• Title/Summary/Keyword: DNA회복

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Cloning of a Gene Involved in Biosynthesis of ${\beta}-1,3-glucan$ in Saccharomyces cerevisiae (베타-1,3-글루칸 생합성에 관여하는 Saccharomyces cerevisiae 유전자의 클로닝)

  • Jin, Eun-Hee;Lee, Dong-Won;Kim, Jin-Mi;Park, Hee-Moon
    • The Korean Journal of Mycology
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    • v.23 no.2 s.73
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    • pp.129-138
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    • 1995
  • DNA fragment being able to restore in vitro activity of ${\beta}-1,3-glucan$ synthase was cloned by transformation of the Saccharomyces cerevisiae LP353 mutant strain with genomic library constructed in the YCp50. For the selection of transformants which showed no detectable phenotype linked to recovery of the defect in ${\beta}-1,3-glucan$ synthase activity, the colony autoradiography was succesfully applied. The restriction map of the cloned DNA fragment, which is 8.5-kb in length, was constructed. Both the YEplac195 and the YCp50 carrying the 8.5-kb fragment increased ${\beta}-1,3-glucan$ synthase activity of LP353 by two fold. Neither the YEplac195 nor the YCp50 carrying the 8.5-kb DNA fragment, however, complemented the temperature-dependent osmotic sensitivity which is another distinctive phenotype of LP353. Subcloning experiments indicated that a functional region was located in 4.8-kb BglII-KpnI fragment. The 4.8-kb fragment was also able to increase the level of ${\beta}-1,3-glucan$ content in cell wall as well as the resistance of cells to cell wall lytic enzyme, ${\beta}-1,3-glucanase$. The growth rate of the LP353 with 4.8-kb fragment was almost same as that of wild type strain in liquid medium with 1.2 M sorbitol at nonpermissive temperature. Taken these results together, the 4.8-kb fragment seemed to contain the BGS2 gene for ${\beta}-1,3-glucan$ synthase activity in yeast S. cerevisiae.

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Beta-adrenergic regulation of the DNA Synthesis and Epidermal Growth Factor Secretion in cultured Submandibular Gland Cells (악하선 배양세포의 DNA합성 및 Epidermal Growth Factor분비에 관련된 Beta-adrenergic 조절에 관한 연구)

  • 이금영;소준노
    • The Korean Journal of Zoology
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    • v.34 no.3
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    • pp.410-419
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    • 1991
  • 마우스 악하선 배양세포의 DNA와 단백질 합성 및 epidermal growth factor(EGF) 분비에 미치는 isoproterenol(IPR)의 효과를 조사하였다. 마우스 악하선으로부터 분리되어 배양된 상피형세포의 DNA및 단백질 합성은 IRP에 의해 농도 의존적으로 현저하게 감소하였다. 이와는 달리 IPR처리 1시간 후에 IPR-처리 마우스로부터 얻은 혈청은 악하선 배양세포의 단백질 합성에는 별 영향을 미치지 못하였으나, DNA합성은 현저하게 증가시켰다. IPR에 의한 악하선 세포의 DNA 합성능의 감소는 propranolol에 의해 차단되지 않았으나 ascorbate에 의해서는 회복되었다. 악하선 배양세포의 DNA 및 단백질 합성을 저해한 IPR의 처리에 의해 배양세포의 EGF분비는 현저히 증가되었다. 이상과 같은 결과는 악하선 세포의 DNA 및 단백질 합성에 작용한 IPR의 효과는 beta-adrenoceptor의 흥분에 의한 것이라기 보다는 IPR로부터 유래된 free radical에 의한 세포독성에 기인함을 시사한다. 따라서 IPR의 생체내 투여에 의한 악하선의 비대화를 보고 한 기존의 결과는 IPR이 악하선에 직접 작용하여 유발된 것이 아닌 다른 경로를 통한 간접적인 효과로 판단될 수 있을 것이다.

