Acid phosphatase (EC3.1.3.2) from carrots was partially purified by ammonium sulfate fractionation (30%-80%), Sephacryl S-200 gel filtration, cm-Sepharose CL-6B and DEAE -Sephacel ion exchange chromatography. The optimum ph and temperature of acid phosphatase from carrots were pH 5.5 and 55$^{\circ}C$, respectively. The enzyme was most stable at ph 6.0 and relatively unstable below pH 4.0 . The activation energy of the enayme was determined to be 10.6kcal/mole. The enzyme utilized p-nitrophenyl phosphate as a substrate among tested possible substrates, whereas it hydrolyzed 5' -IMP and 5'-GMP poorly. The Michaelis -Menten constant(Km) of the enzyme with p-nitrophenyl phosphate as a substrate was identified as 0.55mM. Amongtested metal ions and inhibitors, Al+++ Zn++, Cu++ , fluoride, metavanadate and molybdate ions inhibited the enzyme activity drastically.
$\beta $-Glucosidase (EC 3.2.1.21) was purified from Aspergillus niger SFN-416 by a sequential process of ammonium sulfate precipitation, Sepadex G-100 and DEAE-Sephacel column chromatography. Molecular weight of the enzyme was 46, 000 daltons. The K$_{m}$ and V$_{max}$ values for PNPG were 0.67 mM and 25 moles/ml $\cdot $min., respectively. The optimum pH and temperature of the enzyme activity were 3.5 and 58$\circ $C, respectively. The enzyme activity was decreased by addition of metal ions, and increased by addition of metanol, ethanol, isopropanol and 1-butanol at a concentration of 10% (v/v). Stability of the enzyme was increased by addition of isopropanol and 1-butanol at a concentration of 10% (v/v).
A glutathione S-transferase (GST) from Lactuca sativa was purified to electrophoretic homogeneity approximately 403-fold with a 9.6% activity yield by DEAE-Sephacel and glutathione (GSH)-Sepharose column chromatography. The molecular weight of the enzyme was determined to be approximately 23,000 by SDS-polyacrylamide gel electrophoresis and 48,000 by gel chromatography, indicating a homodimeric structure. The activity of the enzyme was significantly inhibited by S-hexylGSH and S-(2,4-dinitrophenyl) glutathione. The enzyme displayed activity towards 1-chloro-2,4-dinitrobenzene, a general GST substrate and high activities towards ethacrynic acid. It also exhibited glutathione peroxidase activity toward cumene hydroperoxide.
Farnesyl protein transferase는 Ras precursor의 C-terminal에 있는 cystein residue에 farnesyl group을 결합시키는 효소다. 이 효소를 bovine testis에서 30-50% ammonium sulfate fractionation, DEAE-sephacel ion exchange, Sephacryl s-300 gel filtration, hexapeptide(KKCVIM) affinity chromatography를 통해 30000배로 분리하였다. 분리된 효소는 gel filtration시 약 100kDa으로, SDS-polyacrylamide 전기영동시 50kDa의 인접한 두 bands로 나타났고 이것은 $\alpha$, $\beta$ subunits으로 생각되었다. $\alpha$ subunit을 encoding하는 RAM2 유전자를 site directed mutagenesis로 145번의 histidine을 aspartate로, 140번의 aspartate를 asparagine 으로 바꾸었더니 optimal pH와 $K_{m}$ 값이 변했다. Diethyl pyrocarbonate로 histidine residues를 chemical modification시켰을때 효소의 활성이 저하되었다. 145번 histidine이 aspartate로 바뀐 돌연변이효소에서 비교적 느리게 활성이 저하되므로 145번 histidine이 이 효소의 active site에 있을것으로 추측된다.
An ascorbic acid phosphorylating enzyme, which catalyzes the formation of ascorbic acid-2-phosphate from ascorbic acid and pyrophosphate, was purified 32.7-folds to homogeneity from a cell-free extract of Cellulomonas sp. AP-7. The combination of DEAE- Sephacel ion exchange chromatography and Sephacryl S-200 get filtration was used for their purification. The molecular weight of the native protein was estimated to be 96.lkDa on high performance gel filtration chromatography. The SDS-PAGE analysis indicated that the protein consisted of four identical subunits of 24.6 kDa. The purified enzyme showed the optimal tempeature of 40$\circ$C and optimal pH of 4.5. The Km for ascorbic acid and pyrophosphate were 119 mM and 11.9 mM, respectively. The addition of 5,5'-dithiobis-(2-nitrobenzoic acid) into the reaction mixture resulted in the reduction of the enzyme activity at 51%. The enzyme also had a phosphatase activity at weakly acidic pH and the Km for ascorbic acid-2-phosphate in phosphatase activity was 7.9 mM.
