• 한국어류학회지
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• 제35권4호
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• pp.224-235
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• 2023

우리나라는 전 세계에서 유일한 분단국가로 군사분계선을 가지고 있다. 군사분계선을 기준으로 비무장지대 및 민간인통제구역이 설정되었고, 국가보안 및 안전을 위해 출입이 통제되고 있어, 우리나라 다른 지역에 비해 생태계 교란이 비교적 적은 지역이다. 하지만 유실지뢰 및 불발탄들로 인해 안전이 위협받음에 따라 생태계 연구에 많은 제한사항이 발생하기 때문에, 연구를 보완 및 대체하기 위해 eDNA 분석법을 활용하여 민간인통제구역 내부에 존재하는 평화의 길 세 지점에서 직접조사와 eDNA를 이용한 간접조사를 실시하고 비교했다. 평화의 길 인제노선, 양구노선, 화천노선 세 지점에서 2022년 5, 7, 9월에 직접조사와 eDNA 시료 채취를 진행했으며, 시료에서 채취한 유전자를 증폭한 후 library를 제작하여 Miseq를 수행하고 ASV를 생성하여 간접조사를 완료했다. 이후, 직접조사 결과와 비교했다. 그 결과 양구-1 지점에서 관찰된 2종 모두 eDNA가 검출되었으며, 양구-2 지점에서 관찰된 4종 중 2종의 eDNA가 검출되었다. 화천-1에서 관찰된 1종 중 1종의 eDNA가 검출되었고, 화천-2에서 12종 중 7종, 화천-3에서는 6종 중 4종, 화천-4에서 관찰된 1종 모두 eDNA가 검출되어 직접조사 결과 확인된 종의 약 69%의 어류의 eDNA가 검출된 간접조사 결과를 확인했다. 대륙종개, 메기 등 일부 어류가 오동정된 상태로 NCBI에 유전정보가 등재된 것은 아닌지 확인이 필요하고, 다른 서열부를 이용한 마커 개발 연구가 필요할 것으로 생각되며, 위험성 때문에 조사가 제한적인 CCZ 지역 어류 연구의 보완책으로써 적합할 것으로 생각된다.

• 한국발생생물학회지:발생과생식
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• 제22권3호
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• pp.283-288
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• 2018

The author carried out PCR-based genetic platform to investigate the hierarchical polar dendrogram of Euclidean genetic distances of one bastard halibut population, particularly for Paralichthys olivaceus, which was further connected with those of the other fish population, by involving with the precisely designed oligonucleotide primer sets. Eight oligonucleotides primers were used generating excessively alterating fragments, ranging in size of DNA bands from larger than approximately 100 bp to less than 2,000 bp. As regards average bandsharing value (BS) results, individuals from Hampyeong population (0.810) displayed lower bandsharing values than did individuals from Wando population (0.877). The genetic distance between individuals approved the existence of close relationship in the cluster II. Relatively, individuals of one bastard halibut population were fairly related to that of the other fish population, as shown in the polar hierarchical dendrogram of Euclidean genetic distances. The points of a noteworthy genetic distance between two P. olivaceus populations demonstrated this PCR procedure is one of the quite a few means for individuals and/or populations biological DNA investigates, for species security and proliferation of bastard halibut individuals in coastal region of the Korea.

• 한국발생생물학회지:발생과생식
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• 제24권4호
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• pp.327-335
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• 2020

Genomic DNA (gDNA) extracted from two populations of natural and cultured river pufferfish (Takifugu obscurus) was amplified by polymerase chain reaction (PCR). The complexity of the fragments derived from the two locations varied dramatically. The genetic distances (GDs) between individuals numbered 15 and 12 in the cultured population was 0.053, which was the lowest acknowledged. The oligonucleotide primer OPC-11 identified 88 unique loci shared within each population reflecting the natural population. The OPC-05 primer identified 44 loci shared by the two populations. The average band-sharing (BS) values of individuals in the natural population (0.683±0.014) were lower than in those derived from the cultured population (0.759±0.009) (p<0.05). The shortest GD demonstrating a significant molecular difference was found between the cultured individuals # 15 and # 12 (GD=0.053). Individual # 02 of the natural population was most distantly related to cultured individual # 22 (GD=0.827). A cluster tree was built using the unweighted pair group method with arithmetic mean (UPGMA) Euclidean GD analysis based on a total of 578 various fragments derived from five primers in the two populations. Obvious markers identified in this study represent the genetic structure, species security, and proliferation of river pufferfish in the rivers of the Korean peninsula.

