대구경 배관에서 소구경 배관으로 연결하는 부위 및 배관의 방향 전환을 위해 사용하는 소켓용접부는 용입불량 및 사용시간이 경과되면서 내부로부터 진전될 수 있는 균열 등의 결함을 가질 수 있다. 그러나 지금까지 적용하고 있는 비파괴검사법인 액체침투탐상과 방사선투과검사로는 내부에 존재하는 균열성 결함의 검출이 어렵다. 본 연구에서는 소켓용접부 내부의 균열성 결함 검출을 위한 초음파 검사 기법을 확립하였고, 검사를 수행할 수 있는 초음파 탐촉자를 설계 제작하였으며, 자동으로 검사할 수 있는 검사 장비와 제어용 운영 프로그램을 개발하였다. 개발된 장비는 컴퓨터를 기반으로 하고 있으며, pulser/receiver를 내장하고 100 MHz 고속 A/D board를 사용하여 초음파 탐상기 역할을 프로그램으로 구현하였으며, ISA interface type으로 4축 제어용 motion controller를 개발하여 자동 검사를 수행하는 scanner를 제어하도록 하였으며, 검사 결과는 소켓용접부 단면을 실시간 영상으로 나타내도록 되어 있다. 인공결함 시험편의 결함을 평가한 결과 결함의 깊이가 1mm인 결함의 평가 길이는 실제 크기보다 작게 나타내고 있으며, 결함의 깊이가 증가할수록 결함의 길이가 더 크게 평가되었다. 본 연구로 개발한 장비는 원자력 발전소나 화학플랜트에 많이 널려 있는 소켓용접부 내의 용입불량, 피로 균열 등을 검출하여 객관적인 검사 결과를 제시할 수 있으므로 설비 안전 관리 및 보수 부위 결정에 기여할 수 있을 것으로 기대된다.
Park, Seon-Mee;Kwon, Soon-Kil;Son, Bo-Ra;Shin, Kyeong-Seob;Woo, Chan-Won;Kim, Eung-Gook;Kim, Seok-Yong
대한미생물학회지
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제35권1호
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pp.19-29
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2000
Although most persons infected with Helicobacter pylori harbor a single strain of the organism, multiple strain colonization in the same patient is also occasionally reported in developed countries. The aims of this study were to determine the prevalence of multiple strain colonization in Korean patients and to detect the cagA, iceA1, and babA status of H. pylori isolated from the antrum and body of the stomach. H. pylori was obtained from 35 patients from the antrum and body of the stomach. The genomic diversity of H. pylori was determined by random amplified polymorphic DNA analysis. The status of cagA, iceA1, and babA genes of H. pylori was assessed by polymerase chain reaction with appropriate primers. Clearly different diversity patterns were identified among the isolates from 35 individual patients. Eighteen (51.4%) patients had a single strain of H. pylori. Eight (22.9%) and nine (25.7%) patients had subtypically (one or two bands difference) and typically (clearly different pattern) different strains of H. pylori in the antrum and body, respectively. Among the 70 isolates of H. pylori from 35 patients, the positive rates of 349-bp and 208-bp cagA gene fragments and the iceA1 gene were 68/70 (97.1%), 68/70 (97.1%), and 58/70 (82.9%), respectively. However, the babA gene was found in 22/66 cases (31.4%). In five out of 18 patients with a single strain, the genetic status of cagA, iceA1, and babA varied between the isolates from the antrum and the body. In 8/17 patients with sub typically or typically different strains, the gene status differed between antrum and body isolates. The prevalence of co-colonization with typically or subtypically different strains is high in Korea, and sub-clones with different pathogenic gene status exist within strains of identical RAPD patterns.
