• 대한의생명과학회지
• /
• 제15권1호
• /
• pp.1-8
• /
• 2009

Human genomic DNA is continuously attacked by oxygen radicals originated from cellular metabolic processes and numerous environmental carcinogens. 2-deoxyribonolactone (dL) is a major type of oxidized abasic (AP) lesion implicated in DNA strand scission, mutagenesis, and formation of covalent DNA-protein crosslink (DPC) with DNA polymerase (Pol) ${\beta}$. We show here that human DNA polymerase (Pol)${\iota}$ and mitochondrial $Pol{\gamma}$ give rise to stable DNA-protein crosslink (DPC) formation that is specifically mediated by dL lesion. $Pol{\gamma}$ mediates DPC formation at the incised dL residue by its 5'-deoxyribose-5-phosphate (dRP) lyase activity, while $Pol{\gamma}$ cross links with dL thorough its intrinsic dRP lyase and AP lyase activities. Reactivity in forming dL-mediated DPC was significantly higher with $Pol{\gamma}$ than with $Pol{\iota}$. DPC formation by $Pol{\gamma}$, however, can be reduced by an accessory factor of $Pol{\gamma}$ holoenzyme that may attenuate deleterious effects of crosslink adducts on mitochondrial DNA. Comparative kinetic analysis of DPC formation showed that the rate of DPC formation with either $Pol{\iota}$ or $Pol{\gamma}$ was lower than that with $Pol{\beta}$. These results revealed that the activity of catalytic lyase in DNA polymerases determine the efficiency of DPC formation with dL damages. Irreversible crosslink formation of such DNA polymerases by dL lesions may result in a prolonged strand scission and a suicide of DNA repair proteins, both of which could pose a threat to the genetic and structural integrity of DNA.

• 한국환경성돌연변이발암원학회지
• /
• 제9권2호
• /
• pp.111-121
• /
• 1989

Ps. aeruginosa 의 DNA repair 기구 결손변이주인 rec-, Hcr- 그리고 R931 plasmid 를 가진 R2 (Carbenicillin, Kanamycin, Streptomycin) plasmid transconjugants 가 R2 Plasmid 획득에 의해서 Gamma선 및 돌연변이제 (4NQO, NTG)에 대해서도 내성을 증강시키는지를 검토함으로써 방사선에 대한 내성화 기구를 해명하고자 했다. 그리고, DNA repair 기구에 작용하는 DNA polymerase I 생산에 관여하는 유전자가 R2 plasmid에 code 되어 있는지를 검토하여 다음과 같은 결과를 얻었다. 1) Ps. aeruginosa PAO균주의 R2 plasmid transconjugants는 R2 plasmid 획득에 의해 자외선, Gamma선 및 돌연변이제에 대한 내성을 부여받았으나 transconjugant 균주에 따라 다른 종류의 내성결과를 얻어졌다.

• 한국가금학회:학술대회논문집
• /
• 한국가금학회 1999년도 제16차 정기총회및학술발표회
• /
• pp.34-50
• /
• 1999

A cDNA encoding chicken interferon-gamma (chIFN-${\gamma}$) was amplified from P34, a CD4$^{+}$ T-cell hybridoma by reverse transcription-polymerase chain reaction (RT-PCR) and cloned into pUC18. THe sequences of cloned PCR products were determined to confirm the correct cloning. Using this cDNA as probe, chicken genomic library from White Leghorn spleen was screened. Phage clones harboring chicken interferon-gamma (chIFN-${\gamma}$) were isolated and their genomic structure elucidated. The chIFN-${\gamma}$ contains 4 exons and 3 introns spanning over 14 kb, and follows the GT/AG rule for correct splicing at the exon/intron boundaries. The four exons encode 41, 26, 57 and 40 amino acids, respectively, suggesting that the overall structure of IFN-${\gamma}$ is evolutionairly conserved in mammalian and avian species. The 5’-untranslated region and signal sequences are located in exon 1. Several AT-rich sequences located in the fourth exon may indicate a role in mRNA turnover. The 5’-flanking region contains sequences homologous to the potential binding sites for the mammalian transcription factors, activator protein-1(AP-1) activator protein-2(AP-2) cAMP-response element binding protein(CREB), activating transcription factor(ATF), GATA-binding fator(GATA), upstream stimulating factor(USF), This suggests that the mechanisms underlying transcriptional regulation of chicken and mammalian IFN-${\gamma}$ genes may be similar.r.

