• 한국식품영양과학회지
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• 제28권1호
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• pp.87-93
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• 1999

This study was carried out to investigate the effects of nucleic acid related compounds and metal ions on activities of cytidine deaminase from Bacillus subtilis ED 213. The purified cytidine deaminase was weakly inhibited by 1mM GMP, IMP and ATP, but not affected by other nucleic acid related compounds such as CMP and UDP. The apparent Km values for cytidine, deoxycytidine, 5 methylcy tidine, fluorodeoxycytidine, and 5 bromocytidine were calculated to be 6.6$\times$10-4M, 6.0$\times$10-4M, 0.9$\times$10-4M, 0.8$\times$10-4M, and 2.0$\times$10-3M, respectively. The cytidine deaminase was completely inhibited by 1mM Hg2＋, and mildly inhibited over 40% by metal ions such as Na＋ and Fe2＋. However the enzyme activity was activated more than 40% by 1mM Mg2＋.

• 한국식품영양과학회지
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• 제21권3호
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• pp.279-285
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• 1992

황산암모늄 분획 (35-60%) 효소액을 사용하여 Aspergillus fumigatus IFO 5840의 cytidine deaminase에 대한 효소학적 성질을 조사하였다. 효소반응의 전처리시간은 25분이었으며 본 효소의 최적pH와 최적온도는 각각 6.8-7.2와 $37^{\circ}C$부근이었다. PH에 대한 안정성은 pH7.2에서 9.0의 범위에서 안정하였으며 온도의 안정성은 4$0^{\circ}C$에서 10분 열처리시 대체로 안정하였으나 6$0^{\circ}C$에서 20분간 처리시는 77%의 효소실활을 나타내었고 7$0^{\circ}C$에서 25분간 처리하였을때 완전히 실활되었다. 본 효소의 활성화 에너지 값(Ea)은 14.190kca1/mo1이었고 온도계수 ($Q_{10}$ )는 2.163이었다.

• 환경생물
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• 제21권1호
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• pp.60-65
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• 2003

The cytidine deaminase was partialy purified with sephadex G-200 and the characteristics of the enzyme were clarified. The molecular mass of the plasmid-encoded protein was identified as about 30 kDa in a minicell system. The native enzyme was estimated to have the molecular mass of 60 kDa by gel filtration. This indicates that the native enzyme may exist as a dimer composed of two identical subunits. The enzyme was reasonably stable in the pH range of 6 to 9, and was labile under high temperature above $50^{\circ}C$. Mercaptoethanol, pCMB, mercury and copper were found to inhibit the enzyme activity. The cytidine analogues of bromo- and iodo-(deoxy)-cytidine were also found to inhibit the activity, while fluorodeoxycytidine and azacytidine were found to activate it. Deoxycytidine, cytidine, ara-C and Methyldeoxycytidine have excellent substrates for the enzyme.

• 한국미생물생명공학회:학술대회논문집
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• 한국미생물생명공학회 1986년도 추계학술대회
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• pp.512.2-512
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• 1986

A mutant of bacillus subtilis with a defective cdd gene encoding deoxycytidine-cytidine deaminase(EC 3.5.4.5.) has been characterized genetically. The genetic lesion causing the altered deoxycytidine-cytidine deaminase, cdd, was mapped at 225 min on the linkage map of B.subtilis by AR9 transduction Transductional analysis of the cdd region established the gene order as trp-lys-dnaE-cdd-aroD. The cdd gene was linked 72% with the aroD and 20% with the lys.

• 한국미생물·생명공학회지
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• 제16권6호
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• pp.536-539
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• 1988

A mutant of Bacillus subtilis with a defective cdd gene encoding deoxycytidine-cytidine deaminase (EC 3.5.4.5) has been characterized genetically. The genetic lesion, cdd, causing the altered deoxycytidine-cytidine deaminase was mapped at 225 min on the linkage map of B. subtilis by AR9 transduction, Transductional analysis of the cdd region established the gene order in clockwise as trp-lys-cdd-aroD. The cdd gene was linked 72% with the aroD and 20% with the lys.

• 한국미생물·생명공학회지
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• 제17권4호
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• pp.334-342
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• 1989

Bacillus stearothermophilus의 cytidine deaminase (cytidine/2'-deoxycytidine aminohydrolase：EC 3.5.4.5)를 코딩하는 cdd 유전자를 E. coli cdd$^-$ 결손변이주를 cloning host로 하여 3-10Kbp의 B. stearothermophilus DNA 단편으로부터 shot gun 법으로 클로닝하였다. 고 복제수 플라스미드 pBR322 의 PstI 부위에 3.0Kb의 B. stearothermophilus DNA 단편을 함유한 pJSC101이 cdd$^+$와 tetracy-line 내성으로서 cloning되었으며, 이어서, 결실 및 subcloning을 연속 수행한 결과 약 1.35kbp의 Eco RI$_1$/PstI$_2$단편이 동일 부위의 pBR322에 삽입된 cdd 양성의 pJSC201을 얻었다. Mini 세포 실험결과, 이 단편에서 합성되는 polypeptide는 약 33 KDa이었기에 이 polypeptide가 cytidine deaminase 로 추정되었다. 또한 이 단편에 함유한 550bp의 EcoRI/AvaI 부분을 lacZ 프로모터 영역에 삽입한 경우 프로모터 활성을 나타내었기에 이 단편의 Eco RI 부위에서 PstI부위로 cdd 유전자가 전사됨을 알 수 있었다. B. subilis와 E. coli에서 발현이 가능한 shuttle vector에 cdd가 함유된 단편을 삽입한 후 이를 양세포에서 동시 발현시켰을 때 B. subtilis에서 발현시킨 경우가 E. coli에서 보다높은 cytidine deaminase 활성을 나타내었으며 이 유전자는 B. subtilis 에서도 E. coli에서와 같이 안정하게 유지됨을 알 수 있었다.