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Environmental Toxic Agents on Genetic Material and Cellular Ativity V. The Roles of DNA Polymerases on Mutagen-Induced DNA Repair Synthesis in Relation to Cell Cycle in Chinese Hamster Ovary Cells (환경성 유해요인이 유전물질과 세포활성에 미치는 영향 V. CHO세포에서 세포주기에 따라 돌연변이원에 의해 유발된 DNA회복합성에 미치는 DNA중합효소의 역할)

  • 엄경일;김춘광;신은주;문용석;이천복
    • Environmental Mutagens and Carcinogens
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    • v.9 no.1
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    • pp.23-32
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    • 1989
  • Chinese hamster ovary (CHO)-K1 cells echibited a differential sensitivity in the process of DNA repair synthesis induced by ethyl methanesulfonate (EMS) or bleomycin (BLM) in relation to cell cycle. Two assays were employed in this study: alkaline elution and unscheduled DNA synthesis. The post-treat-ment with aphidicolin (APC), an inhibitor of DNA polymerase alpha, inhibited DNA repair synthesis induced by EMS in G2 phase, while APC did not show any effect on BLM-induced DNA repair synthesis in all phases. On the other hands, the 2', 3'-dideoxythymidine (ddTTP), an inhibitor of DNA polymerase beta, inhibited DNA repair synthesis induced by EMS or BLM in both of G1 and G2 phases. These results suggested that the involvement of DNA polymerase alpha and beta in DNA repair was dependent on cell stage or used chemical agent.

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Chinese Hamster Ovary세포에서 Benzo(a)pyrene과 3-Methylcholanthrene에 의한 DNA 단사절단과 복제억제에 미치는 Saponin의 영향

  • 이정섭;이형호;박기현;박상대
    • Environmental Mutagens and Carcinogens
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    • v.10 no.2
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    • pp.127-134
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    • 1990
  • 본 연구는 Chinese hamster ovary (CHO-KI) 배양세포에서 S-15분획에 의해 활성화된 bezo(a) pyrene (BP)과 3-methylcholanthrene(MC)에 의해 유발된 DNA단사절단과 DNA복제억제 및 그 회복과정에 미치는 한국산 인삼추출물 saponin의 영향을 조사하여 다음과 같은 결과를 얻었다. S-15분획으로 활성화된 10-5 M의 BP 또는 MC를 1.0-10ng/ml의 saponin과 함께 처리할 경우 BP와 MC단독처리군에 비해 DNA 단사절단률이 감소하였다. DNA 합성률은 활성화된 10-5M의 BP와 10-6 M의 MC에 의해 각각 50% 및 75% 억제되었으나, 0.1-10ng/ml의 saponin을 동시에 처리할 경우 DNA 합성억제률이 약 10% 이상 둔화되었다.

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T$_4$ Endonuclease V에 대한 안정동위원소 핵자기공명 연구

  • 이봉진;이태우;유준석;임형미
    • Proceedings of the Korean Society of Applied Pharmacology
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    • 1993.04a
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    • pp.137-137
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    • 1993
  • 방사선, 자외선, 화학물질 등 여러 변이원에 의해 생긴 DNA 손상의 대부분은 생체내에 존재하는 효소들에 의해 수복(repair)되어 DNA는 안정하게 유지된다. T$_4$ phage 유래의 T$_4$ endonuclease V는 자외선에 의해 DNA에 pyrimidine dimer가 생겼을때 이것을 특이적으로 절제 수복하는 효소이다. 인간의 질환인 색소성 걸피증(Xeroderma pigmentosum)은 태양광선, 특히 자외선에 의해 고빈도로 피부암을 발생한다. 이 질환은 유전적으로 DNA 수복기구에 장애가 있기 때문에 일어난다. 색소성 건피증의 배양세포에 T$_4$ endonuclease V를 도입하면 세포의 DNA 수복능력이 회복되기 때문에 인간과 phage라는 서로 멀리 떨어진 생물종에 공통의 DNA 수복기구가 존재하고 있다는 것을 알 수 있다.