Xylanase (EC 3.2.1.8) was purified approximately 4.3 fold from Aspergillus niger SFN-416 by ammonium sulfate fractionation, Sephadex G-100 gel filtration and DEAE-Sephacel ion exchange chromatography. Molecular weight of the enzyme was approximately 42,000 daltons. The optimum pH and temperature of the enzyme activity were 5.5 and 50$\circ$C, respectively. The enzyme activity was enhanced by Fe$^{2+}$, and inhibited by Hg$^{2+}$. The activity was decreased by addition of methanol, ethanol, isopropanol and 1-butanol at a concentration of 10%(v/v).
겨울철 토양에서 ${\beta}-Galactosidase$를 생산하는 균주를 분리하였으며 동정한 결과 그람 음성 간균이고 Pantoea spp. 로 확인되었다. Pantoea spp. 균주의 세포 추출물로부터 DEAE-Sephacel chromatography와 affinity chromatography를 이용하여 ${\beta}-Galactosidase$를 분리하였다. Pantoea spp. 의 ${\beta}-Galactosidase$의 반응 최적 온도는 $45^{\circ}C$이이고 최적 pH는 $5.5{\sim}7.5$이고 열안정성을 조사한 결과 $45^{\circ}C$이상의 온도에서 불활성 되는 것으로 나타났고 E. coli에서 분리된 효소보다 저온에서의 활력이 좋았지만 상업적인 효소인 Kluyveromyces lactis (Validase) 보다는 낮았다.
A minor anionic isoperoxidase named $A_{3n}$, was isolated from Korean radish (Raphanus sativus L.) root. Purification of the enzyme was accomplished by CMcellulose chromatography, DEAE-Sephacel chromatography, and Sephadex G-75 gel filtration. The enzyme was a glycoprotein with molecular weight of approximately 31,000 as determined by SDS-PAGE and 33,000 by Sepadex G-150 gel filtration, which is by far the smallest among the reported isoperoxidases. The pI value was 3.5. The optimum pH of the enzyme was 6.5 for guaiacol and $H_2O_2$, and the $K_m$ values for guaiacol and $H_2O_2$ were 13.3 mM and 1.5 mM, respectively. Kinetic studies with various substrates revealed that only A3n, unlike other isoperoxidases from radish, did not use scopoletin as a substrate and had very low $K_m$ value of 0.25 mM for ferolic acid among naturally occurring phenolic substrates.
$\alpha$-Galactosidase from A. oryzae DR-5 was induced in the presence of melibiose, raffinose, galactose, and locust bean galactomannan. The enzyme was purified to homogeneity by precipitation with acetone followed by ion-exchange chromatography using DEAE-Sephacel. The purified enzyme showed a single band in both nondenaturing-PAGE and SDS-PAGE. The enzyme was a glycoprotein in nature by activity staining. The molecular weight of the purified enzyme was 93-95 kDa by SDS-PAGE. The enzyme exhibited the optimum pH and temperature at 4.7 and $60^\circ{C}$, respectively. $\alpha$-Galactosidase activity was strongly inhibited by $Ag^{2+}, Hg^{2+}, Cu^{2+}$, and galactose. EDTA, 1,10-phenanthraline, and PMSF did not inhibit the enzyme activity, whereas N-bromosuccinimide completely inhibited enzyme activity. Investigation by TLC showed complete hydrolysis of stachyose and raffinose in soymilk in 3 h at pH 5.0 and $50^\circ{C}$.
Farnesyl Protein transferase(FPT)는 발암유전자 ras의 단백질 산물인 p$^{21}$의 post-translational modification의 첫 단계인 ras-farnesylation에 관여하는 효소로 본 연구에서는 정제된 FPT와 E. coli에서의 발현 system을 이용하여 FPT의 구조와 기능을 밝히고 이를 FPT 방해제의 설계에 이용하고자 한다. Bovine testis에 존재하는 FPT를 30%-50%의 Ammonium sulfate로 fractionation하고, DEAE-Sephacel, Sephacryl S-300 column을 통과시킨 후 peptide(KKCVIM) affinity column을 이용하여 순수 정제하였다. 정제된 효소의 분자량은 gel-filtration에 의해 100KDa으로 추정되었고 SDS-PAGE 결과 49KDa과 46KDa의 두 subunit로 구성되었음이 확인되었다. 효소활성에는 $Mg^{2+}$ 와 $Zn^{2+}$가 필수적이며 최적 pH는 7.0이었다. Yeast의 FPT의 두 subunit 유전자는 Yeast genomic DNA를 template로 사용하고 각 subunit에 specific한 합성된 primer들과 vent polymerase를 이용하여 Polymerase chain reaction을 통하여 얻었다. 두 유전자를 pBluescriptII SK+ vector를 변형시킨 두 vector, pBSK+4와 pBChl+4에 재조합 시킨 후 E.coli에 transformation시켜 발현시켰다. 현재 정제된 Bovine FPT와 E. coli에서 발현된 Yeast FPT의 chemical modification과 site-directed mutagenesis를 통하여 FPT의 active site와 substrate binding site에 관한 연구를 진행시키고 있다.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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