• 한국미생물·생명공학회지
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• 제18권6호
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• pp.607-612
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• 1990

생분해성 고분자로서 중요한 poly-$\beta$-hydroxybutyrate(PHB)의 생합성에 있어서 포도당과 암모늄농도의 영향을 규명하기 위하여 Alcaligenes eutrophus를 회분식으로 배양하였다. PHB는 질소원이 고갈되면서 생성되었고 건조세포무게의 약 80까지 축적되었다. 초기 포도당농도가 높을수록 세포성장과 PHB 합성은 억제되었지만 최종 세포농도와 건조세포무게에 대한 PHB 축적비는 증가하였다. 초기 암모늄농도가 낮을수록 최종 세포와 PHB 농도가 낮았지만 건조세포무게에 대한 PHB 축적비는 증가하였다. 배양도중 산소공급을 중단했을 때 세포성장과 PHB 합성이 중단되었다.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제9권4호
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• pp.422-428
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• 1999

Aromatic hydrocarbons can be utilized as carbon and energy sources by some microorganisms at lower concentrations. However, they can also act as stresses to these organisms at higher concentrations. Pseudomonas sp. DJ-12 is capable of degrading 0.5 mM concentration of benzoate and 4-chlorobenzoate (4CBA). In this study, the exposure of Pseudomonas sp. DJ-12 to the pollutant stresses of benzoate and 4CBA at various concentrations was comparatively studied for its cellular responses, including survival tolerance, degradability of the aromatics, and morphological changes. Pseudomonas sp. DJ-12 utilized 0.5 to 1.0mM benzoate and 4CBA as carbon and energy sources for growth. However, the organism could not degrade the aromatics at concentrations of 3 mM or higher, resulting in reduced cell viability due to the destruction of the cell envelopes. Pseudomonas sp. DJ-12 cells produced stress-shock proteins such as DnaK and GroEL when treated with benzoate and 4CBA at concentrations of 0.5mM, or higher as sublethal dosage; Yet, there were differing responses between the cells treated with either benzoate or 4CBA. 4CBA affected the degradability of the cells more critically than benzoate. The DnaK and GroEL stress-shock proteins were produced either by 1mM benzoate with 5 min treatment or by higher concentrations after 10min. The proteins were also induced by 0.5mM 4CBA, however, it needed at least 20min treatment or longer. These results indicate that the chlorination of benzoate increased the recalcitrance of the pollutant aromatics and changed the conditions to lower concentrations and longer treatment times for the production of stress-shock proteins. of stress-shock proteins produced by the aromatics at sublethal concentrations functioned interactively between the aromatics for survival tolerance to lethal concentrations.

• 원예과학기술지
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• 제34권3호
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• pp.442-452
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• 2016

Plasmodiophora brassicae Woron.에 의한 뿌리혹병은 배추과 작물에 발생하여 전세계적으로 심각한 피해를 주고 있다. 본 연구에서는 뿌리혹병균에 대한 양배추의 저항성 특성을 조사하기 위하여, 일반 품종, 뿌리혹병 저항성(CR) 품종 및 CR 계통 그리고 저항성과 감수성 계통의 교배로부터 얻은 $F_3$ 계통에서 뿌리혹병균 균주들에 의한 뿌리혹병 발생 조사하였다. 국내 시판 중인 일반 양배추 16품종에서 뿌리혹병균 4균주(DJ, HN1, GN1 및 YC)에 의한 뿌리혹병 발생을 조사한 결과, 이들 뿌리혹병균들은 감수성 배추에서는 유사한 뿌리혹병 발생을 보였으나, 양배추 16품종에서는 균주에 따라 뿌리혹병 발생에 큰 차이가 있었다. 양배추에서 병원력이 가장 강한 균주는 YC 균주였고, 그 다음은 GN1, HN1, DJ 균주순이었다. 일반 양배추 품종에서 뿌리혹병 발생이 뿌리혹병균의 병원력에 따라 차이를 보이는 것과 달리, CR 양배추 계통인 'YCR478'과 CR 양배추 2품종은 YC, GN1, HN1 및 DJ 균주를 포함한 뿌리혹병균 12개 균주에 대하여 모두 고도의 저항성을 보였다. 한편, 'YCR478'과 감수성 계통 'C1176'의 교배로부터 얻은 $F_3$ 107계통의 뿌리혹병균 3개 균주에 대한 저항성 차이를 조사한 결과, YC, GN1 및 DJ 균주에 대하여 감수성 반응을 나타내는 $F_3$ 계통은 각각 89, 33, 6개였다. 이와 반대로 이들 균주에 대하여 저항성을 보이는 계통은 각각 6, 36, 67개였다. 이상의 결과로 양배추의 뿌리혹병 저항성은 P. brassicae 균주들의 병원력 정도에 따라 영향을 받는 것으로 생각되었다.