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A Comparison of Hydrated versus Dehydrated Gels for Evaluation of Apoptosis in Comet Assay Slides (Comet assay slides 에서 나타난 apoptosis 평가에서 함수 및 탈수 겔의 비교)

  • 최민철;수즌엠러루;에드워드엘질럿
    • Journal of Veterinary Clinics
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    • v.13 no.2
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    • pp.158-162
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    • 1996
  • Comet assay 는 포유류 세포에서 DNA의 파괴를 측정하는데 있어 신속하고 단순하며 시각적이고 민감한 방법이다. Apoptosis에서는 세포핵의 광범위한 DNA의 붕괴가 일어나므로 comet assay는 종양세포에서 apoptosis가 발생되었는가를 알아내는데 유용하다. 본 연구는 apoptosis 연구의 결과가 변화되지 않도록 comet assay slides를 좀 더 오래 보관할 수 있는 방법을 개발하고자 시행되었다. 개의 종양세포를 가지고 alkali comet assay를 끝낸 뒤 slides를 진공 건조기에서 꺼내서 증류수로 점적하여 10-20분간 침수시키고 현광현미경하에서 육안적으로 관찰하였다. 건조후 3-4일, 1주, 2주, 3주, 4주 및 7주의 slides에서 apoptosis 회복율(%)은 각각 98.1, 98.3, 99.4, 80.8 및 35.2%이었다. 3주 이내의 slides에서 대조군과 비교하여 apoptosis 회복율에서 차이가 없었으나 4주 이상의 slides를 건조후 침수시키는 방법을 이용하였을 때 apoptosis 평가에서 건조 후 3주간까지는 처음의 결과와 차이가 없으며, 이 방법을 이용하여 comet slide의 좀 더 긴 기간이 보관과 보관후의 재평가에서 이용될 수 있는 좋은 방법이 된다.

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Genetic Relationships of Sandfish (Arctoscopus japonicas) from Five Different Areas of Korea and Japan Based on Mitochondrial DNA and Microsatellite Analyses (Mitochondrial DNA와 microsatellite marker 분석을 통한 한국과 일본에 서식하는 5 지역의 도루묵(Arctoscopus japonicas)에 대한 유전학적 유연관계 분석)

  • Kim, Eun-Mi;Kang, Hyun-Sook;Kang, Jung-Ha;Kim, Dong-Gyun;An, Cheul Min;Lee, Hae Won;Park, Jung Youn
    • Journal of Life Science
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    • v.25 no.11
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    • pp.1204-1213
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    • 2015
  • A comprehensive analysis of the population structure of the sandfish (Arctoscopus japonicas), the most abundant fishery resource in the East Sea of Korea, has not been carried out, despite its importance in Korea. The present study examined the genetic diversity and differences between five populations (two Japanese and three Korean populations) of A. japonicas captured in the East Sea using both the 401 bp sequence of mitochondrial DNA (mtDNA, cytochrome b) and five microsatellite DNA (msDNA) markers. The results of the analysis using the Cyt b sequence revealed 27 haplotypes. Based on msDNA variations, the estimated expected heterozygosity (HE) in each population ranged from 0.68 (Gampo, Korea) to 0.7765 (Erimo, Japan). Pairwise FST and AMOVA tests using both the Cyt b sequence and msDNA data pointed to significant differences between the Korean and Japanese populations (mtDNA; FST=0.2648, p<0.05, msDNA; FST=0.0814, p<0.05). These results were similar to the results of UPGMA, PCA, and structure analysis. In these analyses, the five populations were assigned to two groups (Korean populations and Japanese populations). These results shed light on the genetic diversity and relationships of A. japonicas and contribute to research on the evaluation, conservation, and utilization of Korean A. japonicas as genetic resources.

Benzopyrene에 노출된 광어(Conger myriaster) 혈액 cells과 개조게(Saxidomus purpurata) 조직 cells을 이용한 in vivo DNA single strand breakage

