study, and was also verified by biochemical assay.

• Animal cells and systems
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• 제1권2호
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• pp.363-370
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• 1997

RNase MRP is a ribonucleoprotein complex with a site-specific endonuclease activity. Its original substrate for cleavage is the small mitochondrial RNA near the mitochondrial DNA replication origin, thus it was proposed to generate the primer for mtDNA replication. Recently, it has been shown to have another substrate in the nucleus, such as pre-S.8S ribosomal RNA in nucleolus. The gene for the RNA component of RNase MRP (MRP RNA) was found to be encoded by the nucleus genome, suggesting an interesting intracellular trafficking of MRP RNA to both mitochondria and nucleolus after transcription in nucleus. In this study, genomic DNA encoding MRP RNA was microinjected into the nucleus of Xenopus oocytes, to analyze promoter regions involved in the transcription. It showed that the proximal sequence element and TATA box are important for basal level transcription; octamer motif and Sp1 binding sites are for elevated level transcription. Most of Xenopus MRP RNA was exported out to the cytoplasm following transcription in the nucleus. Utilizing various hybrid constructs, export of MRP RNA was found to be regulated by the promoter and the 5' half of the coding region of the gene. Interestingly, the transcription in nucleus seems to be coupled to the export of MRP RNA to cytoplasm. Intracellular transport of injected MRP RNA can be easily visualized by whole-mount in situ hybridization following microinjection; it also shows possible intra-nuclear sites for transcription and export of MRP RNA.

• Bulletin of the Korean Chemical Society
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• 제34권3호
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• pp.735-742
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• 2013

Peptide nucleic acids (PNAs) that bind to complementary nucleic acid sequences with extraordinarily high affinity and sequence specificity can be used as antisense oligonucleotides against microRNAs, namely antagomir PNAs. However, methods for efficient cellular delivery must be developed for effective use of PNAs as therapeutic agents. Here, we demonstrate that antagomir PNAs can be delivered to hepatic cells by complementary DNA oligonucleotide and cationic liposomes containing galactosylated ceramide and a novel cationic lipid, DMKE (O,O'-dimyristyl-N-lysyl glutamate), through glycoprotein-mediated endocytosis. An antagomir PNA was designed to target miR-122, which is required for translation of the hepatitis C virus (HCV) genome in hepatocytes, and was hybridized to a DNA oligonucleotide for complexation with cationic liposome. The PNA-DNA hybrid molecules were efficiently internalized into hepatic cells by complexing with the galactosylated cationic liposome in vitro. Galactosylation of liposome significantly enhanced both lipoplex cell binding and PNA delivery to the hepatic cells. After 4-h incubation with galactosylated lipoplexes, PNAs were efficiently delivered into hepatic cells and HCV genome translation was suppressed more than 70% through sequestration of miR-122 in cytoplasm. PNAs were readily released from the PNA-DNA hybrid in the low pH environment of the endosome. The present study indicates that transfection of PNA-DNA hybrid molecules using galactosylated cationic liposomes can be used as an efficient non-viral carrier for antagomir PNAs targeted to hepatocytes.