• 한국산학기술학회논문지
• /
• 제11권6호
• /
• pp.2093-2098
• /
• 2010

지방간은 대사증후군의 한 형태로 인슐린저항성이 중요한 역할을 한다. 본 연구는 당뇨 및 대사 인자들과 연관성이 있는 것으로 알려진 말초혈액의 사립체 DNA (mtDNA) copy 수와 지방간 및 인슐린저항성 관련 인자와의 연관성을 알아보고자 하였다. 지방간 진단을 위해 음주력 설문과 복부 초음파 검사를 시행하였으며 실시간 중합효소 연쇄반응을 이용하여 말초혈액의 백혈구에서 mtDNA copy 수를 측정하였다. 총 445 명의 대상자 중 지방간이 있는군(fatty liver group)은 148 명이고 정상군은 297 명이었다. 지방간이 있는 군에서 정상군에 비해 mtDNA copy수가 유의하게 낮았다. 비알콜성 지방간과 알코올성 지방간 모두 지방간이 있는 군에서 말초혈액 mtDNA copy 수가 낮았다. 말초혈액의 mtDNA copy 수는 ALT, AST, $\gamma$-GTP, 체질량지수, 허리둘레, 이완기혈압, 유리지방산 수치와 역의 상관관계를 보였다. 말초혈액에서의 mtDNA copy 수는 지방간 여부 및 인슐린저항성 관련 대사 인자들과 높은 연관성이 있었다.

• 대한약리학회지
• /
• 제25권1호
• /
• pp.115-134
• /
• 1989

Ganciclovir(GCV)와 Vidarabine(ara-A)을 단독으로 또는 동시에 HSV-1에 작용시켰을때 HSV-1의 복제, DNA합성 및 단백질 합성에 미치는 영향을 관찰할 목적으로 본 연구를 시행하였다. 본 실험에서는 4가지의 다른 HSV-1(Wild type KOS, $VCV^r$, $IUdR^r$, 및 $PAA^r5$)를 사용하였다. Virus복제에 미치는 항 virus약의 효과는 Vero 세포단층 배양에서 Yield reduction assay에 의해서 관찰하였다. 항 virus약의 virus DNA 합성에 미치는 영향은 NaI 밀도 구배초원심침전후 $H^3-$표지 virus DNA의 방사능에 의해서 관찰하였다. Virus 단백질의 합성에 미치는 항 virus약의 효과는 $^{35}S$를 표지한 후 polyacrylamide 겔 전기영동법, 자가방사기록법 그러고 virus bands의 음영농도주사법을 이용, 관찰하여 다음과 같은 결과를 얻었다. 1. GCV는 wild trype HSV-1 KOS와 $PAA^r5$의 복제를 강력하게 억제하였으나 $ACV^r$와 $IUdR^r$는 GCV에 대해서 중등도의 저항을 보였다. ara-A는 실험대상의 모든 HSV-(KOS, $ACV^r$, $IUdR^r$ 및 $PAA^r5$)의 복제에 대해서 거의 비슷하게 억제효과를 보였다. GCV와 ara-A 동시첨가는 KOS와 $PAA^r5$의 복제에 대해서 상승적인 억제효과를 보였고 $ACV^r$와 $IUdR^r5$의 복제에 대해서는 상가작용이하의 억제 효과를 보였다. 2. GCV또는 ara-A는 HSV-1감염 Vero세포에서 virus DNA의 합성을 유의하게 억제하였다. GCV와 ara-A의 동시첨가는 KOS 또는 $PAA^r5$ 감염세포에서 virus DNA 합성을 GCV 또는 ara-A를 단독 첨가하였을때 보다 현저하게 억제하였다. $ACV^r$ 또는 $IUdR^r$ 감염세포에서는 이런 현상을 관찰할 수 없었다. 3. Wild type HSV-1 감염세포에서 virus-단백질의 합성은 GCV, ara-A의 단독 첨가 또는 GCV와 ara-A의 동시첨가에 의해서 변경되지 않았다. Wild type HSV-1 감염말기에 GCV 또는 ara-A 단독 혹은 동시첨가에 의해서 virus 단백질의 합성은 경미하나마 유의성있게 증가하였다. Wild type HSV-1과 $PAA^r5$에 의한 단백질의 합성은 GCV 또는 ara-A 단독 첨가에 의해서 유의성있게 억제되었다. GCV또는 ara-A의 동시첨가는 GCV또는 ara-A를 단독으로 첨가했을 경우보다 단백질의 합성을 더욱 억제하였다. 이상의 실험결과로 보아 GCV와 ara-A의 동시사용은 HSV-1 혹은 ACV저항 DNA polymerase변이주인 $PAA^r5$에 대해서 상승적인 억제작용을 나타냈으며 이 효과는 virus DNA 합성 억제에 의한 것으로 생각된다. ACV저항 thymidine kinase 변이주인 $ACV^r$ 및 $IUdR^r$에 대해서는 ara-A가 유효하였다. 항 virus 약물에 의한 virus 단백질합성의 변화는 virus DNA 합성에 대한 억제효과에 인한 것으로 사려된다.