배경 : 결핵의 진단에 있어 결핵균 배양검사는 결핵의 확진 검사이지만 배양에 최소한 6-8주가 소요되어 진단 및 치료가 지연되는 단점이 있다. PCR 법은 신속하고 예민하게 결핵균을 검출할 수 있지만 위양성율과 위음성율이 높아 문제시 되고 있다. 최근에 개발된 LCR법과 PCR-Hybridization은 PCR 법 보다도 민감하게 결핵균을 검출할 수 있는 것으로 알려져 있다. 이에 저자들은 하상균 배양을 기준으로 in house PCR, LCR 및 PCR- Hybridization 각각의 임상적 유용성을 알아보고자 한다. 방법 : 1998년 8월에 결핵진단을 위해 세브란스 병원 임상 병리과에 의뢰된 75검체를 대상으로 AFB 도말 염색 검사, 결핵균 배양 검사(3% Ogawa 배지, 8주간), in house PCR, LCR(Abbott LCx kit) 및 PCR Hybridization을 시행하여 각각의 민간도와 특이도를 평가해보았다. 결과 : 항산균 배양법을 기준으로 판단할 때 in house PCR, LCR(Abbott LCx kit) 및 PCR-Hybridization의 민감도는 각각 40%, 80%, 100%였고 특이도는 98.6%, 94.3%, 94.3%였다. 결론 : LCR법과 PCR-Hybridization은 결핵균 검출에 있어 우수한 민감도와 특이도를 보여 결핵의 조기진단에 유용할 것으로 사료된다.
한국생물정보시스템생물학회 2000년도 International Symposium on Bioinformatics
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pp.21-22
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2000
Expressed sequence tags (EFTs) are the partial segments of cDNA produced from 5 or 3 single-pass sequencing of cDNA clones, error-prone and generated in highly redundant sets. Advancement and expansion of Genomics made biologists to generate huge amount of ESTs from variety of organisms-human, microorganisms as well as plants, and the cumulated number of ESTs is over 5.3 million, As the EST data being accumulate more rapidly, it becomes bigger that the needs of the EST analysis tools for extraction of biological meaning from EST data. Among the several needs of EST analyses, the extraction of protein sequence or functional motifs from ESTs are important for the identification of their function in vivo. To accomplish that purpose the precise and accurate identification of the region where the coding sequences (CDSs) is a crucial problem to solve primarily, and it will be helpful to extract and detect of genuine CD5s and protein motifs from EST collections. Although several public tools are available for EST analysis, there is not any one to accomplish the object. Furthermore, they are not targeted to the plant ESTs but human or microorganism. Thus, to correspond the urgent needs of collaborators deals with plant ESTs and to establish the analysis system to be used as general-purpose public software we constructed the pipelined-EST analysis system by integration of public software components. The software we used are as follows - Phred/Cross-match for the quality control and vector screening, NCBI Blast for the similarity searching, ICATools for the EST clustering, Phrap for EST contig assembly, and BLOCKS/Prosite for protein motif searching. The sample data set used for the construction and verification of this system was 1,386 ESTs from human intrathymic T-cells that verified using UniGene and Nr database of NCBI. The approach for the extraction of CDSs from sample data set was carried out by comparison between sample data and protein sequences/motif database, determining matched protein sequences/motifs that agree with our defined parameters, and extracting the regions that shows similarities. In recent future, in addition to these components, it is supposed to be also integrated into our system and served that the software for the peptide mass spectrometry fingerprint analysis, one of the proteomics fields. This pipelined-EST analysis system will extend our knowledge on the plant ESTs and proteins by identification of unknown-genes.