• KSII Transactions on Internet and Information Systems (TIIS)
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• 제12권4호
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• pp.1572-1593
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• 2018

The diversity and fast growth of Internet traffic volume are highly influenced by mobile and computer applications being developed. Moreover, the developed applications are too dynamic to be identified and monitored by network administrators. Several approaches have been proposed to identify network applications, however, are still not robust enough to identify modern applications. This paper proposes both, TSA (Traffic collection, Signature generation and Applications identification) system and a derived algorithm so called CSP (Contiguous Sequential Patterns) to identify applications for management and security in IP networks. The major focus of this paper is the CSP algorithm which is automated in two modules (Signature generation and Applications identification) of the proposed system. The proposed CSP algorithm generates DNA-like unique signatures capable of identifying applications and their individual services. In this paper, we show that the algorithm is suitable for generating efficient signatures to identify applications and application services in high accuracy.

• 한국정보통신학회:학술대회논문집
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• 한국해양정보통신학회 2005년도 춘계종합학술대회
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• pp.824-827
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• 2005

개인의 정보뿐만 아니라 산업체나 국가기관의 정보보안에 있어서 비밀번호는 매우 중요한 수단이 되어왔다. 그러나 비밀번호는 암기에 대한 부담, 정보 누출의 문제뿐만 아니라 여러 가지 해킹기술에 의하여 거의 무용지물이 되고 있는 실정이다. 인터넷 금융 업무를 위해 정부에서 시행하고 있는 공인인증서(PKI, 공개키기반구조)도 비밀번호 방식에 근간을 두고 있는 것이다. 사람은 손 모양, 지문, 손등의 혈관 패턴, 눈동자의 망막, 홍채, 서명, 음성 등 저마다 다른 생리적(Physiological), 행동적(Behavioral) 특징을 가지고 있다. 이것이 한계에 이른 개인의 비밀번호를 대체하거나 보완할 수 있는 생체인식기술이다. 본 논문에서는 생체인식기술에 대한 종류, 시장 분석, 다중생체인식, 표준화, 개인 프라이버시 보호 및 생체인식산업의 향후 전망 등에 대해 살펴보고자 한다.

• 정보보호학회지
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• 제12권2호
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• pp.34-40
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• 2002

컴퓨터와 유\ulcorner무선 인터넷이 확산되어 더욱 보안의 중요성이 요구되면서 살아있는 개별 인간의 신체 일부를 이용한 생체인증 보안기술이 핫 이슈로 회자되고있다. 지문인증, 얼굴인증, 홍채인증, 정맥인증, DNA 인증, 뇌파인증, 손금/손모양인증, 음성인증, 서명인증 등 많은 생체인식기술들은 이미 수십 년 전부터 연구되었고, 과거 한때 상품화도 되었으나 시대의 요구에 부응하지 못하고 사라졌지만, 최근 들어서는 더욱 활발한 연구가 진행되고 있고 다양한 영역에서 상용화가 된 상태이다. 본 서명인증 보안기술은 전자펜(혹은 마우스)으로 입력된 개인의 동적인 서명을 이용하는 것으로써, 쓰는 모양, 쓰는 속도, 필체의 각도, 획수, 획순서, 펜DOWN/UP 정보 등의 여러 가지 정보를 비교\ulcorner분석하여 진서명인지 모조서명인지를 실시간으로 검증하는 것이다. 경제성, 보안성, 활용성, 안정성, 편의성 등의 여러 가지 관점에서 볼 때, 앞으로 널리 확산될 전망이다. 본 논문에서는 지난 10여 년간 직접 연구 개발하여 2000년 8월에 교수실험실창업으로 사업화한 서명기술의 개요와 응용/구축사례를 소개하고자 한다.