• 한국응용약물학회:학술대회논문집
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• 한국응용약물학회 2007년도 Proceedings of The Convention of The Korean Society of Applied Pharmacology
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• pp.147-153
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• 2007

Central to developing new treatment strategies for late onset sporadic Parkinson's disease (PD) and early onset familial PD is resolving the enigma of the specific vulnerability exhibited by substantia nigra dopamine (DA) neurons despite multiple risk factors. Neuropathological evidence from both human and experimental models of PD firmly supports a significant role for oxidative stress (OS) and mitochondrial dysfunction in the death of nigral DA neurons. Largely unknown are the genes underlying selective susceptibility of nigral DA neuron to OS and mitochondrial dysfunction and how they effect nigral DA cell death. To overcome the paucity of nigral DA neurons as well as the dilution effect of non-DA cells in brain tissues, we have developed wild type DA cell line model, SN4741 and mutant DJ-1 (-/-) DA cells, appropriate for microarray analysis and differential mitochondrial proteomics. Mutations in the DJ-1 gene (PARK7), localized in cytoplasm and mitochondria, cause autosomal recessive early onset PD. Through microarray analysis using SN4741 cells followed by validation tests, we have identified a novel phylogenically conserved neuroprotective gene, Oxi-a, which is specifically expressed in DA neurons. The knockdown of the gene dramatically increased vulnerability to as. Importantly as down-regulated the expression level of the gene and recovery of its expression via transient transfection exerted significant neuroprotection against as insult. We also have identified altered expression of mitochondrial proteins and other familial PD genes in DJ-1 (-/-) mutant cells by differential mitochondrial proteomics. In DJ-1 (-/-) cells the knockdown of the other familial PD genes (Parkin and PINK1) dramatically increased susceptibility to as. Thus, further functional characterization of the Oxi-$\alpha$ gene family and the mitochondrial alteration in the DJ-1 (-/-) cell model will provide the rationale for the neuroprotective therapy against both sporadic and familial PD.

• 미생물학회지
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• 제33권1호
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• pp.22-26
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• 1997

Pseudomonas sp. DJ77의 게놈 library로부터 phenanthrene 분해에 관련된 유전자를 포함하는 약 5-kb의 XhoI 절편을 pBLUESCRIPT SK(+)로 클로닝하였으며, 이 재조합 plasmid를 pUPX5라 명명하였다. 이 재조합 균주에 catechol과 2,3-dihydroxybiphenyl 용액을 분무하면 노란색의 meta-cleavage 화합물이 생성됨을 관찰 할 수 있었다. 그리고 효소 활성을 측정한 결과 catechol에서보다 2,3-dihydroxybiphenyl에 더 큰 활성을 나타냈다. 이 부분에 존재하는 2,3-dihydroxybiphenyl 1,2-dioxygenase 유전자의 위치를 결정하고, 이 유전자를 phnQ라 명명하였다.

• 한국미생물·생명공학회지
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• 제23권1호
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• pp.104-109
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• 1995

The gene responsible for dechlorination of 4-chlorobenzoate (4CBA) was cloned in E. coli XL1-Blue from Pseudomonas sp. DJ-12. The cloned cell of E. coli Cjl had the hybrid pBluescript SK(+) plasmid, into which about 9.5 kb genomic DNA fragment of PseudOmonas sp. DJ-12 was inserted. The subclone of pCJlOl was constructed by inserting the 3.4 kb EcoRI-HindIII fragment of pCJl into the vector. Those cloned cells could be simply selected by halo formation around the colonies which was the precipitate of AgCl produced by reaction of AgNO$_{3}$ and chloride ion liberated by bacterial dechlorination of 4CBA- Such a plate assay method was standardized by the procedure that the colonies grown for 2 days on the Cl$^{-}$-free plate medium containing 1 mM 4CBA were flooded with 0.1 M AgNO$_{3}$ solution.

• 한국조리학회지
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• 제15권1호
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• pp.59-66
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• 2009

제주 대정 마늘의 일반성분 함량은 평균적으로 수분 63.0%, 유기물 35.6%, 무기물 1.40%로 전국 주요 산지별 마늘과 유사하였다. 제주 대정 마늘의 마그네슘, 인, 나트륨 함량은 전국 주요 산지별 마늘보다 높았지만, 철, 칼슘, 총산도는 비슷하였다. 특히 제주 대정 알뜨르 마늘의 평균 비타민 C함량은 전국 주요 산지별 마늘과 중국산 마늘보다 매우 높은 함량을 나타내었다. 제주 대정 마늘의 유리당 함량은 전국 주요 산지별 마늘보다는 매우 높았지만 중국산 마늘보다는 낮았다.