• Journal of Genetic Medicine
• /
• 제18권2호
• /
• pp.121-126
• /
• 2021

Chronic progressive external ophthalmoplegia (CPEO) is a complex slowly progressive mitochondrial disorder characterized by extraocular muscle weakness with or without multisystem involvement. The mainstay of therapy in a patient with CPEO is supportive. However, in moderate cases, surgery might be indicated including surgeries for ptosis and strabismus. In this article, we report a Saudi patient with CPEO due to compound heterozygous variants in the DNA polymerase gamma (POLG) gene c.2246T>C p.(Phe749Ser) and c.1735C>T p.(Arg579Trp), which are classified as pathogenic. Proper diagnosis with genetic testing confirmation is important to guide the management and counsel the patient about the prognosis and the management options. The patient was successfully managed with bilateral frontalis sling and illustrates the importance of surgical intervention to improve vision and cosmetic appearance in patients with CPEO. We emphasize the importance of multidisciplinary care in the management of cases of mitochondriopathy, especially CPEO.

• Biomolecules & Therapeutics
• /
• 제31권3호
• /
• pp.340-349
• /
• 2023

Mad2B (Mad2L2), the human homolog of the yeast Rev7 protein, is a regulatory subunit of DNA polymerase ζ that shares sequence similarity with the mitotic checkpoint protein Mad2A. Previous studies on Mad2B have concluded that it is a mitotic checkpoint protein that functions by inhibiting the anaphase-promoting complex/cyclosome (APC/C). Here, we demonstrate that Mad2B is activated in response to cisplatin-induced DNA damage. Mad2B co-localizes at nuclear foci with DNA damage markers, such as proliferating cell nuclear antigen and gamma histone H2AX (γ-H2AX), following cisplatin-induced DNA damage. However, unlike Mad2A, the binding of Mad2B to Cdc20 does not inhibit the activity of APC/C in vitro. In contrast to Mad2A, Mad2B does not localize to kinetochores or binds to Cdc20 in spindle assembly checkpoint-activated cells. Loss of the Mad2B protein leads to damaged nuclei following cisplatin-induced DNA damage. Mad2B/Rev7 depletion causes the accumulation of damaged nuclei, thereby accelerating apoptosis in human cancer cells in response to cisplatin-induced DNA damage. Therefore, our results suggest that Mad2B may be a critical modulator of DNA damage response.

