• Title/Summary/Keyword: DNA comet

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방사선조사된 채소류 및 곡물류의 DNA Comet Assay 특성 연구 (Study on the Characteristics of DNA Comet Assay for Irradiated Vegetables and Grains)

  • 서정은;오세욱;김윤지;이남혁;홍상필;김영호
    • 한국식품영양과학회지
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    • 제37권4호
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    • pp.472-476
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    • 2008
  • 국내에서 주로 소비되는 채소류와 곡물류의 방사선조사 여부를 신속하게 검지하기 위하여 DNA comet assay의 활용 가능성을 조사하였다. 식품의 종류에 따라 세포용출시간, 세포현탁액의 정치시간 및 세포용해시간 등의 DNA comet assay 조건을 달리하여야 DNA comet이 관찰되는 것으로 나타났다. 전반적으로 방사선조사선량에 따라 comet assay 값이 증가하였는데 유의적 차이는 식품의 종류에 따라 달리 나타났다. 즉, 파는 2 kGy, 마늘은 3 kGy, 토마토는 1 kGy, 쌀가루는 9 kGy, 그리고 서리태는 3 kGy에서 방사선조사 여부에 대한 검지가 가능한 것으로 나타났다. 식물세포는 동물세포에 비해 외부의 영향에 민감하게 작용하기 때문에 DNA도 쉽게 손상되어 크기뿐만 아니라 핵의 모양도 다양하게 나타나는 것으로 보고된 바와 같이 DNA comet assay를 다양한 식품의 방사선조사 신속검지법으로 활용하기 위해서는 식품의 종류에 따른 표준화된 comet 분석조건 및 통계 분석법에 대한 가이드라인 설정이 필요한 것으로 나타났다.

인체 산화적 DNA손상에 대한 Human Biomonitoring도구로서 Alkaline Comet Assay의 활용 가능성 연구 (Application of the Alkaline Comet Assay for Detecting Oxidative DNA Damage in Human Biomonitoring)

  • 박은주;강명희
    • Journal of Nutrition and Health
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    • 제35권2호
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    • pp.213-222
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    • 2002
  • The alkaline comet assay has been used with increasing popularity to investigate the level of DNA damage in biomonitoring studies within the last decade in Western countries. The purpose of this study was to evaluate the usefulness of the alkaline comet assay as a biomarker of oxidative DNA damage for monitoring in the Korean population, and also to evaluate the effect of nutritional status and lifestyle factors on H2O2 induced oxidative DNA damage measured by the alkaline comet assay in human lymphocytes. The study population consisted of 61 healthy Korean male volunteers, aged 20-28. Epidemiological background data including dietary habits, smoking habits and anthropometrical measurements were collected through personal interviews. After blood collection, the comet assay in peripheral lymphocytes and plasma lipids analysis was carried out and the results analyzed. Tail moment (TM) and tail length (TL) of the comet assay were use\ulcorner to measure DNA damage in the lymphocytes of the subjects. Statistically significant (p < 0.05) positive correlations were observed between DNA damage (TM or TL) and smoking habits expressed as cigarettes smoked per day and pack years (r = 0.311 and 0.382 for TM, r = 0.294 and 0.350 for TL, respectively). There were also significant positive correlations between DNA damage parameter and waist-hip ratio. Higher plasma triglyceride levels were associated with increased damage to DNA. There were no correlations between the consumption frequencies of vegetables and DNA damage to the subjects. However, consumption frequencies of fruit and fruit juice intake were inversely associated with the TM and TL. The results indicate that die comet assay is a simple, rapid and sensitive method for detecting lymphocyte DNA damage induced by cigarette smoking. Consumption of fruit or fruit juices could potentiall modify the damaged DNA in the human peripheral lymphocytes of young Korean men.