• 한국어류학회지
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• 제18권1호
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• pp.1-11
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• 2006

RAPD 분석을 하기 위해서 우리나라 내륙의 충주지역과 서해에 인접한 당진지역에서 빙어 (Hypomesus nipponensis)의 두 지리적 집단으로부터 genomic DNA 를 분리 추출하였다. OPB-06, OPB-10, OPB-13, OPB-17, OPC-09, OPC-17 및 OPC-20의 7개 primer를 사용하여 shared loci, polymorphic 및 specific loci를 확인하였다. 충주 빙어집단에서는 한 primer 당 383개의 loci가 관찰되었고, 당진 집단에서는 287개의 loci가 확인되었다. 관찰된 loci 중에 23.8%에 해당되는 91개의 polymorphic loci가 충주 집단에서 확인되었고, 당진 집단에서는 47 (16.4%)개가 확인되었다. 각 집단에서 공유하는 loci의 수는 각각 충주 빙어집단에서 198개 그리고 당진 집단에서는 176개로 관찰되었다. 충주 빙어집단과 당진 집단에서는 각각 44개와 75개의 specific loci가 나타났다. 특히 두 집단이 공유하는 loci의 수는 99개로서 primer 당 평균 14.1개로 확인되었다. 두 빙어 집단의 bandsharing value의 평균값은 $0.700{\pm}0.008$로서 0.600에서 0.846의 범위를 나타내었다. 각각을 비교해 보면, 충주 집단에 속한 개체의 bandsharing value의 평균값이 당진 집단에서의 값보다 높게 나타났다. 7개의 primer를 사용하여 얻어진 dendrogram은 cluster 1 (CJ 01, 02, 03, 04, 05, 06, 07, 08, 09, 10 및 11), cluster 2 (DJ 01, 02, 03, 04, 05, 06, 07, 08 및 09) 및 cluster 3 (DJ 10 및 11)와 같이 3개의 유전적 클러스터로 나뉘어졌다. 두 집단의 유전적 거리는 0.040에서 0.545 사이로 나타났다. 따라서 RAPD-PCR 분석을 통해서 빙어 두 집단의 유의성이 있는 유전적 거리를 확인하였다.

• The Korean Journal of Physiology and Pharmacology
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• 제21권6호
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• pp.625-632
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• 2017

Familial Parkinson's disease (PD) has been linked to point mutations and duplication of the ${\alpha}$-synuclein (${\alpha}$-syn) gene. Mutant ${\alpha}$-syn expression increases the vulnerability of neurons to exogenous insults. In this study, we developed a new PD model in the transgenic mice expressing mutant hemizygous (hemi) or homozygous (homo) A53T ${\alpha}$-synuclein (${\alpha}$-syn Tg) and their wildtype (WT) littermates by treatment with sub-toxic (10 mg/kg, i.p., daily for 5 days) or toxic (30 mg/kg, i.p., daily for 5 days) dose of 1-methyl-4-phenyl-1,2,3,6-tetrahydropyridine (MPTP). Tyrosine hydroxylase and Bcl-2 levels were reduced in the ${\alpha}$-syn Tg but not WT mice by sub-toxic MPTP injection. In the adhesive removal test, time to remove paper was significantly increased only in the homo ${\alpha}$-syn Tg mice. In the challenging beam test, the hemi and homo ${\alpha}$-syn Tg mice spent significantly longer time to traverse as compared to that of WT group. In order to find out responsible proteins related with vulnerability of mutant ${\alpha}$-syn expressed neurons, DJ-1 and ubiquitin enzyme expressions were examined. In the SN, DJ-1 and ubiquitin conjugating enzyme, UBE2N, levels were significantly decreased in the ${\alpha}$-syn Tg mice. Moreover, A53T ${\alpha}$-syn overexpression decreased DJ-1 expression in SH-SY5Y cells. These findings suggest that the vulnerability to oxidative injury such as MPTP of A53T ${\alpha}$-syn mice can be explained by downregulation of DJ-1.

• Journal of Microbiology
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• 제37권4호
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• pp.224-228
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• 1999

Benzaldehyde dehydrogenase (BZDH), an enzyme involved in the degradation of toluene and xylenes, is encoded by the phnN gene of Pseudomonas sp. strain DJ77. We determined the nucleotide sequence of a DNA fragment of 1,803 base pairs which included the phnN gene. The fragment contained an open reading frame of 1,506 base pairs to accommodate th 55 kDa sized enzyme encoding BZDH. The enzyme efficiently oxidized benzaldehyde, salicylaldehyde, m-tolualdehyde and ps-tolualdehyde.