본 논문에서는 산불에 의한 가공송전선의 열화에 대한 몇 가지 특성들과 비파괴 검사를 다룬다. 노화된 ACSR 도체에 대한 대기부식과 전해부식과 같은 부식기구를 설명한 후에 부식검출에 대해서 기술한다. 솔레노이드 코일의 임피던스 해석을 통하여 와류센서가 도체의 싱한 결함과 국부부식을 검사하는데 유용하게 사용될 수 있음을 확인하였다. 시험 도체를 코일 내부에 삽입한 경우에 센서코일의 임피던스가 변하므로, 산불에 의해 초래된 열화 정도를 측정하는 것이 가능하였다. 인공화염에 의해 열화 된 몇 개의 시료들을 사용하여 인장강도, 신장율과 센서 임피던스가 측정되었다. 화염 기간을 어느 정도 증가시키면, 알루미늄 소선의 인장은 현저하게 감소하기 시작하나 아연도금 강소선은 약간의 아연층이 부식되지만 인장은 초기와 유사하게 유지하였다. 일반적으로 도체의 인장하중이 감소하고 반대로 신장율이 증가하면 센서 임피던스는 감소하는 것을 알 수 있었다. 따라서, 센서의 출력은 도체의 기계적 특성 변화를 나타내므로 이 센서는 산등성이에 가설된 ACSR 도체에 대해 산불로 인한 열화상태를 검출하는데 이용할 수 있다. 결국, 산불에 의한 심한 열화상태에 대한 중요한 정보를 얻는데 솔레노이드 코일을 응용할 수 있다는 것을 확인하였다.
Background and Objectives : Serum stimulated thyroglobulin(stim Tg) was well-known for useful marker in detecting of recurrent or persistent papillary thyroid cancer after total thyroidectomy. Serum stim Tg level may be possibly related with recurrent tumor volume, but rarely studied. The purpose of this study was to examine the relationship between preoperative serum stim Tg level and recurrent tumor burden and to find additional clinical usefulness of stim Tg more than to detect a recurrence. Material and Methods : From January 2000 to December 2009, 40 patients who were operated due to neck recurrence of papillary thyroid cancer after total thyroidectomy were enrolled. All patients had preoperative stim Tg. We compared the clinical correlation of stim Tg and other variables to influence the preoperative stim Tg levels. Results : Preoperative stim Tg levels weren't correlated with site of recurrence, number of metastasis, maximal size, and presence of extra-capsular spread. But considerable increase of stim Tg more than 50ng/mL was identified in recurrence of lateral neck. Patients who have higher stim Tg level after surgery tend to be have higher preoperative stim Tg level. Conclusion : stim Tg was not elevated in 7.5% of recurrent PTC patients. Thus, other diagnostic modalities such as US may be important for these patients. If preoperative stim Tg was more than 50ng/mL, it may suggest recurrence in lateral neck and have less possibility to achieve postoperative biochemical remission.
Over the last 30 years, Hanwoo has been selectively bred to improve economically important traits. Hanwoo is currently the representative Korean native beef cattle breed, and it is believed that it shared an ancestor with a Chinese breed, Yanbian cattle, until the last century. However, these two breeds have experienced different selection pressures during recent decades. Here, we whole-genome sequenced 10 animals each of Hanwoo and Yanbian cattle (20 total) using the Illumina HiSeq 2000 sequencer. A total of approximately 3.12 and 3.07 billion sequence reads were mapped to the bovine reference sequence assembly (UMD 3.1) at an average of approximately 10.71- and 10.53-fold coverage for Hanwoo and Yanbian cattle, respectively. A total of 17,936,399 single nucleotide polymorphisms (SNPs) were yielded, of which 22.3% were found to be novel. By annotating the SNPs, we further retrieved numerous nonsynonymous SNPs that may be associated with traits of interest in cattle. Furthermore, we performed whole-genome screening to detect signatures of selection throughout the genome. We located several promising selective sweeps that are potentially responsible for economically important traits in cattle; the PPP1R12A gene is an example of a gene that potentially affects intramuscular fat content. These discoveries provide valuable genomic information regarding potential genomic markers that could predict traits of interest for breeding programs of these cattle breeds.