DNA damage와 Apoptosis를 정량화하는 단세포전기영동법 (Single Cell Gel Electrophoresis (comet assay) to Detect DNA Damage and Apoptosis in Cell Level)

  • 류재천;김현주;서영록;김경란
    • 한국환경성돌연변이발암원학회지
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    • 제17권2호
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    • pp.71-77
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    • 1997
  • The single cell gel electrophoressis(SCGE) assay, also known as the comet assay, is a rapid, simple, visual and sensitive technique for measuring and analysing DNA breakage in mammalian cells. The SCGE or comet assay is a promising test for the detection of DNA damage and repair in individnal cells. It has widespread potential applications in DNA damage and repair studies, genotoxicity testing and biomonitoring. In this microgel electrophoresis technique, cells are embedded in agarose gel on microscope slides, iysed and electrophoresed under alkaline conditions. Cells with increased DNA damage display increased migration of DNA from the nucleus towards the anode. The length of DNA migration indicates the amount of DNA breakage in the cell. The comet assay is also capable of identifying apoptotic cells which contain highly fragmented DNA. Here we review the development of the SCGE assay, existing protocols for the detection and analysis of comets, the relevant underlying principles determining the behaviour of DNA and the potential applications of the technique.

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Comet 분석을 통한 방사선처리 고추세포의 핵 DNA 손상평가 (Assessment of Nucleus-DNA Damage in Red Pepper Cells Treated with γ-Radiation through Comet Assay)

  • 안정희;백명화;김재성;정정학;권순태
    • Journal of Plant Biotechnology
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    • 제31권3호
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    • pp.225-230
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    • 2004
  • 방사선에 노출된 고추유묘의 잎으로부터 세포핵을 분리하여 단세포전기영동방법인 comet 분석을 통하여 핵 DNA의 손상정도를 조사하였다. Comet 분석에서 꼬리부분의 길이 (T)와 머리부분의 길이 (H)를 측정하여 T/H 비율을 조사하였다. 무처리세포는 T/H 비율이 1.28이었으나 50 및 100 Gy의 방사선을 처리한 세포는 각각 3.54 및 3.39로 방사선처리에 의해 상당량의 핵 DNA가 손상을 입은 것으로 나타났다. Comet의 head-DNA량은 무처리가 76.8%였으나 50 및 100 Gy를 처리한 세포는 각각 55.9% 및 59.5%를 보였다. 고선량의 방사선을 처리하기 전에 미리 20 Gy 이하의 저선량 방사선을 종자에 전처리하였을 경우 종자의 발아 및 생장에 대한 영향은 없었지만, 후속 고선량에 대한 핵 DNA의 손상은 경감되는 경향을 보였다.

DNA Comet Assay를 이용한 과일의 방사선 조사 확인 (Detection of Irradiated Fruits Using the DNA Comet Assay)

  • 오경남;박준영;김경은;양재승
    • 한국식품과학회지
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    • 제32권3호
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    • pp.531-537
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    • 2000
  • 과일의 방사선 조사 여부를 DNA comet assay로 확인하였다. 포도, 자두, 딸기, 복숭아, 사과, 천도복숭아를 구입하여 1.0kGy이하의 저선량으로 조사하고 비조사 시료와 조사시료간의 DNA 손상청도를 육안 검사 및 측정된 comet tail length로 비교하였다. 모든 시료에서 비조사 시료보다 조사시료의 tail length가 더 길었으며 포도와 자두는 $0{\sim}0.5kGy$에서 뚜렷한 증가가 관찰되었다. 특히 자두의 비조사 시료는 포도, 딸기, 복숭아, 사과, 그리고 천도복숭아의 비조사 시료에 비해서 손상된 세포의 comet 모양의 핵이 많이 관찰되기는 하였으나 항상 비손상된 세포의 원형모양의 핵이 동반되었으며 조사된 시료에서는 모두 전반적으로 comet모양의 핵이 관찰되어 비조사 시료와 조사시료 간에 comet 양상을 비교할 수 있었다. Comet 분석을 이용한 과일의 방사선 조사 유무의 확인은 비조사 시료와 조사시료의 tail length의 측정 및 육안 검사 그리고 통계분석으로 확인이 가능하였다. 한편, 이미지 분석기와 같은 정밀한 시스템이 동반되면 저선량으로 조사된 시료들간의 comet 양상을 정확하게 확인하는 것이 가능하다고 생각된다. 따라서 식품의 'DNA comet assay'는 시료의 저장상태 및 화학적 물리적 충격에 대한 몇가지 제한점을 가지고 있지만 간단하고 신속하게 검지할 수 있으므로 다양한 식품의 방사선 조사 유무를 확인하는데 유용하게 활용될 수 있을 것으로 기대한다.