• 한국미생물·생명공학회지
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• 제18권6호
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• pp.640-646
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• 1990

E.coli의 cytidine deaminase(cytidine/2'-deoxy-cytidine aminohydrolas` EC 3.5.4.5)를 코딩하는 cdd 유전자를 E.coli cdd- pyr- 결손 변이주를 cloning host로 하여 southern blotting과 colony hybridization을 통하여 클로닝하였다. cdd 유전자가 단편인, cdd 유전자의 transcription initiation 부위의 23개 nucleotide를 합성한 후 probe로 사용하여 Southern hybridization에 의해 회수된 cdd 유전자를 함유한 단편을 얻었으며, 이를 pBR322에 삽입한 후 형질전환하여 colony hybridization한 결과 cdd+ cell을 얻었다. 삽입된 DNA 단편의 size는 27kb이었으며 이를 결실 및 subcloning을 연속 수행한 결과 2.1kb의 SalI/ DraI fragment(pTK605)에 cdd 유전자가 location 되어 있음을 알게 되었다. Mini cell 실험결과 합성된 cytidine deaminase의 활성이 pBR322에서 증폭시킴으로서 37배 정도 배가되었으며, pBR322에 비해 pUC vector계에서 다시 활성이 7배 정도 증가됨을 알 수 있었다.

• 한국미생물·생명공학회지
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• 제16권6호
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• pp.468-475
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• 1988

고초균 (Bacillus subtilis)의 cytidine/2'deoxycytidine deaminase (EC 3.5.4.5)를 로드하는 cdd 유전자를 cdd 결손변이주 B. subtilis ED4O에서 발현시켰다. 이 cdd 유전자는 Bacillus의 λD69 유전자은행으로부터 처음 클로닝된 것으로서 B. subtilis-Escherichia coli 의 shuttle vector pGB 215-110ΔB의 EcoRl/Pvul 부위에 삽입시켰다. 형질전환된 ED4O는 야생주에 비해 3700unit의 강한 cdd 활성을 나타내었으며 이 클론된 백터 pSO100 을 E. coli에서 발현시키면 B. subtilis 비해 2배의 강한 활성을 나타내었다. 겔 여과로 부분정제한 본 효소의 Km치는 1.88$\times$$10^{-4}$M이었으며 Vmax=11.1 $\mu$mol/min/mg 단백이었다. 이 효소는 0.1M mercaptoethanol과 수은에 의해 완전저해되었으며 p-chloromercurybenzoic acid에 대해 Ki=5$\mu$M로 나타났다. 본 효소의 활성상실은 monomer에 함유된 6개의 cysteine 잔기의 일부가 활성단으로 작용하는 과정이 저해되었거나 tetramer로서의 회합과정이 저해되었기 때문인 것으로 추측되었다.

• IMMUNE NETWORK
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• 제12권6호
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• pp.230-239
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• 2012

Activation-induced cytidine deaminase (AID) is an enzyme that is predominantly expressed in germinal center B cells and plays a pivotal role in immunoglobulin class switch recombination and somatic hypermutation for antibody (Ab) maturation. These two genetic processes endow Abs with protective functions against a multitude of antigens (pathogens) during humoral immune responses. In B cells, AID expression is regulated at the level of either transcriptional activation on AID gene loci or post-transcriptional suppression of AID mRNA. Furthermore, AID stabilization and targeting are determined by post-translational modifications and interactions with other cellular/nuclear factors. On the other hand, aberrant expression of AID causes B cell leukemias and lymphomas, including Burkitt's lymphoma caused by c-myc/IgH translocation. AID is also ectopically expressed in T cells and non-immune cells, and triggers point mutations in relevant DNA loci, resulting in tumorigenesis. Here, I review the recent literatures on the function of AID, regulation of AID expression, stability and targeting in B cells, and AID-related tumor formation.

• 미생물학회지
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• 제35권2호
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• pp.133-138
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• 1999

Bacillus subtilis ED 213의 cytidine deaminase 의 활성부위에 존재하는 필수 아미노산잔기를 화학수식 방법으로 측정하였다. 본 효소는 1mM o-phenanthroline 에 의하여 효소활성이 43% 저해되어 효소활성 발현에 Fe\sup 2+\가 요구된다고 추정되며, 1mM ethylenediaminetetraacetic acid 에 의해서는 효소활성이 오히려 28% 정도 촉진되었다. 본 효소는 1mM N-bromosuccinimide, 1mM chloramine-T 와 1mM $\rho$-chloromercuribenzoic acid에 의하여 100% 저해되었으며, 그의 저해 양상은 경쟁적 저해 양상을 나타내었다. 본 효소의 효소활성은 1mM pyridoxal-5-phosphate 에 의항 36% 저해되었으며, 1mM 1ethyl-3-carbodiamide 와 1mM glycine methylester에 의해 저해된 효소활성이 5mM cysteine에 의해 완전히 회복되었다. 이상의 결과로부터 Bacillus subtilis ED 213 cytidine deaminase의 활성부위에는 tyrosine, methionine, cysteine 과 serine 잔기가 관여할 뿐만 아니라 lysine 과 glycine 도 효소활성에 관여하는 것으로 추정된다.