The gastric pathogen Helicobacter pylori(H. pylori) establishes long-term chronic infection that can lead to atrophic gastritis, intestinal metaplasia, and gastric cancer. H. pylori, which express cytotoxic genes is now recohnized as a cause of peptic ulcer and is also a major risk factor for the development of gastric adenocarcinoma. We performed this study 1) to assess the detection rate of H. pylori according to direct investigation of bacteria of gastric biopsy specimen and two serologic tests of GAP test and Helico blot 2.0 system in the symptomatic and non-symptomatic group 2) to evaluate and compare the efficacy of two serologic tests of GAP test and Helico blot 2.0 system for the diagnosis of H. pylori infection. Forty-nine patients were positive for H pylori infection based on direct investigation of bacteria by histology. The detection rates of H. pylori infection based on direct investigation of bacteria by histology. The detection rates of H. phlori were significantly lower in gastric cancer than in other gastroduodenal disease(p<0.05). The concordance of two serologic tests of GAP test and Helico blot 2.0 system is poor. There was no statistically significant difference between the expression rate of CagA and VacA in the symptomatic and non-symptomatic group. Although Helico blot 2.0 system may not displace GAP test, it was a very sensitive serologic test for the diagnosis of H. pylori infection and it was used to detect IgG antibodies to H. pylori-specific antigens, including CagA, VacA and the various urease subunit. Our data suggest that further investigation is needed to determine whether or not the serologic expression of cytotoxic gene may be clinical usefulness of diagnostic methods in the gastroduodenal disease.
본 연구에서는 조선시대부터 최근까지의 약 200년간의 서울지점 연강수량 자료를 이용하여 다우해 및 과우해의 재현특성에 대해서 살펴보았다. 기본적으로 원자료에 나타난 자기상관특성을 분석함은 물론 몇 개의 절단수준(truncation level)에 대해 다우해 및 과우해의 재현경향이 어떤지를 살펴보았다. 또한 각각의 절단수준에 대해 연강수량을 평년, 다우해 및 과우해로 나누고 각각의 전이확률을 조사하여 봄으로서 궁극적으로는 각각의 경우에 대해 평년, 다우해 및 과우해의 평균재해기간이 얼마나 되는지를 추정해 보았다. 이러한 분석은 조선시대의 측우기기록과 근대의 강우관측기록을 포함한 전체의 기록뿐만 아니라 측우기 관측기록 및 근대 관측기록에 대해 각각 적용해 봄으로서 비교 분석될 수 있도록 하였다. 전체자료를 이용한 결과의 경우 1900년 전후의 건조기의 영향을 제외한다면 건조기의 전반부 및 후반부만을 이용한 결과와 어느 정도 유사한 결과를 줌을 알 수 있었다. 아울러 건조기의 전반부와 후반부에 대한 비교에서는 건조기 후반부의 기록에서, 특히 상대적으로 큰 절단수준에 대해, 과우해의 재현기간이 상대적으로 크게 나타나는 차이를 살펴볼 수 있었다. 대략 평균에서 표준편차(약370mm)정도가 벗어난 수준을 다우해 및 과우해의 기준으로 본다면 다우해의 재현기간은 5∼6년, 과우해의 재현기간은 6∼7년 정도로 과우해의 재현기간이 다우해의 재현기간 보다 약간 길게 나타나고 있음을 알 수 있었다.
우리나라 난 재배 농가에서 많이 재배하고 있는 호접란 대만 수입묘의 바이러스 감염 정도를 검정하기 위하여 플라스크묘 상태의 실생 번식 식물체를 공시하여 역전사 중합효소 연쇄반응(RT-PCR) 기술에 의해 CymMV와 ORSV의 감염 여부를 검정하였다. 호접란 식물체의 잎에서 조즙액을 추출하여 RT-PCR을 위한 total RNA로 사용하였다. $42^{\circ}C$에서 45분간 반응시켜 cDNA를 합성하였으며, $96^{\circ}C$에서 2분간 template를 예비 변성시킨 후, $96^{\circ}C$에서 30초간 template 변성, $60^{\circ}C$에서 30초간 primer 부착 및 $72^{\circ}C$에서 1분간 DNA 합성을 1cycle로 하여 총 36cycle을 반응시키고, $72^{\circ}C$에서 10분간 안정화하는 조건으로 one-step RT-PCR을 수행하였다. 바이러스 검정 결과 정도의 차이는 있으나, 40개 시료 모두 CymMV에 감염되어 있었으며, ORSV에 감염된 식물체는 없었다.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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