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DNA Comet Assay를 이용한 콩류의 방사선 조사 확인 (Detection of Irradiated Beans Using the DNA Comet Assay)

  • 오경남;김경은;양재승
    • 한국식품영양과학회지
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    • 제29권5호
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    • pp.843-848
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    • 2000
  • 콩류의 방사선 조사 여부를 DNA comet assay로 확인하였다. 대두, 강남콩, 그리고 팥을 각각 0.1, 0.3, 0.5, 0.7, 그리고 1.0 kGy의 저선량으로 조사하고 비조사 시료와 조사시료간의 DNA 손상정도를 현미경으로 육안 검사 및 comet의 tail 길이를 측정하여 상호 비교하였다. 모든 시료에서 비조사 시료보다 조사시료의 tail 길이가 더 길었으며 조사 선량이 증가할수록 tail 길이가 길게 나타났다. 비조사 시료에서도 손상된 세포의 comet 모양의 핵이 관찰되기는 하였으나 대부분 비손상된 세포의 원형모양의 핵이 관찰되었으며 조사된 시료에서는 comet 모양의 핵이 주로 관찰되는 경향이어서 비조사 시료와 조사 시료간에 comet 양상을 비교할 수 있었다. 한편 100개의 세포를 무작위로 선택하여 comet tail 길이를 측정하고 통계분한 결과, 비조사 시료와 조사시료간의 유의적인 차이가 있었고 조사선량이 증가할수록 tail 길이가 유의적으로 증가함을 확인하였다. DNA comet assay로 간단하고 비교적 저렴한 비용을 짧은 시간 내에 콩류의 방사선 조사 여부를 확인할 수 있었다.

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Mechanism study on DNA damage and Apoptosis induced by heak shock using Comet Assay

  • Seo, Young-Rok;Han, Sung-Sik;Kim, L. O′Neill;Ryu, Jae-Chun
    • 한국환경독성학회:학술대회논문집
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    • 한국환경독성학회 1997년도 제20회 화학물질의 환경독성과 건강영향
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    • pp.101-101
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    • 1997
  • Comet assay, single cell gel electrophoresis has been known as useful, rapid, simple, visual, and sensitive technique for measuring the DNA breakage in mammalian ce1ls. For evaluation of DNA damage using comet assay, early studies reported a change in comet length and intensity with DNA damage using simple visual technique, such as fluorescence microscopy with eyespiece. In recent, some workers are observing and analyzing nucleotide of comets using quantitative fluorescence image analysis system to estimate 'tail moment', which is defined as the product of the tail length and the fraction of total DNA in tail. Our laboratory also adopted the image analysis software for qualification. In addition, many of the practical features of comet assay render it potentially attractive as useful tool for molecular toxicology and carcinogenesis, because the system is already showing considerable promise as rapid predictor in both in vitro and in vivo experimental designs. Recently, the comet assay becomes a attractive technique to study of apoptosis, because apoptotic fragmentation of nuclear DNA into nucleosomal sizes can be evaluated by the comet assay. So, we attempted to apply the comet assay to studying the effect of various stress on the apoptosis-sensitive cell lines. Particularly, focusing on the hyperthermic apoptosis, we could find that heat shock(44˚C for 60 minutes) was sufficient to induced apoptosis in these cell lines. But using the highly sensitive comet assay, we could not detect DNA breaks immediately after heat shock.