  • 김소정;오로라;하병혁;최은석;장만;이택견
    • Proceedings of the Korea Society of Environmental Biology Conference
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    • 2002.11a
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    • pp.145-153
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    • 2002
  • 유해 화학 물질류에 의해 오염된 해양 환경 시료의 환경독성 수준을 평가하기 위하여 다양한 화학물질에 대해 민감성이 우수한 생물학적 독성평가기법을 개발 하고자하였다. 지속성 유기오염 물질 중 다환 방향 족 탄화수소(PAHs)를 처리한 광어(Conger myriaster)와 개조개(Saxidomus pupurata)의 DNA 손상정도를 single cell gel electrophoresis assay(comet assay)를 통해 분석하였다. PAHs 중 광양만에서 높은 농도로 검출되는 benzo(a)pyrene을 농도별(0, 10, 50, 100 ppb)로 처리한 후 2일과 4일에 광어의 혈액세포와 개조개의 근육세포를 채취해 comet assay를 실시하였다. benso(a)pyrene에 대한 DNA 손상정도를 처리된 농도와 생물종에 따라 다르게 나타났는데 광어의 혈액세포는 2일에 가장 DNA 손상정도가 높았고, 4일에는 회복되는 경향을 나타냈다. 개조개의 근육세포는 시간이 지나면서 DNA 손상정도가 증가하는 경향을 보였다. 이와 같은 결과는 comet assay 기법이 유해 화학물질로 오염된 해양생물 종의 환경독성을 검색하는 유용한 수단이 될 수 있음을 보여준다.

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Ecophysiological Characteristics Changes in the Pacific Oyster, Crassostrea gigas, after Spawning Season in Off-bottom Culture (수평망식 양식 굴, Crassostrea gigas의 산란기 이후 생태·생리학적 특성 변화)

  • Kim, Su Kyoung;Choi, Eun Hee;Han, Hyun Seob;Lim, Hyun Jeong
    • The Korean Journal of Malacology
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    • v.28 no.3
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    • pp.215-223
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    • 2012
  • The ecophysiological characteristics of the oyster Crassostrea gigas in Taean area, west coast of Korea, were investigated after main spawning season from September 2011 to January 2012 to confirm the recovery process of condition. The cupped oysters, from 4 different off-bottom culture areas were compared the gonad indices, histological analysis combined with measurement of RNA/DNA contents and ratios in gonad of each sex were undertaken. To evaluate the health condition of oyster after spawning, the RNA/DNA ratio in adductor muscle, fatness and condition index (CI) were used. The results showed that cupped oysters cultured in Uihang coastal area were different physiological aspects than other experiment areas, namely continuously decreasing RNA/DNA content and ratio in adductor muscle, lowest CI and fatness. Oysters cultured in Iwon Station 1 and 2 showed fast recovery in RNA/DNA, increase in fatness and CI during post-spawning stage until October rapidly and there after it decreased. Oysters in Shinduri showed rapidly decrease in fatness and CI until October. On the contrary to this factors, RNA/DNA ratio in adductor muscle increased as like protein until October. Partially spawning season could be observed until December in Shinduri and Iwon Station 1.

Effect of fisetin on UVB-induced apoptosis and DNA single strand breaks in NIH3T3 cells (NIH3T3 세포에서 UVB에 의한 세포고사와 DNA 단사절단에 미치는 fisetin의 효과)

  • Jeong, Se-Jin;Kim, Don-Young;Han, Seol-Hee;Shin, Sang-Min;Cha, Jae-Young;Park, Nou-Bog;Lee, Jung-Sup;Park, Jong-Kun
    • Journal of Life Science
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    • v.17 no.1 s.81
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    • pp.64-69
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    • 2007
  • In the present study, we have investigated the effect of fisetin on the apoptosis and DNA single strand breaks in ultraviolet light B (UVB)-exposed NIH3T3 cells. Exposure of cells to UVB light $(200J/m^2)$ and post-incubation in growth medium for 48 hr resulted in about 50% of cells with apoptotic nuclear fragmentation. Addition of various concentrations of fisetin in the postincubation medium, however, significantly reduced the apoptotic nuclear fragmentation as compared with the values expected when the effects are additive and independent. DNA single strand breaks induced by UVB exposure were also significantly decreased by postincubation with fisetin. By Western blot analysis, fisetin post-incubation was shown to attenuate the p53 upregulation upon UVB exposure. Furthermore, the decrease of proliferating cell nuclear antigen (PCNA) level upon UVB exposure was alleviated by fisetin postincubation. These results suggest that fisetin decrease the apoptosis and increae DNA repair in a possible association with alteration of p53 and PCNA levels in UVB-exposed cells.