• 정보보호학회지
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• 제17권1호
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• pp.38-46
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• 2007

유비쿼터스 네트워크(u-network)를 통해 u-health의 개념이 실현됨에 있어 생체 신호를 최초로 측정, 처리하는 부분의 생체 신호 측정용 칩들에 대한 최근 기술 개발 동향을 기술하였다. 이러한 추세에 맞추어 여러 가지 핵심 기술들이 부상하고 있지만, 본 기고에서는 이러한 시스템의 최종 하위 계층, 즉 단말기 등의 부분에 적용되는 bio 관련 시스템 반도체 칩(SoC : system-on-a-chip)에 대해 기술한다. 바이오 칩 중, 기존의 광을 사용하지 않고 값 싸게 구현 할 수 있는 CMOS 기반의 DNA 칩 개발 동향을 살펴보았으며, 신약 개발이나 치료에 사용할 수 있도록 신경 신호 전달을 검출할 수 있는 신경 신호 전달 측정 칩들의 기술 개발도 살펴보았다. 개인의 의료 생체정보를 모니터링 할 수 있도록 심전도, 근전도, 뇌파, 산소포화도, 체지방 등을 측정할 수 있는 의료용 칩들의 개발 현황도 살펴보았다.

• Journal of the Korean Society for Industrial and Applied Mathematics
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• 제11권4호
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• pp.19-38
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• 2007

Graph theory is becoming increasingly significant as it is applied of mathematics, science and technology. It is being actively used in fields as varied as biochemistry(genomics), electrical engineering(communication networks and coding theory), computer science(algorithms and computation) and operations research(scheduling). The powerful results in other areas of pure mathematics. Rhis paper, besides giving a general outlook of these facts, includes new graph theoretical proofs of Fermat's Little Theorem and the Nielson-Schreier Theorem. New applications to DNA sequencing (the SNP assembly problem) and computer network security (worm propagation) using minimum vertex covers in graphs are discussed. We also show how to apply edge coloring and matching in graphs for scheduling (the timetabling problem) and vertex coloring in graphs for map coloring and the assignment of frequencies in GSM mobile phone networks. Finally, we revisit the classical problem of finding re-entrant knight's tours on a chessboard using Hamiltonian circuits in graphs.

• Design & Manufacturing
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• 제16권3호
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• pp.34-38
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• 2022

Regular expression pattern matching is widely used in applications such as computer virus vaccine, NIDS and DNA sequencing analysis. Hardware-based pattern matching is used when high-performance processing is required due to time constraints. ReCPU, SMPU, and REMP, which are processor-based regular expression matching processors, have been proposed to solve the problem of the hardware-based method that requires resynthesis whenever a pattern is updated. However, these processor-based regular expression matching processors inefficiently handle repetitive operations of regular expressions. In this paper, we propose a new instruction set to improve the inefficient repetitive operations of ReCPU and SMPU. We propose REMPi, a regular expression matching processor that enables efficient iterative operations based on the REMP instruction set. REMPi improves the inefficient method of processing a particularly short sub-pattern as a repeat operation OR, and enables processing with a single instruction. In addition, by using a down counter and a counter stack, nested iterative operations are also efficiently processed. REMPi was described with Verilog and synthesized on Intel Stratix IV FPGA.

• 생명과학회지
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• 제9권5호
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• pp.556-563
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• 1999

Presence of antibody to the capsid protein p24 is the main diagnostic criterion, since this reflects reliable antibody response to HIV infection. However, it takes about 6-8 weeks for antibody production after infection and people who are infected but antibodies are not produced yet are classified as seronegative. Therefore, there is a strong need for an improved diagnostic method for better health security. As a first step for developing such an improved diagnostic system, gag protein of human immunodificiency virus type 1 was expressed in E. coli DH5$\alpha$. The gag fragment of HIV-1 (including a portion of p17 and whole p24) was amplified by polymerase chain reaction (PCR) and BamH I/EcoR I sites were created during PCR. The amplified DNA fragment was cleaved with BamH I/EcoR I and was subcloned into the GEX-2T vector which had been digested with BamHI/EcoRI, resulting gene fusion with gst gene of pGEX-2T. The recombinant DNA was transferred into E. coli DH5$\alpha$. The transformed bacteria were grown at 37$^{\circ}C$ for 3h and protein expression was induced with 0.1mM IPTG at $25^{\circ}C$ for 3h. Recombinant gag protein or GST-gag fusion protein was purified with glutathione-sepharose 4B bead and migrated as a single band when analyzed by 10% polyacrylamide gel. These proteins were confirmed by immunoblotting with anti-GST goat sera or Korean AIDS patients sera. The results of this study establish the expression and single step pulification of HIV-1 gag protein which can specifically bind with Korean AIDS patients sera.