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DNA Comet Assay를 이용한 방사선 조사 쇠고기와 돼지고기의 검지 기술 (Detection of Irradiated Beef and Pork by DNA Comet Assay)

  • 박준영;오경남;김경은;양재승
    • 한국식품영양과학회지
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    • 제29권6호
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    • pp.1025-1029
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    • 2000
  • 방사선 조사된 쇠고기와 돼지고기의 방사선 조사 여부를 판별하는데 DNA comet assay의 활용 가능성을 검토하였다. 쇠고기와 돼지고기는 Co-60 동위 원소를 조사원으로 하여 0.1, 0.3, 0.5, 0.7, 1.0 kGy의 총흡수선량( $\pm$ 5.0%)이 되도록 조사하여, 냉동상태로 보관하였다. 시료로부터 분리 된 세포는 agarose gel과 혼합하여 슬라이드에 깔아주고, lysis 및 전기영동을 하였다. 방사선 조사된 시료의 경우 세포로부터 끌려나오는 DNA절편들은 양극을 방향으로 tail이 형성되었고, 비조사 시료의 경우 tail이 없거나, 일부에서만 작은 tail이 관찰되었다. 방사선 조사유무는 0.1 kGy부터 현미경상으로 검지가 가능하였고, 선량간 차이의 유의성 여부는 통계분석을 통하여 검지가 가능하여, 쇠고기와 돼지고기의 신속한 검지 방법으로 DNA comet assay를 활용할 수 있을 것이다.

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어류혈구세포에 있어서 Single Cell Gel Electrophoresis를 응용한 DNA Single Strand Breack의 측정 (Application of Single Cell Gel Electrophoresis for Detection of DNA Single Strand Breaks in DNA of Fish Blood Cell)

  • 김기범
    • 한국수산과학회지
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    • 제36권4호
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    • pp.346-351
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    • 2003
  • Single-cell gel electrophoresis (comet assay) was used to detect DNA single strand break in blood cells from several marine fish species. Three fish species were collected from Georgia coastal area. Mummichog, Fundulus heteroclitus showed higher DNA damage than sea bass, Lateolabrax japonicus and trout, Oncorhynchus masou masou under the same experimental conditions. Mummichogs had more alkaline-labile sites on their DNA than other fish species. The comet assay with mummichog blood cells at pH 12.5 showed a dose-response curve with the increasing concentrations of hydrogen peroxide. While the isolated leucocytes showed no increase of DNA damage after in vitro exposure to 2-methyl-1,4-naphthoquinone (MNQ), erythrocytes showed dose-dependent DNA damage. These results indicate that the comet assay can be applied successfully as a bioassay using erythrocyte for environmental monitoring.

Comet assay를 이용한 방사선 조사육의 판별 (Discrimination of Irradiated Beef Using Comet Assay)

  • 정석규;박종흠;지승택;박금주;김해홍;현창기;신현길
    • 한국식품과학회지
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    • 제32권4호
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    • pp.747-754
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    • 2000
  • Comet assay를 이용하여 방사선 조사육의 조사여부 및 조사량을 판별해내는 방법을 개발하기 위해 1-10 kGy의 감마선 조사량으로 조사한 육조직에서 일어나는 DNA 손상을 측정하였다. Comet assay에 있어 최적의 comet image를 얻기 위해 세포 분리, 세포 lysis 및 전기영동에 대한 여러 조건들을 적용하여 최적의 조건을 확립하였다. DNA 손상도는 관찰되는 comet의 평균 tail length와 tail length에 의해 구분된 4 손상 등급에의 분포, 그리고 그 분포비율에 의해 본 연구에서 제시한 식에 의해 계산한 relative damage index(RDI) 값 등으로 비교 판정하였다. 평균 tail length와 RDI 값은 조사량이 증가함에 따라 증가하여 DNA 손상도가 증가됨을 나타내었으며, 평균 tail length으로는 조사량 간의 차이를 명확히 분별하기가 어려웠던 반면 RDI 값에 의하면 조사여부 및 조사량을 판별하기에 적합함을 알 수 있었다. 국내산 한우육과 수입 냉장육에 대하여 blind test를 실시한 결과 수입육이 높은 DNA 손상도를 나타내었는데 그 RDI 값은 방사선 조사에 의한 값보다는 비교적 낮은 것이어서 수입육의 DNA 손상은 방사선 조사가 아닌 저온처리의 결과인 것으로 판단되었다. 본 연구의 결과로부터 Comet assay가 우육의 방사선 조사여부 및 조사량 판별에 유용한 기술로 응용될 수 있을 것으로 판단되었다.

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