• 한국자원식물학회지
• /
• 제14권3호
• /
• pp.235-240
• /
• 2001

Polyphenol 화합물이 다량 함유된 식물종의 유연관계 분석이나 형질전환 유전자 확인 등을 위해 PCR을 이용할 경우 다량의 재료로부터 신속 간편하게 분리한 DNA를 이용할 수 있는 조건을 설정 하였다. 폴리페놀 함량이 높은 포도, 사과, 복분자와 같은 과수류에서 간편법에 의해 추출된 DNA를 이용한 PCR 반응액에 2%의 BLOTTO를 첨가함으로서 DNA의 재현적 증폭이 가능하였다. 간편 추출 DNA를 이용한 PCR에서 의 BLOTTO효과는 primer, 품종, 식물종에 관계없이 일반적으로 발현되었다. 상추의 형질전환 유전자 검색을 위한 PCR에서 도 BLOTTO 효과가 확인되었다. 따라서 PCR 반응액에 2% BLOTTO를 첨가하면 간편 법 에 의해 추출된 polyphenol 화합물 고함유 식물종의 DNA를 이용하여서도 PCR에 의한 유전배경 및 특정 유전자의 대량 신속 분석이 가능할 것이다.

• Annals of Clinical Neurophysiology
• /
• 제19권1호
• /
• pp.40-45
• /
• 2017

Background: Telbivudine is a nucleoside analogue used for the treatment of chronic hepatitis B, but it often develops mitochondrial toxicity leading to symptomatic myopathy. In this study, three patients with telbivudine induced myopathy were enrolled in order to investigate the nature and pathogenesis of mitochondrial toxicity caused by long-term use of telbivudine. Methods: Clinical features, laboratory findings, muscle pathology, and quantitation of mitochondrial DNA were studied in three patients. Results: Patients presented with progressive muscle weakness with high serum creatine kinase levels. Light microscopic findings of muscle pathology showed ragged red fibers that reacted strongly with succinate dehydrogenase stain, but negative for cytochrome c oxidase activities. Electron microscopy revealed abnormal mitochondrial accumulation with rod shaped inclusions. The quantitative peroxidase chain reaction showed a depletion of mitochondrial DNA in skeletal muscle of the patients. Conclusions: Nucleoside analogues including telbivudine are potent inhibitors of viral DNA polymerases. However, they are not specific for viral DNA and can disturb mitochondrial replication at the same time. All nucleotide analogues should be used with close clinical observation in order to avoid development of mitochondrial myopathy.

• Biotechnology and Bioprocess Engineering:BBE
• /
• 제11권2호
• /
• pp.154-159
• /
• 2006

Interleukin-18 (IL-18), otherwise known as interferon-gamma-inducing factor (IGIF), is one of several well characterized and important cytokines that contribute to host defenses. The complementary DNA (cDNA) of mature human interleukin-18 gene (hIL-18) was fused with the signal peptide of the rice amylase 1A gene (Ramy1A) and introduced into the plant expression vector under the control of a duplicated CaMV 35S promoter. The recombinant plasmid was transformed into tobacco (Nicotiana tabacum L. cv Havana) using the Agrobacterium-mediated transformation method. The integration of the hlL-18 gene into the genome of transgenic tobacco plants was confirmed by polymerase chain reaction (PCR) amplification and its expression was observed in the suspension cells that were derived from the transgenic plant callus by using Northern blot analysis. The hlL-18 protein was detected in the extracts of the transgenic callus and in the medium of the transgenic tobacco suspension culture by using immunoblot analysis. Based upon enzyme-linked immunosorbant assay (ELISA) results, the expression level of the hlL-18 protein approximated $166{\mu}g/L$ in the suspension culture medium. Bioassay results from the induction of $interferon-{\gamma}$ from a KG-1 cell line indicated that the hlL-18 secreted into the suspension culture medium was bioactive.